MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 46649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017167	CGA	2	6	63787	63792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133848
1002	NC_017167	GTG	2	6	63842	63847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133848
1003	NC_017167	TGA	2	6	64056	64061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133848
1004	NC_017167	GGC	2	6	64100	64105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133848
1005	NC_017167	CCG	2	6	64128	64133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133848
1006	NC_017167	CGT	2	6	64140	64145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133848
1007	NC_017167	TGG	2	6	64271	64276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133848
1008	NC_017167	CGA	2	6	64281	64286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133848
1009	NC_017167	ACG	2	6	64353	64358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133848
1010	NC_017167	GCC	2	6	64375	64380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133848
1011	NC_017167	GAG	2	6	64397	64402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133848
1012	NC_017167	GCG	2	6	64430	64435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133848
1013	NC_017167	GCG	2	6	64437	64442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133848
1014	NC_017167	GTA	2	6	64762	64767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133848
1015	NC_017167	CGG	2	6	64768	64773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133848
1016	NC_017167	GGC	2	6	64790	64795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133848
1017	NC_017167	GAC	2	6	64826	64831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133848
1018	NC_017167	AGC	2	6	64832	64837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133848
1019	NC_017167	AGG	2	6	64904	64909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133848
1020	NC_017167	CCA	2	6	64912	64917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133848
1021	NC_017167	TCG	2	6	64989	64994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133848
1022	NC_017167	CTG	2	6	64996	65001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133848
1023	NC_017167	CCA	2	6	65099	65104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133848
1024	NC_017167	GAG	2	6	65130	65135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133848
1025	NC_017167	CGA	2	6	65184	65189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133848
1026	NC_017167	ACG	2	6	65219	65224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133848
1027	NC_017167	GTC	2	6	65233	65238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133848
1028	NC_017167	GTA	2	6	65440	65445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133848
1029	NC_017167	TGA	2	6	65565	65570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133848
1030	NC_017167	GCC	2	6	65638	65643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133848
1031	NC_017167	GCC	2	6	65689	65694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133848
1032	NC_017167	GCG	2	6	65909	65914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133848
1033	NC_017167	TGG	2	6	66003	66008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133848
1034	NC_017167	AGA	2	6	66117	66122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133848
1035	NC_017167	CGG	2	6	66129	66134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133848
1036	NC_017167	CGA	2	6	66136	66141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133848
1037	NC_017167	GCG	2	6	66182	66187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133848
1038	NC_017167	TCG	2	6	66270	66275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133848
1039	NC_017167	CGT	2	6	66381	66386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133848
1040	NC_017167	GTC	2	6	66427	66432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133848
1041	NC_017167	TGA	2	6	66531	66536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133848
1042	NC_017167	CGG	2	6	66537	66542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133848
1043	NC_017167	TCT	2	6	66561	66566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133848
1044	NC_017167	CAG	2	6	66693	66698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133848
1045	NC_017167	ACG	2	6	66789	66794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133849
1046	NC_017167	GAG	2	6	66828	66833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133849
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1048	NC_017167	TGC	2	6	67111	67116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133849
1049	NC_017167	GCG	2	6	67126	67131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133849
1050	NC_017167	GTT	2	6	67142	67147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133849
1051	NC_017167	CGG	2	6	67195	67200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133849
1052	NC_017167	CGT	2	6	67217	67222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133849
1053	NC_017167	CAT	2	6	67266	67271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133849
1054	NC_017167	CGG	2	6	67306	67311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133849
1055	NC_017167	GAG	2	6	67383	67388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133849
1056	NC_017167	GCG	2	6	67420	67425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133849
1057	NC_017167	CGG	2	6	67468	67473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133849
1058	NC_017167	GCG	3	9	67515	67523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133849
1059	NC_017167	CGA	2	6	67568	67573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133849
1060	NC_017167	GAC	2	6	67607	67612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133849
1061	NC_017167	CAG	2	6	67632	67637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133849
1062	NC_017167	CAG	2	6	67641	67646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133849
1063	NC_017167	GCC	2	6	67650	67655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133849
1064	NC_017167	TCA	2	6	67669	67674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133849
1065	NC_017167	GAG	2	6	67680	67685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133849
1066	NC_017167	GTC	2	6	67730	67735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133849
1067	NC_017167	GAG	2	6	67811	67816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133850
1068	NC_017167	GGT	3	9	67837	67845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133850
1069	NC_017167	TCC	2	6	67917	67922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133850
1070	NC_017167	ACG	2	6	67950	67955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133850
1071	NC_017167	GAT	2	6	67981	67986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133850
1072	NC_017167	CAT	2	6	67999	68004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133850
1073	NC_017167	GAA	2	6	68035	68040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133850
1074	NC_017167	GCA	2	6	68113	68118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133850
1075	NC_017167	GTG	2	6	68153	68158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133850
1076	NC_017167	AGG	2	6	68229	68234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133850
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1078	NC_017167	ACC	2	6	68273	68278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133850
1079	NC_017167	CGA	2	6	68465	68470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133851
1080	NC_017167	GAA	2	6	68483	68488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133851
1081	NC_017167	CGG	2	6	68506	68511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133851
1082	NC_017167	GAG	2	6	68585	68590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133851
1083	NC_017167	CGC	2	6	68591	68596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133851
1084	NC_017167	CGA	2	6	68603	68608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133851
1085	NC_017167	CCG	2	6	68635	68640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133851
1086	NC_017167	CGC	2	6	68696	68701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133851
1087	NC_017167	CCA	2	6	68710	68715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133851
1088	NC_017167	TCA	2	6	68740	68745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133851
1089	NC_017167	TTG	2	6	68757	68762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133851
1090	NC_017167	ATG	2	6	68817	68822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133851
1091	NC_017167	GTT	2	6	68828	68833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133851
1092	NC_017167	GCG	2	6	68916	68921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133851
1093	NC_017167	AGC	2	6	68922	68927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133851
1094	NC_017167	GCC	2	6	68954	68959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133851
1095	NC_017167	CCA	2	6	69028	69033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133851
1096	NC_017167	GAT	2	6	69119	69124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133851
1097	NC_017167	GCC	2	6	69140	69145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133851
1098	NC_017167	CGC	2	6	69237	69242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133851
1099	NC_017167	ACG	2	6	69270	69275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133851
1100	NC_017167	CGA	2	6	69305	69310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133851
1101	NC_017167	CGA	2	6	69472	69477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133851
1102	NC_017167	ACG	2	6	69555	69560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133851
1103	NC_017167	GCG	2	6	69573	69578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133851
1104	NC_017167	GGC	2	6	69638	69643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133851
1105	NC_017167	CCG	2	6	69666	69671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133851
1106	NC_017167	GAT	2	6	69692	69697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133851
1107	NC_017167	CGT	2	6	69839	69844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133851
1108	NC_017167	CAA	2	6	69875	69880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133851
1109	NC_017167	GAT	2	6	69941	69946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133851
1110	NC_017167	GTG	2	6	69987	69992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133851
1111	NC_017167	TCT	2	6	70058	70063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133852
1112	NC_017167	CGC	2	6	70144	70149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133852
1113	NC_017167	TCT	2	6	70161	70166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133852
1114	NC_017167	GAC	2	6	70180	70185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133852
1115	NC_017167	GAA	2	6	70341	70346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133852
1116	NC_017167	TCG	2	6	70373	70378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133852
1117	NC_017167	GCG	2	6	70402	70407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133852
1118	NC_017167	CCG	2	6	70473	70478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133852
1119	NC_017167	CCT	2	6	70519	70524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_017167	TCA	2	6	70725	70730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133853
1121	NC_017167	CGT	2	6	70731	70736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133853
1122	NC_017167	CGA	2	6	70761	70766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133853
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