MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 46649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017167	GAA	2	6	322016	322021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134111
5002	NC_017167	GTT	2	6	322220	322225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017167	AGA	2	6	322292	322297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017167	AAG	2	6	322404	322409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134112
5005	NC_017167	GAA	2	6	322415	322420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134112
5006	NC_017167	GGC	3	9	322436	322444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134112
5007	NC_017167	TTG	2	6	322462	322467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134112
5008	NC_017167	GCG	2	6	322518	322523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134112
5009	NC_017167	CGC	2	6	322585	322590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134112
5010	NC_017167	GAT	2	6	322602	322607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134112
5011	NC_017167	GAA	2	6	322631	322636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134112
5012	NC_017167	CAG	2	6	322698	322703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134112
5013	NC_017167	CTC	2	6	322734	322739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134112
5014	NC_017167	GGC	2	6	322787	322792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134112
5015	NC_017167	AAC	2	6	322866	322871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134112
5016	NC_017167	GCA	2	6	322907	322912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134112
5017	NC_017167	AAG	2	6	322917	322922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134112
5018	NC_017167	GGC	2	6	322923	322928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134112
5019	NC_017167	GGT	2	6	322931	322936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134112
5020	NC_017167	GCA	2	6	323069	323074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134112
5021	NC_017167	GCA	2	6	323090	323095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134112
5022	NC_017167	AGC	3	9	323179	323187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134112
5023	NC_017167	ACG	2	6	323251	323256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134112
5024	NC_017167	GCC	2	6	323304	323309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134112
5025	NC_017167	AAG	2	6	323340	323345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134112
5026	NC_017167	AAC	2	6	323376	323381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134112
5027	NC_017167	TCA	2	6	323452	323457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134112
5028	NC_017167	CAC	2	6	323468	323473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134112
5029	NC_017167	AGC	2	6	323500	323505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134112
5030	NC_017167	CTT	2	6	323557	323562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_017167	ACG	2	6	323564	323569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_017167	AGG	2	6	323572	323577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017167	TCG	2	6	323707	323712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134113
5034	NC_017167	ACC	2	6	323736	323741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134113
5035	NC_017167	GAT	2	6	323747	323752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134113
5036	NC_017167	AGC	2	6	323764	323769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134113
5037	NC_017167	GCG	2	6	323921	323926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134113
5038	NC_017167	GCG	2	6	323975	323980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134113
5039	NC_017167	CGG	2	6	324050	324055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134113
5040	NC_017167	CGA	2	6	324116	324121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134113
5041	NC_017167	CCG	2	6	324127	324132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134113
5042	NC_017167	CGT	2	6	324140	324145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134113
5043	NC_017167	GCA	2	6	324146	324151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134113
5044	NC_017167	GTG	2	6	324255	324260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134113
5045	NC_017167	GGC	2	6	324323	324328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134113
5046	NC_017167	AGG	2	6	324352	324357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134113
5047	NC_017167	CGC	2	6	324411	324416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134114
5048	NC_017167	CAT	2	6	324441	324446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134114
5049	NC_017167	CAA	2	6	324460	324465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134114
5050	NC_017167	AAC	2	6	324517	324522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134114
5051	NC_017167	TGC	2	6	324557	324562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134114
5052	NC_017167	TCC	2	6	324605	324610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134114
5053	NC_017167	AGG	2	6	324848	324853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134114
5054	NC_017167	CAT	2	6	324864	324869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134114
5055	NC_017167	AAC	2	6	324871	324876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134114
5056	NC_017167	TGG	2	6	324929	324934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134114
5057	NC_017167	CTC	2	6	324946	324951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134114
5058	NC_017167	TGA	2	6	325055	325060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134114
5059	NC_017167	TGC	2	6	325133	325138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134114
5060	NC_017167	GGC	2	6	325189	325194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134114
5061	NC_017167	GGC	2	6	325272	325277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134114
5062	NC_017167	CGG	2	6	325281	325286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134114
5063	NC_017167	TCG	2	6	325289	325294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134114
5064	NC_017167	GCG	2	6	325312	325317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134114
5065	NC_017167	CGG	2	6	325329	325334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134114
5066	NC_017167	CGG	2	6	325374	325379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134114
5067	NC_017167	CGG	2	6	325392	325397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134114
5068	NC_017167	GCA	2	6	325442	325447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134114
5069	NC_017167	TGG	2	6	325496	325501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134114
5070	NC_017167	CTG	2	6	325513	325518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134114
5071	NC_017167	GCG	2	6	325551	325556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134114
5072	NC_017167	TTG	2	6	325635	325640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017167	GTT	2	6	325651	325656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_017167	CAC	2	6	325689	325694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5075	NC_017167	ATG	2	6	325723	325728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134115
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5077	NC_017167	CAT	2	6	325884	325889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134115
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5079	NC_017167	TGT	2	6	325949	325954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134115
5080	NC_017167	ACG	2	6	325970	325975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134115
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5082	NC_017167	GCG	2	6	326136	326141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134115
5083	NC_017167	CGG	2	6	326215	326220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134115
5084	NC_017167	GAG	2	6	326278	326283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134115
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5087	NC_017167	GAA	2	6	326398	326403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134115
5088	NC_017167	GTC	2	6	326470	326475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134115
5089	NC_017167	AGG	2	6	326507	326512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134115
5090	NC_017167	GAG	2	6	326530	326535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134115
5091	NC_017167	CGC	2	6	326563	326568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_017167	CGA	2	6	326601	326606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_017167	GGT	2	6	326646	326651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_017167	ACC	2	6	326721	326726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5095	NC_017167	AGA	2	6	326776	326781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_017167	GTC	2	6	326960	326965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5098	NC_017167	GTA	2	6	327026	327031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017167	CGT	2	6	327058	327063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_017167	CTG	2	6	327065	327070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_017167	CGA	2	6	327137	327142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134116
5102	NC_017167	CCA	2	6	327248	327253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134116
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5105	NC_017167	CCG	2	6	327654	327659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134116
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5107	NC_017167	GCC	2	6	327733	327738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134116
5108	NC_017167	AAG	2	6	327776	327781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134116
5109	NC_017167	GAA	2	6	327911	327916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134116
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5111	NC_017167	AGG	2	6	327966	327971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134116
5112	NC_017167	TAG	2	6	328023	328028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134116
5113	NC_017167	GCT	2	6	328037	328042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134116
5114	NC_017167	GAT	2	6	328121	328126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134116
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5117	NC_017167	TCT	2	6	328341	328346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_017167	TGT	2	6	328429	328434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_017167	AGT	2	6	328478	328483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5121	NC_017167	GGC	2	6	328573	328578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5486	NC_017167	GCT	2	6	356732	356737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5487	NC_017167	GTC	2	6	356804	356809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134135
5488	NC_017167	GAT	2	6	356918	356923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134135
5489	NC_017167	GAC	2	6	356935	356940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134135
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