MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 46649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017167	CAT	2	6	222322	222327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134018
3502	NC_017167	CGA	2	6	222342	222347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134018
3503	NC_017167	CGT	2	6	222357	222362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134018
3504	NC_017167	ACG	2	6	222368	222373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134018
3505	NC_017167	GGC	2	6	222774	222779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134019
3506	NC_017167	GGA	2	6	222794	222799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134019
3507	NC_017167	GGC	2	6	222895	222900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134019
3508	NC_017167	ACG	2	6	222910	222915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134019
3509	NC_017167	GCG	2	6	222947	222952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134019
3510	NC_017167	GCC	2	6	222963	222968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134019
3511	NC_017167	GTG	2	6	222975	222980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134019
3512	NC_017167	GAC	2	6	223053	223058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134019
3513	NC_017167	TCG	2	6	223084	223089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134019
3514	NC_017167	CGG	2	6	223098	223103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134019
3515	NC_017167	CGC	2	6	223208	223213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134019
3516	NC_017167	CGA	2	6	223253	223258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134019
3517	NC_017167	CCA	2	6	223275	223280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134019
3518	NC_017167	GGC	2	6	223289	223294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134019
3519	NC_017167	CGG	2	6	223331	223336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134019
3520	NC_017167	CCG	2	6	223339	223344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134019
3521	NC_017167	TGG	2	6	223495	223500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134019
3522	NC_017167	CGC	2	6	223517	223522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134019
3523	NC_017167	GCG	2	6	223756	223761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134019
3524	NC_017167	GCC	2	6	223818	223823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134019
3525	NC_017167	GCG	2	6	223846	223851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134019
3526	NC_017167	TCG	2	6	223858	223863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134019
3527	NC_017167	GAC	2	6	224060	224065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134019
3528	NC_017167	TCG	2	6	224077	224082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134019
3529	NC_017167	GCG	2	6	224260	224265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134019
3530	NC_017167	TCA	2	6	224296	224301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134019
3531	NC_017167	CGA	2	6	224348	224353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134019
3532	NC_017167	TCG	2	6	224374	224379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134019
3533	NC_017167	CGA	2	6	224393	224398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134019
3534	NC_017167	GGT	2	6	224405	224410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134019
3535	NC_017167	GAC	2	6	224421	224426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134019
3536	NC_017167	GGC	2	6	224622	224627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134019
3537	NC_017167	GGC	3	9	224660	224668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134019
3538	NC_017167	GTG	2	6	224871	224876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134019
3539	NC_017167	CGT	2	6	224903	224908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134019
3540	NC_017167	GGA	2	6	224909	224914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134019
3541	NC_017167	CGA	2	6	224942	224947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134019
3542	NC_017167	AGG	2	6	224959	224964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134019
3543	NC_017167	TCT	3	9	225012	225020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134019
3544	NC_017167	CGC	2	6	225086	225091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134019
3545	NC_017167	GGA	2	6	225108	225113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134019
3546	NC_017167	CGC	2	6	225143	225148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134019
3547	NC_017167	AGG	2	6	225152	225157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134019
3548	NC_017167	GAG	2	6	225163	225168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134019
3549	NC_017167	GCC	2	6	225251	225256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_017167	TGT	2	6	225291	225296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134020
3551	NC_017167	CGA	2	6	225349	225354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134020
3552	NC_017167	GTC	2	6	225404	225409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134020
3553	NC_017167	GCG	2	6	225534	225539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134020
3554	NC_017167	CGC	2	6	225571	225576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134020
3555	NC_017167	CGG	2	6	225586	225591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134020
3556	NC_017167	CGC	2	6	225601	225606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134020
3557	NC_017167	CCT	2	6	225855	225860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134020
3558	NC_017167	GAG	2	6	225872	225877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134020
3559	NC_017167	GGT	2	6	225913	225918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134020
3560	NC_017167	CAT	2	6	226102	226107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134020
3561	NC_017167	GGC	2	6	226136	226141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134020
3562	NC_017167	GAG	2	6	226167	226172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134020
3563	NC_017167	TCG	2	6	226220	226225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_017167	TCG	2	6	226359	226364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134021
3565	NC_017167	GGC	2	6	226373	226378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134021
3566	NC_017167	CGG	2	6	226524	226529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134021
3567	NC_017167	TGG	2	6	226536	226541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134021
3568	NC_017167	GGT	3	9	226570	226578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134021
3569	NC_017167	CGC	2	6	226606	226611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134021
3570	NC_017167	AGC	2	6	226659	226664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134021
3571	NC_017167	ACG	2	6	226688	226693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134021
3572	NC_017167	GAC	2	6	226781	226786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134021
3573	NC_017167	CGG	2	6	226860	226865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134021
3574	NC_017167	AGA	2	6	226893	226898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134021
3575	NC_017167	GAG	2	6	227007	227012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134021
3576	NC_017167	GCG	2	6	227149	227154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134022
3577	NC_017167	CGG	3	9	227203	227211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134022
3578	NC_017167	CCA	2	6	227239	227244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134022
3579	NC_017167	GGT	2	6	227273	227278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134022
3580	NC_017167	GGC	2	6	227339	227344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134022
3581	NC_017167	TCG	2	6	227377	227382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134022
3582	NC_017167	ATG	2	6	227442	227447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_017167	GCC	2	6	227467	227472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3584	NC_017167	GTG	2	6	227525	227530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134023
3585	NC_017167	TCG	2	6	227622	227627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134023
3586	NC_017167	CAA	2	6	227653	227658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134023
3587	NC_017167	AAG	2	6	227684	227689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134023
3588	NC_017167	TCG	2	6	227729	227734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134023
3589	NC_017167	AGA	2	6	227745	227750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134023
3590	NC_017167	AGG	2	6	227754	227759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134023
3591	NC_017167	CGC	2	6	227767	227772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134023
3592	NC_017167	TAC	2	6	227774	227779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134023
3593	NC_017167	AGG	2	6	227787	227792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134023
3594	NC_017167	GGA	2	6	227969	227974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_017167	GAT	2	6	228075	228080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134024
3596	NC_017167	CAC	2	6	228082	228087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134024
3597	NC_017167	GTG	4	12	228127	228138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134024
3598	NC_017167	GGC	2	6	228162	228167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134024
3599	NC_017167	AGC	2	6	228203	228208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134024
3600	NC_017167	GCG	2	6	228232	228237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134024
3601	NC_017167	GAG	2	6	228337	228342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134024
3602	NC_017167	CGT	2	6	228357	228362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134024
3603	NC_017167	GCG	2	6	228367	228372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134024
3604	NC_017167	TCG	2	6	228437	228442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134024
3605	NC_017167	CGC	2	6	228601	228606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134024
3606	NC_017167	GGA	2	6	228633	228638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134024
3607	NC_017167	AAC	2	6	228661	228666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134024
3608	NC_017167	GAT	2	6	228723	228728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134024
3609	NC_017167	GGT	2	6	228741	228746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134024
3610	NC_017167	GCG	2	6	228996	229001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134024
3611	NC_017167	TCG	2	6	229019	229024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134024
3612	NC_017167	CGA	2	6	229173	229178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134024
3613	NC_017167	CGT	2	6	229239	229244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134024
3614	NC_017167	ACG	2	6	229252	229257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134024
3615	NC_017167	CGA	2	6	229275	229280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134024
3616	NC_017167	ACC	2	6	229309	229314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134024
3617	NC_017167	TCA	2	6	229554	229559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134025
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3619	NC_017167	CGT	2	6	229651	229656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134025
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