MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 46649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017167	CTC	2	6	93188	93193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133870
1502	NC_017167	TCA	2	6	93231	93236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133870
1503	NC_017167	CGC	2	6	93337	93342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133870
1504	NC_017167	TGG	2	6	93369	93374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133870
1505	NC_017167	CGC	2	6	93465	93470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133870
1506	NC_017167	CGC	2	6	93472	93477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133870
1507	NC_017167	GTG	2	6	93644	93649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133870
1508	NC_017167	GCG	2	6	93897	93902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133870
1509	NC_017167	CGG	2	6	94012	94017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133870
1510	NC_017167	GTG	2	6	94121	94126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133871
1511	NC_017167	TCG	2	6	94139	94144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133871
1512	NC_017167	GGC	2	6	94154	94159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133871
1513	NC_017167	CCA	2	6	94200	94205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133871
1514	NC_017167	CCG	2	6	94265	94270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133871
1515	NC_017167	TCG	2	6	94286	94291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133871
1516	NC_017167	GTG	2	6	94376	94381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133871
1517	NC_017167	GTC	2	6	94420	94425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133871
1518	NC_017167	TTC	2	6	94430	94435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133871
1519	NC_017167	TGG	2	6	94451	94456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133871
1520	NC_017167	ACG	2	6	94586	94591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133871
1521	NC_017167	CGG	2	6	94782	94787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133871
1522	NC_017167	CCG	2	6	94829	94834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133871
1523	NC_017167	AGC	2	6	94895	94900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133871
1524	NC_017167	TGC	2	6	94970	94975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133871
1525	NC_017167	TCC	2	6	95027	95032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133871
1526	NC_017167	CGC	2	6	95059	95064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133871
1527	NC_017167	ACC	2	6	95087	95092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133871
1528	NC_017167	CGC	2	6	95147	95152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133871
1529	NC_017167	CCG	2	6	95250	95255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_017167	AGT	2	6	95260	95265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017167	CGG	2	6	95313	95318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133872
1532	NC_017167	TCA	2	6	95352	95357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133872
1533	NC_017167	GGC	2	6	95386	95391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133872
1534	NC_017167	GCG	2	6	95448	95453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133872
1535	NC_017167	CTG	2	6	95585	95590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133872
1536	NC_017167	CAA	2	6	95593	95598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133872
1537	NC_017167	CAC	2	6	95626	95631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133872
1538	NC_017167	GTG	2	6	95732	95737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133872
1539	NC_017167	AGC	2	6	95744	95749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133872
1540	NC_017167	GTG	2	6	95993	95998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133872
1541	NC_017167	CGC	2	6	96046	96051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133872
1542	NC_017167	GCG	2	6	96072	96077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133872
1543	NC_017167	CGT	2	6	96115	96120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133872
1544	NC_017167	CGC	2	6	96151	96156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133872
1545	NC_017167	GAG	2	6	96359	96364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017167	CGA	2	6	96398	96403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_017167	GCG	2	6	96415	96420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_017167	TCG	3	9	96457	96465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133873
1549	NC_017167	AGG	2	6	96466	96471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133873
1550	NC_017167	TGG	2	6	96520	96525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133873
1551	NC_017167	GCA	2	6	96557	96562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133873
1552	NC_017167	GGC	2	6	96653	96658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133873
1553	NC_017167	AGA	2	6	96680	96685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133873
1554	NC_017167	CGA	2	6	96727	96732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133873
1555	NC_017167	CGG	2	6	96788	96793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133873
1556	NC_017167	ACT	2	6	96826	96831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133873
1557	NC_017167	GCG	2	6	96888	96893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_017167	CCG	2	6	96970	96975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133874
1559	NC_017167	ACG	2	6	97077	97082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133874
1560	NC_017167	GGC	2	6	97121	97126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133874
1561	NC_017167	TGA	2	6	97165	97170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133874
1562	NC_017167	TGC	2	6	97199	97204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133874
1563	NC_017167	GAG	2	6	97430	97435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017167	ACG	2	6	97457	97462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133875
1565	NC_017167	ATC	2	6	97465	97470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133875
1566	NC_017167	CCG	2	6	97484	97489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133875
1567	NC_017167	CGC	2	6	97497	97502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133875
1568	NC_017167	TGG	2	6	97511	97516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133875
1569	NC_017167	TGC	2	6	97538	97543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133875
1570	NC_017167	CAT	2	6	97584	97589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133875
1571	NC_017167	CGC	2	6	97613	97618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133875
1572	NC_017167	CAA	2	6	97620	97625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133875
1573	NC_017167	GCT	2	6	97643	97648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133875
1574	NC_017167	GCG	2	6	97658	97663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133875
1575	NC_017167	TCA	2	6	97664	97669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133875
1576	NC_017167	CCG	2	6	97718	97723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133875
1577	NC_017167	CGG	2	6	97728	97733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133875
1578	NC_017167	GCG	2	6	97863	97868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133875
1579	NC_017167	TCG	2	6	97997	98002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133875
1580	NC_017167	TGG	2	6	98012	98017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133875
1581	NC_017167	CGG	2	6	98031	98036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133875
1582	NC_017167	TGC	2	6	98078	98083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133875
1583	NC_017167	CAA	2	6	98151	98156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133875
1584	NC_017167	CGT	2	6	98301	98306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133875
1585	NC_017167	GGC	2	6	98331	98336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133875
1586	NC_017167	CAT	2	6	98487	98492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133875
1587	NC_017167	GCC	2	6	98522	98527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133875
1588	NC_017167	AGG	2	6	98576	98581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133875
1589	NC_017167	TGC	2	6	98606	98611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133875
1590	NC_017167	GAT	2	6	98640	98645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133875
1591	NC_017167	GGC	2	6	98817	98822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133875
1592	NC_017167	GCG	2	6	98828	98833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133875
1593	NC_017167	GGC	2	6	98878	98883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_017167	GTG	2	6	99045	99050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133876
1595	NC_017167	GAC	2	6	99060	99065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133876
1596	NC_017167	AAT	2	6	99214	99219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133876
1597	NC_017167	GAC	2	6	99263	99268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133876
1598	NC_017167	CGA	2	6	99322	99327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133876
1599	NC_017167	CGA	2	6	99371	99376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133876
1600	NC_017167	GGA	2	6	99443	99448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133876
1601	NC_017167	GGC	2	6	99469	99474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133876
1602	NC_017167	CGT	2	6	99508	99513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133876
1603	NC_017167	CTC	3	9	99518	99526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133876
1604	NC_017167	CAT	2	6	99530	99535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133876
1605	NC_017167	GGC	2	6	99622	99627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133876
1606	NC_017167	GCC	2	6	99674	99679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133876
1607	NC_017167	GCC	2	6	99710	99715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133876
1608	NC_017167	TCG	2	6	99799	99804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133876
1609	NC_017167	CGC	2	6	99919	99924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133876
1610	NC_017167	GGC	2	6	99929	99934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133876
1611	NC_017167	TCG	2	6	99960	99965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133876
1612	NC_017167	CGC	2	6	100076	100081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133876
1613	NC_017167	GCG	2	6	100107	100112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133876
1614	NC_017167	GCG	2	6	100318	100323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133877
1615	NC_017167	ATG	2	6	100377	100382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133877
1616	NC_017167	GGT	2	6	100453	100458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133877
1617	NC_017167	GCG	2	6	100601	100606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133877
1618	NC_017167	GCG	2	6	100620	100625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133877
1619	NC_017167	AGG	2	6	100633	100638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133877
1620	NC_017167	AGG	2	6	100641	100646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133877
1621	NC_017167	CGG	2	6	100689	100694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133877
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1623	NC_017167	ACG	2	6	100917	100922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133877
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1979	NC_017167	CAC	2	6	121727	121732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133898
1980	NC_017167	TGA	3	9	121759	121767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133898
1981	NC_017167	CTT	2	6	121832	121837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133898
1982	NC_017167	TCC	2	6	121926	121931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133898
1983	NC_017167	GAA	2	6	121942	121947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133898
1984	NC_017167	CCA	2	6	122113	122118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133898
1985	NC_017167	CCT	2	6	122125	122130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133898
1986	NC_017167	CCG	2	6	122158	122163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133898
1987	NC_017167	GCA	2	6	122217	122222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1988	NC_017167	TTC	2	6	122468	122473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133899
1989	NC_017167	CGG	2	6	122534	122539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133899
1990	NC_017167	ACG	2	6	122550	122555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133899
1991	NC_017167	CGC	2	6	122573	122578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133899
1992	NC_017167	CTG	2	6	122689	122694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133899
1993	NC_017167	TTG	2	6	122826	122831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133899
1994	NC_017167	CTG	2	6	122891	122896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133899
1995	NC_017167	CGC	2	6	122912	122917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133899
1996	NC_017167	CGC	2	6	122954	122959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1997	NC_017167	CTG	2	6	122967	122972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1998	NC_017167	GGT	2	6	123170	123175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133901
1999	NC_017167	CGC	2	6	123272	123277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133901
2000	NC_017167	GAG	2	6	123333	123338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133901

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