MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 46649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017167	GCG	2	6	289312	289317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134080
4502	NC_017167	GCG	2	6	289326	289331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134080
4503	NC_017167	GGC	2	6	289404	289409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134081
4504	NC_017167	TCG	2	6	289416	289421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134081
4505	NC_017167	TTG	2	6	289528	289533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134081
4506	NC_017167	GCT	2	6	289557	289562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134081
4507	NC_017167	GGT	3	9	289584	289592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134081
4508	NC_017167	TGG	2	6	289601	289606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134081
4509	NC_017167	CTC	3	9	289753	289761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134081
4510	NC_017167	ACT	2	6	289892	289897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134081
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4512	NC_017167	CGA	2	6	290007	290012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134081
4513	NC_017167	TGC	2	6	290015	290020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134081
4514	NC_017167	CTT	2	6	290223	290228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134081
4515	NC_017167	CAC	2	6	290241	290246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134081
4516	NC_017167	TGC	2	6	290258	290263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134081
4517	NC_017167	GCG	2	6	290295	290300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134081
4518	NC_017167	GGC	2	6	290303	290308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134081
4519	NC_017167	GCG	2	6	290338	290343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134081
4520	NC_017167	GTG	2	6	290410	290415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134081
4521	NC_017167	CGT	2	6	290424	290429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134081
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4527	NC_017167	CGG	2	6	290765	290770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134081
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4533	NC_017167	CGT	2	6	291263	291268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134082
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4545	NC_017167	GAT	3	9	291989	291997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4555	NC_017167	GAG	2	6	292710	292715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_017167	TGT	2	6	292931	292936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_017167	CAA	2	6	293065	293070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4859	NC_017167	CAT	2	6	312215	312220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134103
4860	NC_017167	CGG	2	6	312244	312249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134103
4861	NC_017167	TCG	2	6	312349	312354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134103
4862	NC_017167	GGC	2	6	312434	312439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134103
4863	NC_017167	CGA	2	6	312478	312483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134103
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4866	NC_017167	ACG	2	6	312559	312564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134103
4867	NC_017167	CAT	2	6	312581	312586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134103
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4874	NC_017167	GTG	2	6	312971	312976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134104
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4878	NC_017167	GTC	2	6	313237	313242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134104
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4893	NC_017167	GTC	2	6	314296	314301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134105
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4914	NC_017167	TCG	2	6	315425	315430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134105
4915	NC_017167	TCC	2	6	315518	315523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134105
4916	NC_017167	TCG	2	6	315557	315562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134105
4917	NC_017167	TCG	2	6	315692	315697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134105
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4924	NC_017167	TCG	2	6	316074	316079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134106
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4977	NC_017167	CAT	2	6	320183	320188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134110
4978	NC_017167	GGC	3	9	320189	320197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134110
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4980	NC_017167	AGC	2	6	320262	320267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134110
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4982	NC_017167	CGC	2	6	320372	320377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134110
4983	NC_017167	CAC	2	6	320381	320386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134110
4984	NC_017167	CCA	2	6	320405	320410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134110
4985	NC_017167	GAG	2	6	320435	320440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134110
4986	NC_017167	CCG	2	6	320446	320451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134110
4987	NC_017167	CGC	2	6	320481	320486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134110
4988	NC_017167	GCC	2	6	320553	320558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134110
4989	NC_017167	GTA	2	6	320621	320626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134110
4990	NC_017167	GCC	2	6	320674	320679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134110
4991	NC_017167	GAG	2	6	320865	320870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4992	NC_017167	CGT	2	6	320891	320896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134111
4993	NC_017167	TGG	2	6	320992	320997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134111
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4995	NC_017167	GAC	2	6	321195	321200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134111
4996	NC_017167	TGG	2	6	321208	321213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134111
4997	NC_017167	TCG	2	6	321433	321438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134111
4998	NC_017167	TGT	2	6	321523	321528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134111
4999	NC_017167	CAC	2	6	321870	321875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134111
5000	NC_017167	CAA	2	6	321998	322003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134111

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