MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 3575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015564	ACACG	2	10	1892	1901	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_015564	TGCGC	2	10	4339	4348	0 %	20 %	40 %	40 %	333917682
3	NC_015564	CAGGG	2	10	4870	4879	20 %	0 %	60 %	20 %	333917683
4	NC_015564	GGTGA	2	10	7898	7907	20 %	20 %	60 %	0 %	333917685
5	NC_015564	GTCTC	2	10	9568	9577	0 %	40 %	20 %	40 %	333917685
6	NC_015564	GGGAC	2	10	13994	14003	20 %	0 %	60 %	20 %	333917690
7	NC_015564	CGTTG	2	10	15005	15014	0 %	40 %	40 %	20 %	333917692
8	NC_015564	GATGT	2	10	15437	15446	20 %	40 %	40 %	0 %	333917692
9	NC_015564	GCGTT	2	10	17427	17436	0 %	40 %	40 %	20 %	333917694
10	NC_015564	TTCGA	2	10	19702	19711	20 %	40 %	20 %	20 %	333917697
11	NC_015564	TTCGG	2	10	23555	23564	0 %	40 %	40 %	20 %	333917701
12	NC_015564	CCCGG	2	10	23572	23581	0 %	0 %	40 %	60 %	333917701
13	NC_015564	GGATT	2	10	23654	23663	20 %	40 %	40 %	0 %	333917701
14	NC_015564	TCAGT	2	10	23761	23770	20 %	40 %	20 %	20 %	333917702
15	NC_015564	GACCA	2	10	24037	24046	40 %	0 %	20 %	40 %	333917702
16	NC_015564	CTGGG	2	10	24175	24184	0 %	20 %	60 %	20 %	333917702
17	NC_015564	CAGCG	2	10	26610	26619	20 %	0 %	40 %	40 %	333917707
18	NC_015564	CCCTT	2	10	27758	27767	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_015564	CCCGG	2	10	27936	27945	0 %	0 %	40 %	60 %	333917709
20	NC_015564	TCACG	2	10	29901	29910	20 %	20 %	20 %	40 %	333917710
21	NC_015564	TGCGC	2	10	30843	30852	0 %	20 %	40 %	40 %	333917711
22	NC_015564	CGGCG	2	10	31275	31284	0 %	0 %	60 %	40 %	333917711
23	NC_015564	CGGCC	2	10	31816	31825	0 %	0 %	40 %	60 %	333917712
24	NC_015564	GTTCT	2	10	32036	32045	0 %	60 %	20 %	20 %	333917712
25	NC_015564	GCCGG	2	10	38470	38479	0 %	0 %	60 %	40 %	333917717
26	NC_015564	GTGTG	2	10	38515	38524	0 %	40 %	60 %	0 %	333917717
27	NC_015564	GCGTC	2	10	38944	38953	0 %	20 %	40 %	40 %	333917717
28	NC_015564	CGGCC	2	10	39517	39526	0 %	0 %	40 %	60 %	333917717
29	NC_015564	GTTCC	2	10	40228	40237	0 %	40 %	20 %	40 %	333917717
30	NC_015564	GTTGC	2	10	43095	43104	0 %	40 %	40 %	20 %	333917718
31	NC_015564	CGGCA	2	10	43928	43937	20 %	0 %	40 %	40 %	333917718
32	NC_015564	GCGCG	2	10	45401	45410	0 %	0 %	60 %	40 %	333917719
33	NC_015564	GATTC	2	10	45806	45815	20 %	40 %	20 %	20 %	333917719
34	NC_015564	CGGAC	2	10	46922	46931	20 %	0 %	40 %	40 %	333917720
35	NC_015564	CGCGC	2	10	47373	47382	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_015564	TCTCA	2	10	49969	49978	20 %	40 %	0 %	40 %	333917723
37	NC_015564	CGGTC	2	10	50146	50155	0 %	20 %	40 %	40 %	333917723
38	NC_015564	CGGAG	2	10	52807	52816	20 %	0 %	60 %	20 %	333917727
39	NC_015564	CTGCG	2	10	54975	54984	0 %	20 %	40 %	40 %	333917730
40	NC_015564	TGCCG	2	10	55371	55380	0 %	20 %	40 %	40 %	333917731
41	NC_015564	GCCGA	2	10	57260	57269	20 %	0 %	40 %	40 %	333917733
42	NC_015564	ACCGC	2	10	57731	57740	20 %	0 %	20 %	60 %	333917733
43	NC_015564	GCTGC	2	10	58247	58256	0 %	20 %	40 %	40 %	333917733
44	NC_015564	CATGC	2	10	59238	59247	20 %	20 %	20 %	40 %	333917734
45	NC_015564	ATCGG	2	10	63462	63471	20 %	20 %	40 %	20 %	333917738
46	NC_015564	AATTA	2	10	64707	64716	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015564	CGCGC	2	10	65995	66004	0 %	0 %	40 %	60 %	333917741
48	NC_015564	CGCGA	2	10	66592	66601	20 %	0 %	40 %	40 %	333917742
49	NC_015564	TGTGG	2	10	67218	67227	0 %	40 %	60 %	0 %	333917742
50	NC_015564	GGGGC	2	10	67793	67802	0 %	0 %	80 %	20 %	333917744
51	NC_015564	CAGAT	2	10	68079	68088	40 %	20 %	20 %	20 %	333917744
52	NC_015564	CGGCC	2	10	70113	70122	0 %	0 %	40 %	60 %	333917748
53	NC_015564	GTCGA	2	10	70951	70960	20 %	20 %	40 %	20 %	333917750
54	NC_015564	AGCGA	2	10	71458	71467	40 %	0 %	40 %	20 %	333917750
55	NC_015564	GCCAC	2	10	72356	72365	20 %	0 %	20 %	60 %	333917750
56	NC_015564	GCACG	2	10	72825	72834	20 %	0 %	40 %	40 %	333917751
57	NC_015564	CGCCC	2	10	74490	74499	0 %	0 %	20 %	80 %	333917754
58	NC_015564	GTTCG	2	10	74903	74912	0 %	40 %	40 %	20 %	333917754
59	NC_015564	GGCGT	2	10	75539	75548	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_015564	CGCTG	2	10	77172	77181	0 %	20 %	40 %	40 %	333917756
61	NC_015564	CCGGC	2	10	79277	79286	0 %	0 %	40 %	60 %	333917759
62	NC_015564	CGGCT	2	10	81502	81511	0 %	20 %	40 %	40 %	333917762
63	NC_015564	CGGAC	2	10	81930	81939	20 %	0 %	40 %	40 %	333917762
64	NC_015564	GCCCG	2	10	82651	82660	0 %	0 %	40 %	60 %	333917763
65	NC_015564	CAGGA	2	10	82795	82804	40 %	0 %	40 %	20 %	333917763
66	NC_015564	AACGG	2	10	83449	83458	40 %	0 %	40 %	20 %	333917764
67	NC_015564	CGTGA	2	10	83650	83659	20 %	20 %	40 %	20 %	333917764
68	NC_015564	GGGCT	2	10	84173	84182	0 %	20 %	60 %	20 %	333917765
69	NC_015564	GCACC	2	10	84873	84882	20 %	0 %	20 %	60 %	333917766
70	NC_015564	GCGCT	2	10	85778	85787	0 %	20 %	40 %	40 %	333917767
71	NC_015564	CGAAG	2	10	87245	87254	40 %	0 %	40 %	20 %	333917769
72	NC_015564	GCTAG	2	10	90128	90137	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_015564	GAGAA	2	10	90222	90231	60 %	0 %	40 %	0 %	333917773
74	NC_015564	TGCTG	2	10	90942	90951	0 %	40 %	40 %	20 %	333917774
75	NC_015564	GCTGT	2	10	91378	91387	0 %	40 %	40 %	20 %	333917774
76	NC_015564	CGGTG	2	10	91960	91969	0 %	20 %	60 %	20 %	333917775
77	NC_015564	CGTTC	2	10	92859	92868	0 %	40 %	20 %	40 %	333917776
78	NC_015564	TGCCG	2	10	96519	96528	0 %	20 %	40 %	40 %	333917778
79	NC_015564	GTCTC	2	10	98584	98593	0 %	40 %	20 %	40 %	333917779
80	NC_015564	GTTCG	2	10	99318	99327	0 %	40 %	40 %	20 %	333917780
81	NC_015564	GGTGC	2	10	101138	101147	0 %	20 %	60 %	20 %	333917781
82	NC_015564	GCATG	2	10	103196	103205	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_015564	CGAAA	2	10	105249	105258	60 %	0 %	20 %	20 %	333917783
84	NC_015564	GTGCG	2	10	105322	105331	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_015564	ACGAC	2	10	105993	106002	40 %	0 %	20 %	40 %	333917785
86	NC_015564	TGCGC	2	10	106094	106103	0 %	20 %	40 %	40 %	333917785
87	NC_015564	ACCGC	2	10	108404	108413	20 %	0 %	20 %	60 %	333917786
88	NC_015564	CACGG	2	10	110480	110489	20 %	0 %	40 %	40 %	333917787
89	NC_015564	CGTCG	2	10	110925	110934	0 %	20 %	40 %	40 %	333917787
90	NC_015564	CGAAA	2	10	111021	111030	60 %	0 %	20 %	20 %	333917787
91	NC_015564	CAGCG	2	10	113015	113024	20 %	0 %	40 %	40 %	333917787
92	NC_015564	CACCT	2	10	115784	115793	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_015564	CAGTC	2	10	116173	116182	20 %	20 %	20 %	40 %	333917789
94	NC_015564	CGCGT	2	10	116282	116291	0 %	20 %	40 %	40 %	333917789
95	NC_015564	CGAGG	2	10	117728	117737	20 %	0 %	60 %	20 %	333917789
96	NC_015564	GCGAC	2	10	122121	122130	20 %	0 %	40 %	40 %	333917790
97	NC_015564	AGGCG	2	10	123534	123543	20 %	0 %	60 %	20 %	333917792
98	NC_015564	CGCGG	2	10	123974	123983	0 %	0 %	60 %	40 %	333917794
99	NC_015564	TCGCA	2	10	126098	126107	20 %	20 %	20 %	40 %	333917794
100	NC_015564	CGGCG	2	10	126438	126447	0 %	0 %	60 %	40 %	333917795
101	NC_015564	CGGCC	2	10	128322	128331	0 %	0 %	40 %	60 %	333917797
102	NC_015564	GCCCA	2	10	129020	129029	20 %	0 %	20 %	60 %	333917797
103	NC_015564	CGCGC	2	10	131484	131493	0 %	0 %	40 %	60 %	333917802
104	NC_015564	GCCTG	2	10	131512	131521	0 %	20 %	40 %	40 %	333917802
105	NC_015564	TGCCT	2	10	131862	131871	0 %	40 %	20 %	40 %	333917803
106	NC_015564	CTTTG	2	10	138240	138249	0 %	60 %	20 %	20 %	333917809
107	NC_015564	CGGTC	2	10	140134	140143	0 %	20 %	40 %	40 %	333917811
108	NC_015564	CCACG	2	10	140315	140324	20 %	0 %	20 %	60 %	333917811
109	NC_015564	GCGGG	2	10	142184	142193	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015564	CGTCC	2	10	144334	144343	0 %	20 %	20 %	60 %	333917814
111	NC_015564	AGCTC	2	10	146590	146599	20 %	20 %	20 %	40 %	333917817
112	NC_015564	GCGTG	2	10	147343	147352	0 %	20 %	60 %	20 %	333917817
113	NC_015564	CGGTG	2	10	148444	148453	0 %	20 %	60 %	20 %	333917817
114	NC_015564	CAACG	2	10	148617	148626	40 %	0 %	20 %	40 %	333917817
115	NC_015564	GCCCT	2	10	149694	149703	0 %	20 %	20 %	60 %	333917817
116	NC_015564	CGATC	2	10	150608	150617	20 %	20 %	20 %	40 %	333917817
117	NC_015564	GACTG	2	10	151489	151498	20 %	20 %	40 %	20 %	333917817
118	NC_015564	CGGGT	2	10	153356	153365	0 %	20 %	60 %	20 %	333917817
119	NC_015564	GACTC	2	10	154401	154410	20 %	20 %	20 %	40 %	333917818
120	NC_015564	CTGGT	2	10	155566	155575	0 %	40 %	40 %	20 %	333917819
121	NC_015564	TGCAG	2	10	157265	157274	20 %	20 %	40 %	20 %	333917819
122	NC_015564	TCACA	2	10	159767	159776	40 %	20 %	0 %	40 %	333917819
123	NC_015564	GACTC	2	10	159889	159898	20 %	20 %	20 %	40 %	333917820
124	NC_015564	TGACC	2	10	160159	160168	20 %	20 %	20 %	40 %	333917821
125	NC_015564	CGTCG	2	10	160651	160660	0 %	20 %	40 %	40 %	333917821
126	NC_015564	ACGCG	2	10	162475	162484	20 %	0 %	40 %	40 %	333917823
127	NC_015564	GGGTG	2	10	164519	164528	0 %	20 %	80 %	0 %	333917824
128	NC_015564	CCTTG	2	10	164537	164546	0 %	40 %	20 %	40 %	333917824
129	NC_015564	CGGCC	2	10	164569	164578	0 %	0 %	40 %	60 %	333917824
130	NC_015564	GACGG	2	10	167251	167260	20 %	0 %	60 %	20 %	333917826
131	NC_015564	GCCAG	2	10	168606	168615	20 %	0 %	40 %	40 %	333917828
132	NC_015564	GGGCA	2	10	170081	170090	20 %	0 %	60 %	20 %	333917829
133	NC_015564	GTCGC	2	10	173019	173028	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_015564	CGCGG	2	10	174516	174525	0 %	0 %	60 %	40 %	333917835
135	NC_015564	GCGTC	2	10	176256	176265	0 %	20 %	40 %	40 %	333917837
136	NC_015564	ACCCC	2	10	181509	181518	20 %	0 %	0 %	80 %	333917840
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231	NC_015564	GTCAT	2	10	313176	313185	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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234	NC_015564	GCGGG	2	10	320041	320050	0 %	0 %	80 %	20 %	333917981
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240	NC_015564	CGGCA	2	10	323288	323297	20 %	0 %	40 %	40 %	333917985
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247	NC_015564	GCGCA	2	10	337713	337722	20 %	0 %	40 %	40 %	333917998
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251	NC_015564	CGCGC	2	10	341657	341666	0 %	0 %	40 %	60 %	333918004
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262	NC_015564	CGCGG	2	10	355751	355760	0 %	0 %	60 %	40 %	333918023
263	NC_015564	GGGGC	2	10	356476	356485	0 %	0 %	80 %	20 %	333918024
264	NC_015564	CGGCT	2	10	358164	358173	0 %	20 %	40 %	40 %	333918026
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267	NC_015564	AGGCG	2	10	361690	361699	20 %	0 %	60 %	20 %	333918029
268	NC_015564	CCATC	2	10	362825	362834	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
269	NC_015564	TGCAG	2	10	363080	363089	20 %	20 %	40 %	20 %	333918032
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307	NC_015564	CGTTA	2	10	411458	411467	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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393	NC_015564	TCCGC	2	10	557537	557546	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
394	NC_015564	GTCTC	2	10	558070	558079	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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431	NC_015564	AGCGG	2	10	624503	624512	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
432	NC_015564	CGCGG	2	10	625120	625129	0 %	0 %	60 %	40 %	333918263
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499	NC_015564	CGAAG	2	10	708418	708427	40 %	0 %	40 %	20 %	333918348
500	NC_015564	TTCGG	2	10	708593	708602	0 %	40 %	40 %	20 %	333918348

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