MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 3575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015564	CCGCA	2	10	709067	709076	20 %	0 %	20 %	60 %	333918349
502	NC_015564	CATTC	2	10	709768	709777	20 %	40 %	0 %	40 %	333918350
503	NC_015564	CCGAC	2	10	711035	711044	20 %	0 %	20 %	60 %	333918351
504	NC_015564	GCGAT	2	10	711284	711293	20 %	20 %	40 %	20 %	333918351
505	NC_015564	CCGGG	2	10	711445	711454	0 %	0 %	60 %	40 %	333918351
506	NC_015564	CACCT	2	10	712795	712804	20 %	20 %	0 %	60 %	333918352
507	NC_015564	GGCTG	2	10	714018	714027	0 %	20 %	60 %	20 %	333918354
508	NC_015564	CACAT	2	10	714078	714087	40 %	20 %	0 %	40 %	333918354
509	NC_015564	GACGG	2	10	718050	718059	20 %	0 %	60 %	20 %	333918356
510	NC_015564	CGGTG	2	10	718496	718505	0 %	20 %	60 %	20 %	333918356
511	NC_015564	GGTGA	2	10	719952	719961	20 %	20 %	60 %	0 %	333918359
512	NC_015564	CAGCC	2	10	723343	723352	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
513	NC_015564	GCGCG	2	10	723367	723376	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
514	NC_015564	CGGCA	2	10	723703	723712	20 %	0 %	40 %	40 %	333918362
515	NC_015564	GGCGA	2	10	724529	724538	20 %	0 %	60 %	20 %	333918362
516	NC_015564	TGGGC	2	10	725199	725208	0 %	20 %	60 %	20 %	333918363
517	NC_015564	GTCCG	2	10	726613	726622	0 %	20 %	40 %	40 %	333918365
518	NC_015564	CCTCG	2	10	728007	728016	0 %	20 %	20 %	60 %	333918367
519	NC_015564	AACGA	2	10	730276	730285	60 %	0 %	20 %	20 %	333918368
520	NC_015564	CGGCG	2	10	731458	731467	0 %	0 %	60 %	40 %	333918369
521	NC_015564	TCCGC	2	10	732123	732132	0 %	20 %	20 %	60 %	333918370
522	NC_015564	TCGAC	2	10	734057	734066	20 %	20 %	20 %	40 %	333918371
523	NC_015564	CGGCG	2	10	734103	734112	0 %	0 %	60 %	40 %	333918371
524	NC_015564	GCAAA	2	10	736349	736358	60 %	0 %	20 %	20 %	333918373
525	NC_015564	CGGAC	2	10	737810	737819	20 %	0 %	40 %	40 %	333918375
526	NC_015564	GCTGC	2	10	739137	739146	0 %	20 %	40 %	40 %	333918377
527	NC_015564	TCGTA	2	10	740619	740628	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
528	NC_015564	CCCCG	2	10	741867	741876	0 %	0 %	20 %	80 %	333918380
529	NC_015564	ACCGA	2	10	743811	743820	40 %	0 %	20 %	40 %	333918382
530	NC_015564	ATCGG	2	10	744079	744088	20 %	20 %	40 %	20 %	333918382
531	NC_015564	AGGGG	2	10	744869	744878	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015564	GCCGA	2	10	744963	744972	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
533	NC_015564	ATCGA	2	10	745478	745487	40 %	20 %	20 %	20 %	333918383
534	NC_015564	CCAGG	2	10	748676	748685	20 %	0 %	40 %	40 %	333918385
535	NC_015564	CTTCG	2	10	749157	749166	0 %	40 %	20 %	40 %	333918385
536	NC_015564	GGTTC	2	10	751139	751148	0 %	40 %	40 %	20 %	333918387
537	NC_015564	GCCGC	2	10	751159	751168	0 %	0 %	40 %	60 %	333918387
538	NC_015564	CGTCG	2	10	752587	752596	0 %	20 %	40 %	40 %	333918387
539	NC_015564	TGCAC	2	10	753739	753748	20 %	20 %	20 %	40 %	333918388
540	NC_015564	GCTTG	2	10	755405	755414	0 %	40 %	40 %	20 %	333918389
541	NC_015564	CTGAG	2	10	756162	756171	20 %	20 %	40 %	20 %	333918390
542	NC_015564	GGTCG	2	10	756928	756937	0 %	20 %	60 %	20 %	333918390
543	NC_015564	TTCGG	2	10	758191	758200	0 %	40 %	40 %	20 %	333918393
544	NC_015564	CTGGC	2	10	759281	759290	0 %	20 %	40 %	40 %	333918393
545	NC_015564	CAGAT	2	10	762618	762627	40 %	20 %	20 %	20 %	333918396
546	NC_015564	GCGCC	2	10	766478	766487	0 %	0 %	40 %	60 %	333918401
547	NC_015564	GGCGG	2	10	768086	768095	0 %	0 %	80 %	20 %	333918402
548	NC_015564	CTGCG	2	10	768423	768432	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
549	NC_015564	ACAGC	2	10	770571	770580	40 %	0 %	20 %	40 %	333918405
550	NC_015564	GGGCC	2	10	774614	774623	0 %	0 %	60 %	40 %	333918410
551	NC_015564	CGGTC	2	10	774830	774839	0 %	20 %	40 %	40 %	333918410
552	NC_015564	CCTGG	2	10	776031	776040	0 %	20 %	40 %	40 %	333918411
553	NC_015564	CAGTA	2	10	777511	777520	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
554	NC_015564	ACCCG	2	10	780222	780231	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
555	NC_015564	CACTG	2	10	786315	786324	20 %	20 %	20 %	40 %	333918424
556	NC_015564	GCCGC	2	10	786376	786385	0 %	0 %	40 %	60 %	333918424
557	NC_015564	CCGGG	2	10	786493	786502	0 %	0 %	60 %	40 %	333918424
558	NC_015564	ACCGC	2	10	787258	787267	20 %	0 %	20 %	60 %	333918425
559	NC_015564	GGGCG	2	10	788593	788602	0 %	0 %	80 %	20 %	333918427
560	NC_015564	CCGGG	2	10	789739	789748	0 %	0 %	60 %	40 %	333918427
561	NC_015564	GCATC	2	10	789985	789994	20 %	20 %	20 %	40 %	333918428
562	NC_015564	GTCAC	2	10	793279	793288	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
563	NC_015564	CGGGC	2	10	793463	793472	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
564	NC_015564	CCGCG	2	10	794172	794181	0 %	0 %	40 %	60 %	333918432
565	NC_015564	GATGA	2	10	795213	795222	40 %	20 %	40 %	0 %	333918433
566	NC_015564	GCAGT	2	10	797042	797051	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
567	NC_015564	CGACC	2	10	799733	799742	20 %	0 %	20 %	60 %	333918441
568	NC_015564	CCCGG	2	10	800819	800828	0 %	0 %	40 %	60 %	333918442
569	NC_015564	CAGGC	2	10	801932	801941	20 %	0 %	40 %	40 %	333918443
570	NC_015564	TCTGC	2	10	803108	803117	0 %	40 %	20 %	40 %	333918445
571	NC_015564	TGCCG	2	10	803973	803982	0 %	20 %	40 %	40 %	333918446
572	NC_015564	CGCGG	2	10	806661	806670	0 %	0 %	60 %	40 %	333918448
573	NC_015564	GATTG	2	10	808613	808622	20 %	40 %	40 %	0 %	333918451
574	NC_015564	TTCGG	2	10	809379	809388	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
575	NC_015564	GCACG	2	10	810621	810630	20 %	0 %	40 %	40 %	333918452
576	NC_015564	CTCAT	2	10	811309	811318	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
577	NC_015564	GCCGG	2	10	811900	811909	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
578	NC_015564	GAGCT	2	10	814593	814602	20 %	20 %	40 %	20 %	333918456
579	NC_015564	CGGGC	2	10	815142	815151	0 %	0 %	60 %	40 %	333918457
580	NC_015564	TCGGA	2	10	815931	815940	20 %	20 %	40 %	20 %	333918457
581	NC_015564	TGAGT	2	10	816715	816724	20 %	40 %	40 %	0 %	333918458
582	NC_015564	TTCGG	2	10	818809	818818	0 %	40 %	40 %	20 %	333918461
583	NC_015564	GACCC	2	10	819256	819265	20 %	0 %	20 %	60 %	333918461
584	NC_015564	GCGCT	2	10	820830	820839	0 %	20 %	40 %	40 %	333918462
585	NC_015564	GGCGC	2	10	824543	824552	0 %	0 %	60 %	40 %	333918466
586	NC_015564	CGCGG	2	10	825502	825511	0 %	0 %	60 %	40 %	333918466
587	NC_015564	AAAGG	2	10	828172	828181	60 %	0 %	40 %	0 %	333918469
588	NC_015564	GTTCT	2	10	832599	832608	0 %	60 %	20 %	20 %	333918471
589	NC_015564	GCACG	2	10	833475	833484	20 %	0 %	40 %	40 %	333918472
590	NC_015564	CGCTG	2	10	833816	833825	0 %	20 %	40 %	40 %	333918472
591	NC_015564	AGCGC	2	10	836674	836683	20 %	0 %	40 %	40 %	333918475
592	NC_015564	TGGGG	2	10	837687	837696	0 %	20 %	80 %	0 %	333918477
593	NC_015564	TGGTG	2	10	840675	840684	0 %	40 %	60 %	0 %	333918479
594	NC_015564	CGTTC	2	10	841620	841629	0 %	40 %	20 %	40 %	333918482
595	NC_015564	CAGTG	2	10	843313	843322	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
596	NC_015564	CCTCG	2	10	847008	847017	0 %	20 %	20 %	60 %	333918488
597	NC_015564	CGTCG	2	10	847200	847209	0 %	20 %	40 %	40 %	333918488
598	NC_015564	GCGCC	2	10	847484	847493	0 %	0 %	40 %	60 %	333918488
599	NC_015564	GCCAC	2	10	848746	848755	20 %	0 %	20 %	60 %	333918489
600	NC_015564	CCAGT	2	10	849884	849893	20 %	20 %	20 %	40 %	333918490
601	NC_015564	GCTGC	2	10	850706	850715	0 %	20 %	40 %	40 %	333918491
602	NC_015564	AAGGA	2	10	851569	851578	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015564	CGAAC	2	10	851798	851807	40 %	0 %	20 %	40 %	333918492
604	NC_015564	CGGCC	2	10	854988	854997	0 %	0 %	40 %	60 %	333918493
605	NC_015564	TGATC	2	10	856034	856043	20 %	40 %	20 %	20 %	333918494
606	NC_015564	ACAGA	2	10	857420	857429	60 %	0 %	20 %	20 %	333918494
607	NC_015564	ATGGG	2	10	859950	859959	20 %	20 %	60 %	0 %	333918499
608	NC_015564	AAGGC	2	10	861108	861117	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
609	NC_015564	GCCGC	2	10	864166	864175	0 %	0 %	40 %	60 %	333918505
610	NC_015564	GTCGC	2	10	864442	864451	0 %	20 %	40 %	40 %	333918505
611	NC_015564	GGTCG	2	10	867201	867210	0 %	20 %	60 %	20 %	333918510
612	NC_015564	GGGCC	2	10	867820	867829	0 %	0 %	60 %	40 %	333918510
613	NC_015564	GGCCG	2	10	868682	868691	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
614	NC_015564	GCGGG	2	10	870474	870483	0 %	0 %	80 %	20 %	333918514
615	NC_015564	TTGCG	2	10	871061	871070	0 %	40 %	40 %	20 %	333918515
616	NC_015564	CTCGC	2	10	871830	871839	0 %	20 %	20 %	60 %	333918517
617	NC_015564	ACCCC	2	10	872154	872163	20 %	0 %	0 %	80 %	333918518
618	NC_015564	GAACG	2	10	872685	872694	40 %	0 %	40 %	20 %	333918518
619	NC_015564	AGCTG	2	10	874812	874821	20 %	20 %	40 %	20 %	333918521
620	NC_015564	GATTC	2	10	875246	875255	20 %	40 %	20 %	20 %	333918521
621	NC_015564	CGGAC	2	10	877231	877240	20 %	0 %	40 %	40 %	333918523
622	NC_015564	GCCGA	2	10	880598	880607	20 %	0 %	40 %	40 %	333918527
623	NC_015564	AGCCG	2	10	881497	881506	20 %	0 %	40 %	40 %	333918527
624	NC_015564	CCAGC	2	10	884485	884494	20 %	0 %	20 %	60 %	333918530
625	NC_015564	CGTGC	2	10	886446	886455	0 %	20 %	40 %	40 %	333918532
626	NC_015564	CACCG	2	10	886607	886616	20 %	0 %	20 %	60 %	333918532
627	NC_015564	CTGGG	2	10	889255	889264	0 %	20 %	60 %	20 %	333918536
628	NC_015564	GCTTG	2	10	890689	890698	0 %	40 %	40 %	20 %	333918537
629	NC_015564	GGAGG	2	10	891674	891683	20 %	0 %	80 %	0 %	333918540
630	NC_015564	ATCGC	2	10	891809	891818	20 %	20 %	20 %	40 %	333918540
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998	NC_015564	GGACC	2	10	1428128	1428137	20 %	0 %	40 %	40 %	333919042
999	NC_015564	CGGCA	2	10	1428382	1428391	20 %	0 %	40 %	40 %	333919042
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