MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 3575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015564	TGCCT	2	10	1429838	1429847	0 %	40 %	20 %	40 %	333919044
1002	NC_015564	CGTGC	2	10	1430753	1430762	0 %	20 %	40 %	40 %	333919045
1003	NC_015564	CCAGG	2	10	1431028	1431037	20 %	0 %	40 %	40 %	333919045
1004	NC_015564	GACCC	2	10	1433030	1433039	20 %	0 %	20 %	60 %	333919047
1005	NC_015564	ATCCC	2	10	1433475	1433484	20 %	20 %	0 %	60 %	333919047
1006	NC_015564	CGAAC	2	10	1436251	1436260	40 %	0 %	20 %	40 %	333919048
1007	NC_015564	GCCGA	2	10	1436293	1436302	20 %	0 %	40 %	40 %	333919048
1008	NC_015564	CGCTG	2	10	1438710	1438719	0 %	20 %	40 %	40 %	333919050
1009	NC_015564	CGCTG	2	10	1442162	1442171	0 %	20 %	40 %	40 %	333919054
1010	NC_015564	GCACA	2	10	1443290	1443299	40 %	0 %	20 %	40 %	333919054
1011	NC_015564	AGCTC	2	10	1444866	1444875	20 %	20 %	20 %	40 %	333919055
1012	NC_015564	GGCGG	2	10	1445844	1445853	0 %	0 %	80 %	20 %	333919056
1013	NC_015564	TGTGC	2	10	1446268	1446277	0 %	40 %	40 %	20 %	333919056
1014	NC_015564	CGCGG	2	10	1448537	1448546	0 %	0 %	60 %	40 %	333919058
1015	NC_015564	GGCGC	2	10	1449883	1449892	0 %	0 %	60 %	40 %	333919060
1016	NC_015564	CCCGG	2	10	1450545	1450554	0 %	0 %	40 %	60 %	333919061
1017	NC_015564	GAAGC	2	10	1451958	1451967	40 %	0 %	40 %	20 %	333919063
1018	NC_015564	CACCG	2	10	1453000	1453009	20 %	0 %	20 %	60 %	333919064
1019	NC_015564	CGACG	2	10	1456135	1456144	20 %	0 %	40 %	40 %	333919068
1020	NC_015564	GATCG	2	10	1456748	1456757	20 %	20 %	40 %	20 %	333919070
1021	NC_015564	GGCGA	2	10	1457997	1458006	20 %	0 %	60 %	20 %	333919071
1022	NC_015564	AGTCG	2	10	1458683	1458692	20 %	20 %	40 %	20 %	333919071
1023	NC_015564	GGAGC	2	10	1459417	1459426	20 %	0 %	60 %	20 %	333919072
1024	NC_015564	TGAGA	2	10	1462050	1462059	40 %	20 %	40 %	0 %	333919075
1025	NC_015564	GGTGG	2	10	1463638	1463647	0 %	20 %	80 %	0 %	333919077
1026	NC_015564	GATCA	2	10	1468857	1468866	40 %	20 %	20 %	20 %	333919082
1027	NC_015564	AGACC	2	10	1470490	1470499	40 %	0 %	20 %	40 %	333919083
1028	NC_015564	CGGAA	2	10	1473920	1473929	40 %	0 %	40 %	20 %	333919087
1029	NC_015564	CCCAG	2	10	1474351	1474360	20 %	0 %	20 %	60 %	333919087
1030	NC_015564	GCTGC	2	10	1474576	1474585	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1031	NC_015564	TTCGT	2	10	1475976	1475985	0 %	60 %	20 %	20 %	333919090
1032	NC_015564	GATGC	2	10	1476161	1476170	20 %	20 %	40 %	20 %	333919091
1033	NC_015564	GCTGC	2	10	1478924	1478933	0 %	20 %	40 %	40 %	333919092
1034	NC_015564	TCGAT	2	10	1482289	1482298	20 %	40 %	20 %	20 %	333919095
1035	NC_015564	GCAGG	2	10	1483913	1483922	20 %	0 %	60 %	20 %	333919096
1036	NC_015564	CGTTT	2	10	1484830	1484839	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1037	NC_015564	TCGGC	2	10	1486116	1486125	0 %	20 %	40 %	40 %	333919097
1038	NC_015564	TCGAA	2	10	1488397	1488406	40 %	20 %	20 %	20 %	333919100
1039	NC_015564	GGCCA	2	10	1488412	1488421	20 %	0 %	40 %	40 %	333919100
1040	NC_015564	AACGC	2	10	1488616	1488625	40 %	0 %	20 %	40 %	333919101
1041	NC_015564	AGTCG	2	10	1490738	1490747	20 %	20 %	40 %	20 %	333919102
1042	NC_015564	CAGCC	2	10	1493098	1493107	20 %	0 %	20 %	60 %	333919106
1043	NC_015564	AGCGC	2	10	1494195	1494204	20 %	0 %	40 %	40 %	333919107
1044	NC_015564	GGATG	2	10	1494572	1494581	20 %	20 %	60 %	0 %	333919107
1045	NC_015564	CGATT	2	10	1494865	1494874	20 %	40 %	20 %	20 %	333919107
1046	NC_015564	CACAC	2	10	1498915	1498924	40 %	0 %	0 %	60 %	333919111
1047	NC_015564	GTCGG	2	10	1499054	1499063	0 %	20 %	60 %	20 %	333919111
1048	NC_015564	GTGCT	2	10	1499463	1499472	0 %	40 %	40 %	20 %	333919112
1049	NC_015564	TGAAG	2	10	1499492	1499501	40 %	20 %	40 %	0 %	333919112
1050	NC_015564	CGGTT	2	10	1502409	1502418	0 %	40 %	40 %	20 %	333919117
1051	NC_015564	CGTGA	2	10	1503846	1503855	20 %	20 %	40 %	20 %	333919119
1052	NC_015564	TCTCG	2	10	1508980	1508989	0 %	40 %	20 %	40 %	333919126
1053	NC_015564	TGGAC	2	10	1509884	1509893	20 %	20 %	40 %	20 %	333919127
1054	NC_015564	GGCCG	2	10	1510464	1510473	0 %	0 %	60 %	40 %	333919127
1055	NC_015564	CCGGT	2	10	1512943	1512952	0 %	20 %	40 %	40 %	333919130
1056	NC_015564	GGCGC	2	10	1516505	1516514	0 %	0 %	60 %	40 %	333919131
1057	NC_015564	CGTGA	2	10	1516643	1516652	20 %	20 %	40 %	20 %	333919131
1058	NC_015564	GAATG	2	10	1518093	1518102	40 %	20 %	40 %	0 %	333919132
1059	NC_015564	CTGCG	2	10	1518802	1518811	0 %	20 %	40 %	40 %	333919132
1060	NC_015564	CTGGG	2	10	1519147	1519156	0 %	20 %	60 %	20 %	333919132
1061	NC_015564	CGCGG	2	10	1520533	1520542	0 %	0 %	60 %	40 %	333919133
1062	NC_015564	CGAAG	2	10	1520560	1520569	40 %	0 %	40 %	20 %	333919133
1063	NC_015564	CGTTG	2	10	1522267	1522276	0 %	40 %	40 %	20 %	333919137
1064	NC_015564	CGCCT	2	10	1522756	1522765	0 %	20 %	20 %	60 %	333919137
1065	NC_015564	TCCGC	2	10	1523888	1523897	0 %	20 %	20 %	60 %	333919139
1066	NC_015564	TCGGC	2	10	1523988	1523997	0 %	20 %	40 %	40 %	333919139
1067	NC_015564	CGAAC	2	10	1524061	1524070	40 %	0 %	20 %	40 %	333919139
1068	NC_015564	TGAAC	2	10	1524204	1524213	40 %	20 %	20 %	20 %	333919139
1069	NC_015564	CGCTG	2	10	1526610	1526619	0 %	20 %	40 %	40 %	333919140
1070	NC_015564	TGGGC	2	10	1526740	1526749	0 %	20 %	60 %	20 %	333919141
1071	NC_015564	CTGAA	2	10	1527885	1527894	40 %	20 %	20 %	20 %	333919142
1072	NC_015564	GCAGC	2	10	1535337	1535346	20 %	0 %	40 %	40 %	333919148
1073	NC_015564	GAACC	2	10	1535989	1535998	40 %	0 %	20 %	40 %	333919148
1074	NC_015564	AGGCA	2	10	1536057	1536066	40 %	0 %	40 %	20 %	333919148
1075	NC_015564	CGGTG	2	10	1536375	1536384	0 %	20 %	60 %	20 %	333919148
1076	NC_015564	CGCTG	2	10	1536513	1536522	0 %	20 %	40 %	40 %	333919148
1077	NC_015564	TTCGA	2	10	1536989	1536998	20 %	40 %	20 %	20 %	333919149
1078	NC_015564	CGCAG	2	10	1537972	1537981	20 %	0 %	40 %	40 %	333919150
1079	NC_015564	CGATG	2	10	1540351	1540360	20 %	20 %	40 %	20 %	333919153
1080	NC_015564	TCCGG	2	10	1543764	1543773	0 %	20 %	40 %	40 %	333919156
1081	NC_015564	CGAAG	2	10	1545401	1545410	40 %	0 %	40 %	20 %	333919158
1082	NC_015564	GGTCC	2	10	1547917	1547926	0 %	20 %	40 %	40 %	333919160
1083	NC_015564	TTTCG	2	10	1548447	1548456	0 %	60 %	20 %	20 %	333919161
1084	NC_015564	TCCGA	2	10	1550586	1550595	20 %	20 %	20 %	40 %	333919163
1085	NC_015564	GAGCC	2	10	1552277	1552286	20 %	0 %	40 %	40 %	333919165
1086	NC_015564	GTGCG	2	10	1553938	1553947	0 %	20 %	60 %	20 %	333919166
1087	NC_015564	TGGAC	2	10	1555504	1555513	20 %	20 %	40 %	20 %	333919167
1088	NC_015564	CGGCT	2	10	1557166	1557175	0 %	20 %	40 %	40 %	333919168
1089	NC_015564	CGGTC	2	10	1559273	1559282	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1090	NC_015564	GGCAA	2	10	1561312	1561321	40 %	0 %	40 %	20 %	333919173
1091	NC_015564	GCACA	2	10	1561720	1561729	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1092	NC_015564	GGCGC	2	10	1561940	1561949	0 %	0 %	60 %	40 %	333919174
1093	NC_015564	GCGAG	2	10	1563952	1563961	20 %	0 %	60 %	20 %	333919175
1094	NC_015564	AGGTG	2	10	1565731	1565740	20 %	20 %	60 %	0 %	333919176
1095	NC_015564	TTCGG	2	10	1568046	1568055	0 %	40 %	40 %	20 %	333919178
1096	NC_015564	CAGCT	2	10	1569510	1569519	20 %	20 %	20 %	40 %	333919180
1097	NC_015564	GGCCG	2	10	1572661	1572670	0 %	0 %	60 %	40 %	333919183
1098	NC_015564	CATCG	2	10	1574493	1574502	20 %	20 %	20 %	40 %	333919184
1099	NC_015564	CCGGG	2	10	1577212	1577221	0 %	0 %	60 %	40 %	333919185
1100	NC_015564	GGTAG	2	10	1577730	1577739	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_015564	GATCC	2	10	1577754	1577763	20 %	20 %	20 %	40 %	333919186
1102	NC_015564	ACTGG	2	10	1579569	1579578	20 %	20 %	40 %	20 %	333919189
1103	NC_015564	GCGAA	2	10	1580121	1580130	40 %	0 %	40 %	20 %	333919189
1104	NC_015564	CGGCG	2	10	1580453	1580462	0 %	0 %	60 %	40 %	333919189
1105	NC_015564	TTTGG	2	10	1580685	1580694	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015564	TCGTG	2	10	1581955	1581964	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1107	NC_015564	CGTCA	2	10	1582291	1582300	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1108	NC_015564	GGGAG	2	10	1583322	1583331	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015564	TGGGG	2	10	1583383	1583392	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_015564	CAACA	2	10	1585883	1585892	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1111	NC_015564	AGCGG	2	10	1585979	1585988	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1112	NC_015564	ACGCT	2	10	1587545	1587554	20 %	20 %	20 %	40 %	333919191
1113	NC_015564	TCGAG	2	10	1590381	1590390	20 %	20 %	40 %	20 %	333919196
1114	NC_015564	GCCGA	2	10	1591484	1591493	20 %	0 %	40 %	40 %	333919196
1115	NC_015564	CGGGC	2	10	1591848	1591857	0 %	0 %	60 %	40 %	333919196
1116	NC_015564	ACGGG	2	10	1594093	1594102	20 %	0 %	60 %	20 %	333919198
1117	NC_015564	CTTCC	2	10	1595113	1595122	0 %	40 %	0 %	60 %	333919199
1118	NC_015564	ACCCG	2	10	1599893	1599902	20 %	0 %	20 %	60 %	333919204
1119	NC_015564	GCGTC	2	10	1600511	1600520	0 %	20 %	40 %	40 %	333919205
1120	NC_015564	GCCCT	2	10	1603659	1603668	0 %	20 %	20 %	60 %	333919208
1121	NC_015564	TCAGC	2	10	1604544	1604553	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1122	NC_015564	TGAAG	2	10	1605049	1605058	40 %	20 %	40 %	0 %	333919210
1123	NC_015564	TTTCC	2	10	1605384	1605393	0 %	60 %	0 %	40 %	333919211
1124	NC_015564	TCAGC	2	10	1605574	1605583	20 %	20 %	20 %	40 %	333919211
1125	NC_015564	GATTC	2	10	1606872	1606881	20 %	40 %	20 %	20 %	333919212
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1370	NC_015564	GCAGT	2	10	1933024	1933033	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1371	NC_015564	GGAAC	2	10	1934120	1934129	40 %	0 %	40 %	20 %	333919529
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1496	NC_015564	TGCGC	2	10	2081424	2081433	0 %	20 %	40 %	40 %	333919677
1497	NC_015564	GACGA	2	10	2081597	2081606	40 %	0 %	40 %	20 %	333919677
1498	NC_015564	GTCAG	2	10	2082225	2082234	20 %	20 %	40 %	20 %	333919678
1499	NC_015564	CGGCC	2	10	2083034	2083043	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1500	NC_015564	GCGTC	2	10	2086030	2086039	0 %	20 %	40 %	40 %	333919682

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