MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 3575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015564	TTGCC	2	10	3339725	3339734	0 %	40 %	20 %	40 %	333920919
2502	NC_015564	CAAAG	2	10	3341699	3341708	60 %	0 %	20 %	20 %	333920922
2503	NC_015564	GCAGC	2	10	3343121	3343130	20 %	0 %	40 %	40 %	333920923
2504	NC_015564	GCCTG	2	10	3343493	3343502	0 %	20 %	40 %	40 %	333920923
2505	NC_015564	CCTGC	2	10	3345111	3345120	0 %	20 %	20 %	60 %	333920925
2506	NC_015564	AGCCC	2	10	3345466	3345475	20 %	0 %	20 %	60 %	333920925
2507	NC_015564	AGCCG	2	10	3346806	3346815	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2508	NC_015564	CTGAC	2	10	3347378	3347387	20 %	20 %	20 %	40 %	333920929
2509	NC_015564	CCGCA	2	10	3347539	3347548	20 %	0 %	20 %	60 %	333920929
2510	NC_015564	CGCAC	2	10	3349725	3349734	20 %	0 %	20 %	60 %	333920931
2511	NC_015564	TCCTT	2	10	3350743	3350752	0 %	60 %	0 %	40 %	333920931
2512	NC_015564	CGGAG	2	10	3354959	3354968	20 %	0 %	60 %	20 %	333920935
2513	NC_015564	CGAAA	2	10	3357641	3357650	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2514	NC_015564	CCGGA	2	10	3358534	3358543	20 %	0 %	40 %	40 %	333920937
2515	NC_015564	GCTGC	2	10	3361336	3361345	0 %	20 %	40 %	40 %	333920943
2516	NC_015564	CCGTT	2	10	3362056	3362065	0 %	40 %	20 %	40 %	333920945
2517	NC_015564	GGGCC	2	10	3362725	3362734	0 %	0 %	60 %	40 %	333920945
2518	NC_015564	TCAGC	2	10	3363438	3363447	20 %	20 %	20 %	40 %	333920946
2519	NC_015564	CCATG	2	10	3364123	3364132	20 %	20 %	20 %	40 %	333920946
2520	NC_015564	GCGTC	2	10	3364979	3364988	0 %	20 %	40 %	40 %	333920948
2521	NC_015564	GGCAC	2	10	3366841	3366850	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2522	NC_015564	GTTCT	2	10	3367610	3367619	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2523	NC_015564	TGCCG	2	10	3370658	3370667	0 %	20 %	40 %	40 %	333920952
2524	NC_015564	GGACG	2	10	3371597	3371606	20 %	0 %	60 %	20 %	333920953
2525	NC_015564	CCGGC	2	10	3372065	3372074	0 %	0 %	40 %	60 %	333920954
2526	NC_015564	CCGCG	2	10	3372290	3372299	0 %	0 %	40 %	60 %	333920954
2527	NC_015564	CGGCC	2	10	3373919	3373928	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2528	NC_015564	GCAAG	2	10	3374168	3374177	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2529	NC_015564	TTCAG	2	10	3375026	3375035	20 %	40 %	20 %	20 %	333920959
2530	NC_015564	GCACA	2	10	3376260	3376269	40 %	0 %	20 %	40 %	333920960
2531	NC_015564	GCAGC	2	10	3378876	3378885	20 %	0 %	40 %	40 %	333920963
2532	NC_015564	CGTCA	2	10	3379066	3379075	20 %	20 %	20 %	40 %	333920963
2533	NC_015564	GCGAT	2	10	3381007	3381016	20 %	20 %	40 %	20 %	333920964
2534	NC_015564	GAGTC	2	10	3381812	3381821	20 %	20 %	40 %	20 %	333920965
2535	NC_015564	CGACG	2	10	3382183	3382192	20 %	0 %	40 %	40 %	333920965
2536	NC_015564	AGCCA	2	10	3384060	3384069	40 %	0 %	20 %	40 %	333920968
2537	NC_015564	GGTGA	2	10	3384989	3384998	20 %	20 %	60 %	0 %	333920968
2538	NC_015564	CGGCC	2	10	3385584	3385593	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2539	NC_015564	CGGCT	2	10	3386573	3386582	0 %	20 %	40 %	40 %	333920971
2540	NC_015564	CCAGC	2	10	3386626	3386635	20 %	0 %	20 %	60 %	333920971
2541	NC_015564	AGCGA	2	10	3388271	3388280	40 %	0 %	40 %	20 %	333920974
2542	NC_015564	ACTGC	2	10	3389307	3389316	20 %	20 %	20 %	40 %	333920975
2543	NC_015564	GCATC	2	10	3389847	3389856	20 %	20 %	20 %	40 %	333920975
2544	NC_015564	CGTTC	2	10	3393907	3393916	0 %	40 %	20 %	40 %	333920979
2545	NC_015564	GCCCG	2	10	3394371	3394380	0 %	0 %	40 %	60 %	333920980
2546	NC_015564	GCGAC	2	10	3394468	3394477	20 %	0 %	40 %	40 %	333920980
2547	NC_015564	ACGCG	2	10	3395976	3395985	20 %	0 %	40 %	40 %	333920982
2548	NC_015564	ATCGG	2	10	3396880	3396889	20 %	20 %	40 %	20 %	333920983
2549	NC_015564	TGGGA	2	10	3397397	3397406	20 %	20 %	60 %	0 %	333920984
2550	NC_015564	GGGAT	2	10	3397952	3397961	20 %	20 %	60 %	0 %	333920985
2551	NC_015564	GCACT	2	10	3398860	3398869	20 %	20 %	20 %	40 %	333920985
2552	NC_015564	GCTCA	2	10	3400175	3400184	20 %	20 %	20 %	40 %	333920986
2553	NC_015564	GGACA	2	10	3402173	3402182	40 %	0 %	40 %	20 %	333920986
2554	NC_015564	GCCCG	2	10	3402281	3402290	0 %	0 %	40 %	60 %	333920986
2555	NC_015564	AAGCA	2	10	3403066	3403075	60 %	0 %	20 %	20 %	333920987
2556	NC_015564	TACCG	2	10	3404921	3404930	20 %	20 %	20 %	40 %	333920987
2557	NC_015564	TGCGC	2	10	3405298	3405307	0 %	20 %	40 %	40 %	333920987
2558	NC_015564	GGACA	2	10	3405623	3405632	40 %	0 %	40 %	20 %	333920987
2559	NC_015564	GGACC	2	10	3405959	3405968	20 %	0 %	40 %	40 %	333920987
2560	NC_015564	CCGCG	2	10	3410345	3410354	0 %	0 %	40 %	60 %	333920991
2561	NC_015564	CGCGC	2	10	3410529	3410538	0 %	0 %	40 %	60 %	333920991
2562	NC_015564	GCCTA	2	10	3411992	3412001	20 %	20 %	20 %	40 %	333920995
2563	NC_015564	CGTCA	2	10	3412801	3412810	20 %	20 %	20 %	40 %	333920996
2564	NC_015564	TGTGA	2	10	3413343	3413352	20 %	40 %	40 %	0 %	333920996
2565	NC_015564	CGACT	2	10	3414372	3414381	20 %	20 %	20 %	40 %	333920999
2566	NC_015564	CGGAT	2	10	3418586	3418595	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2567	NC_015564	TCCCC	2	10	3418709	3418718	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2568	NC_015564	GCGCG	2	10	3423618	3423627	0 %	0 %	60 %	40 %	333921007
2569	NC_015564	CAGCG	2	10	3424326	3424335	20 %	0 %	40 %	40 %	333921008
2570	NC_015564	CGAGT	2	10	3424467	3424476	20 %	20 %	40 %	20 %	333921008
2571	NC_015564	ACCAG	2	10	3427992	3428001	40 %	0 %	20 %	40 %	333921013
2572	NC_015564	CGGTC	2	10	3438226	3438235	0 %	20 %	40 %	40 %	333921022
2573	NC_015564	CTCTC	2	10	3439058	3439067	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2574	NC_015564	GAAAC	2	10	3439115	3439124	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2575	NC_015564	CAGCC	2	10	3439344	3439353	20 %	0 %	20 %	60 %	333921024
2576	NC_015564	CACGC	2	10	3439716	3439725	20 %	0 %	20 %	60 %	333921024
2577	NC_015564	GCCCG	2	10	3439929	3439938	0 %	0 %	40 %	60 %	333921024
2578	NC_015564	CTTCA	2	10	3440686	3440695	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2579	NC_015564	TCACC	2	10	3440815	3440824	20 %	20 %	0 %	60 %	333921026
2580	NC_015564	TGCGC	2	10	3441702	3441711	0 %	20 %	40 %	40 %	333921026
2581	NC_015564	GCTGG	2	10	3443613	3443622	0 %	20 %	60 %	20 %	333921028
2582	NC_015564	ACGTG	2	10	3444062	3444071	20 %	20 %	40 %	20 %	333921029
2583	NC_015564	CGCGC	2	10	3445148	3445157	0 %	0 %	40 %	60 %	333921029
2584	NC_015564	GCGCC	2	10	3445523	3445532	0 %	0 %	40 %	60 %	333921029
2585	NC_015564	CTGAG	2	10	3446130	3446139	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2586	NC_015564	TCACC	2	10	3447154	3447163	20 %	20 %	0 %	60 %	333921032
2587	NC_015564	AGCCG	2	10	3447758	3447767	20 %	0 %	40 %	40 %	333921033
2588	NC_015564	CTTGC	2	10	3450563	3450572	0 %	40 %	20 %	40 %	333921034
2589	NC_015564	GCCGT	2	10	3452233	3452242	0 %	20 %	40 %	40 %	333921037
2590	NC_015564	CGGTG	2	10	3452817	3452826	0 %	20 %	60 %	20 %	333921037
2591	NC_015564	GCCGC	2	10	3453928	3453937	0 %	0 %	40 %	60 %	333921038
2592	NC_015564	GGCCC	2	10	3454549	3454558	0 %	0 %	40 %	60 %	333921038
2593	NC_015564	TCCGG	2	10	3455044	3455053	0 %	20 %	40 %	40 %	333921039
2594	NC_015564	GGCTG	2	10	3459084	3459093	0 %	20 %	60 %	20 %	333921043
2595	NC_015564	ACGCC	2	10	3460844	3460853	20 %	0 %	20 %	60 %	333921045
2596	NC_015564	CCGGC	2	10	3462410	3462419	0 %	0 %	40 %	60 %	333921047
2597	NC_015564	TTTGA	2	10	3464665	3464674	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_015564	CAGGC	2	10	3465050	3465059	20 %	0 %	40 %	40 %	333921051
2599	NC_015564	CGCTT	2	10	3466869	3466878	0 %	40 %	20 %	40 %	333921053
2600	NC_015564	AGCGC	2	10	3468544	3468553	20 %	0 %	40 %	40 %	333921054
2601	NC_015564	CGTTT	2	10	3470320	3470329	0 %	60 %	20 %	20 %	333921054
2602	NC_015564	GCATC	2	10	3471143	3471152	20 %	20 %	20 %	40 %	333921055
2603	NC_015564	TCGTT	2	10	3471392	3471401	0 %	60 %	20 %	20 %	333921055
2604	NC_015564	CGACC	2	10	3472741	3472750	20 %	0 %	20 %	60 %	333921056
2605	NC_015564	CGCTG	2	10	3472986	3472995	0 %	20 %	40 %	40 %	333921056
2606	NC_015564	ATTCA	2	10	3473226	3473235	40 %	40 %	0 %	20 %	333921056
2607	NC_015564	ATGTC	2	10	3476274	3476283	20 %	40 %	20 %	20 %	333921060
2608	NC_015564	CCGGA	2	10	3478133	3478142	20 %	0 %	40 %	40 %	333921063
2609	NC_015564	GATGC	2	10	3478244	3478253	20 %	20 %	40 %	20 %	333921063
2610	NC_015564	ACGGA	2	10	3480780	3480789	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2611	NC_015564	GTGCC	2	10	3481057	3481066	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2612	NC_015564	CGTTC	2	10	3481323	3481332	0 %	40 %	20 %	40 %	333921066
2613	NC_015564	GGCAG	2	10	3481836	3481845	20 %	0 %	60 %	20 %	333921066
2614	NC_015564	GCGGT	2	10	3483943	3483952	0 %	20 %	60 %	20 %	333921067
2615	NC_015564	TCGAT	2	10	3486634	3486643	20 %	40 %	20 %	20 %	333921070
2616	NC_015564	GGCGA	2	10	3488094	3488103	20 %	0 %	60 %	20 %	333921072
2617	NC_015564	GCGCA	2	10	3488226	3488235	20 %	0 %	40 %	40 %	333921072
2618	NC_015564	CGATC	2	10	3488516	3488525	20 %	20 %	20 %	40 %	333921072
2619	NC_015564	TGGCC	2	10	3489029	3489038	0 %	20 %	40 %	40 %	333921073
2620	NC_015564	GCTCC	2	10	3490023	3490032	0 %	20 %	20 %	60 %	333921074
2621	NC_015564	CGCAG	2	10	3492195	3492204	20 %	0 %	40 %	40 %	333921076
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2623	NC_015564	ACCGC	2	10	3492783	3492792	20 %	0 %	20 %	60 %	333921077
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2625	NC_015564	CTTCG	2	10	3496582	3496591	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2997	NC_015564	GGCAA	2	10	3984476	3984485	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2998	NC_015564	ATGGC	2	10	3986211	3986220	20 %	20 %	40 %	20 %	333921574
2999	NC_015564	GATGC	2	10	3987562	3987571	20 %	20 %	40 %	20 %	333921575
3000	NC_015564	AGTGC	2	10	3989057	3989066	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

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