MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 3575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015564	CACAG	2	10	4639271	4639280	40 %	0 %	20 %	40 %	333922135
3502	NC_015564	GGGGC	2	10	4639472	4639481	0 %	0 %	80 %	20 %	333922135
3503	NC_015564	AACGA	2	10	4639957	4639966	60 %	0 %	20 %	20 %	333922136
3504	NC_015564	TAGGG	2	10	4640312	4640321	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_015564	GCCGG	2	10	4640552	4640561	0 %	0 %	60 %	40 %	333922137
3506	NC_015564	GCCCG	2	10	4641185	4641194	0 %	0 %	40 %	60 %	333922138
3507	NC_015564	GGCCG	2	10	4641855	4641864	0 %	0 %	60 %	40 %	333922138
3508	NC_015564	GAAAC	2	10	4644462	4644471	60 %	0 %	20 %	20 %	333922140
3509	NC_015564	CTGCA	2	10	4644842	4644851	20 %	20 %	20 %	40 %	333922140
3510	NC_015564	TCGCC	2	10	4645886	4645895	0 %	20 %	20 %	60 %	333922142
3511	NC_015564	GTTCA	2	10	4646288	4646297	20 %	40 %	20 %	20 %	333922142
3512	NC_015564	TTCCT	2	10	4647410	4647419	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3513	NC_015564	CGGCG	2	10	4647775	4647784	0 %	0 %	60 %	40 %	333922144
3514	NC_015564	ACTGA	2	10	4650183	4650192	40 %	20 %	20 %	20 %	333922146
3515	NC_015564	GCGCG	2	10	4650582	4650591	0 %	0 %	60 %	40 %	333922146
3516	NC_015564	CTGAA	2	10	4654114	4654123	40 %	20 %	20 %	20 %	333922148
3517	NC_015564	GGAAC	2	10	4655035	4655044	40 %	0 %	40 %	20 %	333922150
3518	NC_015564	TCACC	2	10	4659853	4659862	20 %	20 %	0 %	60 %	333922153
3519	NC_015564	GCTAT	2	10	4660128	4660137	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3520	NC_015564	CAAGC	2	10	4661440	4661449	40 %	0 %	20 %	40 %	333922157
3521	NC_015564	CAGAA	2	10	4664021	4664030	60 %	0 %	20 %	20 %	333922160
3522	NC_015564	GCCCC	2	10	4668182	4668191	0 %	0 %	20 %	80 %	333922166
3523	NC_015564	GTCTG	2	10	4668606	4668615	0 %	40 %	40 %	20 %	333922167
3524	NC_015564	ATCCG	2	10	4668838	4668847	20 %	20 %	20 %	40 %	333922168
3525	NC_015564	CACTC	2	10	4670954	4670963	20 %	20 %	0 %	60 %	333922170
3526	NC_015564	GGCCA	2	10	4671098	4671107	20 %	0 %	40 %	40 %	333922170
3527	NC_015564	ACACG	2	10	4672120	4672129	40 %	0 %	20 %	40 %	333922172
3528	NC_015564	ACGAA	2	10	4672155	4672164	60 %	0 %	20 %	20 %	333922172
3529	NC_015564	AGCCG	2	10	4672401	4672410	20 %	0 %	40 %	40 %	333922172
3530	NC_015564	ATCGC	2	10	4673447	4673456	20 %	20 %	20 %	40 %	333922173
3531	NC_015564	TCGCG	2	10	4675488	4675497	0 %	20 %	40 %	40 %	333922177
3532	NC_015564	TGAAC	2	10	4675510	4675519	40 %	20 %	20 %	20 %	333922177
3533	NC_015564	CTCGT	2	10	4675755	4675764	0 %	40 %	20 %	40 %	333922177
3534	NC_015564	TCGCC	2	10	4677086	4677095	0 %	20 %	20 %	60 %	333922178
3535	NC_015564	TCAGT	2	10	4684760	4684769	20 %	40 %	20 %	20 %	333922187
3536	NC_015564	CCTTC	2	10	4685553	4685562	0 %	40 %	0 %	60 %	333922189
3537	NC_015564	CGCGC	2	10	4688013	4688022	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3538	NC_015564	GCCAG	2	10	4689340	4689349	20 %	0 %	40 %	40 %	333922192
3539	NC_015564	GTCGG	2	10	4689828	4689837	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3540	NC_015564	CCTGA	2	10	4689886	4689895	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3541	NC_015564	TCGCA	2	10	4692549	4692558	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3542	NC_015564	CATCG	2	10	4692925	4692934	20 %	20 %	20 %	40 %	333922195
3543	NC_015564	CCGCA	2	10	4693197	4693206	20 %	0 %	20 %	60 %	333922195
3544	NC_015564	GCATC	2	10	4694219	4694228	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3545	NC_015564	CGCGA	2	10	4694683	4694692	20 %	0 %	40 %	40 %	333922197
3546	NC_015564	CGCAG	2	10	4694815	4694824	20 %	0 %	40 %	40 %	333922197
3547	NC_015564	TCGGA	2	10	4695297	4695306	20 %	20 %	40 %	20 %	333922198
3548	NC_015564	TGCGA	2	10	4696786	4696795	20 %	20 %	40 %	20 %	333922200
3549	NC_015564	ATGTG	2	10	4701302	4701311	20 %	40 %	40 %	0 %	333922204
3550	NC_015564	GCGTT	2	10	4703620	4703629	0 %	40 %	40 %	20 %	333922206
3551	NC_015564	ACAGA	2	10	4704011	4704020	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3552	NC_015564	CTCAC	2	10	4704092	4704101	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3553	NC_015564	GCAGC	2	10	4704401	4704410	20 %	0 %	40 %	40 %	333922207
3554	NC_015564	ACGGT	2	10	4705296	4705305	20 %	20 %	40 %	20 %	333922207
3555	NC_015564	TTCGT	2	10	4705352	4705361	0 %	60 %	20 %	20 %	333922207
3556	NC_015564	GCCGA	2	10	4709605	4709614	20 %	0 %	40 %	40 %	333922211
3557	NC_015564	GTCCA	2	10	4710087	4710096	20 %	20 %	20 %	40 %	333922211
3558	NC_015564	TCTTT	2	10	4711092	4711101	0 %	80 %	0 %	20 %	333922211
3559	NC_015564	CGATG	2	10	4711129	4711138	20 %	20 %	40 %	20 %	333922211
3560	NC_015564	CGGGG	2	10	4712685	4712694	0 %	0 %	80 %	20 %	333922212
3561	NC_015564	AGGGG	2	10	4714675	4714684	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_015564	CGCAG	2	10	4717709	4717718	20 %	0 %	40 %	40 %	333922218
3563	NC_015564	AGAGT	2	10	4719614	4719623	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_015564	GGGAT	2	10	4719979	4719988	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_015564	CGTCG	2	10	4724105	4724114	0 %	20 %	40 %	40 %	333922222
3566	NC_015564	GCCAG	2	10	4725569	4725578	20 %	0 %	40 %	40 %	333922222
3567	NC_015564	GGCGC	2	10	4725618	4725627	0 %	0 %	60 %	40 %	333922222
3568	NC_015564	GGCGC	2	10	4725795	4725804	0 %	0 %	60 %	40 %	333922222
3569	NC_015564	CGGCG	2	10	4725887	4725896	0 %	0 %	60 %	40 %	333922222
3570	NC_015564	GCTCG	2	10	4728214	4728223	0 %	20 %	40 %	40 %	333922224
3571	NC_015564	CGCAC	2	10	4729163	4729172	20 %	0 %	20 %	60 %	333922225
3572	NC_015564	GAATG	2	10	4733514	4733523	40 %	20 %	40 %	0 %	333922230
3573	NC_015564	AGGGG	2	10	4736551	4736560	20 %	0 %	80 %	0 %	333922234
3574	NC_015564	AAGGA	2	10	4736791	4736800	60 %	0 %	40 %	0 %	333922234
3575	NC_015564	CTCGG	2	10	4736973	4736982	0 %	20 %	40 %	40 %	333922234

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.