MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 3575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015564	CGCAC	2	10	2720508	2720517	20 %	0 %	20 %	60 %	333920338
2002	NC_015564	ACGCA	2	10	2723294	2723303	40 %	0 %	20 %	40 %	333920341
2003	NC_015564	CGCGC	2	10	2723393	2723402	0 %	0 %	40 %	60 %	333920341
2004	NC_015564	CGCGG	2	10	2723501	2723510	0 %	0 %	60 %	40 %	333920341
2005	NC_015564	TTGCC	2	10	2724094	2724103	0 %	40 %	20 %	40 %	333920341
2006	NC_015564	GCGCC	2	10	2724366	2724375	0 %	0 %	40 %	60 %	333920342
2007	NC_015564	GCACC	2	10	2724585	2724594	20 %	0 %	20 %	60 %	333920342
2008	NC_015564	CGACG	2	10	2724825	2724834	20 %	0 %	40 %	40 %	333920342
2009	NC_015564	TGCGC	2	10	2727465	2727474	0 %	20 %	40 %	40 %	333920345
2010	NC_015564	CATCG	2	10	2727808	2727817	20 %	20 %	20 %	40 %	333920345
2011	NC_015564	GCAAG	2	10	2728531	2728540	40 %	0 %	40 %	20 %	333920347
2012	NC_015564	CGGTG	2	10	2729539	2729548	0 %	20 %	60 %	20 %	333920347
2013	NC_015564	CTCTG	2	10	2730386	2730395	0 %	40 %	20 %	40 %	333920348
2014	NC_015564	TTGCT	2	10	2731474	2731483	0 %	60 %	20 %	20 %	333920349
2015	NC_015564	GGTAC	2	10	2734480	2734489	20 %	20 %	40 %	20 %	333920353
2016	NC_015564	CCGCA	2	10	2736655	2736664	20 %	0 %	20 %	60 %	333920355
2017	NC_015564	GAGCT	2	10	2737360	2737369	20 %	20 %	40 %	20 %	333920355
2018	NC_015564	GCTTT	2	10	2738581	2738590	0 %	60 %	20 %	20 %	333920357
2019	NC_015564	ATTCG	2	10	2739265	2739274	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2020	NC_015564	CCCAG	2	10	2742080	2742089	20 %	0 %	20 %	60 %	333920361
2021	NC_015564	TTCCG	2	10	2742218	2742227	0 %	40 %	20 %	40 %	333920361
2022	NC_015564	CCGCA	2	10	2743491	2743500	20 %	0 %	20 %	60 %	333920363
2023	NC_015564	CCCGG	2	10	2743616	2743625	0 %	0 %	40 %	60 %	333920363
2024	NC_015564	CCAGT	2	10	2743642	2743651	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2025	NC_015564	GAACC	2	10	2743685	2743694	40 %	0 %	20 %	40 %	333920364
2026	NC_015564	GATCA	2	10	2746008	2746017	40 %	20 %	20 %	20 %	333920367
2027	NC_015564	GTCCG	2	10	2746342	2746351	0 %	20 %	40 %	40 %	333920367
2028	NC_015564	CTGCA	2	10	2747088	2747097	20 %	20 %	20 %	40 %	333920367
2029	NC_015564	CCACT	2	10	2748428	2748437	20 %	20 %	0 %	60 %	333920368
2030	NC_015564	TGTGA	2	10	2748580	2748589	20 %	40 %	40 %	0 %	333920368
2031	NC_015564	CCAGC	2	10	2748855	2748864	20 %	0 %	20 %	60 %	333920368
2032	NC_015564	CGCGG	2	10	2749672	2749681	0 %	0 %	60 %	40 %	333920369
2033	NC_015564	TGGAC	2	10	2751028	2751037	20 %	20 %	40 %	20 %	333920370
2034	NC_015564	CCGTG	2	10	2753814	2753823	0 %	20 %	40 %	40 %	333920375
2035	NC_015564	CAGCC	2	10	2754175	2754184	20 %	0 %	20 %	60 %	333920375
2036	NC_015564	AGCCG	2	10	2755638	2755647	20 %	0 %	40 %	40 %	333920377
2037	NC_015564	GCTGC	2	10	2756167	2756176	0 %	20 %	40 %	40 %	333920377
2038	NC_015564	GAACT	2	10	2759303	2759312	40 %	20 %	20 %	20 %	333920381
2039	NC_015564	CTGGC	2	10	2759727	2759736	0 %	20 %	40 %	40 %	333920381
2040	NC_015564	GATGA	2	10	2760979	2760988	40 %	20 %	40 %	0 %	333920382
2041	NC_015564	ACACC	2	10	2763365	2763374	40 %	0 %	0 %	60 %	333920384
2042	NC_015564	GCCAC	2	10	2767007	2767016	20 %	0 %	20 %	60 %	333920390
2043	NC_015564	TTGTG	2	10	2767074	2767083	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2044	NC_015564	TTTCC	2	10	2768584	2768593	0 %	60 %	0 %	40 %	333920392
2045	NC_015564	GAGCG	2	10	2769130	2769139	20 %	0 %	60 %	20 %	333920392
2046	NC_015564	TCACG	2	10	2769896	2769905	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2047	NC_015564	CGCGT	2	10	2771428	2771437	0 %	20 %	40 %	40 %	333920394
2048	NC_015564	AGCGG	2	10	2772721	2772730	20 %	0 %	60 %	20 %	333920397
2049	NC_015564	TGCCG	2	10	2773097	2773106	0 %	20 %	40 %	40 %	333920397
2050	NC_015564	CACGC	2	10	2775405	2775414	20 %	0 %	20 %	60 %	333920397
2051	NC_015564	GGGTC	2	10	2775449	2775458	0 %	20 %	60 %	20 %	333920397
2052	NC_015564	GCAGT	2	10	2775768	2775777	20 %	20 %	40 %	20 %	333920397
2053	NC_015564	CCGCC	2	10	2776636	2776645	0 %	0 %	20 %	80 %	333920397
2054	NC_015564	TTCGA	2	10	2778078	2778087	20 %	40 %	20 %	20 %	333920398
2055	NC_015564	CAGCC	2	10	2778404	2778413	20 %	0 %	20 %	60 %	333920398
2056	NC_015564	TCGGG	2	10	2779168	2779177	0 %	20 %	60 %	20 %	333920398
2057	NC_015564	TCGCG	2	10	2779183	2779192	0 %	20 %	40 %	40 %	333920398
2058	NC_015564	TGGCC	2	10	2779353	2779362	0 %	20 %	40 %	40 %	333920398
2059	NC_015564	CGCTG	2	10	2779463	2779472	0 %	20 %	40 %	40 %	333920398
2060	NC_015564	CGCGG	2	10	2780024	2780033	0 %	0 %	60 %	40 %	333920398
2061	NC_015564	CCCTG	2	10	2780169	2780178	0 %	20 %	20 %	60 %	333920398
2062	NC_015564	GGTCA	2	10	2780414	2780423	20 %	20 %	40 %	20 %	333920398
2063	NC_015564	CCGAG	2	10	2780797	2780806	20 %	0 %	40 %	40 %	333920398
2064	NC_015564	CGGTC	2	10	2780866	2780875	0 %	20 %	40 %	40 %	333920398
2065	NC_015564	ACCGC	2	10	2782302	2782311	20 %	0 %	20 %	60 %	333920398
2066	NC_015564	ACCGC	2	10	2782872	2782881	20 %	0 %	20 %	60 %	333920398
2067	NC_015564	GCGTG	2	10	2784436	2784445	0 %	20 %	60 %	20 %	333920399
2068	NC_015564	ATCTG	2	10	2784747	2784756	20 %	40 %	20 %	20 %	333920400
2069	NC_015564	AGCGA	2	10	2784850	2784859	40 %	0 %	40 %	20 %	333920400
2070	NC_015564	AGCAC	2	10	2787167	2787176	40 %	0 %	20 %	40 %	333920403
2071	NC_015564	GCGAG	2	10	2787563	2787572	20 %	0 %	60 %	20 %	333920403
2072	NC_015564	CGCTT	2	10	2787638	2787647	0 %	40 %	20 %	40 %	333920403
2073	NC_015564	GCTGG	2	10	2789151	2789160	0 %	20 %	60 %	20 %	333920405
2074	NC_015564	GAACT	2	10	2789591	2789600	40 %	20 %	20 %	20 %	333920406
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2077	NC_015564	GCAGC	2	10	2792926	2792935	20 %	0 %	40 %	40 %	333920408
2078	NC_015564	CCGCA	2	10	2798872	2798881	20 %	0 %	20 %	60 %	333920414
2079	NC_015564	GCCGG	2	10	2799364	2799373	0 %	0 %	60 %	40 %	333920414
2080	NC_015564	CGCAT	2	10	2799761	2799770	20 %	20 %	20 %	40 %	333920414
2081	NC_015564	TGCTG	2	10	2801106	2801115	0 %	40 %	40 %	20 %	333920416
2082	NC_015564	CGGGT	2	10	2801542	2801551	0 %	20 %	60 %	20 %	333920416
2083	NC_015564	CGGCG	2	10	2802083	2802092	0 %	0 %	60 %	40 %	333920417
2084	NC_015564	ACGCC	2	10	2803909	2803918	20 %	0 %	20 %	60 %	333920418
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2089	NC_015564	CCGAG	2	10	2809077	2809086	20 %	0 %	40 %	40 %	333920426
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2091	NC_015564	GCGCC	2	10	2809812	2809821	0 %	0 %	40 %	60 %	333920426
2092	NC_015564	CCCGA	2	10	2810219	2810228	20 %	0 %	20 %	60 %	333920426
2093	NC_015564	ACTTC	2	10	2811411	2811420	20 %	40 %	0 %	40 %	333920427
2094	NC_015564	GCTCA	2	10	2812505	2812514	20 %	20 %	20 %	40 %	333920430
2095	NC_015564	GCACG	2	10	2812897	2812906	20 %	0 %	40 %	40 %	333920430
2096	NC_015564	TGGAT	2	10	2815005	2815014	20 %	40 %	40 %	0 %	333920432
2097	NC_015564	CGTCG	2	10	2815154	2815163	0 %	20 %	40 %	40 %	333920432
2098	NC_015564	TGCGC	2	10	2815315	2815324	0 %	20 %	40 %	40 %	333920432
2099	NC_015564	CGCCC	2	10	2815726	2815735	0 %	0 %	20 %	80 %	333920433
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2101	NC_015564	GCCCC	2	10	2817042	2817051	0 %	0 %	20 %	80 %	333920435
2102	NC_015564	TGTGG	2	10	2817149	2817158	0 %	40 %	60 %	0 %	333920435
2103	NC_015564	GCATC	2	10	2818770	2818779	20 %	20 %	20 %	40 %	333920436
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2107	NC_015564	GCCAG	2	10	2823061	2823070	20 %	0 %	40 %	40 %	333920441
2108	NC_015564	GCCAC	2	10	2825395	2825404	20 %	0 %	20 %	60 %	333920443
2109	NC_015564	GCCCT	2	10	2827557	2827566	0 %	20 %	20 %	60 %	333920445
2110	NC_015564	GCGCG	2	10	2830004	2830013	0 %	0 %	60 %	40 %	333920447
2111	NC_015564	TACCG	2	10	2830921	2830930	20 %	20 %	20 %	40 %	333920448
2112	NC_015564	CGATC	2	10	2831085	2831094	20 %	20 %	20 %	40 %	333920449
2113	NC_015564	CCACA	2	10	2835409	2835418	40 %	0 %	0 %	60 %	333920452
2114	NC_015564	CGAAG	2	10	2836920	2836929	40 %	0 %	40 %	20 %	333920453
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2116	NC_015564	CGCCC	2	10	2837456	2837465	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
2117	NC_015564	ACCGC	2	10	2837868	2837877	20 %	0 %	20 %	60 %	333920454
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2122	NC_015564	CCGGT	2	10	2846631	2846640	0 %	20 %	40 %	40 %	333920460
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2124	NC_015564	GCGAA	2	10	2847703	2847712	40 %	0 %	40 %	20 %	333920462
2125	NC_015564	CGGTG	2	10	2848406	2848415	0 %	20 %	60 %	20 %	333920462
2126	NC_015564	CACGC	2	10	2849003	2849012	20 %	0 %	20 %	60 %	333920463
2127	NC_015564	CAATT	2	10	2850632	2850641	40 %	40 %	0 %	20 %	333920464
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2129	NC_015564	CGGAC	2	10	2851496	2851505	20 %	0 %	40 %	40 %	333920464
2130	NC_015564	GACGG	2	10	2852815	2852824	20 %	0 %	60 %	20 %	333920465
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2132	NC_015564	CAGCT	2	10	2853799	2853808	20 %	20 %	20 %	40 %	333920466
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2137	NC_015564	GTCGC	2	10	2860212	2860221	0 %	20 %	40 %	40 %	333920474
2138	NC_015564	ACCGT	2	10	2861729	2861738	20 %	20 %	20 %	40 %	333920475
2139	NC_015564	ACGTG	2	10	2861776	2861785	20 %	20 %	40 %	20 %	333920475
2140	NC_015564	CATCG	2	10	2861957	2861966	20 %	20 %	20 %	40 %	333920475
2141	NC_015564	CGCGC	2	10	2862979	2862988	0 %	0 %	40 %	60 %	333920476
2142	NC_015564	TCAAA	2	10	2864555	2864564	60 %	20 %	0 %	20 %	333920478
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2147	NC_015564	GTCAG	2	10	2871229	2871238	20 %	20 %	40 %	20 %	333920484
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2153	NC_015564	GAATC	2	10	2879773	2879782	40 %	20 %	20 %	20 %	333920488
2154	NC_015564	CGGAT	2	10	2880980	2880989	20 %	20 %	40 %	20 %	333920489
2155	NC_015564	GAGTC	2	10	2882170	2882179	20 %	20 %	40 %	20 %	333920489
2156	NC_015564	TTGCA	2	10	2883723	2883732	20 %	40 %	20 %	20 %	333920490
2157	NC_015564	GCATC	2	10	2884382	2884391	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2158	NC_015564	CTTCC	2	10	2884821	2884830	0 %	40 %	0 %	60 %	333920492
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2220	NC_015564	TCCAT	2	10	2962929	2962938	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2221	NC_015564	GCCGG	2	10	2963077	2963086	0 %	0 %	60 %	40 %	333920561
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2229	NC_015564	CCGGC	2	10	2974834	2974843	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2230	NC_015564	CCCGC	2	10	2979814	2979823	0 %	0 %	20 %	80 %	333920580
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2236	NC_015564	TGACC	2	10	2993388	2993397	20 %	20 %	20 %	40 %	333920596
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2239	NC_015564	CAGTG	2	10	2996003	2996012	20 %	20 %	40 %	20 %	333920599
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2242	NC_015564	GCCAC	2	10	2999816	2999825	20 %	0 %	20 %	60 %	333920603
2243	NC_015564	AGCGC	2	10	3000317	3000326	20 %	0 %	40 %	40 %	333920603
2244	NC_015564	CGATT	2	10	3001076	3001085	20 %	40 %	20 %	20 %	333920604
2245	NC_015564	CCATC	2	10	3002215	3002224	20 %	20 %	0 %	60 %	333920605
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2495	NC_015564	CAGCC	2	10	3332081	3332090	20 %	0 %	20 %	60 %	333920910
2496	NC_015564	CCGCG	2	10	3332609	3332618	0 %	0 %	40 %	60 %	333920911
2497	NC_015564	GAGCG	2	10	3332936	3332945	20 %	0 %	60 %	20 %	333920911
2498	NC_015564	GATCT	2	10	3336784	3336793	20 %	40 %	20 %	20 %	333920916
2499	NC_015564	CACCG	2	10	3337888	3337897	20 %	0 %	20 %	60 %	333920916
2500	NC_015564	ACTGC	2	10	3338415	3338424	20 %	20 %	20 %	40 %	333920917

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