MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 3575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015564	CCGCG	2	10	3990470	3990479	0 %	0 %	40 %	60 %	333921580
3002	NC_015564	CGCGC	2	10	3993022	3993031	0 %	0 %	40 %	60 %	333921582
3003	NC_015564	CCGGA	2	10	3993903	3993912	20 %	0 %	40 %	40 %	333921583
3004	NC_015564	CGAGC	2	10	3995063	3995072	20 %	0 %	40 %	40 %	333921584
3005	NC_015564	TGCGG	2	10	3996292	3996301	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3006	NC_015564	TCGCA	2	10	3996857	3996866	20 %	20 %	20 %	40 %	333921587
3007	NC_015564	CGGAC	2	10	3996989	3996998	20 %	0 %	40 %	40 %	333921587
3008	NC_015564	CATGA	2	10	3997140	3997149	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3009	NC_015564	CAGTC	2	10	3997250	3997259	20 %	20 %	20 %	40 %	333921588
3010	NC_015564	TCGAT	2	10	3998992	3999001	20 %	40 %	20 %	20 %	333921589
3011	NC_015564	AGCGC	2	10	3999040	3999049	20 %	0 %	40 %	40 %	333921589
3012	NC_015564	CGCGG	2	10	3999743	3999752	0 %	0 %	60 %	40 %	333921589
3013	NC_015564	CGACG	2	10	4001462	4001471	20 %	0 %	40 %	40 %	333921591
3014	NC_015564	GCAGC	2	10	4002704	4002713	20 %	0 %	40 %	40 %	333921593
3015	NC_015564	TGACA	2	10	4003010	4003019	40 %	20 %	20 %	20 %	333921594
3016	NC_015564	ACAGC	2	10	4005494	4005503	40 %	0 %	20 %	40 %	333921597
3017	NC_015564	GCCAA	2	10	4006030	4006039	40 %	0 %	20 %	40 %	333921597
3018	NC_015564	CACCG	2	10	4006345	4006354	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3019	NC_015564	CGCGC	2	10	4006502	4006511	0 %	0 %	40 %	60 %	333921598
3020	NC_015564	CGCTG	2	10	4008599	4008608	0 %	20 %	40 %	40 %	333921600
3021	NC_015564	AAACC	2	10	4009637	4009646	60 %	0 %	0 %	40 %	333921600
3022	NC_015564	CAGCG	2	10	4010670	4010679	20 %	0 %	40 %	40 %	333921601
3023	NC_015564	GTCGC	2	10	4011346	4011355	0 %	20 %	40 %	40 %	333921601
3024	NC_015564	CGAAC	2	10	4012700	4012709	40 %	0 %	20 %	40 %	333921602
3025	NC_015564	GCGCT	2	10	4014276	4014285	0 %	20 %	40 %	40 %	333921603
3026	NC_015564	ACGGT	2	10	4015899	4015908	20 %	20 %	40 %	20 %	333921605
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3029	NC_015564	CGGGA	2	10	4021792	4021801	20 %	0 %	60 %	20 %	333921612
3030	NC_015564	TGGCT	2	10	4023622	4023631	0 %	40 %	40 %	20 %	333921613
3031	NC_015564	TGCCG	2	10	4027714	4027723	0 %	20 %	40 %	40 %	333921618
3032	NC_015564	CCTGC	2	10	4029549	4029558	0 %	20 %	20 %	60 %	333921619
3033	NC_015564	CACGC	2	10	4030439	4030448	20 %	0 %	20 %	60 %	333921620
3034	NC_015564	ACGCC	2	10	4031213	4031222	20 %	0 %	20 %	60 %	333921621
3035	NC_015564	CGCAC	2	10	4032155	4032164	20 %	0 %	20 %	60 %	333921622
3036	NC_015564	GAAGC	2	10	4032855	4032864	40 %	0 %	40 %	20 %	333921623
3037	NC_015564	CGGCG	2	10	4034141	4034150	0 %	0 %	60 %	40 %	333921624
3038	NC_015564	ACCGC	2	10	4034920	4034929	20 %	0 %	20 %	60 %	333921624
3039	NC_015564	GCTCG	2	10	4035374	4035383	0 %	20 %	40 %	40 %	333921624
3040	NC_015564	GCACC	2	10	4035803	4035812	20 %	0 %	20 %	60 %	333921625
3041	NC_015564	TGACG	2	10	4036803	4036812	20 %	20 %	40 %	20 %	333921626
3042	NC_015564	CTCAG	2	10	4040799	4040808	20 %	20 %	20 %	40 %	333921630
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3044	NC_015564	ATCGA	2	10	4043909	4043918	40 %	20 %	20 %	20 %	333921633
3045	NC_015564	GGAAC	2	10	4044150	4044159	40 %	0 %	40 %	20 %	333921633
3046	NC_015564	TTCCC	2	10	4046344	4046353	0 %	40 %	0 %	60 %	333921636
3047	NC_015564	GTGAT	2	10	4048457	4048466	20 %	40 %	40 %	0 %	333921638
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3049	NC_015564	GCTCG	2	10	4055987	4055996	0 %	20 %	40 %	40 %	333921645
3050	NC_015564	CCGAG	2	10	4059880	4059889	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3051	NC_015564	GCGCC	2	10	4061939	4061948	0 %	0 %	40 %	60 %	333921650
3052	NC_015564	ACCGC	2	10	4064267	4064276	20 %	0 %	20 %	60 %	333921652
3053	NC_015564	GTGCG	2	10	4066815	4066824	0 %	20 %	60 %	20 %	333921655
3054	NC_015564	TCAGA	2	10	4066990	4066999	40 %	20 %	20 %	20 %	333921655
3055	NC_015564	TCGAC	2	10	4067301	4067310	20 %	20 %	20 %	40 %	333921655
3056	NC_015564	CGGCC	2	10	4067695	4067704	0 %	0 %	40 %	60 %	333921656
3057	NC_015564	ACGGA	2	10	4068785	4068794	40 %	0 %	40 %	20 %	333921657
3058	NC_015564	ACGGG	2	10	4069043	4069052	20 %	0 %	60 %	20 %	333921657
3059	NC_015564	TCCGG	2	10	4069489	4069498	0 %	20 %	40 %	40 %	333921658
3060	NC_015564	CCCTG	2	10	4070655	4070664	0 %	20 %	20 %	60 %	333921659
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3062	NC_015564	GCGCG	2	10	4074547	4074556	0 %	0 %	60 %	40 %	333921663
3063	NC_015564	CCGCC	2	10	4076061	4076070	0 %	0 %	20 %	80 %	333921664
3064	NC_015564	ACCGG	2	10	4078186	4078195	20 %	0 %	40 %	40 %	333921664
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3066	NC_015564	AGCAA	2	10	4079352	4079361	60 %	0 %	20 %	20 %	333921665
3067	NC_015564	CATCG	2	10	4079575	4079584	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3068	NC_015564	TCCGT	2	10	4079683	4079692	0 %	40 %	20 %	40 %	333921666
3069	NC_015564	GAACG	2	10	4079837	4079846	40 %	0 %	40 %	20 %	333921666
3070	NC_015564	TGGGC	2	10	4080145	4080154	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3071	NC_015564	CGGAG	2	10	4080444	4080453	20 %	0 %	60 %	20 %	333921667
3072	NC_015564	GCGCT	2	10	4082110	4082119	0 %	20 %	40 %	40 %	333921669
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3081	NC_015564	TGCGC	2	10	4095604	4095613	0 %	20 %	40 %	40 %	333921682
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3089	NC_015564	TCAGC	2	10	4106696	4106705	20 %	20 %	20 %	40 %	333921692
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3095	NC_015564	GAGCT	2	10	4115825	4115834	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3096	NC_015564	CGAGA	2	10	4121118	4121127	40 %	0 %	40 %	20 %	333921707
3097	NC_015564	CCGGT	2	10	4122731	4122740	0 %	20 %	40 %	40 %	333921708
3098	NC_015564	GTTCA	2	10	4125137	4125146	20 %	40 %	20 %	20 %	333921708
3099	NC_015564	CTCAT	2	10	4126343	4126352	20 %	40 %	0 %	40 %	333921709
3100	NC_015564	CTCGC	2	10	4126553	4126562	0 %	20 %	20 %	60 %	333921709
3101	NC_015564	CACGT	2	10	4126663	4126672	20 %	20 %	20 %	40 %	333921709
3102	NC_015564	GCGCT	2	10	4127338	4127347	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3103	NC_015564	CAGTC	2	10	4127622	4127631	20 %	20 %	20 %	40 %	333921710
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3107	NC_015564	GTGCA	2	10	4130062	4130071	20 %	20 %	40 %	20 %	333921712
3108	NC_015564	CGCAC	2	10	4130515	4130524	20 %	0 %	20 %	60 %	333921713
3109	NC_015564	GGCGC	2	10	4130849	4130858	0 %	0 %	60 %	40 %	333921713
3110	NC_015564	CTTCG	2	10	4131826	4131835	0 %	40 %	20 %	40 %	333921714
3111	NC_015564	TCGCG	2	10	4132060	4132069	0 %	20 %	40 %	40 %	333921714
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3113	NC_015564	CGGCC	2	10	4137278	4137287	0 %	0 %	40 %	60 %	333921718
3114	NC_015564	ACGCG	2	10	4137481	4137490	20 %	0 %	40 %	40 %	333921718
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3117	NC_015564	GTCAC	2	10	4140996	4141005	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3118	NC_015564	CCGCG	2	10	4145113	4145122	0 %	0 %	40 %	60 %	333921724
3119	NC_015564	CCGGC	2	10	4146731	4146740	0 %	0 %	40 %	60 %	333921724
3120	NC_015564	CGAGC	2	10	4146824	4146833	20 %	0 %	40 %	40 %	333921724
3121	NC_015564	ACGTC	2	10	4148287	4148296	20 %	20 %	20 %	40 %	333921724
3122	NC_015564	GAGGG	2	10	4150335	4150344	20 %	0 %	80 %	0 %	333921724
3123	NC_015564	CCCGG	2	10	4150911	4150920	0 %	0 %	40 %	60 %	333921724
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3497	NC_015564	CAGTC	2	10	4634852	4634861	20 %	20 %	20 %	40 %	333922132
3498	NC_015564	TCGAC	2	10	4637072	4637081	20 %	20 %	20 %	40 %	333922134
3499	NC_015564	ACCCG	2	10	4638270	4638279	20 %	0 %	20 %	60 %	333922135
3500	NC_015564	GCTTG	2	10	4638639	4638648	0 %	40 %	40 %	20 %	333922135

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