MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 2629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021081	GGCCT	2	10	1484	1493	0 %	20 %	40 %	40 %	482881637
2	NC_021081	TACGC	2	10	2093	2102	20 %	20 %	20 %	40 %	482881638
3	NC_021081	GGCCA	2	10	2295	2304	20 %	0 %	40 %	40 %	482881639
4	NC_021081	CACCC	2	10	2540	2549	20 %	0 %	0 %	80 %	482881639
5	NC_021081	TTTGG	2	10	5337	5346	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021081	GCCCT	2	10	5474	5483	0 %	20 %	20 %	60 %	482881644
7	NC_021081	GCACC	2	10	6668	6677	20 %	0 %	20 %	60 %	482881647
8	NC_021081	TCTAG	2	10	8251	8260	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021081	TTTGG	2	10	8444	8453	0 %	60 %	40 %	0 %	482881651
10	NC_021081	GGCCA	2	10	9055	9064	20 %	0 %	40 %	40 %	482881652
11	NC_021081	ACGGG	2	10	9563	9572	20 %	0 %	60 %	20 %	482881652
12	NC_021081	GCCCG	2	10	10347	10356	0 %	0 %	40 %	60 %	482881652
13	NC_021081	GTGCG	2	10	11252	11261	0 %	20 %	60 %	20 %	482881652
14	NC_021081	GGTGA	2	10	11491	11500	20 %	20 %	60 %	0 %	482881653
15	NC_021081	CTGGC	2	10	13095	13104	0 %	20 %	40 %	40 %	482881655
16	NC_021081	CAGCC	2	10	14163	14172	20 %	0 %	20 %	60 %	482881657
17	NC_021081	CGCCA	2	10	14447	14456	20 %	0 %	20 %	60 %	482881657
18	NC_021081	GGTGG	2	10	15680	15689	0 %	20 %	80 %	0 %	482881659
19	NC_021081	GGGGT	2	10	16364	16373	0 %	20 %	80 %	0 %	482881659
20	NC_021081	GGCCC	2	10	17582	17591	0 %	0 %	40 %	60 %	482881662
21	NC_021081	TGCTT	2	10	21945	21954	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021081	CGGTG	2	10	24336	24345	0 %	20 %	60 %	20 %	482881667
23	NC_021081	CTAAA	2	10	28398	28407	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_021081	GGTGG	2	10	29083	29092	0 %	20 %	80 %	0 %	482881672
25	NC_021081	CAGGC	2	10	29864	29873	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_021081	TCGCC	2	10	34028	34037	0 %	20 %	20 %	60 %	482881676
27	NC_021081	TCTCC	2	10	36189	36198	0 %	40 %	0 %	60 %	482881677
28	NC_021081	TACGC	2	10	36360	36369	20 %	20 %	20 %	40 %	482881677
29	NC_021081	CCGAA	2	10	37103	37112	40 %	0 %	20 %	40 %	482881678
30	NC_021081	CAGGC	2	10	39178	39187	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_021081	GCCCC	2	10	39680	39689	0 %	0 %	20 %	80 %	482881681
32	NC_021081	GGCCA	2	10	40159	40168	20 %	0 %	40 %	40 %	482881682
33	NC_021081	GCCGA	2	10	41262	41271	20 %	0 %	40 %	40 %	482881683
34	NC_021081	ATCGG	2	10	42229	42238	20 %	20 %	40 %	20 %	482881684
35	NC_021081	TGGGC	2	10	44066	44075	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021081	GGGCT	2	10	47539	47548	0 %	20 %	60 %	20 %	482881690
37	NC_021081	TGGAC	2	10	48018	48027	20 %	20 %	40 %	20 %	482881690
38	NC_021081	GCCGG	2	10	50076	50085	0 %	0 %	60 %	40 %	482881692
39	NC_021081	GCCGG	2	10	50365	50374	0 %	0 %	60 %	40 %	482881692
40	NC_021081	CTTCA	2	10	50579	50588	20 %	40 %	0 %	40 %	482881692
41	NC_021081	CAGCT	2	10	51550	51559	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_021081	GACCA	2	10	53073	53082	40 %	0 %	20 %	40 %	482881697
43	NC_021081	TGGGG	2	10	57382	57391	0 %	20 %	80 %	0 %	482881699
44	NC_021081	TGGCG	2	10	58763	58772	0 %	20 %	60 %	20 %	482881700
45	NC_021081	CCTGG	2	10	59275	59284	0 %	20 %	40 %	40 %	482881701
46	NC_021081	TGGTT	2	10	60113	60122	0 %	60 %	40 %	0 %	482881701
47	NC_021081	GCTGG	2	10	61969	61978	0 %	20 %	60 %	20 %	482881703
48	NC_021081	GCCCG	2	10	62153	62162	0 %	0 %	40 %	60 %	482881703
49	NC_021081	GCCAC	2	10	62873	62882	20 %	0 %	20 %	60 %	482881704
50	NC_021081	GCGCA	2	10	66141	66150	20 %	0 %	40 %	40 %	482881707
51	NC_021081	ACAGC	2	10	66836	66845	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_021081	CACTG	2	10	67720	67729	20 %	20 %	20 %	40 %	482881708
53	NC_021081	GGGCA	2	10	68555	68564	20 %	0 %	60 %	20 %	482881708
54	NC_021081	ACAGA	2	10	68922	68931	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_021081	CCTCA	2	10	69165	69174	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_021081	TTCCA	2	10	70024	70033	20 %	40 %	0 %	40 %	482881709
57	NC_021081	CGGGC	2	10	72395	72404	0 %	0 %	60 %	40 %	482881712
58	NC_021081	CGCAG	2	10	72637	72646	20 %	0 %	40 %	40 %	482881712
59	NC_021081	GAAAA	2	10	76018	76027	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021081	CGCTG	2	10	76141	76150	0 %	20 %	40 %	40 %	482881715
61	NC_021081	CGGCA	2	10	76675	76684	20 %	0 %	40 %	40 %	482881715
62	NC_021081	CGGAG	2	10	78177	78186	20 %	0 %	60 %	20 %	482881717
63	NC_021081	AGGGG	2	10	79885	79894	20 %	0 %	80 %	0 %	482881719
64	NC_021081	CTGGG	2	10	80426	80435	0 %	20 %	60 %	20 %	482881719
65	NC_021081	CCCGG	2	10	84736	84745	0 %	0 %	40 %	60 %	482881724
66	NC_021081	GGGGT	2	10	86003	86012	0 %	20 %	80 %	0 %	482881725
67	NC_021081	CGGCC	2	10	86948	86957	0 %	0 %	40 %	60 %	482881725
68	NC_021081	CCCGG	2	10	87421	87430	0 %	0 %	40 %	60 %	482881726
69	NC_021081	GGGCT	2	10	87982	87991	0 %	20 %	60 %	20 %	482881726
70	NC_021081	GGCGG	2	10	91902	91911	0 %	0 %	80 %	20 %	482881730
71	NC_021081	GGGCG	2	10	91922	91931	0 %	0 %	80 %	20 %	482881730
72	NC_021081	CGGCG	2	10	92695	92704	0 %	0 %	60 %	40 %	482881731
73	NC_021081	CGGCG	2	10	93908	93917	0 %	0 %	60 %	40 %	482881733
74	NC_021081	CTGGG	2	10	94829	94838	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_021081	TATTT	2	10	94911	94920	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021081	CAAGC	2	10	100518	100527	40 %	0 %	20 %	40 %	482881746
77	NC_021081	CTGGC	2	10	102901	102910	0 %	20 %	40 %	40 %	482881748
78	NC_021081	GATCA	2	10	103410	103419	40 %	20 %	20 %	20 %	482881749
79	NC_021081	GCCCA	2	10	103637	103646	20 %	0 %	20 %	60 %	482881749
80	NC_021081	CCAGC	2	10	105664	105673	20 %	0 %	20 %	60 %	482881751
81	NC_021081	GGGTG	2	10	108125	108134	0 %	20 %	80 %	0 %	482881754
82	NC_021081	GTGCG	2	10	109663	109672	0 %	20 %	60 %	20 %	482881756
83	NC_021081	GCCCT	2	10	112791	112800	0 %	20 %	20 %	60 %	482881761
84	NC_021081	GGCCT	2	10	112887	112896	0 %	20 %	40 %	40 %	482881761
85	NC_021081	CTGGC	2	10	113382	113391	0 %	20 %	40 %	40 %	482881761
86	NC_021081	CGGCC	2	10	116600	116609	0 %	0 %	40 %	60 %	482881763
87	NC_021081	GGGTG	2	10	119019	119028	0 %	20 %	80 %	0 %	482881764
88	NC_021081	TGCGG	2	10	119973	119982	0 %	20 %	60 %	20 %	482881765
89	NC_021081	GGTTG	2	10	122096	122105	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021081	CCCTA	2	10	123607	123616	20 %	20 %	0 %	60 %	482881768
91	NC_021081	CTGGG	2	10	123956	123965	0 %	20 %	60 %	20 %	482881768
92	NC_021081	ACGAA	2	10	124648	124657	60 %	0 %	20 %	20 %	482881769
93	NC_021081	CCGCC	2	10	125759	125768	0 %	0 %	20 %	80 %	482881771
94	NC_021081	CCTGG	2	10	125793	125802	0 %	20 %	40 %	40 %	482881771
95	NC_021081	GCCCC	2	10	125907	125916	0 %	0 %	20 %	80 %	482881771
96	NC_021081	TTCGG	2	10	129377	129386	0 %	40 %	40 %	20 %	482881776
97	NC_021081	TGGGG	2	10	129463	129472	0 %	20 %	80 %	0 %	482881776
98	NC_021081	AACCC	2	10	132046	132055	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
99	NC_021081	GCGCT	2	10	133402	133411	0 %	20 %	40 %	40 %	482881780
100	NC_021081	CTGGC	2	10	134826	134835	0 %	20 %	40 %	40 %	482881781
101	NC_021081	GCCGC	2	10	135270	135279	0 %	0 %	40 %	60 %	482881781
102	NC_021081	TGGTT	2	10	136084	136093	0 %	60 %	40 %	0 %	482881782
103	NC_021081	CAAAT	2	10	139747	139756	60 %	20 %	0 %	20 %	482881787
104	NC_021081	CTTCA	2	10	139767	139776	20 %	40 %	0 %	40 %	482881788
105	NC_021081	CAGAG	2	10	140925	140934	40 %	0 %	40 %	20 %	482881789
106	NC_021081	CTGCC	2	10	141312	141321	0 %	20 %	20 %	60 %	482881790
107	NC_021081	TGGGG	2	10	141484	141493	0 %	20 %	80 %	0 %	482881790
108	NC_021081	GCTTT	2	10	141576	141585	0 %	60 %	20 %	20 %	482881790
109	NC_021081	TGGCT	2	10	141948	141957	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_021081	TAGTT	2	10	142159	142168	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021081	AGGGC	2	10	143374	143383	20 %	0 %	60 %	20 %	482881792
112	NC_021081	TTTAG	2	10	144891	144900	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021081	AGGGC	2	10	146569	146578	20 %	0 %	60 %	20 %	482881795
114	NC_021081	CCGCC	2	10	148491	148500	0 %	0 %	20 %	80 %	482881798
115	NC_021081	ACCCC	2	10	149719	149728	20 %	0 %	0 %	80 %	482881799
116	NC_021081	AGGCC	2	10	150354	150363	20 %	0 %	40 %	40 %	482881800
117	NC_021081	CGCAC	2	10	151265	151274	20 %	0 %	20 %	60 %	482881800
118	NC_021081	CAGGC	2	10	151760	151769	20 %	0 %	40 %	40 %	482881800
119	NC_021081	TGGGG	2	10	153277	153286	0 %	20 %	80 %	0 %	482881802
120	NC_021081	GGCTG	2	10	153315	153324	0 %	20 %	60 %	20 %	482881802
121	NC_021081	ACCCG	2	10	154349	154358	20 %	0 %	20 %	60 %	482881803
122	NC_021081	GGCCG	2	10	155390	155399	0 %	0 %	60 %	40 %	482881805
123	NC_021081	GCCCG	2	10	156021	156030	0 %	0 %	40 %	60 %	482881806
124	NC_021081	AGCTC	2	10	156153	156162	20 %	20 %	20 %	40 %	482881806
125	NC_021081	CCCAG	2	10	161410	161419	20 %	0 %	20 %	60 %	482881812
126	NC_021081	CAGGT	2	10	163288	163297	20 %	20 %	40 %	20 %	482881815
127	NC_021081	GCCAG	2	10	163883	163892	20 %	0 %	40 %	40 %	482881815
128	NC_021081	GCCCC	2	10	164977	164986	0 %	0 %	20 %	80 %	482881816
129	NC_021081	CCACC	2	10	165854	165863	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
130	NC_021081	AGCCC	2	10	166660	166669	20 %	0 %	20 %	60 %	482881818
131	NC_021081	TCCAA	2	10	166892	166901	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_021081	GCCCC	2	10	167548	167557	0 %	0 %	20 %	80 %	482881820
133	NC_021081	CGGCG	2	10	168779	168788	0 %	0 %	60 %	40 %	482881822
134	NC_021081	GGTGC	2	10	171130	171139	0 %	20 %	60 %	20 %	482881824
135	NC_021081	GGTGG	2	10	171853	171862	0 %	20 %	80 %	0 %	482881825
136	NC_021081	CCCAG	2	10	173533	173542	20 %	0 %	20 %	60 %	482881827
137	NC_021081	GCCGG	2	10	174391	174400	0 %	0 %	60 %	40 %	482881828
138	NC_021081	AGGCC	2	10	174459	174468	20 %	0 %	40 %	40 %	482881828
139	NC_021081	GTTGG	2	10	174874	174883	0 %	40 %	60 %	0 %	482881828
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141	NC_021081	AGGGC	2	10	176157	176166	20 %	0 %	60 %	20 %	482881830
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151	NC_021081	TCGTG	2	10	190525	190534	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
152	NC_021081	CCCAT	2	10	194504	194513	20 %	20 %	0 %	60 %	482881845
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162	NC_021081	CCCGC	2	10	211201	211210	0 %	0 %	20 %	80 %	482881860
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182	NC_021081	GGGCT	2	10	229631	229640	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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185	NC_021081	GCCCC	2	10	232702	232711	0 %	0 %	20 %	80 %	482881880
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187	NC_021081	GCCCG	2	10	234948	234957	0 %	0 %	40 %	60 %	482881881
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263	NC_021081	GGGCC	2	10	305087	305096	0 %	0 %	60 %	40 %	482881938
264	NC_021081	TGGCC	2	10	307621	307630	0 %	20 %	40 %	40 %	482881942
265	NC_021081	AACGG	2	10	308418	308427	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
266	NC_021081	ACACC	2	10	308708	308717	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
267	NC_021081	CTTGC	2	10	309192	309201	0 %	40 %	20 %	40 %	482881944
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401	NC_021081	ACAAT	2	10	455175	455184	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
402	NC_021081	TGGAT	2	10	460077	460086	20 %	40 %	40 %	0 %	482882098
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