MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 2629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021081	GCATA	2	10	2936863	2936872	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2502	NC_021081	CCCAG	2	10	2936987	2936996	20 %	0 %	20 %	60 %	482884535
2503	NC_021081	CACCC	2	10	2940421	2940430	20 %	0 %	0 %	80 %	482884537
2504	NC_021081	CCGGG	2	10	2941471	2941480	0 %	0 %	60 %	40 %	482884538
2505	NC_021081	AGGCC	2	10	2941515	2941524	20 %	0 %	40 %	40 %	482884538
2506	NC_021081	GCCCG	2	10	2944308	2944317	0 %	0 %	40 %	60 %	482884541
2507	NC_021081	CGGCG	2	10	2944357	2944366	0 %	0 %	60 %	40 %	482884541
2508	NC_021081	TCTGG	2	10	2945130	2945139	0 %	40 %	40 %	20 %	482884542
2509	NC_021081	GCTGT	2	10	2945477	2945486	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2510	NC_021081	GAAGC	2	10	2947545	2947554	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2511	NC_021081	TGCAG	2	10	2948013	2948022	20 %	20 %	40 %	20 %	482884547
2512	NC_021081	GGCCC	2	10	2950516	2950525	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2513	NC_021081	GGCAC	2	10	2951009	2951018	20 %	0 %	40 %	40 %	482884549
2514	NC_021081	TGCCC	2	10	2954760	2954769	0 %	20 %	20 %	60 %	482884554
2515	NC_021081	AGGGC	2	10	2955619	2955628	20 %	0 %	60 %	20 %	482884555
2516	NC_021081	CGGGG	2	10	2957873	2957882	0 %	0 %	80 %	20 %	482884558
2517	NC_021081	CAGGC	2	10	2958504	2958513	20 %	0 %	40 %	40 %	482884558
2518	NC_021081	AGGGG	2	10	2958736	2958745	20 %	0 %	80 %	0 %	482884558
2519	NC_021081	CCCCA	2	10	2961252	2961261	20 %	0 %	0 %	80 %	482884560
2520	NC_021081	AGGCC	2	10	2961729	2961738	20 %	0 %	40 %	40 %	482884560
2521	NC_021081	GCCAG	2	10	2962299	2962308	20 %	0 %	40 %	40 %	482884560
2522	NC_021081	CCTGG	2	10	2962695	2962704	0 %	20 %	40 %	40 %	482884560
2523	NC_021081	AGGGG	2	10	2963671	2963680	20 %	0 %	80 %	0 %	482884561
2524	NC_021081	GGCCT	2	10	2964689	2964698	0 %	20 %	40 %	40 %	482884561
2525	NC_021081	CCTGG	2	10	2965639	2965648	0 %	20 %	40 %	40 %	482884563
2526	NC_021081	AGTGA	2	10	2966015	2966024	40 %	20 %	40 %	0 %	482884563
2527	NC_021081	TGGCC	2	10	2966656	2966665	0 %	20 %	40 %	40 %	482884564
2528	NC_021081	TTTGG	2	10	2966875	2966884	0 %	60 %	40 %	0 %	482884564
2529	NC_021081	TCCGC	2	10	2970693	2970702	0 %	20 %	20 %	60 %	482884566
2530	NC_021081	GGAGG	2	10	2971531	2971540	20 %	0 %	80 %	0 %	482884567
2531	NC_021081	CTTCT	2	10	2974768	2974777	0 %	60 %	0 %	40 %	482884572
2532	NC_021081	GCCAC	2	10	2974985	2974994	20 %	0 %	20 %	60 %	482884572
2533	NC_021081	TGGCC	2	10	2977649	2977658	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2534	NC_021081	GCAAG	2	10	2977704	2977713	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2535	NC_021081	GTTCC	2	10	2978260	2978269	0 %	40 %	20 %	40 %	482884575
2536	NC_021081	AAAGA	2	10	2978339	2978348	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_021081	GGTTC	2	10	2979542	2979551	0 %	40 %	40 %	20 %	482884577
2538	NC_021081	TCCAG	2	10	2980559	2980568	20 %	20 %	20 %	40 %	482884578
2539	NC_021081	GGGCG	2	10	2983728	2983737	0 %	0 %	80 %	20 %	482884583
2540	NC_021081	GGGGT	2	10	2984180	2984189	0 %	20 %	80 %	0 %	482884583
2541	NC_021081	CTTCG	2	10	2984400	2984409	0 %	40 %	20 %	40 %	482884583
2542	NC_021081	CCCAG	2	10	2984859	2984868	20 %	0 %	20 %	60 %	482884583
2543	NC_021081	CCCGA	2	10	2985296	2985305	20 %	0 %	20 %	60 %	482884583
2544	NC_021081	GAAAA	2	10	2986323	2986332	80 %	0 %	20 %	0 %	482884584
2545	NC_021081	GGGGT	2	10	2987171	2987180	0 %	20 %	80 %	0 %	482884585
2546	NC_021081	TGGGC	2	10	2987451	2987460	0 %	20 %	60 %	20 %	482884585
2547	NC_021081	CCCAC	2	10	2987948	2987957	20 %	0 %	0 %	80 %	482884585
2548	NC_021081	TGGCG	2	10	2989644	2989653	0 %	20 %	60 %	20 %	482884588
2549	NC_021081	CGGGC	2	10	2990737	2990746	0 %	0 %	60 %	40 %	482884589
2550	NC_021081	GGCCC	2	10	2996885	2996894	0 %	0 %	40 %	60 %	482884594
2551	NC_021081	GGCCT	2	10	2997057	2997066	0 %	20 %	40 %	40 %	482884594
2552	NC_021081	CCGGC	2	10	3000171	3000180	0 %	0 %	40 %	60 %	482884596
2553	NC_021081	GCCCA	2	10	3001613	3001622	20 %	0 %	20 %	60 %	482884597
2554	NC_021081	TGGTT	2	10	3001723	3001732	0 %	60 %	40 %	0 %	482884598
2555	NC_021081	CGGCT	2	10	3006173	3006182	0 %	20 %	40 %	40 %	482884602
2556	NC_021081	GCCGG	3	15	3006911	3006925	0 %	0 %	60 %	40 %	482884602
2557	NC_021081	AGCAG	2	10	3007600	3007609	40 %	0 %	40 %	20 %	482884603
2558	NC_021081	CTGGC	2	10	3007899	3007908	0 %	20 %	40 %	40 %	482884603
2559	NC_021081	CCGGC	2	10	3008672	3008681	0 %	0 %	40 %	60 %	482884604
2560	NC_021081	CGCGA	2	10	3009047	3009056	20 %	0 %	40 %	40 %	482884604
2561	NC_021081	CGCAA	2	10	3016200	3016209	40 %	0 %	20 %	40 %	482884612
2562	NC_021081	GCCGG	2	10	3017971	3017980	0 %	0 %	60 %	40 %	482884615
2563	NC_021081	CCAGG	2	10	3018405	3018414	20 %	0 %	40 %	40 %	482884616
2564	NC_021081	GACTG	2	10	3022331	3022340	20 %	20 %	40 %	20 %	482884619
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2566	NC_021081	CCGCT	2	10	3023056	3023065	0 %	20 %	20 %	60 %	482884619
2567	NC_021081	GGCCA	2	10	3023157	3023166	20 %	0 %	40 %	40 %	482884619
2568	NC_021081	GGCCC	2	10	3024646	3024655	0 %	0 %	40 %	60 %	482884619
2569	NC_021081	GCCCA	2	10	3024976	3024985	20 %	0 %	20 %	60 %	482884620
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2571	NC_021081	GGGCA	2	10	3027149	3027158	20 %	0 %	60 %	20 %	482884622
2572	NC_021081	GGGGT	2	10	3027766	3027775	0 %	20 %	80 %	0 %	482884622
2573	NC_021081	GGGCC	2	10	3029963	3029972	0 %	0 %	60 %	40 %	482884625
2574	NC_021081	CCCCG	2	10	3032797	3032806	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
2575	NC_021081	TGGGC	2	10	3032971	3032980	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2576	NC_021081	GCTGC	2	10	3034069	3034078	0 %	20 %	40 %	40 %	482884627
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2578	NC_021081	GGCCC	2	10	3035857	3035866	0 %	0 %	40 %	60 %	482884628
2579	NC_021081	GGCCG	2	10	3037526	3037535	0 %	0 %	60 %	40 %	482884628
2580	NC_021081	GGCCC	2	10	3037807	3037816	0 %	0 %	40 %	60 %	482884628
2581	NC_021081	GGGCG	2	10	3037886	3037895	0 %	0 %	80 %	20 %	482884628
2582	NC_021081	TGGCC	2	10	3039008	3039017	0 %	20 %	40 %	40 %	482884630
2583	NC_021081	CCGGG	2	10	3039530	3039539	0 %	0 %	60 %	40 %	482884630
2584	NC_021081	GGCCT	2	10	3040428	3040437	0 %	20 %	40 %	40 %	482884630
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2586	NC_021081	GGCTG	2	10	3041445	3041454	0 %	20 %	60 %	20 %	482884631
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2589	NC_021081	CATTG	2	10	3052854	3052863	20 %	40 %	20 %	20 %	482884644
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2592	NC_021081	GGTTC	2	10	3060803	3060812	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2593	NC_021081	AGCCC	2	10	3062991	3063000	20 %	0 %	20 %	60 %	482884656
2594	NC_021081	CCACC	2	10	3064821	3064830	20 %	0 %	0 %	80 %	482884657
2595	NC_021081	GCACC	2	10	3065223	3065232	20 %	0 %	20 %	60 %	482884657
2596	NC_021081	CCTGG	2	10	3065753	3065762	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2597	NC_021081	CCAGG	2	10	3065768	3065777	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2598	NC_021081	CCAGC	2	10	3067240	3067249	20 %	0 %	20 %	60 %	482884659
2599	NC_021081	CACCC	2	10	3068867	3068876	20 %	0 %	0 %	80 %	482884661
2600	NC_021081	CGGCG	2	10	3071021	3071030	0 %	0 %	60 %	40 %	482884663
2601	NC_021081	GGCCG	2	10	3071154	3071163	0 %	0 %	60 %	40 %	482884663
2602	NC_021081	CCCCA	2	10	3071274	3071283	20 %	0 %	0 %	80 %	482884663
2603	NC_021081	GGGCC	2	10	3071298	3071307	0 %	0 %	60 %	40 %	482884663
2604	NC_021081	AACCA	2	10	3071676	3071685	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
2605	NC_021081	GTTTG	2	10	3071953	3071962	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_021081	TGCAC	2	10	3073632	3073641	20 %	20 %	20 %	40 %	482884665
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2608	NC_021081	GGGCA	2	10	3077326	3077335	20 %	0 %	60 %	20 %	482884667
2609	NC_021081	AGGTC	2	10	3077640	3077649	20 %	20 %	40 %	20 %	482884667
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2612	NC_021081	CACCC	2	10	3080851	3080860	20 %	0 %	0 %	80 %	482884671
2613	NC_021081	GGTGG	2	10	3081115	3081124	0 %	20 %	80 %	0 %	482884671
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2618	NC_021081	CCTTT	2	10	3086219	3086228	0 %	60 %	0 %	40 %	482884676
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2621	NC_021081	CCTGG	2	10	3088306	3088315	0 %	20 %	40 %	40 %	482884677
2622	NC_021081	CCGGG	2	10	3089150	3089159	0 %	0 %	60 %	40 %	482884679
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2624	NC_021081	GAAAC	2	10	3093905	3093914	60 %	0 %	20 %	20 %	482884682
2625	NC_021081	GCCGC	2	10	3095492	3095501	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2626	NC_021081	GCCGG	2	10	3095936	3095945	0 %	0 %	60 %	40 %	482884684
2627	NC_021081	ACCAG	2	10	3096338	3096347	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2628	NC_021081	AAAGG	2	10	3096554	3096563	60 %	0 %	40 %	0 %	482884685
2629	NC_021081	GGCCT	2	10	3098490	3098499	0 %	20 %	40 %	40 %	482884689

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