MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 2629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021081	GGGCA	2	10	1699536	1699545	20 %	0 %	60 %	20 %	482883306
1502	NC_021081	GCGAG	2	10	1700990	1700999	20 %	0 %	60 %	20 %	482883307
1503	NC_021081	CCCGG	2	10	1702260	1702269	0 %	0 %	40 %	60 %	482883308
1504	NC_021081	CGGGT	2	10	1703848	1703857	0 %	20 %	60 %	20 %	482883308
1505	NC_021081	AGAAC	2	10	1704185	1704194	60 %	0 %	20 %	20 %	482883309
1506	NC_021081	GCCAG	2	10	1704671	1704680	20 %	0 %	40 %	40 %	482883309
1507	NC_021081	CCCGG	2	10	1712866	1712875	0 %	0 %	40 %	60 %	482883317
1508	NC_021081	GCGGG	2	10	1716245	1716254	0 %	0 %	80 %	20 %	482883320
1509	NC_021081	CCGCC	2	10	1720041	1720050	0 %	0 %	20 %	80 %	482883323
1510	NC_021081	CTTGG	2	10	1722112	1722121	0 %	40 %	40 %	20 %	482883325
1511	NC_021081	GGGAC	2	10	1723240	1723249	20 %	0 %	60 %	20 %	482883326
1512	NC_021081	TGGCC	2	10	1723486	1723495	0 %	20 %	40 %	40 %	482883326
1513	NC_021081	CCGGG	2	10	1723522	1723531	0 %	0 %	60 %	40 %	482883326
1514	NC_021081	GCCCT	2	10	1723547	1723556	0 %	20 %	20 %	60 %	482883326
1515	NC_021081	ACCGT	2	10	1727069	1727078	20 %	20 %	20 %	40 %	482883330
1516	NC_021081	GCCCA	2	10	1727152	1727161	20 %	0 %	20 %	60 %	482883330
1517	NC_021081	GGTGG	2	10	1730533	1730542	0 %	20 %	80 %	0 %	482883334
1518	NC_021081	AAAAC	2	10	1731860	1731869	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1519	NC_021081	GCAGG	2	10	1732784	1732793	20 %	0 %	60 %	20 %	482883336
1520	NC_021081	GCTTT	2	10	1733039	1733048	0 %	60 %	20 %	20 %	482883336
1521	NC_021081	GATCC	2	10	1733520	1733529	20 %	20 %	20 %	40 %	482883336
1522	NC_021081	TATCG	2	10	1733822	1733831	20 %	40 %	20 %	20 %	482883337
1523	NC_021081	CGCTA	2	10	1734598	1734607	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1524	NC_021081	GCTCT	2	10	1734693	1734702	0 %	40 %	20 %	40 %	482883339
1525	NC_021081	TGTCC	2	10	1735777	1735786	0 %	40 %	20 %	40 %	482883340
1526	NC_021081	CTGGG	2	10	1736304	1736313	0 %	20 %	60 %	20 %	482883341
1527	NC_021081	GTGGC	2	10	1737232	1737241	0 %	20 %	60 %	20 %	482883342
1528	NC_021081	GCTGT	2	10	1738110	1738119	0 %	40 %	40 %	20 %	482883342
1529	NC_021081	AGTAA	2	10	1738564	1738573	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_021081	TTTTG	2	10	1738580	1738589	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_021081	CCGGC	2	10	1739973	1739982	0 %	0 %	40 %	60 %	482883346
1532	NC_021081	GGGGT	2	10	1740623	1740632	0 %	20 %	80 %	0 %	482883347
1533	NC_021081	CCCGT	2	10	1742341	1742350	0 %	20 %	20 %	60 %	482883347
1534	NC_021081	CACCC	2	10	1742836	1742845	20 %	0 %	0 %	80 %	482883347
1535	NC_021081	TTTCG	2	10	1744431	1744440	0 %	60 %	20 %	20 %	482883350
1536	NC_021081	GTTGA	2	10	1745530	1745539	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_021081	CAGCG	2	10	1746185	1746194	20 %	0 %	40 %	40 %	482883351
1538	NC_021081	GGGCC	2	10	1750052	1750061	0 %	0 %	60 %	40 %	482883356
1539	NC_021081	GCCCG	2	10	1750344	1750353	0 %	0 %	40 %	60 %	482883356
1540	NC_021081	CGGGC	2	10	1750676	1750685	0 %	0 %	60 %	40 %	482883356
1541	NC_021081	CAGCC	2	10	1752014	1752023	20 %	0 %	20 %	60 %	482883357
1542	NC_021081	TGGGC	2	10	1753942	1753951	0 %	20 %	60 %	20 %	482883359
1543	NC_021081	GGGTG	2	10	1754002	1754011	0 %	20 %	80 %	0 %	482883359
1544	NC_021081	GGGCA	2	10	1754638	1754647	20 %	0 %	60 %	20 %	482883360
1545	NC_021081	GCTTT	2	10	1756052	1756061	0 %	60 %	20 %	20 %	482883362
1546	NC_021081	GGCCC	2	10	1756233	1756242	0 %	0 %	40 %	60 %	482883363
1547	NC_021081	GGGCT	2	10	1756449	1756458	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1548	NC_021081	GGGCT	2	10	1757530	1757539	0 %	20 %	60 %	20 %	482883364
1549	NC_021081	ACCAG	2	10	1757869	1757878	40 %	0 %	20 %	40 %	482883365
1550	NC_021081	CCAGG	2	10	1757928	1757937	20 %	0 %	40 %	40 %	482883365
1551	NC_021081	GCCGG	2	10	1758143	1758152	0 %	0 %	60 %	40 %	482883365
1552	NC_021081	GCGCA	2	10	1760543	1760552	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1553	NC_021081	CGCTA	2	10	1761339	1761348	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1554	NC_021081	CAGCC	2	10	1761632	1761641	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1555	NC_021081	AGCGC	2	10	1762978	1762987	20 %	0 %	40 %	40 %	482883368
1556	NC_021081	GCCCT	2	10	1763189	1763198	0 %	20 %	20 %	60 %	482883368
1557	NC_021081	GCCCT	2	10	1766250	1766259	0 %	20 %	20 %	60 %	482883372
1558	NC_021081	CCACC	2	10	1768272	1768281	20 %	0 %	0 %	80 %	482883374
1559	NC_021081	GCGCT	2	10	1768548	1768557	0 %	20 %	40 %	40 %	482883374
1560	NC_021081	GAGCC	2	10	1770671	1770680	20 %	0 %	40 %	40 %	482883377
1561	NC_021081	CCATC	2	10	1770861	1770870	20 %	20 %	0 %	60 %	482883377
1562	NC_021081	GGCCG	2	10	1771026	1771035	0 %	0 %	60 %	40 %	482883377
1563	NC_021081	GCCCG	2	10	1771152	1771161	0 %	0 %	40 %	60 %	482883377
1564	NC_021081	TGATC	2	10	1771803	1771812	20 %	40 %	20 %	20 %	482883378
1565	NC_021081	TGGGC	2	10	1773651	1773660	0 %	20 %	60 %	20 %	482883379
1566	NC_021081	TGGGG	2	10	1773871	1773880	0 %	20 %	80 %	0 %	482883379
1567	NC_021081	GGCTG	2	10	1778776	1778785	0 %	20 %	60 %	20 %	482883384
1568	NC_021081	GCGAA	2	10	1779169	1779178	40 %	0 %	40 %	20 %	482883384
1569	NC_021081	CCCGG	2	10	1779252	1779261	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1570	NC_021081	CCGAA	2	10	1779882	1779891	40 %	0 %	20 %	40 %	482883385
1571	NC_021081	GCGCT	2	10	1780019	1780028	0 %	20 %	40 %	40 %	482883385
1572	NC_021081	TGGTG	2	10	1781028	1781037	0 %	40 %	60 %	0 %	482883385
1573	NC_021081	AACAA	2	10	1782201	1782210	80 %	0 %	0 %	20 %	482883386
1574	NC_021081	CCTCT	2	10	1783185	1783194	0 %	40 %	0 %	60 %	482883387
1575	NC_021081	TTGGG	2	10	1784057	1784066	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_021081	GTTGT	2	10	1784538	1784547	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_021081	AGCGG	2	10	1784751	1784760	20 %	0 %	60 %	20 %	482883388
1578	NC_021081	GGCCT	2	10	1785484	1785493	0 %	20 %	40 %	40 %	482883388
1579	NC_021081	TCGCT	2	10	1785802	1785811	0 %	40 %	20 %	40 %	482883389
1580	NC_021081	GCGCC	2	10	1788701	1788710	0 %	0 %	40 %	60 %	482883391
1581	NC_021081	GAAGA	2	10	1789100	1789109	60 %	0 %	40 %	0 %	482883392
1582	NC_021081	TACCC	2	10	1790182	1790191	20 %	20 %	0 %	60 %	482883392
1583	NC_021081	GCGGT	2	10	1794900	1794909	0 %	20 %	60 %	20 %	482883399
1584	NC_021081	GGGTG	2	10	1795798	1795807	0 %	20 %	80 %	0 %	482883400
1585	NC_021081	CTGGC	2	10	1797502	1797511	0 %	20 %	40 %	40 %	482883401
1586	NC_021081	GGCCG	2	10	1798903	1798912	0 %	0 %	60 %	40 %	482883402
1587	NC_021081	CCTGG	2	10	1803580	1803589	0 %	20 %	40 %	40 %	482883405
1588	NC_021081	CGGCC	2	10	1803788	1803797	0 %	0 %	40 %	60 %	482883405
1589	NC_021081	CGGCG	2	10	1806217	1806226	0 %	0 %	60 %	40 %	482883408
1590	NC_021081	ACCCG	2	10	1806782	1806791	20 %	0 %	20 %	60 %	482883409
1591	NC_021081	GGGCA	2	10	1808477	1808486	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1592	NC_021081	GATGC	2	10	1809205	1809214	20 %	20 %	40 %	20 %	482883410
1593	NC_021081	CAGTC	2	10	1810130	1810139	20 %	20 %	20 %	40 %	482883411
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1595	NC_021081	TGGGG	2	10	1814505	1814514	0 %	20 %	80 %	0 %	482883414
1596	NC_021081	AGACC	2	10	1815619	1815628	40 %	0 %	20 %	40 %	482883416
1597	NC_021081	GCCTG	2	10	1819179	1819188	0 %	20 %	40 %	40 %	482883421
1598	NC_021081	GTGGC	2	10	1819904	1819913	0 %	20 %	60 %	20 %	482883421
1599	NC_021081	GGGGT	2	10	1820608	1820617	0 %	20 %	80 %	0 %	482883422
1600	NC_021081	GGCGA	2	10	1821038	1821047	20 %	0 %	60 %	20 %	482883422
1601	NC_021081	TGGGC	2	10	1821087	1821096	0 %	20 %	60 %	20 %	482883423
1602	NC_021081	CCCTG	2	10	1824059	1824068	0 %	20 %	20 %	60 %	482883425
1603	NC_021081	TCCAA	2	10	1827051	1827060	40 %	20 %	0 %	40 %	482883428
1604	NC_021081	GCAGG	2	10	1827540	1827549	20 %	0 %	60 %	20 %	482883430
1605	NC_021081	CTTTG	2	10	1831232	1831241	0 %	60 %	20 %	20 %	482883433
1606	NC_021081	TCTGG	2	10	1832510	1832519	0 %	40 %	40 %	20 %	482883435
1607	NC_021081	GGCCC	2	10	1835775	1835784	0 %	0 %	40 %	60 %	482883438
1608	NC_021081	CCGGG	2	10	1835956	1835965	0 %	0 %	60 %	40 %	482883439
1609	NC_021081	GCCAT	2	10	1836177	1836186	20 %	20 %	20 %	40 %	482883439
1610	NC_021081	CGGCC	2	10	1837458	1837467	0 %	0 %	40 %	60 %	482883440
1611	NC_021081	GCACC	2	10	1838539	1838548	20 %	0 %	20 %	60 %	482883441
1612	NC_021081	CCATC	2	10	1838810	1838819	20 %	20 %	0 %	60 %	482883442
1613	NC_021081	CTTCG	2	10	1840289	1840298	0 %	40 %	20 %	40 %	482883443
1614	NC_021081	GGCCG	2	10	1840552	1840561	0 %	0 %	60 %	40 %	482883444
1615	NC_021081	CGGCG	2	10	1840709	1840718	0 %	0 %	60 %	40 %	482883444
1616	NC_021081	CCAGG	2	10	1840957	1840966	20 %	0 %	40 %	40 %	482883444
1617	NC_021081	CGGCT	2	10	1841632	1841641	0 %	20 %	40 %	40 %	482883445
1618	NC_021081	CCTTC	2	10	1842630	1842639	0 %	40 %	0 %	60 %	482883447
1619	NC_021081	GGGCT	2	10	1844948	1844957	0 %	20 %	60 %	20 %	482883448
1620	NC_021081	ACCGC	2	10	1845057	1845066	20 %	0 %	20 %	60 %	482883448
1621	NC_021081	CCAGC	2	10	1847962	1847971	20 %	0 %	20 %	60 %	482883451
1622	NC_021081	GGGGA	2	10	1851223	1851232	20 %	0 %	80 %	0 %	482883456
1623	NC_021081	TCAGG	2	10	1852269	1852278	20 %	20 %	40 %	20 %	482883457
1624	NC_021081	GGCCA	2	10	1852432	1852441	20 %	0 %	40 %	40 %	482883457
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1626	NC_021081	AGGCA	2	10	1855731	1855740	40 %	0 %	40 %	20 %	482883460
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1999	NC_021081	GGCTG	2	10	2318458	2318467	0 %	20 %	60 %	20 %	482883933
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