MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 2629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021081	GCCCA	2	10	556894	556903	20 %	0 %	20 %	60 %	482882192
502	NC_021081	AGACC	2	10	557077	557086	40 %	0 %	20 %	40 %	482882193
503	NC_021081	CAAGG	2	10	557815	557824	40 %	0 %	40 %	20 %	482882193
504	NC_021081	CTCCC	2	10	557933	557942	0 %	20 %	0 %	80 %	482882194
505	NC_021081	CCCAT	2	10	557982	557991	20 %	20 %	0 %	60 %	482882194
506	NC_021081	TGGGT	2	10	558822	558831	0 %	40 %	60 %	0 %	482882194
507	NC_021081	TAGCG	2	10	560713	560722	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
508	NC_021081	CAGGG	2	10	561634	561643	20 %	0 %	60 %	20 %	482882198
509	NC_021081	CGGGG	2	10	567517	567526	0 %	0 %	80 %	20 %	482882205
510	NC_021081	GCCCT	2	10	567910	567919	0 %	20 %	20 %	60 %	482882205
511	NC_021081	CAGCG	2	10	568390	568399	20 %	0 %	40 %	40 %	482882205
512	NC_021081	TGCTA	2	10	570130	570139	20 %	40 %	20 %	20 %	482882207
513	NC_021081	GTCGC	2	10	571101	571110	0 %	20 %	40 %	40 %	482882207
514	NC_021081	TGAGC	2	10	571204	571213	20 %	20 %	40 %	20 %	482882207
515	NC_021081	TGCCC	2	10	573622	573631	0 %	20 %	20 %	60 %	482882210
516	NC_021081	CCGGG	2	10	576817	576826	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
517	NC_021081	AAGGT	2	10	576866	576875	40 %	20 %	40 %	0 %	482882213
518	NC_021081	TGGCC	2	10	577805	577814	0 %	20 %	40 %	40 %	482882215
519	NC_021081	CCGCA	2	10	579527	579536	20 %	0 %	20 %	60 %	482882217
520	NC_021081	GCAGC	2	10	579611	579620	20 %	0 %	40 %	40 %	482882217
521	NC_021081	CATGG	2	10	579818	579827	20 %	20 %	40 %	20 %	482882217
522	NC_021081	TACCC	2	10	581720	581729	20 %	20 %	0 %	60 %	482882220
523	NC_021081	GGCCG	2	10	583308	583317	0 %	0 %	60 %	40 %	482882221
524	NC_021081	CCACC	2	10	586741	586750	20 %	0 %	0 %	80 %	482882225
525	NC_021081	GCGTC	2	10	587165	587174	0 %	20 %	40 %	40 %	482882226
526	NC_021081	GAGCA	2	10	587502	587511	40 %	0 %	40 %	20 %	482882226
527	NC_021081	CGGCC	2	10	588644	588653	0 %	0 %	40 %	60 %	482882227
528	NC_021081	CGGCC	2	10	589889	589898	0 %	0 %	40 %	60 %	482882228
529	NC_021081	CGTCT	2	10	591176	591185	0 %	40 %	20 %	40 %	482882229
530	NC_021081	GGCCA	2	10	592389	592398	20 %	0 %	40 %	40 %	482882230
531	NC_021081	CATAC	2	10	593088	593097	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
532	NC_021081	CGGGG	2	10	596728	596737	0 %	0 %	80 %	20 %	482882237
533	NC_021081	CGCAG	2	10	597169	597178	20 %	0 %	40 %	40 %	482882237
534	NC_021081	GCGGT	2	10	600198	600207	0 %	20 %	60 %	20 %	482882240
535	NC_021081	GCCCC	2	10	601331	601340	0 %	0 %	20 %	80 %	482882243
536	NC_021081	TTGGT	2	10	604105	604114	0 %	60 %	40 %	0 %	482882247
537	NC_021081	CTGGC	2	10	607176	607185	0 %	20 %	40 %	40 %	482882250
538	NC_021081	CCCCA	2	10	607432	607441	20 %	0 %	0 %	80 %	482882251
539	NC_021081	CCCCA	2	10	607452	607461	20 %	0 %	0 %	80 %	482882251
540	NC_021081	GCCGG	3	15	608405	608419	0 %	0 %	60 %	40 %	482882251
541	NC_021081	GCGCC	2	10	608775	608784	0 %	0 %	40 %	60 %	482882251
542	NC_021081	GCGAT	2	10	609206	609215	20 %	20 %	40 %	20 %	482882252
543	NC_021081	GGCTG	2	10	609558	609567	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
544	NC_021081	CGCGC	2	10	610250	610259	0 %	0 %	40 %	60 %	482882254
545	NC_021081	CGGGG	2	10	611418	611427	0 %	0 %	80 %	20 %	482882254
546	NC_021081	GGGCT	2	10	612973	612982	0 %	20 %	60 %	20 %	482882256
547	NC_021081	GCCCA	2	10	613311	613320	20 %	0 %	20 %	60 %	482882256
548	NC_021081	GCTTC	2	10	613564	613573	0 %	40 %	20 %	40 %	482882256
549	NC_021081	TCTGG	2	10	615583	615592	0 %	40 %	40 %	20 %	482882258
550	NC_021081	GGGCT	2	10	616061	616070	0 %	20 %	60 %	20 %	482882259
551	NC_021081	GGATA	2	10	616593	616602	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021081	TGCCA	2	10	617487	617496	20 %	20 %	20 %	40 %	482882260
553	NC_021081	GACCT	2	10	617532	617541	20 %	20 %	20 %	40 %	482882260
554	NC_021081	GGGGA	2	10	621972	621981	20 %	0 %	80 %	0 %	482882263
555	NC_021081	ACCTC	2	10	623600	623609	20 %	20 %	0 %	60 %	482882266
556	NC_021081	AAGTT	2	10	625628	625637	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021081	GACCT	2	10	626404	626413	20 %	20 %	20 %	40 %	482882269
558	NC_021081	GCTTT	2	10	626610	626619	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
559	NC_021081	TGGCC	2	10	628339	628348	0 %	20 %	40 %	40 %	482882271
560	NC_021081	GCTGG	2	10	628965	628974	0 %	20 %	60 %	20 %	482882272
561	NC_021081	GCCTG	2	10	629237	629246	0 %	20 %	40 %	40 %	482882272
562	NC_021081	CGAGC	2	10	629590	629599	20 %	0 %	40 %	40 %	482882272
563	NC_021081	TCTGC	2	10	629664	629673	0 %	40 %	20 %	40 %	482882272
564	NC_021081	GCTGG	2	10	629928	629937	0 %	20 %	60 %	20 %	482882272
565	NC_021081	GCCCG	2	10	630654	630663	0 %	0 %	40 %	60 %	482882273
566	NC_021081	CACCT	2	10	633391	633400	20 %	20 %	0 %	60 %	482882278
567	NC_021081	AGGGC	2	10	634206	634215	20 %	0 %	60 %	20 %	482882279
568	NC_021081	GCCCA	2	10	634432	634441	20 %	0 %	20 %	60 %	482882279
569	NC_021081	GGCCG	2	10	635449	635458	0 %	0 %	60 %	40 %	482882279
570	NC_021081	GGCCC	2	10	635639	635648	0 %	0 %	40 %	60 %	482882280
571	NC_021081	CCCGG	2	10	635824	635833	0 %	0 %	40 %	60 %	482882280
572	NC_021081	GGCCT	2	10	639462	639471	0 %	20 %	40 %	40 %	482882284
573	NC_021081	CCCGG	2	10	641657	641666	0 %	0 %	40 %	60 %	482882285
574	NC_021081	GGGCC	2	10	642375	642384	0 %	0 %	60 %	40 %	482882286
575	NC_021081	GATGG	2	10	643337	643346	20 %	20 %	60 %	0 %	482882287
576	NC_021081	GCCGC	2	10	643822	643831	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
577	NC_021081	TGCCG	2	10	644828	644837	0 %	20 %	40 %	40 %	482882288
578	NC_021081	GCCGT	2	10	646262	646271	0 %	20 %	40 %	40 %	482882290
579	NC_021081	GGCCC	2	10	646557	646566	0 %	0 %	40 %	60 %	482882290
580	NC_021081	TGGGC	2	10	647541	647550	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
581	NC_021081	GCCCG	2	10	648626	648635	0 %	0 %	40 %	60 %	482882293
582	NC_021081	CCGGG	2	10	652382	652391	0 %	0 %	60 %	40 %	482882296
583	NC_021081	CGGGC	2	10	652599	652608	0 %	0 %	60 %	40 %	482882296
584	NC_021081	CCAGG	2	10	654708	654717	20 %	0 %	40 %	40 %	482882298
585	NC_021081	TGTCC	2	10	656585	656594	0 %	40 %	20 %	40 %	482882298
586	NC_021081	GGCCA	2	10	658238	658247	20 %	0 %	40 %	40 %	482882299
587	NC_021081	AGCCC	2	10	658639	658648	20 %	0 %	20 %	60 %	482882299
588	NC_021081	CTCGA	2	10	658809	658818	20 %	20 %	20 %	40 %	482882299
589	NC_021081	GCCCA	2	10	658958	658967	20 %	0 %	20 %	60 %	482882299
590	NC_021081	GCCCA	2	10	659651	659660	20 %	0 %	20 %	60 %	482882299
591	NC_021081	AGGCC	2	10	659929	659938	20 %	0 %	40 %	40 %	482882299
592	NC_021081	TGGCC	2	10	660154	660163	0 %	20 %	40 %	40 %	482882299
593	NC_021081	TGGGC	2	10	660313	660322	0 %	20 %	60 %	20 %	482882299
594	NC_021081	CCCGG	2	10	660928	660937	0 %	0 %	40 %	60 %	482882299
595	NC_021081	CGTAG	2	10	661839	661848	20 %	20 %	40 %	20 %	482882299
596	NC_021081	GGCCC	2	10	662006	662015	0 %	0 %	40 %	60 %	482882299
597	NC_021081	CCCAG	2	10	663088	663097	20 %	0 %	20 %	60 %	482882299
598	NC_021081	CACCC	2	10	663637	663646	20 %	0 %	0 %	80 %	482882300
599	NC_021081	CCAGG	2	10	665833	665842	20 %	0 %	40 %	40 %	482882300
600	NC_021081	AGCGC	2	10	667359	667368	20 %	0 %	40 %	40 %	482882301
601	NC_021081	GATGG	2	10	668700	668709	20 %	20 %	60 %	0 %	482882301
602	NC_021081	ACCTG	2	10	669074	669083	20 %	20 %	20 %	40 %	482882302
603	NC_021081	ACGGT	2	10	669116	669125	20 %	20 %	40 %	20 %	482882302
604	NC_021081	GCCCA	2	10	671610	671619	20 %	0 %	20 %	60 %	482882305
605	NC_021081	GGCCG	2	10	671792	671801	0 %	0 %	60 %	40 %	482882305
606	NC_021081	GTGCG	2	10	672585	672594	0 %	20 %	60 %	20 %	482882306
607	NC_021081	CTACC	2	10	674224	674233	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
608	NC_021081	GGCCC	2	10	674930	674939	0 %	0 %	40 %	60 %	482882308
609	NC_021081	CCGGG	2	10	675184	675193	0 %	0 %	60 %	40 %	482882308
610	NC_021081	CCGCA	2	10	678355	678364	20 %	0 %	20 %	60 %	482882312
611	NC_021081	CGGTG	2	10	679694	679703	0 %	20 %	60 %	20 %	482882313
612	NC_021081	CGCAG	2	10	682773	682782	20 %	0 %	40 %	40 %	482882315
613	NC_021081	CCTGG	2	10	683329	683338	0 %	20 %	40 %	40 %	482882316
614	NC_021081	CAGGG	2	10	686686	686695	20 %	0 %	60 %	20 %	482882318
615	NC_021081	CGGGC	2	10	690531	690540	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
616	NC_021081	GGGGC	2	10	690773	690782	0 %	0 %	80 %	20 %	482882322
617	NC_021081	CTCCA	2	10	692272	692281	20 %	20 %	0 %	60 %	482882323
618	NC_021081	CGGCG	2	10	692475	692484	0 %	0 %	60 %	40 %	482882323
619	NC_021081	GCCCC	2	10	693258	693267	0 %	0 %	20 %	80 %	482882323
620	NC_021081	CCCGG	2	10	694302	694311	0 %	0 %	40 %	60 %	482882324
621	NC_021081	CCCGC	2	10	694318	694327	0 %	0 %	20 %	80 %	482882324
622	NC_021081	CTTCG	2	10	695278	695287	0 %	40 %	20 %	40 %	482882324
623	NC_021081	GCCCA	2	10	697131	697140	20 %	0 %	20 %	60 %	482882326
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625	NC_021081	GCCCT	2	10	707437	707446	0 %	20 %	20 %	60 %	482882339
626	NC_021081	GGGTT	2	10	707596	707605	0 %	40 %	60 %	0 %	482882339
627	NC_021081	CAGGG	2	10	707737	707746	20 %	0 %	60 %	20 %	482882339
628	NC_021081	GGGCC	2	10	707910	707919	0 %	0 %	60 %	40 %	482882339
629	NC_021081	GCGGG	2	10	708720	708729	0 %	0 %	80 %	20 %	482882339
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