MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 2629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021081	CAGGG	2	10	1160916	1160925	20 %	0 %	60 %	20 %	482882768
1002	NC_021081	CTTGT	2	10	1161028	1161037	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1003	NC_021081	GGCCC	2	10	1161899	1161908	0 %	0 %	40 %	60 %	482882770
1004	NC_021081	GTAGG	2	10	1164003	1164012	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021081	GGTGC	2	10	1164632	1164641	0 %	20 %	60 %	20 %	482882772
1006	NC_021081	CCCGC	2	10	1165367	1165376	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1007	NC_021081	GGCGG	2	10	1165380	1165389	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1008	NC_021081	CTATG	2	10	1165513	1165522	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1009	NC_021081	CGGCG	2	10	1171338	1171347	0 %	0 %	60 %	40 %	482882777
1010	NC_021081	CACCG	2	10	1171566	1171575	20 %	0 %	20 %	60 %	482882777
1011	NC_021081	GGCTG	2	10	1172998	1173007	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1012	NC_021081	GCTAC	2	10	1173292	1173301	20 %	20 %	20 %	40 %	482882779
1013	NC_021081	CTGGG	2	10	1173909	1173918	0 %	20 %	60 %	20 %	482882780
1014	NC_021081	CCCGC	2	10	1175084	1175093	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1015	NC_021081	CCTGC	2	10	1175422	1175431	0 %	20 %	20 %	60 %	482882783
1016	NC_021081	GGAAG	2	10	1177082	1177091	40 %	0 %	60 %	0 %	482882784
1017	NC_021081	GGGTG	2	10	1177529	1177538	0 %	20 %	80 %	0 %	482882785
1018	NC_021081	GGCCC	2	10	1177968	1177977	0 %	0 %	40 %	60 %	482882786
1019	NC_021081	CGACC	2	10	1179607	1179616	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1020	NC_021081	CCGCA	2	10	1179657	1179666	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1021	NC_021081	GCCAG	2	10	1181757	1181766	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1022	NC_021081	CCGGC	2	10	1182085	1182094	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1023	NC_021081	CCGGG	2	10	1182259	1182268	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1024	NC_021081	CGGGC	3	15	1182384	1182398	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1025	NC_021081	CCCGG	2	10	1183072	1183081	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1026	NC_021081	CTGGG	2	10	1183559	1183568	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1027	NC_021081	GCGCC	2	10	1184374	1184383	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1028	NC_021081	GCCGC	2	10	1186254	1186263	0 %	0 %	40 %	60 %	482882787
1029	NC_021081	CAGGC	2	10	1187200	1187209	20 %	0 %	40 %	40 %	482882787
1030	NC_021081	AGCCC	2	10	1189541	1189550	20 %	0 %	20 %	60 %	482882790
1031	NC_021081	CAGCG	2	10	1189558	1189567	20 %	0 %	40 %	40 %	482882790
1032	NC_021081	TGTGG	2	10	1191261	1191270	0 %	40 %	60 %	0 %	482882790
1033	NC_021081	CTTCA	2	10	1191550	1191559	20 %	40 %	0 %	40 %	482882790
1034	NC_021081	GCGCC	2	10	1191756	1191765	0 %	0 %	40 %	60 %	482882790
1035	NC_021081	CCCAA	2	10	1196262	1196271	40 %	0 %	0 %	60 %	482882794
1036	NC_021081	CACCC	2	10	1197556	1197565	20 %	0 %	0 %	80 %	482882795
1037	NC_021081	AGCTG	2	10	1198719	1198728	20 %	20 %	40 %	20 %	482882795
1038	NC_021081	CCCTG	2	10	1198977	1198986	0 %	20 %	20 %	60 %	482882795
1039	NC_021081	GCCCC	2	10	1199091	1199100	0 %	0 %	20 %	80 %	482882795
1040	NC_021081	CCCAT	2	10	1201777	1201786	20 %	20 %	0 %	60 %	482882797
1041	NC_021081	GCGGA	2	10	1202685	1202694	20 %	0 %	60 %	20 %	482882797
1042	NC_021081	AGCCC	2	10	1203166	1203175	20 %	0 %	20 %	60 %	482882797
1043	NC_021081	TCCCC	2	10	1203435	1203444	0 %	20 %	0 %	80 %	482882798
1044	NC_021081	TCCCG	2	10	1204964	1204973	0 %	20 %	20 %	60 %	482882799
1045	NC_021081	GGCGG	2	10	1205253	1205262	0 %	0 %	80 %	20 %	482882799
1046	NC_021081	CCCCG	2	10	1206513	1206522	0 %	0 %	20 %	80 %	482882799
1047	NC_021081	GGGCC	2	10	1207744	1207753	0 %	0 %	60 %	40 %	482882800
1048	NC_021081	TAGCC	2	10	1212162	1212171	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1049	NC_021081	GCCCC	2	10	1212607	1212616	0 %	0 %	20 %	80 %	482882804
1050	NC_021081	CGGCG	2	10	1213080	1213089	0 %	0 %	60 %	40 %	482882804
1051	NC_021081	CCTCA	2	10	1214111	1214120	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1052	NC_021081	GCCAG	2	10	1214387	1214396	20 %	0 %	40 %	40 %	482882806
1053	NC_021081	CCCTG	2	10	1215424	1215433	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1054	NC_021081	CCGGG	2	10	1215910	1215919	0 %	0 %	60 %	40 %	482882807
1055	NC_021081	AGATG	2	10	1218960	1218969	40 %	20 %	40 %	0 %	482882810
1056	NC_021081	CAAGC	2	10	1219184	1219193	40 %	0 %	20 %	40 %	482882811
1057	NC_021081	CCGCT	2	10	1221957	1221966	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1058	NC_021081	CGGCG	2	10	1225111	1225120	0 %	0 %	60 %	40 %	482882818
1059	NC_021081	CCTTC	2	10	1226520	1226529	0 %	40 %	0 %	60 %	482882820
1060	NC_021081	CTGGC	2	10	1226614	1226623	0 %	20 %	40 %	40 %	482882820
1061	NC_021081	CCAGG	2	10	1226689	1226698	20 %	0 %	40 %	40 %	482882820
1062	NC_021081	GGCAA	2	10	1226957	1226966	40 %	0 %	40 %	20 %	482882820
1063	NC_021081	CAATC	2	10	1227552	1227561	40 %	20 %	0 %	40 %	482882820
1064	NC_021081	TGGGG	2	10	1228861	1228870	0 %	20 %	80 %	0 %	482882821
1065	NC_021081	GGCCG	2	10	1229351	1229360	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1066	NC_021081	ACCCC	2	10	1229418	1229427	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1067	NC_021081	CTGGG	2	10	1230348	1230357	0 %	20 %	60 %	20 %	482882822
1068	NC_021081	GCGGG	2	10	1235383	1235392	0 %	0 %	80 %	20 %	482882827
1069	NC_021081	CCTGG	2	10	1236167	1236176	0 %	20 %	40 %	40 %	482882828
1070	NC_021081	GGAGC	2	10	1236256	1236265	20 %	0 %	60 %	20 %	482882828
1071	NC_021081	TGCCC	2	10	1236798	1236807	0 %	20 %	20 %	60 %	482882829
1072	NC_021081	GGATG	2	10	1237519	1237528	20 %	20 %	60 %	0 %	482882830
1073	NC_021081	CAACT	2	10	1238081	1238090	40 %	20 %	0 %	40 %	482882831
1074	NC_021081	GGGGC	2	10	1238595	1238604	0 %	0 %	80 %	20 %	482882831
1075	NC_021081	GCCAG	2	10	1239962	1239971	20 %	0 %	40 %	40 %	482882833
1076	NC_021081	AGGGC	2	10	1240277	1240286	20 %	0 %	60 %	20 %	482882833
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1078	NC_021081	GAAAA	2	10	1244345	1244354	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_021081	ACCGC	2	10	1245372	1245381	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1080	NC_021081	GGTTG	2	10	1245402	1245411	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_021081	CGGAT	2	10	1245983	1245992	20 %	20 %	40 %	20 %	482882838
1082	NC_021081	GGGTG	2	10	1246632	1246641	0 %	20 %	80 %	0 %	482882838
1083	NC_021081	ACCCC	2	10	1247205	1247214	20 %	0 %	0 %	80 %	482882838
1084	NC_021081	GGGTG	2	10	1248511	1248520	0 %	20 %	80 %	0 %	482882839
1085	NC_021081	GTACC	2	10	1248634	1248643	20 %	20 %	20 %	40 %	482882839
1086	NC_021081	CCCAG	2	10	1249357	1249366	20 %	0 %	20 %	60 %	482882839
1087	NC_021081	GCCGG	2	10	1249816	1249825	0 %	0 %	60 %	40 %	482882839
1088	NC_021081	CTGGA	2	10	1251347	1251356	20 %	20 %	40 %	20 %	482882840
1089	NC_021081	GCTAG	2	10	1251752	1251761	20 %	20 %	40 %	20 %	482882840
1090	NC_021081	GCTGG	2	10	1253081	1253090	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1091	NC_021081	TAGCG	2	10	1254170	1254179	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1092	NC_021081	GCCGG	2	10	1254973	1254982	0 %	0 %	60 %	40 %	482882844
1093	NC_021081	TCTGG	2	10	1256655	1256664	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1094	NC_021081	TGGGG	2	10	1259374	1259383	0 %	20 %	80 %	0 %	482882848
1095	NC_021081	AGACC	2	10	1259814	1259823	40 %	0 %	20 %	40 %	482882849
1096	NC_021081	AGAGC	2	10	1260465	1260474	40 %	0 %	40 %	20 %	482882849
1097	NC_021081	AAGCA	2	10	1261841	1261850	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1098	NC_021081	GCCGG	2	10	1262586	1262595	0 %	0 %	60 %	40 %	482882851
1099	NC_021081	ACCGT	2	10	1266047	1266056	20 %	20 %	20 %	40 %	482882852
1100	NC_021081	TGCCC	2	10	1268702	1268711	0 %	20 %	20 %	60 %	482882853
1101	NC_021081	CGGTG	2	10	1269156	1269165	0 %	20 %	60 %	20 %	482882854
1102	NC_021081	AGGCC	2	10	1271042	1271051	20 %	0 %	40 %	40 %	482882855
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1104	NC_021081	GCCGG	2	10	1273061	1273070	0 %	0 %	60 %	40 %	482882857
1105	NC_021081	GGCCT	2	10	1276207	1276216	0 %	20 %	40 %	40 %	482882860
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1107	NC_021081	GTGGC	2	10	1279303	1279312	0 %	20 %	60 %	20 %	482882862
1108	NC_021081	CAGGG	2	10	1279323	1279332	20 %	0 %	60 %	20 %	482882862
1109	NC_021081	CCTGG	2	10	1282631	1282640	0 %	20 %	40 %	40 %	482882866
1110	NC_021081	GCGGT	2	10	1283368	1283377	0 %	20 %	60 %	20 %	482882866
1111	NC_021081	CTGGC	2	10	1284432	1284441	0 %	20 %	40 %	40 %	482882867
1112	NC_021081	GGCTG	2	10	1284710	1284719	0 %	20 %	60 %	20 %	482882868
1113	NC_021081	CAGCC	2	10	1284849	1284858	20 %	0 %	20 %	60 %	482882868
1114	NC_021081	AAGGG	2	10	1285573	1285582	40 %	0 %	60 %	0 %	482882869
1115	NC_021081	GCGCT	2	10	1285772	1285781	0 %	20 %	40 %	40 %	482882869
1116	NC_021081	GGGTA	2	10	1286921	1286930	20 %	20 %	60 %	0 %	482882871
1117	NC_021081	AGGTC	2	10	1287032	1287041	20 %	20 %	40 %	20 %	482882871
1118	NC_021081	GCCGG	2	10	1287570	1287579	0 %	0 %	60 %	40 %	482882871
1119	NC_021081	AGCTC	2	10	1288031	1288040	20 %	20 %	20 %	40 %	482882872
1120	NC_021081	CCCGG	2	10	1289256	1289265	0 %	0 %	40 %	60 %	482882873
1121	NC_021081	CGGCC	2	10	1290348	1290357	0 %	0 %	40 %	60 %	482882874
1122	NC_021081	CCGGC	2	10	1291928	1291937	0 %	0 %	40 %	60 %	482882876
1123	NC_021081	GGGGT	2	10	1292217	1292226	0 %	20 %	80 %	0 %	482882876
1124	NC_021081	CCAGG	2	10	1292432	1292441	20 %	0 %	40 %	40 %	482882876
1125	NC_021081	CCAGC	2	10	1293592	1293601	20 %	0 %	20 %	60 %	482882877
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