MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 47741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016112	AAT	2	6	152	157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403389
2	NC_016112	AAC	2	6	171	176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403389
3	NC_016112	TTC	2	6	203	208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403389
4	NC_016112	TTA	2	6	270	275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403389
5	NC_016112	CAT	2	6	312	317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403389
6	NC_016112	TAA	2	6	464	469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403389
7	NC_016112	TTA	2	6	570	575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403389
8	NC_016112	ACA	2	6	710	715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403389
9	NC_016112	GAG	2	6	748	753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403389
10	NC_016112	AAG	2	6	808	813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403389
11	NC_016112	GTT	2	6	836	841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403389
12	NC_016112	TCG	2	6	892	897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403389
13	NC_016112	ATG	2	6	999	1004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403389
14	NC_016112	ACG	2	6	1088	1093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403389
15	NC_016112	CAC	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403389
16	NC_016112	AAG	2	6	1147	1152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403389
17	NC_016112	TCG	2	6	1251	1256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403389
18	NC_016112	CAC	2	6	1370	1375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403389
19	NC_016112	CCT	2	6	1402	1407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357403389
20	NC_016112	ATT	2	6	1438	1443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403389
21	NC_016112	GCA	2	6	1699	1704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403390
22	NC_016112	TTG	2	6	1895	1900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403390
23	NC_016112	CGA	2	6	1933	1938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403390
24	NC_016112	ATC	2	6	2028	2033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403390
25	NC_016112	TAT	2	6	2111	2116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403390
26	NC_016112	ATC	2	6	2234	2239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403390
27	NC_016112	GAT	2	6	2279	2284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403390
28	NC_016112	TAA	2	6	2317	2322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403390
29	NC_016112	AAT	2	6	2339	2344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403390
30	NC_016112	TCA	2	6	2401	2406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403390
31	NC_016112	TTA	2	6	2441	2446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403390
32	NC_016112	TTC	2	6	2512	2517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403390
33	NC_016112	GAA	2	6	2555	2560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403390
34	NC_016112	GAA	3	9	2564	2572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403390
35	NC_016112	TGC	2	6	2693	2698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403390
36	NC_016112	ATT	2	6	2699	2704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403390
37	NC_016112	GCA	2	6	3454	3459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403391
38	NC_016112	AGA	2	6	3612	3617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403391
39	NC_016112	AAT	2	6	3747	3752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403391
40	NC_016112	ATT	2	6	3871	3876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403391
41	NC_016112	GAT	2	6	3918	3923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403391
42	NC_016112	ATT	2	6	4076	4081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403391
43	NC_016112	GAT	2	6	4119	4124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403391
44	NC_016112	CTG	2	6	4129	4134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403391
45	NC_016112	CAT	2	6	4458	4463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403392
46	NC_016112	GTG	2	6	4476	4481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403392
47	NC_016112	AAG	2	6	4519	4524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403392
48	NC_016112	TTA	2	6	4531	4536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403392
49	NC_016112	ATG	2	6	4543	4548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403392
50	NC_016112	GAC	2	6	4566	4571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403392
51	NC_016112	TCA	2	6	4627	4632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403392
52	NC_016112	TGC	2	6	4639	4644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403392
53	NC_016112	CGG	2	6	4649	4654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403392
54	NC_016112	GAG	2	6	4731	4736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403392
55	NC_016112	GGC	2	6	5004	5009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403392
56	NC_016112	AAG	2	6	5086	5091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403392
57	NC_016112	AAT	2	6	5157	5162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403392
58	NC_016112	CGG	2	6	5177	5182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403392
59	NC_016112	CGA	2	6	5272	5277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403392
60	NC_016112	TGA	2	6	5282	5287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403392
61	NC_016112	CGA	2	6	5398	5403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403392
62	NC_016112	ATC	2	6	5469	5474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403392
63	NC_016112	CGG	2	6	5626	5631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403392
64	NC_016112	TCG	2	6	5657	5662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403392
65	NC_016112	AGA	2	6	5738	5743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403392
66	NC_016112	CAT	4	12	5822	5833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403392
67	NC_016112	TTC	2	6	5883	5888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403392
68	NC_016112	ATC	2	6	5907	5912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403392
69	NC_016112	CCG	2	6	5940	5945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403392
70	NC_016112	AAG	2	6	5958	5963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403392
71	NC_016112	TGC	2	6	6040	6045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403392
72	NC_016112	CGA	2	6	6050	6055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403392
73	NC_016112	ACG	2	6	6148	6153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403392
74	NC_016112	AAC	2	6	6166	6171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403392
75	NC_016112	CGA	2	6	6194	6199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403392
76	NC_016112	GGC	2	6	6224	6229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403392
77	NC_016112	TTC	2	6	6381	6386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403392
78	NC_016112	CCG	2	6	6430	6435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403392
79	NC_016112	GAT	2	6	6515	6520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403392
80	NC_016112	GCC	2	6	6616	6621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403392
81	NC_016112	CGC	2	6	6653	6658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403392
82	NC_016112	CGA	2	6	6659	6664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403392
83	NC_016112	GCA	2	6	7263	7268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403393
84	NC_016112	CAT	2	6	7306	7311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403393
85	NC_016112	ATC	2	6	7380	7385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403393
86	NC_016112	TTG	2	6	7389	7394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403393
87	NC_016112	GCA	2	6	7403	7408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403393
88	NC_016112	CGA	2	6	7591	7596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403394
89	NC_016112	CGC	2	6	7639	7644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403394
90	NC_016112	ACG	3	9	7647	7655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403394
91	NC_016112	ACG	2	6	7715	7720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403394
92	NC_016112	CTG	2	6	7721	7726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403394
93	NC_016112	CCG	2	6	7817	7822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403394
94	NC_016112	CAC	2	6	7869	7874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403394
95	NC_016112	TGC	2	6	8012	8017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403395
96	NC_016112	CTG	2	6	8018	8023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403395
97	NC_016112	TCG	2	6	8058	8063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403395
98	NC_016112	AGT	2	6	8278	8283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403395
99	NC_016112	CAG	2	6	8350	8355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403395
100	NC_016112	TTG	2	6	8555	8560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403395
101	NC_016112	CAA	2	6	8818	8823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403395
102	NC_016112	CGG	2	6	8878	8883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403395
103	NC_016112	CCG	2	6	9030	9035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403395
104	NC_016112	GAA	2	6	9056	9061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403395
105	NC_016112	ATT	2	6	9115	9120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403395
106	NC_016112	CAA	2	6	9140	9145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403395
107	NC_016112	GCG	2	6	9305	9310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403396
108	NC_016112	CCG	2	6	9478	9483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403396
109	NC_016112	TAT	2	6	9495	9500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403396
110	NC_016112	ATT	2	6	9570	9575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403396
111	NC_016112	ATT	2	6	9597	9602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403396
112	NC_016112	GCA	2	6	9681	9686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403396
113	NC_016112	ATT	2	6	9694	9699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403396
114	NC_016112	GAA	2	6	9715	9720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403396
115	NC_016112	ATT	2	6	9771	9776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403396
116	NC_016112	TTA	2	6	9814	9819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403396
117	NC_016112	TGT	2	6	9923	9928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403396
118	NC_016112	CGA	2	6	9987	9992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403396
119	NC_016112	CAA	2	6	10072	10077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403396
120	NC_016112	GTC	2	6	10156	10161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403396
121	NC_016112	CGG	2	6	10199	10204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403396
122	NC_016112	AGT	2	6	10296	10301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403396
123	NC_016112	ATC	2	6	10316	10321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403396
124	NC_016112	GGC	3	9	10470	10478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403397
125	NC_016112	GAA	2	6	10572	10577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403397
126	NC_016112	GCT	2	6	10613	10618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403397
127	NC_016112	TGC	2	6	10639	10644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403397
128	NC_016112	GAC	2	6	10793	10798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403397
129	NC_016112	GAG	2	6	10834	10839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403397
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133	NC_016112	GGT	2	6	11237	11242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403397
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142	NC_016112	ATC	2	6	11628	11633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403397
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244	NC_016112	ACG	3	9	20168	20176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403402
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248	NC_016112	ATC	2	6	20461	20466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403402
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251	NC_016112	CAA	2	6	20671	20676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403402
252	NC_016112	ACC	2	6	20770	20775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403402
253	NC_016112	GTG	2	6	20779	20784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403402
254	NC_016112	GCG	2	6	20876	20881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403402
255	NC_016112	GGT	2	6	20907	20912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403402
256	NC_016112	CAA	2	6	20916	20921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403402
257	NC_016112	CGG	2	6	20973	20978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403402
258	NC_016112	TCA	3	9	21107	21115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403403
259	NC_016112	TTG	2	6	21354	21359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403404
260	NC_016112	GAA	2	6	21459	21464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403404
261	NC_016112	AGA	2	6	21473	21478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403404
262	NC_016112	GAG	2	6	21513	21518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403404
263	NC_016112	CAT	2	6	22244	22249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403405
264	NC_016112	CAA	2	6	22266	22271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403405
265	NC_016112	TAA	2	6	22311	22316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403405
266	NC_016112	AAT	2	6	22400	22405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403405
267	NC_016112	CGT	2	6	22406	22411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403405
268	NC_016112	ACG	2	6	22434	22439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403405
269	NC_016112	CCG	2	6	22486	22491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403405
270	NC_016112	GCA	2	6	22495	22500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403405
271	NC_016112	CCA	2	6	22508	22513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403405
272	NC_016112	AAT	2	6	22541	22546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403405
273	NC_016112	TAA	2	6	22569	22574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403405
274	NC_016112	CGT	2	6	22589	22594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403405
275	NC_016112	GAT	2	6	22628	22633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403405
276	NC_016112	AGC	2	6	22725	22730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403405
277	NC_016112	TGA	2	6	22993	22998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403405
278	NC_016112	AAC	2	6	23091	23096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403405
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281	NC_016112	AAC	2	6	23601	23606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403406
282	NC_016112	CAT	2	6	23734	23739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403406
283	NC_016112	GGC	2	6	23756	23761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403406
284	NC_016112	TTG	2	6	23793	23798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403406
285	NC_016112	CAT	2	6	23851	23856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403406
286	NC_016112	CAC	2	6	23859	23864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403406
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288	NC_016112	GTT	2	6	24025	24030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403406
289	NC_016112	GCT	2	6	24105	24110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403406
290	NC_016112	CGG	2	6	24217	24222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403406
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292	NC_016112	GAC	2	6	24390	24395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403407
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359	NC_016112	ATC	2	6	30905	30910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403414
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362	NC_016112	TTC	2	6	31285	31290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403414
363	NC_016112	GCG	2	6	31410	31415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403414
364	NC_016112	CCT	2	6	31440	31445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357403414
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368	NC_016112	AAT	2	6	31890	31895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403415
369	NC_016112	ATT	2	6	31948	31953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403415
370	NC_016112	ATG	2	6	31970	31975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403415
371	NC_016112	GTC	2	6	31976	31981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403415
372	NC_016112	TAA	2	6	32007	32012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403415
373	NC_016112	GGC	2	6	32161	32166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403415
374	NC_016112	CGT	2	6	32213	32218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403415
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376	NC_016112	CGG	2	6	32265	32270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403415
377	NC_016112	GGA	2	6	32371	32376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403415
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