MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 47741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016112	TCT	2	6	94380	94385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403472
1002	NC_016112	GGC	2	6	94441	94446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403472
1003	NC_016112	GGC	2	6	94558	94563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403472
1004	NC_016112	AGC	2	6	94628	94633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403472
1005	NC_016112	CCT	2	6	94677	94682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357403472
1006	NC_016112	TTG	3	9	94793	94801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403472
1007	NC_016112	TTG	2	6	94844	94849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403472
1008	NC_016112	ATC	2	6	95683	95688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403473
1009	NC_016112	CGC	2	6	95841	95846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403473
1010	NC_016112	TGC	2	6	95952	95957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403473
1011	NC_016112	GAT	2	6	96004	96009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403474
1012	NC_016112	TTC	2	6	96106	96111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403474
1013	NC_016112	TCG	2	6	96203	96208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403474
1014	NC_016112	GCT	2	6	96215	96220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403474
1015	NC_016112	ACC	2	6	96316	96321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403474
1016	NC_016112	AAT	2	6	96475	96480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403475
1017	NC_016112	GTT	2	6	96490	96495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403475
1018	NC_016112	ATT	2	6	96536	96541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403475
1019	NC_016112	CGA	2	6	96600	96605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403475
1020	NC_016112	TGA	2	6	96609	96614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403475
1021	NC_016112	CGG	2	6	96619	96624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403475
1022	NC_016112	GTT	2	6	96646	96651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403475
1023	NC_016112	GGC	2	6	96736	96741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403475
1024	NC_016112	TGA	2	6	96981	96986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403475
1025	NC_016112	TAT	3	9	96990	96998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403475
1026	NC_016112	GAG	2	6	97040	97045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403475
1027	NC_016112	CGG	2	6	97239	97244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403476
1028	NC_016112	TTC	2	6	97248	97253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403476
1029	NC_016112	CGC	2	6	97442	97447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403476
1030	NC_016112	TGT	2	6	97477	97482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403476
1031	NC_016112	CGG	2	6	97520	97525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403476
1032	NC_016112	CGT	2	6	97763	97768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403476
1033	NC_016112	TAA	2	6	97782	97787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403476
1034	NC_016112	CGG	2	6	97866	97871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403476
1035	NC_016112	ATG	2	6	97911	97916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403476
1036	NC_016112	CCG	2	6	98020	98025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403476
1037	NC_016112	ACG	2	6	98116	98121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403476
1038	NC_016112	CCG	2	6	98122	98127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403476
1039	NC_016112	TGA	2	6	98168	98173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403476
1040	NC_016112	TAA	2	6	98274	98279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403476
1041	NC_016112	TAA	2	6	98344	98349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403477
1042	NC_016112	CGT	2	6	98448	98453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403477
1043	NC_016112	GCG	3	9	98496	98504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403477
1044	NC_016112	GTC	2	6	98566	98571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403477
1045	NC_016112	ATT	2	6	98610	98615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403478
1046	NC_016112	GCC	2	6	98644	98649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403478
1047	NC_016112	GCG	2	6	98657	98662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403478
1048	NC_016112	GGC	2	6	98697	98702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403478
1049	NC_016112	AGC	2	6	98780	98785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403478
1050	NC_016112	GAA	2	6	98842	98847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403478
1051	NC_016112	TTA	2	6	99121	99126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403479
1052	NC_016112	GCG	2	6	99286	99291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403479
1053	NC_016112	CTT	2	6	99311	99316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403479
1054	NC_016112	AAG	2	6	99504	99509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403479
1055	NC_016112	CGT	2	6	99528	99533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403479
1056	NC_016112	AGG	2	6	99652	99657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403479
1057	NC_016112	CGT	2	6	99722	99727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403479
1058	NC_016112	GAT	2	6	99750	99755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403479
1059	NC_016112	TGG	2	6	99889	99894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403479
1060	NC_016112	ATT	2	6	99965	99970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403479
1061	NC_016112	GGC	2	6	100028	100033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403479
1062	NC_016112	GGA	2	6	100133	100138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403479
1063	NC_016112	GAT	2	6	100307	100312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403479
1064	NC_016112	GCT	2	6	100395	100400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403479
1065	NC_016112	GTT	2	6	100532	100537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403479
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1067	NC_016112	TTA	2	6	100743	100748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403479
1068	NC_016112	CGG	2	6	100759	100764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403479
1069	NC_016112	GAG	2	6	100779	100784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403479
1070	NC_016112	TGA	2	6	100906	100911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403480
1071	NC_016112	AAC	2	6	100918	100923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403480
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1073	NC_016112	ATC	2	6	101040	101045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403480
1074	NC_016112	GAT	3	9	101139	101147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403480
1075	NC_016112	AGA	2	6	101282	101287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403480
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1077	NC_016112	TGA	2	6	101336	101341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403480
1078	NC_016112	TAG	2	6	101444	101449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403480
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1080	NC_016112	CGA	2	6	101486	101491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403480
1081	NC_016112	ATG	2	6	101518	101523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403480
1082	NC_016112	TGC	2	6	101542	101547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403480
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1088	NC_016112	GAT	2	6	102008	102013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403480
1089	NC_016112	AAG	2	6	102091	102096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403480
1090	NC_016112	TGG	2	6	102171	102176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403480
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1092	NC_016112	CGA	2	6	102410	102415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403480
1093	NC_016112	AGA	2	6	102443	102448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403480
1094	NC_016112	CGA	2	6	102478	102483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403480
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1099	NC_016112	CGA	2	6	103191	103196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403481
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1101	NC_016112	ATT	2	6	103489	103494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403481
1102	NC_016112	CGG	2	6	103569	103574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403481
1103	NC_016112	ATC	2	6	103609	103614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403481
1104	NC_016112	CGG	3	9	103644	103652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403481
1105	NC_016112	TTG	2	6	103727	103732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403481
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1108	NC_016112	ATT	2	6	103855	103860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403481
1109	NC_016112	TGC	2	6	103896	103901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403481
1110	NC_016112	CGT	2	6	103967	103972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403481
1111	NC_016112	GAA	2	6	104153	104158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403482
1112	NC_016112	CGG	2	6	104161	104166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403482
1113	NC_016112	AGC	2	6	104169	104174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403482
1114	NC_016112	GTC	2	6	104272	104277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403482
1115	NC_016112	GCC	2	6	104321	104326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403482
1116	NC_016112	GAA	2	6	104366	104371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403482
1117	NC_016112	GAT	2	6	104435	104440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403482
1118	NC_016112	TGA	2	6	104457	104462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403482
1119	NC_016112	CAA	2	6	104468	104473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403482
1120	NC_016112	GTC	2	6	104696	104701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403482
1121	NC_016112	GGC	2	6	104800	104805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403482
1122	NC_016112	GTC	2	6	104822	104827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403482
1123	NC_016112	CGC	2	6	104839	104844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403482
1124	NC_016112	GGC	2	6	104908	104913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403482
1125	NC_016112	TTC	2	6	104971	104976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403482
1126	NC_016112	CGC	2	6	105223	105228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403482
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1129	NC_016112	TGC	2	6	105604	105609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403483
1130	NC_016112	TCG	2	6	105696	105701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403483
1131	NC_016112	GAT	2	6	105727	105732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403483
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1135	NC_016112	TGC	2	6	105901	105906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403483
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1141	NC_016112	ATC	2	6	106112	106117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403483
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1149	NC_016112	GCA	2	6	106749	106754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403484
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1151	NC_016112	TGG	2	6	107116	107121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403485
1152	NC_016112	TTG	2	6	107124	107129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403485
1153	NC_016112	GGC	2	6	107132	107137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403485
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1227	NC_016112	ATC	2	6	114495	114500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403491
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1231	NC_016112	GAT	2	6	115111	115116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403492
1232	NC_016112	TGT	2	6	115187	115192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403492
1233	NC_016112	ATG	2	6	115289	115294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403492
1234	NC_016112	CAA	2	6	115357	115362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403492
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1357	NC_016112	AGA	2	6	137748	137753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403505
1358	NC_016112	GAC	2	6	137785	137790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403505
1359	NC_016112	GTC	2	6	137907	137912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403505
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1372	NC_016112	TGA	2	6	138659	138664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403505
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1474	NC_016112	TGC	2	6	148546	148551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403517
1475	NC_016112	ATT	2	6	148814	148819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403517
1476	NC_016112	ATC	2	6	148851	148856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403517
1477	NC_016112	GAC	2	6	148862	148867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403517
1478	NC_016112	GAA	2	6	148916	148921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403517
1479	NC_016112	GAA	2	6	148937	148942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403517
1480	NC_016112	TTG	2	6	148944	148949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403517
1481	NC_016112	AGC	2	6	149049	149054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403517
1482	NC_016112	CAT	2	6	149482	149487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403517
1483	NC_016112	GTC	2	6	149675	149680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403517
1484	NC_016112	TGC	2	6	149761	149766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403517
1485	NC_016112	GGT	2	6	149827	149832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403517
1486	NC_016112	TGA	2	6	149868	149873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403517
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1488	NC_016112	CGG	2	6	149971	149976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403517
1489	NC_016112	TGA	2	6	150097	150102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403517
1490	NC_016112	GCG	2	6	150116	150121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403517
1491	NC_016112	GTC	3	9	150572	150580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403518
1492	NC_016112	CGG	2	6	150586	150591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403518
1493	NC_016112	GAT	2	6	150598	150603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403518
1494	NC_016112	ATG	2	6	150644	150649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403518
1495	NC_016112	TCG	2	6	150672	150677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403518
1496	NC_016112	GGC	3	9	150683	150691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403518
1497	NC_016112	TTG	2	6	150780	150785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403518
1498	NC_016112	GGC	2	6	150797	150802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403518
1499	NC_016112	GGC	2	6	150842	150847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403518
1500	NC_016112	CAA	2	6	150892	150897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403518

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