MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 47741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016112	CTG	2	6	493937	493942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403829
5002	NC_016112	TCG	3	9	493965	493973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403829
5003	NC_016112	GCC	2	6	493983	493988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403829
5004	NC_016112	GTT	2	6	493990	493995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403829
5005	NC_016112	CGG	2	6	494023	494028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403829
5006	NC_016112	GCG	2	6	494056	494061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403829
5007	NC_016112	ATC	2	6	494243	494248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403829
5008	NC_016112	CAA	2	6	494595	494600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403829
5009	NC_016112	TTC	2	6	494672	494677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403829
5010	NC_016112	GGC	2	6	494795	494800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403829
5011	NC_016112	GCA	2	6	494848	494853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403829
5012	NC_016112	GCC	2	6	495023	495028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403829
5013	NC_016112	AAT	2	6	495038	495043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403829
5014	NC_016112	AAT	2	6	495127	495132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403829
5015	NC_016112	GAA	2	6	495155	495160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403829
5016	NC_016112	AGC	2	6	495178	495183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403829
5017	NC_016112	AAC	2	6	495333	495338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403829
5018	NC_016112	GGC	2	6	495944	495949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403830
5019	NC_016112	GAA	3	9	496092	496100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403830
5020	NC_016112	TTG	2	6	496185	496190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403830
5021	NC_016112	GAA	2	6	496290	496295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403830
5022	NC_016112	GTC	2	6	496356	496361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403830
5023	NC_016112	CTT	6	18	497267	497284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403831
5024	NC_016112	CCT	2	6	497285	497290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357403831
5025	NC_016112	GCC	2	6	497331	497336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403831
5026	NC_016112	CTT	2	6	497432	497437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403831
5027	NC_016112	CGC	2	6	497595	497600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403831
5028	NC_016112	AAT	2	6	497674	497679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403831
5029	NC_016112	CGC	2	6	497686	497691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403831
5030	NC_016112	GAA	2	6	497700	497705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403831
5031	NC_016112	TGA	2	6	497708	497713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403831
5032	NC_016112	GTT	2	6	497736	497741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403831
5033	NC_016112	TGA	2	6	497963	497968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403831
5034	NC_016112	CGA	2	6	497976	497981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403831
5035	NC_016112	GCC	2	6	498039	498044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403831
5036	NC_016112	ATG	2	6	498073	498078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403831
5037	NC_016112	GTT	2	6	498159	498164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403831
5038	NC_016112	TTG	2	6	498394	498399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403831
5039	NC_016112	GCG	2	6	498963	498968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403832
5040	NC_016112	GGA	2	6	498981	498986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403832
5041	NC_016112	GCC	2	6	499002	499007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403832
5042	NC_016112	ATC	2	6	499014	499019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403832
5043	NC_016112	AAT	2	6	499122	499127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403832
5044	NC_016112	AAC	2	6	499144	499149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403832
5045	NC_016112	TCG	2	6	499168	499173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403832
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5048	NC_016112	ATC	2	6	499371	499376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403832
5049	NC_016112	CGA	2	6	499394	499399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403832
5050	NC_016112	TGC	2	6	499402	499407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403832
5051	NC_016112	GCA	2	6	499526	499531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403832
5052	NC_016112	TCG	2	6	499540	499545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403832
5053	NC_016112	TGT	2	6	499569	499574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403832
5054	NC_016112	CGA	2	6	499583	499588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403832
5055	NC_016112	CGA	2	6	499649	499654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403832
5056	NC_016112	TGT	2	6	499660	499665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403832
5057	NC_016112	TCG	2	6	499711	499716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403832
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5059	NC_016112	CAT	2	6	499853	499858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403832
5060	NC_016112	GAG	2	6	499971	499976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403832
5061	NC_016112	GCG	2	6	500008	500013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403833
5062	NC_016112	GGC	2	6	500065	500070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403833
5063	NC_016112	AAT	2	6	500208	500213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403833
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5068	NC_016112	ATG	2	6	500522	500527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403834
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5071	NC_016112	ATT	2	6	500664	500669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403834
5072	NC_016112	CAT	2	6	500686	500691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403834
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5077	NC_016112	TGA	2	6	500792	500797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403834
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5087	NC_016112	ACA	2	6	502015	502020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403835
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5089	NC_016112	GGC	2	6	502201	502206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403835
5090	NC_016112	ACC	2	6	502271	502276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403835
5091	NC_016112	CGG	2	6	502315	502320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403835
5092	NC_016112	CGA	2	6	502380	502385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403835
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5099	NC_016112	GGC	3	9	502865	502873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403835
5100	NC_016112	TGA	2	6	502911	502916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403835
5101	NC_016112	AAG	2	6	502968	502973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403835
5102	NC_016112	AGG	2	6	503031	503036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403835
5103	NC_016112	CGA	2	6	504091	504096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403836
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5105	NC_016112	CGC	2	6	504216	504221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403836
5106	NC_016112	TCA	2	6	504232	504237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403836
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5109	NC_016112	GAC	2	6	504425	504430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403836
5110	NC_016112	GCG	2	6	504527	504532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403836
5111	NC_016112	GCC	2	6	504561	504566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403836
5112	NC_016112	GCC	2	6	504695	504700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403836
5113	NC_016112	CGG	2	6	504907	504912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403836
5114	NC_016112	GCA	2	6	506485	506490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403837
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5117	NC_016112	GAC	2	6	506675	506680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403837
5118	NC_016112	GCA	2	6	506701	506706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403837
5119	NC_016112	GCT	2	6	506863	506868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403837
5120	NC_016112	CAC	2	6	506935	506940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403837
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5123	NC_016112	TTG	2	6	507146	507151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403837
5124	NC_016112	GCA	2	6	507274	507279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403837
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5132	NC_016112	CAT	2	6	507620	507625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403838
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5140	NC_016112	TGA	2	6	508678	508683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403840
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5224	NC_016112	CGG	3	9	518100	518108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403848
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5228	NC_016112	GAT	2	6	518473	518478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403848
5229	NC_016112	CGT	2	6	518490	518495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403848
5230	NC_016112	TGC	2	6	518505	518510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403848
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5232	NC_016112	GGC	2	6	518634	518639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403849
5233	NC_016112	GAG	2	6	518724	518729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403849
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5235	NC_016112	CGA	2	6	518956	518961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403849
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5474	NC_016112	GAC	2	6	544437	544442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403866
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