MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 47741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016112	ACG	2	6	48225	48230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403432
502	NC_016112	CGT	2	6	48324	48329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403432
503	NC_016112	CGT	2	6	48357	48362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403432
504	NC_016112	CAT	2	6	48496	48501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403432
505	NC_016112	GCC	2	6	48556	48561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403432
506	NC_016112	CGA	2	6	48582	48587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403432
507	NC_016112	TGT	2	6	48594	48599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403432
508	NC_016112	ATT	2	6	48628	48633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403432
509	NC_016112	TTG	2	6	48650	48655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403432
510	NC_016112	CCA	2	6	48658	48663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403432
511	NC_016112	TGT	2	6	48741	48746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403432
512	NC_016112	CGG	2	6	48775	48780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403432
513	NC_016112	AGC	2	6	48962	48967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403432
514	NC_016112	GCC	2	6	48987	48992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403432
515	NC_016112	CGG	3	9	49024	49032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403432
516	NC_016112	GTT	2	6	49194	49199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403432
517	NC_016112	TCG	2	6	49229	49234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403432
518	NC_016112	GCG	2	6	49446	49451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403432
519	NC_016112	TCG	2	6	49757	49762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403432
520	NC_016112	AGC	2	6	49778	49783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403432
521	NC_016112	ATA	2	6	49912	49917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403432
522	NC_016112	ACC	2	6	50184	50189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403432
523	NC_016112	TTC	2	6	50212	50217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403432
524	NC_016112	ATC	2	6	50813	50818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403433
525	NC_016112	CGA	2	6	50824	50829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403433
526	NC_016112	CGA	2	6	50871	50876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403433
527	NC_016112	AAT	2	6	50945	50950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403433
528	NC_016112	AGT	2	6	51038	51043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403433
529	NC_016112	ATG	2	6	51227	51232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403433
530	NC_016112	TCG	2	6	51326	51331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403433
531	NC_016112	GTT	2	6	51352	51357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403433
532	NC_016112	GGC	2	6	52494	52499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403434
533	NC_016112	CGA	2	6	52625	52630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403434
534	NC_016112	TCA	2	6	52798	52803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403434
535	NC_016112	CGA	2	6	52960	52965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403435
536	NC_016112	GAA	2	6	53003	53008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403435
537	NC_016112	ATT	2	6	53105	53110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403435
538	NC_016112	TGC	2	6	53230	53235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403435
539	NC_016112	AAG	2	6	53346	53351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403435
540	NC_016112	CGT	2	6	53488	53493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403435
541	NC_016112	TTC	2	6	53511	53516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403435
542	NC_016112	CGA	2	6	53530	53535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403435
543	NC_016112	GAT	2	6	53552	53557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403435
544	NC_016112	GCC	2	6	53571	53576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403435
545	NC_016112	GCC	2	6	53583	53588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403435
546	NC_016112	GAA	2	6	53624	53629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403435
547	NC_016112	GAT	2	6	53641	53646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403435
548	NC_016112	CGA	2	6	53743	53748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403435
549	NC_016112	GAC	2	6	53776	53781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403435
550	NC_016112	ATC	2	6	53859	53864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403435
551	NC_016112	CGG	2	6	53968	53973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403435
552	NC_016112	CTG	2	6	53985	53990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403435
553	NC_016112	ATC	2	6	54095	54100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403435
554	NC_016112	TGA	2	6	54216	54221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403435
555	NC_016112	ATT	2	6	54294	54299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403435
556	NC_016112	TTC	2	6	54318	54323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403435
557	NC_016112	TTA	2	6	54373	54378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403435
558	NC_016112	AGC	2	6	54412	54417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403435
559	NC_016112	GGT	2	6	54574	54579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403435
560	NC_016112	ATC	2	6	54689	54694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403435
561	NC_016112	CAT	2	6	55100	55105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403436
562	NC_016112	CAA	2	6	55107	55112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403436
563	NC_016112	GCA	2	6	55160	55165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403436
564	NC_016112	CGG	2	6	55184	55189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403436
565	NC_016112	ATT	2	6	55418	55423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403436
566	NC_016112	CGG	2	6	55576	55581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403436
567	NC_016112	ATT	2	6	55608	55613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403436
568	NC_016112	GGC	2	6	55785	55790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403436
569	NC_016112	CGA	2	6	55922	55927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403436
570	NC_016112	GAA	2	6	55994	55999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403436
571	NC_016112	TAT	2	6	56091	56096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403436
572	NC_016112	GCG	2	6	56124	56129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403436
573	NC_016112	ATG	2	6	56130	56135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403436
574	NC_016112	CAA	2	6	56333	56338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403436
575	NC_016112	GCG	2	6	56421	56426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403436
576	NC_016112	CCG	2	6	56502	56507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403436
577	NC_016112	GTC	2	6	56643	56648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403436
578	NC_016112	ATT	2	6	56721	56726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403437
579	NC_016112	CAG	2	6	56816	56821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403437
580	NC_016112	GGT	2	6	57086	57091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403437
581	NC_016112	TGT	2	6	57141	57146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403437
582	NC_016112	GCA	2	6	57712	57717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403438
583	NC_016112	CAA	2	6	57797	57802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403438
584	NC_016112	CAG	2	6	57856	57861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403438
585	NC_016112	GAA	2	6	57992	57997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403438
586	NC_016112	CGA	2	6	58081	58086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403438
587	NC_016112	ATT	2	6	58370	58375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403438
588	NC_016112	CGA	2	6	58480	58485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403438
589	NC_016112	AGC	2	6	58497	58502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403438
590	NC_016112	ATT	2	6	58567	58572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403438
591	NC_016112	CAA	2	6	58582	58587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403438
592	NC_016112	TCG	2	6	58677	58682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403438
593	NC_016112	ACT	2	6	58809	58814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403438
594	NC_016112	TGA	2	6	58857	58862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403438
595	NC_016112	GCC	2	6	58921	58926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403438
596	NC_016112	CGA	2	6	59014	59019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403438
597	NC_016112	CGG	2	6	59076	59081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403438
598	NC_016112	TGA	2	6	59173	59178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403438
599	NC_016112	GTT	2	6	59185	59190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403438
600	NC_016112	TGA	2	6	59232	59237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403438
601	NC_016112	GTT	2	6	59317	59322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403438
602	NC_016112	CAA	2	6	59402	59407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403438
603	NC_016112	TGA	2	6	59493	59498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403438
604	NC_016112	TGC	2	6	59610	59615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403438
605	NC_016112	GCG	2	6	59657	59662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403438
606	NC_016112	TCG	2	6	59781	59786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403438
607	NC_016112	GAG	2	6	59822	59827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403438
608	NC_016112	GTC	2	6	60115	60120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403438
609	NC_016112	GAT	2	6	60194	60199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403438
610	NC_016112	GCG	2	6	60211	60216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403438
611	NC_016112	TCA	2	6	60241	60246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403438
612	NC_016112	GCA	2	6	60265	60270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403438
613	NC_016112	GCG	2	6	60291	60296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403438
614	NC_016112	ATT	2	6	60345	60350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403438
615	NC_016112	CGG	2	6	60415	60420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403438
616	NC_016112	GCG	2	6	60660	60665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403438
617	NC_016112	CGA	2	6	60754	60759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403438
618	NC_016112	CGA	2	6	60835	60840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403438
619	NC_016112	CGG	2	6	60928	60933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403438
620	NC_016112	GGC	2	6	60985	60990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403438
621	NC_016112	CTG	2	6	61121	61126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403438
622	NC_016112	ATG	3	9	61196	61204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403438
623	NC_016112	CGA	2	6	61222	61227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403438
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995	NC_016112	TTG	2	6	93472	93477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403471
996	NC_016112	AAT	2	6	93595	93600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403471
997	NC_016112	GCA	2	6	94171	94176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403472
998	NC_016112	ATC	2	6	94292	94297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403472
999	NC_016112	CAT	2	6	94343	94348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403472
1000	NC_016112	TGC	2	6	94369	94374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403472

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