MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 47741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_016112	AAT	2	6	201523	201528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403563
2002	NC_016112	ACA	2	6	201780	201785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403564
2003	NC_016112	ATA	2	6	201832	201837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403564
2004	NC_016112	GGC	2	6	201918	201923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403564
2005	NC_016112	TGA	2	6	201949	201954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403564
2006	NC_016112	CAG	2	6	201985	201990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403565
2007	NC_016112	TCG	2	6	202004	202009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403565
2008	NC_016112	GCA	2	6	202229	202234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403565
2009	NC_016112	GTC	2	6	202285	202290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403565
2010	NC_016112	ATA	2	6	202362	202367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403565
2011	NC_016112	GGT	2	6	202377	202382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403565
2012	NC_016112	ATG	2	6	202419	202424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403565
2013	NC_016112	TGA	2	6	202427	202432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403565
2014	NC_016112	ATT	2	6	202709	202714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403566
2015	NC_016112	GAT	2	6	202836	202841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403566
2016	NC_016112	CGC	2	6	202958	202963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403566
2017	NC_016112	TTG	2	6	203017	203022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403566
2018	NC_016112	CGG	2	6	203094	203099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403566
2019	NC_016112	GGT	2	6	203152	203157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403566
2020	NC_016112	CAG	2	6	203262	203267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403566
2021	NC_016112	GGC	2	6	203340	203345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403566
2022	NC_016112	CGA	2	6	203354	203359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403566
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2024	NC_016112	GCG	2	6	203443	203448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403566
2025	NC_016112	GTA	2	6	203598	203603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403566
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2029	NC_016112	TCG	2	6	204008	204013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403566
2030	NC_016112	TTA	2	6	204426	204431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403567
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2032	NC_016112	TCC	2	6	204506	204511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357403567
2033	NC_016112	CTT	2	6	204564	204569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403567
2034	NC_016112	AAT	2	6	204670	204675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403567
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2036	NC_016112	TTG	2	6	204802	204807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403567
2037	NC_016112	GTC	2	6	204869	204874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403567
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2040	NC_016112	TGA	2	6	205325	205330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403567
2041	NC_016112	AAT	2	6	205468	205473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403567
2042	NC_016112	ACC	2	6	205634	205639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403567
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2052	NC_016112	TGC	2	6	207143	207148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403570
2053	NC_016112	TGC	2	6	207152	207157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403570
2054	NC_016112	CGA	2	6	207345	207350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403570
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2118	NC_016112	ACC	2	6	214664	214669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403579
2119	NC_016112	ATC	2	6	214919	214924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403579
2120	NC_016112	TCA	2	6	214980	214985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403579
2121	NC_016112	ACC	2	6	215018	215023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403579
2122	NC_016112	TCG	2	6	215082	215087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403579
2123	NC_016112	CAT	2	6	215092	215097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403579
2124	NC_016112	CAT	2	6	215099	215104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403579
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2142	NC_016112	GCT	2	6	217881	217886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403583
2143	NC_016112	GTC	2	6	218087	218092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403583
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2148	NC_016112	GGT	2	6	218588	218593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403583
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2355	NC_016112	AAT	2	6	238823	238828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403601
2356	NC_016112	GTC	2	6	238864	238869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403601
2357	NC_016112	GGA	2	6	238945	238950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403601
2358	NC_016112	GTC	2	6	239067	239072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403601
2359	NC_016112	GAT	2	6	239089	239094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403601
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2471	NC_016112	GTA	2	6	252504	252509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403611
2472	NC_016112	TCG	2	6	252529	252534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403611
2473	NC_016112	AGG	2	6	252592	252597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403611
2474	NC_016112	CAT	2	6	253238	253243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403612
2475	NC_016112	GCT	3	9	253335	253343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403612
2476	NC_016112	GCC	2	6	253425	253430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403612
2477	NC_016112	GAA	2	6	253496	253501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403612
2478	NC_016112	TTC	2	6	253543	253548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403612
2479	NC_016112	TTA	2	6	253563	253568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403612
2480	NC_016112	CGG	2	6	254179	254184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403613
2481	NC_016112	CGT	2	6	254239	254244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403613
2482	NC_016112	TAA	2	6	254458	254463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403613
2483	NC_016112	CGT	2	6	254500	254505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403613
2484	NC_016112	GTT	2	6	254658	254663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403613
2485	NC_016112	CAT	2	6	254669	254674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403613
2486	NC_016112	TTC	2	6	254778	254783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403613
2487	NC_016112	GGC	2	6	254898	254903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403613
2488	NC_016112	CAA	2	6	254972	254977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403613
2489	NC_016112	ACA	2	6	254980	254985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403613
2490	NC_016112	TAT	2	6	255159	255164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403614
2491	NC_016112	TAG	2	6	255196	255201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403614
2492	NC_016112	GTG	2	6	255211	255216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403614
2493	NC_016112	GTC	2	6	255301	255306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403614
2494	NC_016112	TGA	2	6	255334	255339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403614
2495	NC_016112	CGA	2	6	255435	255440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403614
2496	NC_016112	CTA	2	6	255535	255540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403614
2497	NC_016112	TTG	2	6	255559	255564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403614
2498	NC_016112	CGG	2	6	255734	255739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403614
2499	NC_016112	CGT	2	6	255781	255786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403614
2500	NC_016112	GCC	2	6	256132	256137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403615

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