MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 36833

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015387	CAC	2	6	248582	248587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949790
4002	NC_015387	GCC	2	6	248588	248593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949790
4003	NC_015387	GCG	2	6	248723	248728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949790
4004	NC_015387	AGG	2	6	248787	248792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949790
4005	NC_015387	CCT	2	6	248892	248897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4006	NC_015387	CGC	2	6	248942	248947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4007	NC_015387	CCA	3	9	248968	248976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4008	NC_015387	GCA	2	6	248994	248999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_015387	CAG	2	6	249089	249094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949791
4010	NC_015387	CAC	2	6	249122	249127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949791
4011	NC_015387	CGC	2	6	249173	249178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949791
4012	NC_015387	CGC	2	6	249190	249195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949791
4013	NC_015387	GAG	2	6	249227	249232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949791
4014	NC_015387	GTG	2	6	249234	249239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949791
4015	NC_015387	CAC	2	6	249254	249259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949791
4016	NC_015387	TGC	2	6	249273	249278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949791
4017	NC_015387	GAA	2	6	249295	249300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949791
4018	NC_015387	GCG	2	6	249304	249309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949791
4019	NC_015387	CTC	2	6	249404	249409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949791
4020	NC_015387	GAG	2	6	249461	249466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949791
4021	NC_015387	AGG	2	6	249513	249518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949791
4022	NC_015387	GAG	2	6	249575	249580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949791
4023	NC_015387	AGG	3	9	249669	249677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949791
4024	NC_015387	GTA	2	6	249755	249760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949791
4025	NC_015387	TGG	2	6	249907	249912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_015387	CCT	2	6	249937	249942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4027	NC_015387	TCC	2	6	250080	250085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949792
4028	NC_015387	CCA	2	6	250086	250091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949792
4029	NC_015387	CCA	2	6	250099	250104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949792
4030	NC_015387	CCG	2	6	250159	250164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949792
4031	NC_015387	CCA	2	6	250185	250190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949792
4032	NC_015387	GCC	3	9	250239	250247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949792
4033	NC_015387	GTT	2	6	250276	250281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949792
4034	NC_015387	AGG	2	6	250288	250293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949792
4035	NC_015387	CCT	2	6	250314	250319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949792
4036	NC_015387	GCA	2	6	250422	250427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949792
4037	NC_015387	AGC	2	6	250517	250522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949792
4038	NC_015387	CCT	2	6	250554	250559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949792
4039	NC_015387	ACC	2	6	250574	250579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949792
4040	NC_015387	CGC	2	6	250628	250633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949792
4041	NC_015387	TCC	2	6	250955	250960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949792
4042	NC_015387	CTC	2	6	251071	251076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949792
4043	NC_015387	GTC	2	6	251299	251304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_015387	GCC	2	6	251448	251453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4045	NC_015387	AGG	2	6	251470	251475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_015387	CTT	2	6	251499	251504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_015387	TGC	2	6	251506	251511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_015387	GCC	2	6	251632	251637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949793
4049	NC_015387	TGG	2	6	251676	251681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949793
4050	NC_015387	TGG	3	9	251748	251756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949793
4051	NC_015387	CTG	2	6	251762	251767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949793
4052	NC_015387	CTC	2	6	251768	251773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949793
4053	NC_015387	GCG	2	6	251792	251797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949793
4054	NC_015387	GTG	3	9	251863	251871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949793
4055	NC_015387	GCG	2	6	251892	251897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949793
4056	NC_015387	CGT	2	6	251904	251909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949793
4057	NC_015387	GCG	2	6	252003	252008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_015387	ACG	2	6	252034	252039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_015387	CGG	2	6	252088	252093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_015387	GGA	2	6	252094	252099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_015387	AGG	2	6	252180	252185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_015387	AGG	2	6	252251	252256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949794
4063	NC_015387	ACG	2	6	252270	252275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949794
4064	NC_015387	GCG	2	6	252288	252293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949794
4065	NC_015387	CTC	2	6	252321	252326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949794
4066	NC_015387	TGC	2	6	252436	252441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949794
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4069	NC_015387	CGG	2	6	252556	252561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949794
4070	NC_015387	GCG	2	6	252599	252604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949794
4071	NC_015387	GAG	2	6	252609	252614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949794
4072	NC_015387	CCG	2	6	252620	252625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949794
4073	NC_015387	GAG	2	6	252726	252731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949794
4074	NC_015387	ACC	2	6	252742	252747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949794
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4077	NC_015387	GAC	2	6	252913	252918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949795
4078	NC_015387	TGG	2	6	252920	252925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949795
4079	NC_015387	GCT	2	6	252958	252963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949795
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4083	NC_015387	GCA	2	6	253397	253402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_015387	GCG	2	6	253486	253491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949796
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4087	NC_015387	CGG	2	6	253817	253822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_015387	CGG	2	6	253835	253840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_015387	GTG	2	6	253873	253878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_015387	TGC	2	6	254041	254046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_015387	GTT	2	6	254237	254242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_015387	AGG	2	6	254328	254333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_015387	ACC	2	6	254448	254453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949797
4094	NC_015387	GGT	2	6	254522	254527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949797
4095	NC_015387	AGC	2	6	254603	254608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949797
4096	NC_015387	GCC	2	6	254619	254624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4097	NC_015387	GCA	2	6	254642	254647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_015387	GCA	2	6	254675	254680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949798
4099	NC_015387	GCG	2	6	254708	254713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949798
4100	NC_015387	GCC	2	6	254855	254860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949798
4101	NC_015387	CAC	2	6	254872	254877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949798
4102	NC_015387	GAG	2	6	255002	255007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949798
4103	NC_015387	ACG	2	6	255047	255052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949798
4104	NC_015387	GCC	2	6	255062	255067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949798
4105	NC_015387	GAC	3	9	255266	255274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949798
4106	NC_015387	TCC	2	6	255276	255281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949798
4107	NC_015387	ATC	2	6	255308	255313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949798
4108	NC_015387	GTG	2	6	255371	255376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949798
4109	NC_015387	CGG	2	6	255412	255417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949798
4110	NC_015387	CCG	2	6	255522	255527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949798
4111	NC_015387	CCA	2	6	255615	255620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949798
4112	NC_015387	CGC	2	6	255667	255672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949798
4113	NC_015387	GGA	2	6	255673	255678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949798
4114	NC_015387	TCC	2	6	255732	255737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949798
4115	NC_015387	TAC	2	6	255764	255769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949798
4116	NC_015387	GAC	2	6	255923	255928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949798
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4118	NC_015387	GGA	2	6	256060	256065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949798
4119	NC_015387	CAC	2	6	256108	256113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949798
4120	NC_015387	CGA	2	6	256134	256139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949798
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4122	NC_015387	GGT	2	6	256204	256209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949798
4123	NC_015387	CGC	2	6	256218	256223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949798
4124	NC_015387	CGC	2	6	256230	256235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949798
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4232	NC_015387	TCA	2	6	262505	262510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949807
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4239	NC_015387	CTG	2	6	262819	262824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949807
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4241	NC_015387	CCT	2	6	262908	262913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949807
4242	NC_015387	GTG	3	9	262963	262971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949807
4243	NC_015387	CGC	2	6	263019	263024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949807
4244	NC_015387	GCG	2	6	263093	263098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949808
4245	NC_015387	CGG	2	6	263172	263177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949808
4246	NC_015387	CTC	2	6	263185	263190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949808
4247	NC_015387	CCT	2	6	263310	263315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949808
4248	NC_015387	TTC	2	6	263386	263391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949808
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4250	NC_015387	CGG	2	6	263490	263495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949808
4251	NC_015387	TCA	2	6	263501	263506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949808
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4259	NC_015387	GAT	2	6	264066	264071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949808
4260	NC_015387	GAT	2	6	264201	264206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949808
4261	NC_015387	GTG	3	9	264223	264231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949808
4262	NC_015387	CTC	2	6	264310	264315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949808
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4264	NC_015387	GGC	2	6	264367	264372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949808
4265	NC_015387	TCA	2	6	264377	264382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949808
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4269	NC_015387	GCA	2	6	264477	264482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949808
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4271	NC_015387	CGC	2	6	264618	264623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949808
4272	NC_015387	CAA	2	6	264654	264659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949808
4273	NC_015387	GAG	2	6	264742	264747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949808
4274	NC_015387	GCG	2	6	264798	264803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949808
4275	NC_015387	GGC	2	6	264807	264812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949808
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4289	NC_015387	CGG	2	6	265808	265813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949809
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4291	NC_015387	CAC	2	6	265824	265829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949809
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4296	NC_015387	GGC	2	6	266072	266077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949809
4297	NC_015387	CGC	2	6	266126	266131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949809
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4299	NC_015387	TCC	2	6	266155	266160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949809
4300	NC_015387	GGC	2	6	266186	266191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949809
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4302	NC_015387	GCC	2	6	266294	266299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4303	NC_015387	CGC	2	6	266363	266368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4304	NC_015387	GGC	2	6	266379	266384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4305	NC_015387	ACC	2	6	266507	266512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949810
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4309	NC_015387	AGC	2	6	266791	266796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949810
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4312	NC_015387	GGC	2	6	267032	267037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949810
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4323	NC_015387	ACC	2	6	267430	267435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949810
4324	NC_015387	TGA	2	6	267522	267527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949810
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4327	NC_015387	TGG	2	6	267806	267811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949810
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4332	NC_015387	AAC	2	6	268472	268477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949810
4333	NC_015387	ACG	2	6	268535	268540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949810
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4335	NC_015387	CAG	2	6	268574	268579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949810
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4343	NC_015387	TCG	2	6	269122	269127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949811
4344	NC_015387	ATA	2	6	269131	269136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328949811
4345	NC_015387	TAC	4	12	269353	269364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949812
4346	NC_015387	TGG	2	6	269483	269488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949812
4347	NC_015387	GCA	2	6	269859	269864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949812
4348	NC_015387	TAG	2	6	269876	269881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949812
4349	NC_015387	CGC	2	6	269918	269923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949812
4350	NC_015387	AAC	2	6	269980	269985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949812
4351	NC_015387	ACA	2	6	270264	270269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949812
4352	NC_015387	GAC	2	6	270316	270321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949812
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4356	NC_015387	CAG	2	6	270569	270574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949812
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4358	NC_015387	GGT	2	6	270591	270596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949812
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4483	NC_015387	TGC	2	6	281984	281989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949820
4484	NC_015387	CGG	2	6	282113	282118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949820
4485	NC_015387	GTG	3	9	282142	282150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949820
4486	NC_015387	CGC	2	6	282159	282164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949820
4487	NC_015387	CGG	2	6	282182	282187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949820
4488	NC_015387	GGA	2	6	282222	282227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949820
4489	NC_015387	TGG	4	12	282278	282289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949820
4490	NC_015387	TGG	2	6	282305	282310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949820
4491	NC_015387	GAG	2	6	282456	282461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949821
4492	NC_015387	CAT	3	9	282518	282526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949821
4493	NC_015387	CGG	2	6	282583	282588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949821
4494	NC_015387	TCA	2	6	282775	282780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949821
4495	NC_015387	AAT	2	6	282803	282808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328949821
4496	NC_015387	CTT	2	6	282835	282840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4497	NC_015387	CGC	2	6	283001	283006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949822
4498	NC_015387	TGG	2	6	283111	283116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949822
4499	NC_015387	CTC	2	6	283149	283154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949822
4500	NC_015387	GCC	2	6	283177	283182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949822

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