MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 36833

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015387	GCA	2	6	312660	312665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949851
5002	NC_015387	TCG	2	6	312731	312736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949851
5003	NC_015387	CAG	2	6	312805	312810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949851
5004	NC_015387	CGG	2	6	312863	312868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949851
5005	NC_015387	GAG	2	6	312895	312900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949851
5006	NC_015387	CGA	2	6	312939	312944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949851
5007	NC_015387	CAC	2	6	313030	313035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949851
5008	NC_015387	GTG	2	6	313118	313123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949851
5009	NC_015387	CTG	2	6	313162	313167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949851
5010	NC_015387	AGG	2	6	313241	313246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949851
5011	NC_015387	CGC	2	6	313303	313308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949851
5012	NC_015387	CCA	2	6	313406	313411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949852
5013	NC_015387	GAA	2	6	313437	313442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949852
5014	NC_015387	CAC	2	6	313506	313511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949852
5015	NC_015387	CCT	2	6	313724	313729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949853
5016	NC_015387	CAA	2	6	313755	313760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949853
5017	NC_015387	CGC	2	6	313770	313775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949853
5018	NC_015387	TGT	2	6	313964	313969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949853
5019	NC_015387	GCC	2	6	313974	313979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949853
5020	NC_015387	CCT	2	6	314042	314047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949853
5021	NC_015387	CCT	2	6	314201	314206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949853
5022	NC_015387	GAG	2	6	314214	314219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949853
5023	NC_015387	GGT	2	6	314358	314363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949853
5024	NC_015387	CCT	2	6	314417	314422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949853
5025	NC_015387	TGC	2	6	314482	314487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949853
5026	NC_015387	CGA	2	6	314540	314545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949853
5027	NC_015387	GGC	3	9	314698	314706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_015387	TGA	2	6	314818	314823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_015387	CCT	2	6	314864	314869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_015387	CTC	3	9	314922	314930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5031	NC_015387	TGG	2	6	315106	315111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_015387	TGG	2	6	315196	315201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_015387	CCT	2	6	315296	315301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5034	NC_015387	CAC	2	6	315368	315373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5035	NC_015387	GGT	2	6	315412	315417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_015387	GCG	2	6	315424	315429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_015387	GGC	2	6	315471	315476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_015387	GTG	2	6	315572	315577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_015387	CTT	2	6	315643	315648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_015387	GTG	2	6	315830	315835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_015387	GCC	2	6	315874	315879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949854
5042	NC_015387	TCC	2	6	315945	315950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949854
5043	NC_015387	CCA	2	6	315951	315956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949854
5044	NC_015387	CCA	2	6	315964	315969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949854
5045	NC_015387	CCG	2	6	316024	316029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949854
5046	NC_015387	CCA	2	6	316050	316055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949854
5047	NC_015387	GCC	3	9	316104	316112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949854
5048	NC_015387	GTT	2	6	316141	316146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949854
5049	NC_015387	AGG	2	6	316153	316158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949854
5050	NC_015387	CCT	2	6	316179	316184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949854
5051	NC_015387	GCA	2	6	316287	316292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949854
5052	NC_015387	AGC	2	6	316382	316387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949854
5053	NC_015387	CCT	2	6	316419	316424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949854
5054	NC_015387	ACC	2	6	316439	316444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949854
5055	NC_015387	CGC	2	6	316493	316498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949854
5056	NC_015387	TCC	2	6	316820	316825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949854
5057	NC_015387	CTC	2	6	316936	316941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949854
5058	NC_015387	GTT	2	6	317189	317194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_015387	AGG	2	6	317224	317229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_015387	GGT	2	6	317292	317297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949855
5061	NC_015387	CGC	2	6	317329	317334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949855
5062	NC_015387	GGC	3	9	317366	317374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949855
5063	NC_015387	GTG	2	6	317433	317438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949855
5064	NC_015387	CGC	2	6	317439	317444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949855
5065	NC_015387	AGG	2	6	317479	317484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949855
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5068	NC_015387	ACC	2	6	317640	317645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949855
5069	NC_015387	GTT	2	6	317654	317659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949855
5070	NC_015387	CCG	2	6	317672	317677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949855
5071	NC_015387	TGC	2	6	317743	317748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949855
5072	NC_015387	GGA	2	6	317783	317788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949855
5073	NC_015387	GTT	2	6	317822	317827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949855
5074	NC_015387	AGG	2	6	317923	317928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949855
5075	NC_015387	GGA	2	6	317978	317983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949855
5076	NC_015387	CCG	2	6	318039	318044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5077	NC_015387	CAG	2	6	318202	318207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949856
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5079	NC_015387	CCA	2	6	318231	318236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949856
5080	NC_015387	GGC	2	6	318338	318343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949856
5081	NC_015387	CAC	2	6	318399	318404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949856
5082	NC_015387	GGC	2	6	318429	318434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949856
5083	NC_015387	GGC	2	6	318453	318458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949856
5084	NC_015387	ACG	2	6	318536	318541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949856
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5087	NC_015387	TGC	2	6	318671	318676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949856
5088	NC_015387	AGG	2	6	318701	318706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949856
5089	NC_015387	CAC	2	6	318816	318821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949856
5090	NC_015387	ACG	2	6	318827	318832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949856
5091	NC_015387	ACT	2	6	318836	318841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949856
5092	NC_015387	TTC	2	6	318853	318858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949856
5093	NC_015387	CCG	2	6	318905	318910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949856
5094	NC_015387	TGG	2	6	318986	318991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949856
5095	NC_015387	CTT	2	6	319017	319022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949856
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5098	NC_015387	CCG	2	6	319301	319306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949856
5099	NC_015387	CGC	2	6	319350	319355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949856
5100	NC_015387	TTC	2	6	319360	319365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949856
5101	NC_015387	AGG	2	6	319376	319381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949856
5102	NC_015387	CGC	2	6	319424	319429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949856
5103	NC_015387	ACC	2	6	319475	319480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949856
5104	NC_015387	GAG	2	6	319510	319515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949856
5105	NC_015387	GCA	2	6	319601	319606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949857
5106	NC_015387	GCG	2	6	319628	319633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949857
5107	NC_015387	CCA	2	6	319781	319786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949857
5108	NC_015387	CCT	2	6	319901	319906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949857
5109	NC_015387	TCC	2	6	319933	319938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949857
5110	NC_015387	GCG	2	6	319950	319955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949857
5111	NC_015387	GGT	2	6	320015	320020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949857
5112	NC_015387	CTC	2	6	320025	320030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949857
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5121	NC_015387	AGG	2	6	320293	320298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949857
5122	NC_015387	CGG	2	6	320350	320355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949857
5123	NC_015387	GAC	2	6	320388	320393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949857
5124	NC_015387	TGG	2	6	320461	320466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949857
5125	NC_015387	CCA	2	6	320504	320509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949857
5126	NC_015387	CCT	2	6	320525	320530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949857
5127	NC_015387	CGC	2	6	320582	320587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949857
5128	NC_015387	GAA	2	6	320619	320624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949857
5129	NC_015387	GTG	2	6	320638	320643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949857
5130	NC_015387	GTA	2	6	320844	320849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949857
5131	NC_015387	CAC	2	6	320973	320978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949857
5132	NC_015387	GCT	2	6	321026	321031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949857
5133	NC_015387	CTC	2	6	321048	321053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949857
5134	NC_015387	GCG	2	6	321078	321083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949857
5135	NC_015387	GCC	2	6	321096	321101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949857
5136	NC_015387	ACC	2	6	321112	321117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949857
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5138	NC_015387	AGG	2	6	321263	321268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5139	NC_015387	CCT	2	6	321339	321344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949858
5140	NC_015387	CAG	2	6	321388	321393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949858
5141	NC_015387	CTT	2	6	321442	321447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949858
5142	NC_015387	CCT	2	6	321486	321491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949858
5143	NC_015387	GAG	2	6	321511	321516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949858
5144	NC_015387	CTC	2	6	321532	321537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949858
5145	NC_015387	CTG	2	6	321627	321632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5146	NC_015387	CAG	2	6	321712	321717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949859
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5149	NC_015387	GCC	2	6	321909	321914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949859
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5151	NC_015387	CCA	2	6	322029	322034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949859
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5153	NC_015387	GCC	2	6	322127	322132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949859
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5172	NC_015387	GGC	2	6	323080	323085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5173	NC_015387	ACG	2	6	323136	323141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949861
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5361	NC_015387	GTG	2	6	333918	333923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949873
5362	NC_015387	CGG	2	6	333944	333949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949873
5363	NC_015387	TGC	2	6	334027	334032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949873
5364	NC_015387	GCC	2	6	334345	334350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949874
5365	NC_015387	TCC	2	6	334401	334406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949874
5366	NC_015387	CGC	2	6	334480	334485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949874
5367	NC_015387	GGC	2	6	334513	334518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949874
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5369	NC_015387	CGC	2	6	334551	334556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949874
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5372	NC_015387	CGG	2	6	334670	334675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949874
5373	NC_015387	GTG	2	6	334715	334720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949874
5374	NC_015387	TGG	3	9	334728	334736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949874
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5391	NC_015387	GCT	2	6	335853	335858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949875
5392	NC_015387	GCT	2	6	335871	335876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949875
5393	NC_015387	TCG	2	6	335930	335935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949875
5394	NC_015387	GCT	2	6	335937	335942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949875
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5414	NC_015387	GAG	2	6	336829	336834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949875
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5417	NC_015387	TGC	2	6	336887	336892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949875
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5420	NC_015387	CGT	2	6	337149	337154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5432	NC_015387	GTG	2	6	338472	338477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949877
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5450	NC_015387	GTC	2	6	339215	339220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949878
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5472	NC_015387	GGA	2	6	340719	340724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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