MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 36833

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015387	CAC	2	6	30302	30307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949569
502	NC_015387	GGC	2	6	30374	30379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949569
503	NC_015387	GCC	2	6	30500	30505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949569
504	NC_015387	GGC	2	6	30645	30650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949569
505	NC_015387	CAC	2	6	30749	30754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949569
506	NC_015387	AGC	2	6	30795	30800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949569
507	NC_015387	CCA	2	6	30892	30897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949569
508	NC_015387	GAG	2	6	30929	30934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949569
509	NC_015387	CTG	2	6	30998	31003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949569
510	NC_015387	CCT	2	6	31049	31054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949570
511	NC_015387	CAC	2	6	31212	31217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949570
512	NC_015387	GCC	2	6	31419	31424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949570
513	NC_015387	CCA	2	6	31433	31438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949570
514	NC_015387	GGT	2	6	31535	31540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949570
515	NC_015387	GCG	2	6	31650	31655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949570
516	NC_015387	CTG	2	6	31659	31664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949570
517	NC_015387	ACC	2	6	31678	31683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949570
518	NC_015387	CCG	2	6	31772	31777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_015387	CGC	2	6	31792	31797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_015387	AGG	2	6	31917	31922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949571
521	NC_015387	CTT	2	6	31934	31939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949571
522	NC_015387	TCT	2	6	32101	32106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949571
523	NC_015387	TTG	2	6	32151	32156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949571
524	NC_015387	GGC	2	6	32222	32227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_015387	CCT	2	6	32449	32454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949572
526	NC_015387	CTC	2	6	32507	32512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949572
527	NC_015387	GTG	2	6	32618	32623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949572
528	NC_015387	GTG	2	6	32681	32686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949572
529	NC_015387	TCC	3	9	32694	32702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949572
530	NC_015387	GCC	2	6	32715	32720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949572
531	NC_015387	GGC	2	6	32721	32726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949572
532	NC_015387	GCG	2	6	32750	32755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_015387	GGC	2	6	32799	32804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949573
534	NC_015387	CAC	2	6	32874	32879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949573
535	NC_015387	GCC	2	6	32890	32895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949573
536	NC_015387	CAG	2	6	32898	32903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949573
537	NC_015387	CGG	2	6	32909	32914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949573
538	NC_015387	GTT	2	6	33396	33401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949573
539	NC_015387	CAC	2	6	33411	33416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949573
540	NC_015387	GCG	2	6	33431	33436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949573
541	NC_015387	CAC	2	6	33495	33500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949573
542	NC_015387	TGT	2	6	33602	33607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949573
543	NC_015387	GGC	2	6	33836	33841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949573
544	NC_015387	GAG	2	6	33967	33972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949574
545	NC_015387	CTC	2	6	34141	34146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949574
546	NC_015387	CCG	2	6	34173	34178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949574
547	NC_015387	ACG	3	9	34214	34222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949574
548	NC_015387	GCA	2	6	34575	34580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949574
549	NC_015387	GCG	2	6	34646	34651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949574
550	NC_015387	CTC	2	6	34675	34680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949574
551	NC_015387	ATC	2	6	34685	34690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949574
552	NC_015387	CAC	2	6	34702	34707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949574
553	NC_015387	GAG	2	6	34732	34737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949574
554	NC_015387	GAT	2	6	34861	34866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949574
555	NC_015387	GCG	2	6	35095	35100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949574
556	NC_015387	TCC	3	9	35235	35243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949575
557	NC_015387	AAG	2	6	35285	35290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949575
558	NC_015387	GCA	2	6	35308	35313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949575
559	NC_015387	CAC	2	6	35432	35437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949575
560	NC_015387	CGC	2	6	35573	35578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949575
561	NC_015387	GGA	2	6	35695	35700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949575
562	NC_015387	GAG	2	6	35711	35716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949575
563	NC_015387	GAA	3	9	35732	35740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949575
564	NC_015387	GAT	2	6	35789	35794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949575
565	NC_015387	TCC	2	6	35837	35842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_015387	TTC	2	6	35929	35934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949576
567	NC_015387	CCG	2	6	35946	35951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949576
568	NC_015387	CGC	2	6	36129	36134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949576
569	NC_015387	CTC	2	6	36148	36153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949576
570	NC_015387	CTT	3	9	36157	36165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949576
571	NC_015387	AAC	2	6	36179	36184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949576
572	NC_015387	GAT	2	6	36253	36258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949576
573	NC_015387	GTG	2	6	36296	36301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949576
574	NC_015387	GCC	2	6	36313	36318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949576
575	NC_015387	GTC	2	6	36382	36387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949576
576	NC_015387	GCC	2	6	36426	36431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949576
577	NC_015387	GAG	2	6	36490	36495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949576
578	NC_015387	GAT	2	6	36520	36525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949576
579	NC_015387	CCA	2	6	36567	36572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949576
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582	NC_015387	CTT	2	6	36739	36744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949576
583	NC_015387	CCT	2	6	36750	36755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949576
584	NC_015387	CTC	2	6	36781	36786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949576
585	NC_015387	GCG	2	6	36859	36864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949576
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587	NC_015387	CGT	2	6	36906	36911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949576
588	NC_015387	GGC	2	6	36954	36959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949576
589	NC_015387	GAG	2	6	37117	37122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949577
590	NC_015387	GAG	2	6	37228	37233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949577
591	NC_015387	GAG	2	6	37240	37245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949577
592	NC_015387	TCC	2	6	37319	37324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949578
593	NC_015387	CCA	2	6	37423	37428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949578
594	NC_015387	ACC	3	9	37496	37504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949578
595	NC_015387	CGG	2	6	37563	37568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949578
596	NC_015387	CGG	2	6	37725	37730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949578
597	NC_015387	GTA	2	6	37744	37749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949578
598	NC_015387	CGC	2	6	37753	37758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949578
599	NC_015387	CGT	2	6	37821	37826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949578
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601	NC_015387	CGA	2	6	37842	37847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949578
602	NC_015387	GCG	2	6	37848	37853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949578
603	NC_015387	TCC	2	6	37892	37897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949578
604	NC_015387	GGA	2	6	38094	38099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949578
605	NC_015387	CAC	2	6	38263	38268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949578
606	NC_015387	CTG	2	6	38284	38289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949578
607	NC_015387	GCA	2	6	38331	38336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949578
608	NC_015387	GTG	2	6	38378	38383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949578
609	NC_015387	TCC	2	6	38411	38416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949578
610	NC_015387	TCG	2	6	38417	38422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949578
611	NC_015387	CAC	2	6	38512	38517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949578
612	NC_015387	GAG	2	6	38566	38571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949578
613	NC_015387	GTC	2	6	38575	38580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949578
614	NC_015387	TGA	2	6	38610	38615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949578
615	NC_015387	GCA	2	6	38658	38663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949578
616	NC_015387	GCG	2	6	38788	38793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949578
617	NC_015387	CAT	2	6	38914	38919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949578
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620	NC_015387	CAC	2	6	39111	39116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949579
621	NC_015387	CCA	2	6	39165	39170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949579
622	NC_015387	TCC	2	6	39191	39196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949579
623	NC_015387	GGA	2	6	39207	39212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949579
624	NC_015387	GCC	2	6	39235	39240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949579
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