MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 36833

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36001	NC_015387	CCT	2	6	2220285	2220290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328951700
36002	NC_015387	GCA	2	6	2220393	2220398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328951700
36003	NC_015387	AGC	2	6	2220488	2220493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328951700
36004	NC_015387	CCT	2	6	2220525	2220530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328951700
36005	NC_015387	ACC	2	6	2220545	2220550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328951700
36006	NC_015387	CGC	2	6	2220599	2220604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951700
36007	NC_015387	TCC	2	6	2220926	2220931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328951700
36008	NC_015387	CTC	2	6	2221042	2221047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328951700
36009	NC_015387	TAA	2	6	2221207	2221212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36010	NC_015387	CTG	2	6	2221281	2221286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328951701
36011	NC_015387	TTC	2	6	2221287	2221292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328951701
36012	NC_015387	GCG	2	6	2221300	2221305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328951701
36013	NC_015387	GGA	2	6	2221403	2221408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328951701
36014	NC_015387	GGT	2	6	2221441	2221446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328951702
36015	NC_015387	GTG	2	6	2221477	2221482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328951702
36016	NC_015387	ACC	2	6	2221521	2221526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328951702
36017	NC_015387	CCG	2	6	2221540	2221545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951702
36018	NC_015387	CCG	2	6	2221609	2221614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951702
36019	NC_015387	GCC	2	6	2221663	2221668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951702
36020	NC_015387	CCT	2	6	2221699	2221704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328951702
36021	NC_015387	CCG	2	6	2221729	2221734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951702
36022	NC_015387	CAC	2	6	2221760	2221765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328951702
36023	NC_015387	TCG	2	6	2221784	2221789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328951702
36024	NC_015387	GCT	2	6	2221846	2221851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328951702
36025	NC_015387	CGC	2	6	2221899	2221904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951702
36026	NC_015387	TCC	2	6	2221911	2221916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328951702
36027	NC_015387	TCG	2	6	2221956	2221961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328951702
36028	NC_015387	ACC	2	6	2222004	2222009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328951702
36029	NC_015387	CAA	2	6	2222054	2222059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328951702
36030	NC_015387	CCA	2	6	2222083	2222088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328951702
36031	NC_015387	CTC	2	6	2222159	2222164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328951702
36032	NC_015387	CCA	2	6	2222188	2222193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328951702
36033	NC_015387	GCC	2	6	2222218	2222223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951702
36034	NC_015387	TTC	2	6	2222253	2222258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328951702
36035	NC_015387	GTA	2	6	2222264	2222269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328951702
36036	NC_015387	CTC	2	6	2222330	2222335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328951702
36037	NC_015387	GAG	2	6	2222372	2222377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328951702
36038	NC_015387	GCG	2	6	2222399	2222404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328951702
36039	NC_015387	CCA	2	6	2222473	2222478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328951702
36040	NC_015387	CCG	2	6	2222490	2222495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951702
36041	NC_015387	CGC	2	6	2222564	2222569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951702
36042	NC_015387	GGC	2	6	2222689	2222694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328951702
36043	NC_015387	CCG	2	6	2222766	2222771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951702
36044	NC_015387	GCG	2	6	2222789	2222794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328951702
36045	NC_015387	CCT	2	6	2222828	2222833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36046	NC_015387	GCC	2	6	2222898	2222903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36047	NC_015387	GCG	2	6	2222977	2222982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36048	NC_015387	GCG	2	6	2223023	2223028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36049	NC_015387	CCA	2	6	2223300	2223305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328951703
36050	NC_015387	GCG	2	6	2223330	2223335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328951703
36051	NC_015387	CAC	3	9	2223376	2223384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328951703
36052	NC_015387	CCG	3	9	2223426	2223434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951703
36053	NC_015387	GGA	2	6	2223450	2223455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328951703
36054	NC_015387	CTC	2	6	2223463	2223468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328951703
36055	NC_015387	AGT	2	6	2223573	2223578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328951703
36056	NC_015387	GCC	2	6	2223611	2223616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951703
36057	NC_015387	GAG	2	6	2223655	2223660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328951703
36058	NC_015387	GCC	2	6	2223711	2223716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951703
36059	NC_015387	GCA	2	6	2223798	2223803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328951703
36060	NC_015387	AGC	2	6	2223818	2223823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328951703
36061	NC_015387	AAG	2	6	2223903	2223908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328951704
36062	NC_015387	CAG	2	6	2223920	2223925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328951704
36063	NC_015387	GTA	2	6	2223926	2223931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328951704
36064	NC_015387	CAT	2	6	2224031	2224036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328951704
36065	NC_015387	CCA	2	6	2224061	2224066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328951704
36066	NC_015387	AGG	2	6	2224080	2224085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328951704
36067	NC_015387	CCG	2	6	2224153	2224158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951704
36068	NC_015387	CGC	2	6	2224191	2224196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951704
36069	NC_015387	CGC	2	6	2224245	2224250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951704
36070	NC_015387	CAC	2	6	2224538	2224543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328951704
36071	NC_015387	GCG	2	6	2224602	2224607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328951704
36072	NC_015387	CCT	2	6	2224679	2224684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328951705
36073	NC_015387	CCT	2	6	2224700	2224705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328951705
36074	NC_015387	GTA	2	6	2224725	2224730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328951705
36075	NC_015387	CGG	2	6	2224927	2224932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328951705
36076	NC_015387	GAG	2	6	2225019	2225024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328951705
36077	NC_015387	ACG	2	6	2225203	2225208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36078	NC_015387	GCC	2	6	2225298	2225303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951706
36079	NC_015387	TGC	2	6	2225365	2225370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328951706
36080	NC_015387	ACT	3	9	2225464	2225472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328951706
36081	NC_015387	GGA	3	9	2225582	2225590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328951706
36082	NC_015387	ACT	2	6	2225623	2225628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328951706
36083	NC_015387	GAG	2	6	2225772	2225777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328951706
36084	NC_015387	AGG	2	6	2225998	2226003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328951706
36085	NC_015387	ACG	2	6	2226148	2226153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328951706
36086	NC_015387	CTT	2	6	2226188	2226193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328951706
36087	NC_015387	CCA	2	6	2226290	2226295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328951706
36088	NC_015387	AGC	2	6	2226373	2226378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328951706
36089	NC_015387	TCC	2	6	2226379	2226384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328951706
36090	NC_015387	GGA	2	6	2226422	2226427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328951706
36091	NC_015387	CGA	2	6	2226449	2226454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328951706
36092	NC_015387	GGA	2	6	2226476	2226481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328951706
36093	NC_015387	CGC	2	6	2226488	2226493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951706
36094	NC_015387	CTG	2	6	2226549	2226554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328951706
36095	NC_015387	GGT	2	6	2226596	2226601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328951706
36096	NC_015387	GCT	2	6	2226608	2226613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328951706
36097	NC_015387	CTC	2	6	2226679	2226684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328951707
36098	NC_015387	CGA	2	6	2226741	2226746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328951707
36099	NC_015387	CGG	2	6	2226778	2226783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328951707
36100	NC_015387	GCG	2	6	2226800	2226805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328951707
36101	NC_015387	TGG	2	6	2226977	2226982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328951707
36102	NC_015387	GGC	2	6	2227020	2227025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328951707
36103	NC_015387	TCT	2	6	2227070	2227075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328951707
36104	NC_015387	ATC	2	6	2227082	2227087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328951707
36105	NC_015387	ACG	2	6	2227103	2227108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328951707
36106	NC_015387	GAG	2	6	2227123	2227128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328951707
36107	NC_015387	GAT	2	6	2227173	2227178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328951707
36108	NC_015387	ACC	2	6	2227184	2227189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328951707
36109	NC_015387	TCG	2	6	2227519	2227524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328951708
36110	NC_015387	CGC	2	6	2227559	2227564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951708
36111	NC_015387	GCC	2	6	2227675	2227680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951708
36112	NC_015387	CGC	2	6	2227718	2227723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951708
36113	NC_015387	GCT	2	6	2227748	2227753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328951708
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36115	NC_015387	TGG	2	6	2227807	2227812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328951708
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36230	NC_015387	CCT	2	6	2234199	2234204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328951714
36231	NC_015387	GAA	2	6	2234227	2234232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328951714
36232	NC_015387	ATG	2	6	2234240	2234245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328951714
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36235	NC_015387	GAA	2	6	2234500	2234505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328951714
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36252	NC_015387	GCG	2	6	2235423	2235428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328951715
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36256	NC_015387	CGC	2	6	2235568	2235573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951715
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36290	NC_015387	CTG	2	6	2237429	2237434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328951716
36291	NC_015387	ACC	2	6	2237460	2237465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328951716
36292	NC_015387	CAC	2	6	2237495	2237500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328951716
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36294	NC_015387	CCT	2	6	2237627	2237632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36295	NC_015387	TCC	2	6	2237691	2237696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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36298	NC_015387	CCG	2	6	2237822	2237827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951717
36299	NC_015387	GGT	2	6	2237843	2237848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328951717
36300	NC_015387	GTC	2	6	2237873	2237878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328951717
36301	NC_015387	TCG	2	6	2237955	2237960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328951717
36302	NC_015387	GGC	2	6	2238023	2238028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328951717
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36324	NC_015387	GCC	2	6	2239640	2239645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951719
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36327	NC_015387	AGG	2	6	2239852	2239857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36328	NC_015387	TTC	2	6	2239880	2239885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328951720
36329	NC_015387	GCA	2	6	2239940	2239945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328951720
36330	NC_015387	CGG	2	6	2240124	2240129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328951720
36331	NC_015387	TGG	2	6	2240147	2240152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328951720
36332	NC_015387	GCT	2	6	2240318	2240323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328951720
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36334	NC_015387	GAG	2	6	2240431	2240436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328951720
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36336	NC_015387	CGG	2	6	2240493	2240498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328951720
36337	NC_015387	CCT	2	6	2240508	2240513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328951720
36338	NC_015387	ACG	2	6	2240555	2240560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328951720
36339	NC_015387	CAC	2	6	2240592	2240597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328951720
36340	NC_015387	CGT	2	6	2240598	2240603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328951720
36341	NC_015387	CGG	2	6	2240631	2240636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328951720
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36452	NC_015387	GAA	2	6	2246329	2246334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36453	NC_015387	CCG	2	6	2246379	2246384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951724
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