MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 36833

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_015387	CGA	2	6	188155	188160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949720
3003	NC_015387	GTG	2	6	188171	188176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949720
3004	NC_015387	CCT	2	6	188197	188202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949720
3005	NC_015387	CAC	2	6	188212	188217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949720
3006	NC_015387	CTA	2	6	188221	188226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949720
3007	NC_015387	GGA	2	6	188329	188334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949720
3008	NC_015387	CCT	2	6	188350	188355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949720
3009	NC_015387	GGC	2	6	188500	188505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949720
3010	NC_015387	GTT	2	6	188557	188562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949720
3011	NC_015387	CCT	2	6	188569	188574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949720
3012	NC_015387	ACG	3	9	188610	188618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949720
3013	NC_015387	CGC	2	6	188650	188655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949720
3014	NC_015387	AGG	2	6	188766	188771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949720
3015	NC_015387	GCG	2	6	188838	188843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949720
3016	NC_015387	CTG	2	6	188867	188872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949720
3017	NC_015387	CGG	2	6	188876	188881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949720
3018	NC_015387	GGT	2	6	188991	188996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949720
3019	NC_015387	GCG	2	6	189025	189030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949721
3020	NC_015387	TAC	2	6	189076	189081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949721
3021	NC_015387	GAG	2	6	189085	189090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949721
3022	NC_015387	GGA	2	6	189138	189143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949721
3023	NC_015387	CGT	2	6	189149	189154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949721
3024	NC_015387	ATG	2	6	189252	189257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949721
3025	NC_015387	AAT	2	6	189344	189349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328949722
3026	NC_015387	CCT	2	6	189429	189434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949723
3027	NC_015387	ATC	2	6	189586	189591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949723
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3029	NC_015387	CCT	2	6	189708	189713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949723
3030	NC_015387	GCC	2	6	189742	189747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949723
3031	NC_015387	CTG	2	6	189760	189765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949723
3032	NC_015387	TGC	2	6	189812	189817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949723
3033	NC_015387	GTG	2	6	189823	189828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949723
3034	NC_015387	CCG	2	6	189839	189844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949723
3035	NC_015387	CTG	2	6	189923	189928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949723
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3040	NC_015387	GCT	2	6	190147	190152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949724
3041	NC_015387	GGC	2	6	190291	190296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949724
3042	NC_015387	TGC	2	6	190314	190319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949724
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3052	NC_015387	GCT	2	6	190801	190806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949724
3053	NC_015387	CTC	2	6	190807	190812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949724
3054	NC_015387	CTG	2	6	190889	190894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949724
3055	NC_015387	CTG	2	6	190931	190936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949724
3056	NC_015387	CTG	2	6	190970	190975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949724
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3065	NC_015387	TGC	2	6	191316	191321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949724
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3069	NC_015387	CCA	2	6	191630	191635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3072	NC_015387	GAG	2	6	192026	192031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3083	NC_015387	GCC	2	6	192557	192562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3084	NC_015387	ACC	2	6	192569	192574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3102	NC_015387	GAA	2	6	193867	193872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949727
3103	NC_015387	CAC	2	6	193938	193943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949727
3104	NC_015387	AGA	2	6	194013	194018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949727
3105	NC_015387	GAG	2	6	194068	194073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949727
3106	NC_015387	GCG	2	6	194103	194108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949727
3107	NC_015387	GAG	2	6	194125	194130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949727
3108	NC_015387	CCA	2	6	194231	194236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949727
3109	NC_015387	AAG	2	6	194273	194278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949727
3110	NC_015387	CTC	2	6	194326	194331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949727
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3119	NC_015387	TGG	2	6	195120	195125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949728
3120	NC_015387	GCA	2	6	195232	195237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949728
3121	NC_015387	CTA	3	9	195259	195267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949728
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3123	NC_015387	CGC	2	6	195326	195331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949728
3124	NC_015387	TCC	2	6	195345	195350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949728
3125	NC_015387	GCA	2	6	195373	195378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949728
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3153	NC_015387	TCA	2	6	196824	196829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949730
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3181	NC_015387	TGC	2	6	198067	198072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949732
3182	NC_015387	TGG	2	6	198124	198129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949732
3183	NC_015387	GCC	3	9	198137	198145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949732
3184	NC_015387	CTC	2	6	198204	198209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949732
3185	NC_015387	GGA	2	6	198320	198325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949732
3186	NC_015387	CAT	2	6	198371	198376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3189	NC_015387	CGG	2	6	198723	198728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949733
3190	NC_015387	TGG	3	9	198803	198811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949733
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3208	NC_015387	TCG	2	6	199998	200003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949735
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3232	NC_015387	TGG	2	6	201919	201924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949738
3233	NC_015387	CAC	2	6	201981	201986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949738
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3361	NC_015387	GCA	2	6	209361	209366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949746
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3447	NC_015387	GGC	2	6	215196	215201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949753
3448	NC_015387	GGC	2	6	215289	215294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949753
3449	NC_015387	CTT	2	6	215318	215323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949753
3450	NC_015387	TAG	2	6	215374	215379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3461	NC_015387	CGC	2	6	215737	215742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949755
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3466	NC_015387	ACG	2	6	215877	215882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949755
3467	NC_015387	TGG	2	6	215934	215939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949755
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3469	NC_015387	CCT	2	6	215995	216000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949755
3470	NC_015387	CGC	2	6	216032	216037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949755
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3472	NC_015387	CCT	2	6	216172	216177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949755
3473	NC_015387	TCA	2	6	216183	216188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949755
3474	NC_015387	GAG	2	6	216226	216231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949755
3475	NC_015387	GCT	2	6	216273	216278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949756
3476	NC_015387	CGG	2	6	216284	216289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949756
3477	NC_015387	CTG	2	6	216349	216354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949756
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3479	NC_015387	GCC	2	6	216405	216410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949756
3480	NC_015387	TCC	2	6	216449	216454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949756
3481	NC_015387	CTC	2	6	216490	216495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949756
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