MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 2388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013851	CGCGC	2	10	563	572	0 %	0 %	40 %	60 %	288939765
2	NC_013851	CACGC	2	10	1504	1513	20 %	0 %	20 %	60 %	288939765
3	NC_013851	GCGAC	2	10	1538	1547	20 %	0 %	40 %	40 %	288939765
4	NC_013851	CGATC	2	10	2324	2333	20 %	20 %	20 %	40 %	288939766
5	NC_013851	GGCCG	2	10	3115	3124	0 %	0 %	60 %	40 %	288939767
6	NC_013851	CTGGA	2	10	3359	3368	20 %	20 %	40 %	20 %	288939767
7	NC_013851	CGGTC	2	10	4579	4588	0 %	20 %	40 %	40 %	288939769
8	NC_013851	CGCCA	2	10	4640	4649	20 %	0 %	20 %	60 %	288939769
9	NC_013851	GCCGA	2	10	7525	7534	20 %	0 %	40 %	40 %	288939771
10	NC_013851	ATGTC	2	10	10270	10279	20 %	40 %	20 %	20 %	288939773
11	NC_013851	CGGCC	2	10	11395	11404	0 %	0 %	40 %	60 %	288939775
12	NC_013851	GCCTG	2	10	11473	11482	0 %	20 %	40 %	40 %	288939775
13	NC_013851	GCGCC	2	10	12422	12431	0 %	0 %	40 %	60 %	288939776
14	NC_013851	GGCGA	2	10	13386	13395	20 %	0 %	60 %	20 %	288939777
15	NC_013851	GTCGA	2	10	17542	17551	20 %	20 %	40 %	20 %	288939779
16	NC_013851	TTCGC	2	10	17951	17960	0 %	40 %	20 %	40 %	288939779
17	NC_013851	TCGAC	2	10	19525	19534	20 %	20 %	20 %	40 %	288939781
18	NC_013851	GCGTC	2	10	21149	21158	0 %	20 %	40 %	40 %	288939783
19	NC_013851	ATGAC	2	10	21335	21344	40 %	20 %	20 %	20 %	288939783
20	NC_013851	TTCGG	2	10	22969	22978	0 %	40 %	40 %	20 %	288939785
21	NC_013851	GCCGG	2	10	26020	26029	0 %	0 %	60 %	40 %	288939790
22	NC_013851	CGTCG	2	10	26079	26088	0 %	20 %	40 %	40 %	288939790
23	NC_013851	GGCGG	2	10	28099	28108	0 %	0 %	80 %	20 %	288939791
24	NC_013851	CGGAC	2	10	29061	29070	20 %	0 %	40 %	40 %	288939793
25	NC_013851	GTTCG	2	10	29078	29087	0 %	40 %	40 %	20 %	288939793
26	NC_013851	TCACG	2	10	29755	29764	20 %	20 %	20 %	40 %	288939794
27	NC_013851	CGGCG	2	10	30303	30312	0 %	0 %	60 %	40 %	288939795
28	NC_013851	GTGCT	2	10	31530	31539	0 %	40 %	40 %	20 %	288939795
29	NC_013851	TGGCA	2	10	32297	32306	20 %	20 %	40 %	20 %	288939795
30	NC_013851	CTGGC	2	10	32532	32541	0 %	20 %	40 %	40 %	288939795
31	NC_013851	GCCGC	2	10	33965	33974	0 %	0 %	40 %	60 %	288939795
32	NC_013851	CAGCC	2	10	34289	34298	20 %	0 %	20 %	60 %	288939796
33	NC_013851	GCGCC	2	10	38189	38198	0 %	0 %	40 %	60 %	288939797
34	NC_013851	CGGAT	2	10	38611	38620	20 %	20 %	40 %	20 %	288939797
35	NC_013851	CCGCG	2	10	40046	40055	0 %	0 %	40 %	60 %	288939797
36	NC_013851	GATCG	2	10	41168	41177	20 %	20 %	40 %	20 %	288939799
37	NC_013851	CGCGA	2	10	43809	43818	20 %	0 %	40 %	40 %	288939802
38	NC_013851	CGTCG	2	10	47144	47153	0 %	20 %	40 %	40 %	288939807
39	NC_013851	ACGCC	2	10	49247	49256	20 %	0 %	20 %	60 %	288939809
40	NC_013851	CGTGC	2	10	51109	51118	0 %	20 %	40 %	40 %	288939810
41	NC_013851	TCAGG	2	10	51490	51499	20 %	20 %	40 %	20 %	288939811
42	NC_013851	GGGCA	2	10	51987	51996	20 %	0 %	60 %	20 %	288939812
43	NC_013851	CGACG	2	10	54696	54705	20 %	0 %	40 %	40 %	288939813
44	NC_013851	GTCGC	2	10	57053	57062	0 %	20 %	40 %	40 %	288939814
45	NC_013851	GCGCC	2	10	59598	59607	0 %	0 %	40 %	60 %	288939816
46	NC_013851	GAGCA	2	10	60720	60729	40 %	0 %	40 %	20 %	288939818
47	NC_013851	GGCGA	2	10	61817	61826	20 %	0 %	60 %	20 %	288939819
48	NC_013851	GCCCG	2	10	63561	63570	0 %	0 %	40 %	60 %	288939821
49	NC_013851	GATGG	2	10	63675	63684	20 %	20 %	60 %	0 %	288939821
50	NC_013851	GATGT	2	10	64198	64207	20 %	40 %	40 %	0 %	288939822
51	NC_013851	GGCGC	2	10	65220	65229	0 %	0 %	60 %	40 %	288939822
52	NC_013851	GGCGC	2	10	67074	67083	0 %	0 %	60 %	40 %	288939823
53	NC_013851	ATCCG	2	10	68140	68149	20 %	20 %	20 %	40 %	288939824
54	NC_013851	GGGCT	2	10	69705	69714	0 %	20 %	60 %	20 %	288939825
55	NC_013851	CGCGA	2	10	70077	70086	20 %	0 %	40 %	40 %	288939826
56	NC_013851	CGCGC	2	10	72955	72964	0 %	0 %	40 %	60 %	288939828
57	NC_013851	CGTGG	2	10	75038	75047	0 %	20 %	60 %	20 %	288939831
58	NC_013851	CCTGG	2	10	77175	77184	0 %	20 %	40 %	40 %	288939833
59	NC_013851	CCGAT	2	10	78631	78640	20 %	20 %	20 %	40 %	288939835
60	NC_013851	GGGCA	2	10	79034	79043	20 %	0 %	60 %	20 %	288939836
61	NC_013851	GGTCA	2	10	85803	85812	20 %	20 %	40 %	20 %	288939843
62	NC_013851	GCGCG	2	10	86473	86482	0 %	0 %	60 %	40 %	288939844
63	NC_013851	GGGCG	2	10	86546	86555	0 %	0 %	80 %	20 %	288939844
64	NC_013851	GATCG	2	10	88390	88399	20 %	20 %	40 %	20 %	288939846
65	NC_013851	GCCAA	2	10	88504	88513	40 %	0 %	20 %	40 %	288939846
66	NC_013851	GCGTC	2	10	88524	88533	0 %	20 %	40 %	40 %	288939846
67	NC_013851	GGCCT	2	10	90115	90124	0 %	20 %	40 %	40 %	288939848
68	NC_013851	ACAGG	2	10	91461	91470	40 %	0 %	40 %	20 %	288939849
69	NC_013851	GCGCC	2	10	91879	91888	0 %	0 %	40 %	60 %	288939850
70	NC_013851	CCAGG	2	10	94990	94999	20 %	0 %	40 %	40 %	288939853
71	NC_013851	GGCCT	2	10	95355	95364	0 %	20 %	40 %	40 %	288939854
72	NC_013851	TAGCG	2	10	97177	97186	20 %	20 %	40 %	20 %	288939858
73	NC_013851	GCCCC	2	10	98550	98559	0 %	0 %	20 %	80 %	288939859
74	NC_013851	GGATC	2	10	101774	101783	20 %	20 %	40 %	20 %	288939863
75	NC_013851	GACCG	2	10	104878	104887	20 %	0 %	40 %	40 %	288939864
76	NC_013851	GGCGT	2	10	106636	106645	0 %	20 %	60 %	20 %	288939866
77	NC_013851	CCGGC	2	10	108304	108313	0 %	0 %	40 %	60 %	288939869
78	NC_013851	ACGGC	2	10	108884	108893	20 %	0 %	40 %	40 %	288939870
79	NC_013851	TGGCT	2	10	110441	110450	0 %	40 %	40 %	20 %	288939872
80	NC_013851	GGGCA	2	10	118057	118066	20 %	0 %	60 %	20 %	288939874
81	NC_013851	AGATC	2	10	118594	118603	40 %	20 %	20 %	20 %	288939875
82	NC_013851	GCCGA	2	10	122902	122911	20 %	0 %	40 %	40 %	288939880
83	NC_013851	GGGCG	2	10	126762	126771	0 %	0 %	80 %	20 %	288939882
84	NC_013851	GCCGC	2	10	126803	126812	0 %	0 %	40 %	60 %	288939882
85	NC_013851	GTCGT	2	10	127892	127901	0 %	40 %	40 %	20 %	288939884
86	NC_013851	GCGCC	2	10	128579	128588	0 %	0 %	40 %	60 %	288939884
87	NC_013851	GATCG	2	10	128719	128728	20 %	20 %	40 %	20 %	288939884
88	NC_013851	GCTCG	2	10	129875	129884	0 %	20 %	40 %	40 %	288939885
89	NC_013851	TTCGC	2	10	131188	131197	0 %	40 %	20 %	40 %	288939886
90	NC_013851	GCGAT	2	10	132540	132549	20 %	20 %	40 %	20 %	288939888
91	NC_013851	CCGCG	2	10	132735	132744	0 %	0 %	40 %	60 %	288939889
92	NC_013851	AGGGC	2	10	134468	134477	20 %	0 %	60 %	20 %	288939889
93	NC_013851	CGGCG	2	10	136706	136715	0 %	0 %	60 %	40 %	288939891
94	NC_013851	CGATC	2	10	137650	137659	20 %	20 %	20 %	40 %	288939892
95	NC_013851	GAAGG	2	10	138065	138074	40 %	0 %	60 %	0 %	288939892
96	NC_013851	CGCGC	2	10	138110	138119	0 %	0 %	40 %	60 %	288939892
97	NC_013851	ACGGT	2	10	138171	138180	20 %	20 %	40 %	20 %	288939892
98	NC_013851	CGGCG	2	10	140432	140441	0 %	0 %	60 %	40 %	288939894
99	NC_013851	GCTCG	2	10	143429	143438	0 %	20 %	40 %	40 %	288939897
100	NC_013851	ATTCG	2	10	143657	143666	20 %	40 %	20 %	20 %	288939897
101	NC_013851	TGATC	2	10	149928	149937	20 %	40 %	20 %	20 %	288939903
102	NC_013851	GACCG	2	10	149982	149991	20 %	0 %	40 %	40 %	288939903
103	NC_013851	CGGGC	2	10	151070	151079	0 %	0 %	60 %	40 %	288939904
104	NC_013851	GGTCA	2	10	151287	151296	20 %	20 %	40 %	20 %	288939904
105	NC_013851	CCGCG	2	10	153256	153265	0 %	0 %	40 %	60 %	288939905
106	NC_013851	TCCGG	2	10	155734	155743	0 %	20 %	40 %	40 %	288939907
107	NC_013851	TCGGC	2	10	156630	156639	0 %	20 %	40 %	40 %	288939909
108	NC_013851	TCGCG	2	10	157678	157687	0 %	20 %	40 %	40 %	288939910
109	NC_013851	CGGGT	2	10	158383	158392	0 %	20 %	60 %	20 %	288939910
110	NC_013851	GCCCG	2	10	160119	160128	0 %	0 %	40 %	60 %	288939913
111	NC_013851	CGACC	2	10	162855	162864	20 %	0 %	20 %	60 %	288939915
112	NC_013851	GGGCG	2	10	162918	162927	0 %	0 %	80 %	20 %	288939915
113	NC_013851	GCCTC	2	10	164121	164130	0 %	20 %	20 %	60 %	288939917
114	NC_013851	CGACG	2	10	165391	165400	20 %	0 %	40 %	40 %	288939918
115	NC_013851	CTCGA	2	10	167499	167508	20 %	20 %	20 %	40 %	288939919
116	NC_013851	TCGCC	2	10	168981	168990	0 %	20 %	20 %	60 %	288939922
117	NC_013851	CAACC	2	10	169075	169084	40 %	0 %	0 %	60 %	288939922
118	NC_013851	CCGTC	2	10	169653	169662	0 %	20 %	20 %	60 %	288939922
119	NC_013851	TTGGC	2	10	171077	171086	0 %	40 %	40 %	20 %	288939923
120	NC_013851	GCCAG	2	10	172803	172812	20 %	0 %	40 %	40 %	288939924
121	NC_013851	CGGGC	2	10	176646	176655	0 %	0 %	60 %	40 %	288939927
122	NC_013851	GCGCG	2	10	178236	178245	0 %	0 %	60 %	40 %	288939928
123	NC_013851	GCAGG	2	10	178264	178273	20 %	0 %	60 %	20 %	288939928
124	NC_013851	CCGCG	2	10	178407	178416	0 %	0 %	40 %	60 %	288939928
125	NC_013851	CCAAT	2	10	184584	184593	40 %	20 %	0 %	40 %	288939936
126	NC_013851	GCGCC	2	10	185758	185767	0 %	0 %	40 %	60 %	288939938
127	NC_013851	CATGA	2	10	186633	186642	40 %	20 %	20 %	20 %	288939939
128	NC_013851	CTGGA	2	10	186948	186957	20 %	20 %	40 %	20 %	288939939
129	NC_013851	CCGTC	2	10	188916	188925	0 %	20 %	20 %	60 %	288939940
130	NC_013851	GCGCT	2	10	193240	193249	0 %	20 %	40 %	40 %	288939942
131	NC_013851	TGACC	2	10	193715	193724	20 %	20 %	20 %	40 %	288939942
132	NC_013851	CTCGA	2	10	196352	196361	20 %	20 %	20 %	40 %	288939943
133	NC_013851	GGCCG	2	10	197083	197092	0 %	0 %	60 %	40 %	288939943
134	NC_013851	CGATC	2	10	197518	197527	20 %	20 %	20 %	40 %	288939943
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389	NC_013851	GATGG	2	10	561116	561125	20 %	20 %	60 %	0 %	288940234
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