MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 2388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013851	CGGCC	2	10	702395	702404	0 %	0 %	40 %	60 %	288940346
502	NC_013851	AGATC	2	10	702517	702526	40 %	20 %	20 %	20 %	288940346
503	NC_013851	GCGGG	2	10	702944	702953	0 %	0 %	80 %	20 %	288940347
504	NC_013851	GAAGA	2	10	704237	704246	60 %	0 %	40 %	0 %	288940348
505	NC_013851	GGCGT	2	10	705384	705393	0 %	20 %	60 %	20 %	288940348
506	NC_013851	CGTCT	2	10	706622	706631	0 %	40 %	20 %	40 %	288940350
507	NC_013851	ATCGA	2	10	708153	708162	40 %	20 %	20 %	20 %	288940351
508	NC_013851	CGATC	2	10	708488	708497	20 %	20 %	20 %	40 %	288940351
509	NC_013851	GCAGC	2	10	709118	709127	20 %	0 %	40 %	40 %	288940351
510	NC_013851	GCATC	2	10	709810	709819	20 %	20 %	20 %	40 %	288940352
511	NC_013851	GAGCT	2	10	712087	712096	20 %	20 %	40 %	20 %	288940353
512	NC_013851	CGCCC	2	10	717809	717818	0 %	0 %	20 %	80 %	288940357
513	NC_013851	CAGGC	2	10	717838	717847	20 %	0 %	40 %	40 %	288940357
514	NC_013851	GCCGG	2	10	720160	720169	0 %	0 %	60 %	40 %	288940359
515	NC_013851	CGAGC	2	10	723084	723093	20 %	0 %	40 %	40 %	288940359
516	NC_013851	CGAGT	2	10	723212	723221	20 %	20 %	40 %	20 %	288940360
517	NC_013851	GTTCG	2	10	723833	723842	0 %	40 %	40 %	20 %	288940360
518	NC_013851	TGGGC	2	10	724439	724448	0 %	20 %	60 %	20 %	288940360
519	NC_013851	GGCGA	2	10	724935	724944	20 %	0 %	60 %	20 %	288940360
520	NC_013851	TCGGC	2	10	725812	725821	0 %	20 %	40 %	40 %	288940360
521	NC_013851	GCGCG	2	10	726493	726502	0 %	0 %	60 %	40 %	288940360
522	NC_013851	CCGCG	2	10	727987	727996	0 %	0 %	40 %	60 %	288940362
523	NC_013851	GCGCG	2	10	730454	730463	0 %	0 %	60 %	40 %	288940364
524	NC_013851	GGCGT	2	10	731284	731293	0 %	20 %	60 %	20 %	288940364
525	NC_013851	GCGCC	2	10	731434	731443	0 %	0 %	40 %	60 %	288940365
526	NC_013851	CATGC	2	10	731919	731928	20 %	20 %	20 %	40 %	288940365
527	NC_013851	CAGAT	2	10	732709	732718	40 %	20 %	20 %	20 %	288940366
528	NC_013851	AACCG	2	10	734892	734901	40 %	0 %	20 %	40 %	288940369
529	NC_013851	GCCCG	2	10	734989	734998	0 %	0 %	40 %	60 %	288940369
530	NC_013851	CGGGC	2	10	735092	735101	0 %	0 %	60 %	40 %	288940369
531	NC_013851	CGGCA	2	10	736232	736241	20 %	0 %	40 %	40 %	288940370
532	NC_013851	CGTGG	2	10	738049	738058	0 %	20 %	60 %	20 %	288940371
533	NC_013851	GGGCT	2	10	742430	742439	0 %	20 %	60 %	20 %	288940375
534	NC_013851	CCGAC	2	10	743095	743104	20 %	0 %	20 %	60 %	288940376
535	NC_013851	GCGCG	2	10	743546	743555	0 %	0 %	60 %	40 %	288940377
536	NC_013851	TCGCC	2	10	745887	745896	0 %	20 %	20 %	60 %	288940378
537	NC_013851	CGCCC	2	10	747335	747344	0 %	0 %	20 %	80 %	288940379
538	NC_013851	GCCAG	2	10	747480	747489	20 %	0 %	40 %	40 %	288940380
539	NC_013851	GCGCC	2	10	749799	749808	0 %	0 %	40 %	60 %	288940381
540	NC_013851	GGCGC	2	10	753112	753121	0 %	0 %	60 %	40 %	288940383
541	NC_013851	CGCCC	2	10	753325	753334	0 %	0 %	20 %	80 %	288940383
542	NC_013851	TCGCC	2	10	753382	753391	0 %	20 %	20 %	60 %	288940383
543	NC_013851	GCCAG	2	10	753985	753994	20 %	0 %	40 %	40 %	288940383
544	NC_013851	GGTGC	2	10	755103	755112	0 %	20 %	60 %	20 %	288940385
545	NC_013851	CTCGA	2	10	755286	755295	20 %	20 %	20 %	40 %	288940385
546	NC_013851	CCGAT	2	10	755584	755593	20 %	20 %	20 %	40 %	288940385
547	NC_013851	TGCTC	2	10	763886	763895	0 %	40 %	20 %	40 %	288940389
548	NC_013851	GGCCG	2	10	764467	764476	0 %	0 %	60 %	40 %	288940390
549	NC_013851	GTCTG	2	10	764926	764935	0 %	40 %	40 %	20 %	288940391
550	NC_013851	GAATG	2	10	766116	766125	40 %	20 %	40 %	0 %	288940392
551	NC_013851	GGAGC	2	10	766604	766613	20 %	0 %	60 %	20 %	288940393
552	NC_013851	GCCAA	2	10	768917	768926	40 %	0 %	20 %	40 %	288940397
553	NC_013851	TGCGG	2	10	769055	769064	0 %	20 %	60 %	20 %	288940397
554	NC_013851	CGCCA	2	10	769286	769295	20 %	0 %	20 %	60 %	288940397
555	NC_013851	AGGGG	2	10	772275	772284	20 %	0 %	80 %	0 %	288940398
556	NC_013851	CCGGA	2	10	772397	772406	20 %	0 %	40 %	40 %	288940398
557	NC_013851	CGGAC	2	10	772492	772501	20 %	0 %	40 %	40 %	288940398
558	NC_013851	TCGAG	2	10	773147	773156	20 %	20 %	40 %	20 %	288940400
559	NC_013851	GTCGA	2	10	774428	774437	20 %	20 %	40 %	20 %	288940400
560	NC_013851	CGGCC	2	10	774562	774571	0 %	0 %	40 %	60 %	288940401
561	NC_013851	TCAAT	2	10	777176	777185	40 %	40 %	0 %	20 %	288940404
562	NC_013851	GGTCA	2	10	779735	779744	20 %	20 %	40 %	20 %	288940408
563	NC_013851	GATCT	2	10	782110	782119	20 %	40 %	20 %	20 %	288940411
564	NC_013851	CTGGC	2	10	783666	783675	0 %	20 %	40 %	40 %	288940413
565	NC_013851	CCGAC	2	10	784297	784306	20 %	0 %	20 %	60 %	288940413
566	NC_013851	CGACC	2	10	787646	787655	20 %	0 %	20 %	60 %	288940415
567	NC_013851	GCGTC	2	10	789068	789077	0 %	20 %	40 %	40 %	288940416
568	NC_013851	CGTCA	2	10	791256	791265	20 %	20 %	20 %	40 %	288940417
569	NC_013851	CACGG	2	10	791306	791315	20 %	0 %	40 %	40 %	288940417
570	NC_013851	ATCCC	2	10	792240	792249	20 %	20 %	0 %	60 %	288940418
571	NC_013851	GCATC	2	10	792700	792709	20 %	20 %	20 %	40 %	288940418
572	NC_013851	GTCGC	2	10	793505	793514	0 %	20 %	40 %	40 %	288940419
573	NC_013851	GCCGC	2	10	794619	794628	0 %	0 %	40 %	60 %	288940420
574	NC_013851	GACCT	2	10	795995	796004	20 %	20 %	20 %	40 %	288940422
575	NC_013851	TCAGC	2	10	797192	797201	20 %	20 %	20 %	40 %	288940423
576	NC_013851	GCTCG	2	10	797252	797261	0 %	20 %	40 %	40 %	288940423
577	NC_013851	ACGGC	2	10	801915	801924	20 %	0 %	40 %	40 %	288940428
578	NC_013851	CAGCA	2	10	802260	802269	40 %	0 %	20 %	40 %	288940428
579	NC_013851	GGTCG	2	10	805904	805913	0 %	20 %	60 %	20 %	288940431
580	NC_013851	GCGCC	2	10	806807	806816	0 %	0 %	40 %	60 %	288940432
581	NC_013851	GCACT	2	10	808350	808359	20 %	20 %	20 %	40 %	288940433
582	NC_013851	CCTGG	2	10	808420	808429	0 %	20 %	40 %	40 %	288940433
583	NC_013851	GCGCG	2	10	815494	815503	0 %	0 %	60 %	40 %	288940439
584	NC_013851	CTGAG	2	10	816038	816047	20 %	20 %	40 %	20 %	288940440
585	NC_013851	GCCGC	2	10	819908	819917	0 %	0 %	40 %	60 %	288940443
586	NC_013851	TTCAG	2	10	822258	822267	20 %	40 %	20 %	20 %	288940450
587	NC_013851	TCGGT	2	10	823342	823351	0 %	40 %	40 %	20 %	288940451
588	NC_013851	ACGCC	2	10	824563	824572	20 %	0 %	20 %	60 %	288940451
589	NC_013851	CGCGC	2	10	830214	830223	0 %	0 %	40 %	60 %	288940453
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591	NC_013851	CTCGC	2	10	834268	834277	0 %	20 %	20 %	60 %	288940458
592	NC_013851	CAGGT	2	10	834526	834535	20 %	20 %	40 %	20 %	288940458
593	NC_013851	GATCT	2	10	837738	837747	20 %	40 %	20 %	20 %	288940461
594	NC_013851	GCGCT	2	10	838128	838137	0 %	20 %	40 %	40 %	288940461
595	NC_013851	CGGCG	2	10	843207	843216	0 %	0 %	60 %	40 %	288940464
596	NC_013851	GCCGG	2	10	845569	845578	0 %	0 %	60 %	40 %	288940465
597	NC_013851	ATCGG	2	10	845995	846004	20 %	20 %	40 %	20 %	288940465
598	NC_013851	CATGG	2	10	846200	846209	20 %	20 %	40 %	20 %	288940465
599	NC_013851	GGTCG	2	10	848710	848719	0 %	20 %	60 %	20 %	288940467
600	NC_013851	CGCGG	2	10	849290	849299	0 %	0 %	60 %	40 %	288940467
601	NC_013851	GCTCG	2	10	849382	849391	0 %	20 %	40 %	40 %	288940467
602	NC_013851	GGCGC	2	10	849547	849556	0 %	0 %	60 %	40 %	288940467
603	NC_013851	GCGCC	2	10	850572	850581	0 %	0 %	40 %	60 %	288940467
604	NC_013851	CGCAG	2	10	856036	856045	20 %	0 %	40 %	40 %	288940473
605	NC_013851	GCCGA	2	10	856594	856603	20 %	0 %	40 %	40 %	288940474
606	NC_013851	CGACC	2	10	859857	859866	20 %	0 %	20 %	60 %	288940476
607	NC_013851	TGCGC	2	10	863426	863435	0 %	20 %	40 %	40 %	288940480
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609	NC_013851	CCGGA	2	10	872695	872704	20 %	0 %	40 %	40 %	288940488
610	NC_013851	GCCGA	2	10	874124	874133	20 %	0 %	40 %	40 %	288940489
611	NC_013851	CAGCA	2	10	874729	874738	40 %	0 %	20 %	40 %	288940490
612	NC_013851	GGATC	2	10	874907	874916	20 %	20 %	40 %	20 %	288940490
613	NC_013851	CGACG	2	10	878500	878509	20 %	0 %	40 %	40 %	288940491
614	NC_013851	ATCTG	2	10	880930	880939	20 %	40 %	20 %	20 %	288940493
615	NC_013851	CAGCA	2	10	881325	881334	40 %	0 %	20 %	40 %	288940493
616	NC_013851	CGCGC	2	10	881813	881822	0 %	0 %	40 %	60 %	288940493
617	NC_013851	CCGAG	2	10	882588	882597	20 %	0 %	40 %	40 %	288940494
618	NC_013851	CGGCT	2	10	883671	883680	0 %	20 %	40 %	40 %	288940495
619	NC_013851	GCGGT	2	10	884237	884246	0 %	20 %	60 %	20 %	288940496
620	NC_013851	CGATG	2	10	884564	884573	20 %	20 %	40 %	20 %	288940496
621	NC_013851	GGCGC	2	10	886046	886055	0 %	0 %	60 %	40 %	288940498
622	NC_013851	CGGCG	2	10	886394	886403	0 %	0 %	60 %	40 %	288940498
623	NC_013851	CGCGG	2	10	889943	889952	0 %	0 %	60 %	40 %	288940502
624	NC_013851	GATGG	2	10	891244	891253	20 %	20 %	60 %	0 %	288940503
625	NC_013851	CCAAC	2	10	896618	896627	40 %	0 %	0 %	60 %	288940509
626	NC_013851	CCGCG	2	10	898908	898917	0 %	0 %	40 %	60 %	288940512
627	NC_013851	AGCCG	2	10	899685	899694	20 %	0 %	40 %	40 %	288940513
628	NC_013851	GGTGG	2	10	900452	900461	0 %	20 %	80 %	0 %	288940514
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