MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 2388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2371	NC_013851	CTTTT	2	10	3486435	3486444	0 %	80 %	0 %	20 %	288942786
2372	NC_013851	TGGGC	2	10	3486975	3486984	0 %	20 %	60 %	20 %	288942787
2373	NC_013851	CCGGC	2	10	3492841	3492850	0 %	0 %	40 %	60 %	288942789
2374	NC_013851	CGGTG	2	10	3494639	3494648	0 %	20 %	60 %	20 %	288942790
2375	NC_013851	CGGTC	2	10	3496088	3496097	0 %	20 %	40 %	40 %	288942791
2376	NC_013851	GGCCG	2	10	3496283	3496292	0 %	0 %	60 %	40 %	288942791
2377	NC_013851	GCGGG	2	10	3496780	3496789	0 %	0 %	80 %	20 %	288942791
2378	NC_013851	CTGGA	2	10	3498048	3498057	20 %	20 %	40 %	20 %	288942792
2379	NC_013851	CGGAC	2	10	3499901	3499910	20 %	0 %	40 %	40 %	288942792
2380	NC_013851	CCATG	2	10	3500150	3500159	20 %	20 %	20 %	40 %	288942792
2381	NC_013851	CATGC	2	10	3501330	3501339	20 %	20 %	20 %	40 %	288942794
2382	NC_013851	GCGCC	2	10	3511418	3511427	0 %	0 %	40 %	60 %	288942804
2383	NC_013851	CGCGG	2	10	3513246	3513255	0 %	0 %	60 %	40 %	288942805
2384	NC_013851	GACGC	2	10	3514135	3514144	20 %	0 %	40 %	40 %	288942805
2385	NC_013851	GCGCC	2	10	3515264	3515273	0 %	0 %	40 %	60 %	288942807
2386	NC_013851	AGCCG	2	10	3520669	3520678	20 %	0 %	40 %	40 %	288942811
2387	NC_013851	GATGC	2	10	3525198	3525207	20 %	20 %	40 %	20 %	288942814
2388	NC_013851	CGGCT	2	10	3526612	3526621	0 %	20 %	40 %	40 %	288942816

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