MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 2388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013851	GAGCC	2	10	1477819	1477828	20 %	0 %	40 %	40 %	288941020
1002	NC_013851	ATCTG	2	10	1478190	1478199	20 %	40 %	20 %	20 %	288941021
1003	NC_013851	GTCGA	2	10	1478516	1478525	20 %	20 %	40 %	20 %	288941021
1004	NC_013851	TGCTC	2	10	1479561	1479570	0 %	40 %	20 %	40 %	288941022
1005	NC_013851	CCACT	2	10	1479594	1479603	20 %	20 %	0 %	60 %	288941022
1006	NC_013851	CGCGG	2	10	1480832	1480841	0 %	0 %	60 %	40 %	288941022
1007	NC_013851	CGGGG	2	10	1481153	1481162	0 %	0 %	80 %	20 %	288941023
1008	NC_013851	CGGGG	2	10	1484488	1484497	0 %	0 %	80 %	20 %	288941026
1009	NC_013851	CCTGG	2	10	1486411	1486420	0 %	20 %	40 %	40 %	288941027
1010	NC_013851	CGACC	2	10	1487490	1487499	20 %	0 %	20 %	60 %	288941028
1011	NC_013851	GGCGC	2	10	1489291	1489300	0 %	0 %	60 %	40 %	288941030
1012	NC_013851	CATGC	2	10	1491875	1491884	20 %	20 %	20 %	40 %	288941033
1013	NC_013851	CGCTA	2	10	1492665	1492674	20 %	20 %	20 %	40 %	288941034
1014	NC_013851	CCATG	2	10	1494060	1494069	20 %	20 %	20 %	40 %	288941037
1015	NC_013851	CGACC	2	10	1495758	1495767	20 %	0 %	20 %	60 %	288941038
1016	NC_013851	GCGCG	2	10	1496235	1496244	0 %	0 %	60 %	40 %	288941038
1017	NC_013851	GATCA	2	10	1500369	1500378	40 %	20 %	20 %	20 %	288941043
1018	NC_013851	GCTGC	2	10	1501947	1501956	0 %	20 %	40 %	40 %	288941044
1019	NC_013851	GCAGG	2	10	1502142	1502151	20 %	0 %	60 %	20 %	288941044
1020	NC_013851	CGCTC	2	10	1503375	1503384	0 %	20 %	20 %	60 %	288941045
1021	NC_013851	CCGCG	2	10	1504710	1504719	0 %	0 %	40 %	60 %	288941046
1022	NC_013851	CGATC	2	10	1506873	1506882	20 %	20 %	20 %	40 %	288941046
1023	NC_013851	GCGTC	2	10	1509540	1509549	0 %	20 %	40 %	40 %	288941050
1024	NC_013851	CGATC	2	10	1510257	1510266	20 %	20 %	20 %	40 %	288941051
1025	NC_013851	GATCA	2	10	1512431	1512440	40 %	20 %	20 %	20 %	288941052
1026	NC_013851	TGGCC	2	10	1514222	1514231	0 %	20 %	40 %	40 %	288941055
1027	NC_013851	GACCC	2	10	1516145	1516154	20 %	0 %	20 %	60 %	288941056
1028	NC_013851	GTTCA	2	10	1516475	1516484	20 %	40 %	20 %	20 %	288941056
1029	NC_013851	ACTGG	2	10	1517293	1517302	20 %	20 %	40 %	20 %	288941057
1030	NC_013851	GGCAG	2	10	1518274	1518283	20 %	0 %	60 %	20 %	288941057
1031	NC_013851	GCTCG	2	10	1520822	1520831	0 %	20 %	40 %	40 %	288941058
1032	NC_013851	GCGCT	2	10	1524541	1524550	0 %	20 %	40 %	40 %	288941061
1033	NC_013851	CGCGA	2	10	1525723	1525732	20 %	0 %	40 %	40 %	288941061
1034	NC_013851	CCGCG	2	10	1526280	1526289	0 %	0 %	40 %	60 %	288941061
1035	NC_013851	GCGTC	2	10	1526433	1526442	0 %	20 %	40 %	40 %	288941061
1036	NC_013851	GTCGA	2	10	1527740	1527749	20 %	20 %	40 %	20 %	288941062
1037	NC_013851	GCCGA	2	10	1530118	1530127	20 %	0 %	40 %	40 %	288941063
1038	NC_013851	TGACG	2	10	1532107	1532116	20 %	20 %	40 %	20 %	288941067
1039	NC_013851	TGGCC	2	10	1532425	1532434	0 %	20 %	40 %	40 %	288941067
1040	NC_013851	GCTCG	2	10	1534775	1534784	0 %	20 %	40 %	40 %	288941069
1041	NC_013851	ATCGC	2	10	1535682	1535691	20 %	20 %	20 %	40 %	288941070
1042	NC_013851	TGGCG	2	10	1536019	1536028	0 %	20 %	60 %	20 %	288941070
1043	NC_013851	CTGGC	2	10	1537847	1537856	0 %	20 %	40 %	40 %	288941070
1044	NC_013851	ACGGC	2	10	1537909	1537918	20 %	0 %	40 %	40 %	288941070
1045	NC_013851	GGCGC	2	10	1538504	1538513	0 %	0 %	60 %	40 %	288941071
1046	NC_013851	GCTGC	2	10	1539529	1539538	0 %	20 %	40 %	40 %	288941072
1047	NC_013851	CGATC	2	10	1539859	1539868	20 %	20 %	20 %	40 %	288941072
1048	NC_013851	TGAGT	2	10	1542137	1542146	20 %	40 %	40 %	0 %	288941075
1049	NC_013851	GCTGC	2	10	1544486	1544495	0 %	20 %	40 %	40 %	288941077
1050	NC_013851	CCCGC	2	10	1545761	1545770	0 %	0 %	20 %	80 %	288941078
1051	NC_013851	GATGC	2	10	1546434	1546443	20 %	20 %	40 %	20 %	288941078
1052	NC_013851	GACCA	2	10	1548007	1548016	40 %	0 %	20 %	40 %	288941081
1053	NC_013851	GCCAG	2	10	1548848	1548857	20 %	0 %	40 %	40 %	288941082
1054	NC_013851	TGGTC	2	10	1550439	1550448	0 %	40 %	40 %	20 %	288941083
1055	NC_013851	ATGGG	2	10	1551200	1551209	20 %	20 %	60 %	0 %	288941083
1056	NC_013851	TGCGC	2	10	1553668	1553677	0 %	20 %	40 %	40 %	288941086
1057	NC_013851	ACTGC	2	10	1554217	1554226	20 %	20 %	20 %	40 %	288941086
1058	NC_013851	GTCTG	2	10	1557589	1557598	0 %	40 %	40 %	20 %	288941087
1059	NC_013851	CTCGC	2	10	1565074	1565083	0 %	20 %	20 %	60 %	288941095
1060	NC_013851	CCTGG	2	10	1566708	1566717	0 %	20 %	40 %	40 %	288941095
1061	NC_013851	GGGGC	2	10	1568008	1568017	0 %	0 %	80 %	20 %	288941096
1062	NC_013851	GCCGC	2	10	1569124	1569133	0 %	0 %	40 %	60 %	288941097
1063	NC_013851	GCGCG	2	10	1576354	1576363	0 %	0 %	60 %	40 %	288941100
1064	NC_013851	GCCAG	2	10	1577179	1577188	20 %	0 %	40 %	40 %	288941100
1065	NC_013851	TTGGT	2	10	1577964	1577973	0 %	60 %	40 %	0 %	288941100
1066	NC_013851	GTCCA	2	10	1578591	1578600	20 %	20 %	20 %	40 %	288941100
1067	NC_013851	ATTCC	2	10	1579235	1579244	20 %	40 %	0 %	40 %	288941100
1068	NC_013851	AATTC	2	10	1582410	1582419	40 %	40 %	0 %	20 %	288941101
1069	NC_013851	TCGCG	2	10	1582668	1582677	0 %	20 %	40 %	40 %	288941101
1070	NC_013851	CGTCG	2	10	1582678	1582687	0 %	20 %	40 %	40 %	288941101
1071	NC_013851	AGCGT	2	10	1585534	1585543	20 %	20 %	40 %	20 %	288941102
1072	NC_013851	GTGCG	2	10	1586875	1586884	0 %	20 %	60 %	20 %	288941103
1073	NC_013851	CAGGT	2	10	1588874	1588883	20 %	20 %	40 %	20 %	288941103
1074	NC_013851	CGTCC	2	10	1592020	1592029	0 %	20 %	20 %	60 %	288941105
1075	NC_013851	CGGGG	2	10	1593390	1593399	0 %	0 %	80 %	20 %	288941106
1076	NC_013851	AGGGC	2	10	1594061	1594070	20 %	0 %	60 %	20 %	288941106
1077	NC_013851	CGGCG	2	10	1594217	1594226	0 %	0 %	60 %	40 %	288941106
1078	NC_013851	CCTGC	2	10	1595656	1595665	0 %	20 %	20 %	60 %	288941107
1079	NC_013851	CGGCG	2	10	1597057	1597066	0 %	0 %	60 %	40 %	288941109
1080	NC_013851	GGCAT	2	10	1597982	1597991	20 %	20 %	40 %	20 %	288941109
1081	NC_013851	GTGAT	2	10	1598060	1598069	20 %	40 %	40 %	0 %	288941110
1082	NC_013851	CCGAG	2	10	1598759	1598768	20 %	0 %	40 %	40 %	288941110
1083	NC_013851	GTCAG	2	10	1599220	1599229	20 %	20 %	40 %	20 %	288941111
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1085	NC_013851	CACGG	2	10	1600208	1600217	20 %	0 %	40 %	40 %	288941111
1086	NC_013851	GAAGA	2	10	1603739	1603748	60 %	0 %	40 %	0 %	288941114
1087	NC_013851	GTGCC	2	10	1608063	1608072	0 %	20 %	40 %	40 %	288941117
1088	NC_013851	GCGCG	2	10	1610135	1610144	0 %	0 %	60 %	40 %	288941119
1089	NC_013851	GACCA	2	10	1610247	1610256	40 %	0 %	20 %	40 %	288941119
1090	NC_013851	CGCGG	2	10	1611311	1611320	0 %	0 %	60 %	40 %	288941120
1091	NC_013851	GGTGC	2	10	1613029	1613038	0 %	20 %	60 %	20 %	288941122
1092	NC_013851	CGAGC	2	10	1614635	1614644	20 %	0 %	40 %	40 %	288941123
1093	NC_013851	CGTAT	2	10	1614859	1614868	20 %	40 %	20 %	20 %	288941124
1094	NC_013851	CAGCG	2	10	1616452	1616461	20 %	0 %	40 %	40 %	288941126
1095	NC_013851	CGGTG	2	10	1619661	1619670	0 %	20 %	60 %	20 %	288941127
1096	NC_013851	GATTG	2	10	1619944	1619953	20 %	40 %	40 %	0 %	288941127
1097	NC_013851	GGCCT	2	10	1621581	1621590	0 %	20 %	40 %	40 %	288941129
1098	NC_013851	CAGGA	2	10	1622769	1622778	40 %	0 %	40 %	20 %	288941130
1099	NC_013851	CAGCC	2	10	1624116	1624125	20 %	0 %	20 %	60 %	288941131
1100	NC_013851	GACCA	2	10	1624491	1624500	40 %	0 %	20 %	40 %	288941131
1101	NC_013851	GCCCG	2	10	1626172	1626181	0 %	0 %	40 %	60 %	288941132
1102	NC_013851	GCGTC	2	10	1626469	1626478	0 %	20 %	40 %	40 %	288941132
1103	NC_013851	TGGGC	2	10	1628140	1628149	0 %	20 %	60 %	20 %	288941134
1104	NC_013851	GCCGC	2	10	1628451	1628460	0 %	0 %	40 %	60 %	288941134
1105	NC_013851	AGCCC	2	10	1630021	1630030	20 %	0 %	20 %	60 %	288941136
1106	NC_013851	CGCCC	2	10	1630184	1630193	0 %	0 %	20 %	80 %	288941136
1107	NC_013851	CAGGA	2	10	1631450	1631459	40 %	0 %	40 %	20 %	288941140
1108	NC_013851	CGGTC	2	10	1632577	1632586	0 %	20 %	40 %	40 %	288941141
1109	NC_013851	GGCGG	2	10	1633043	1633052	0 %	0 %	80 %	20 %	288941141
1110	NC_013851	GGTTC	2	10	1634252	1634261	0 %	40 %	40 %	20 %	288941142
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1112	NC_013851	CGCGC	2	10	1636392	1636401	0 %	0 %	40 %	60 %	288941143
1113	NC_013851	GATCA	2	10	1639342	1639351	40 %	20 %	20 %	20 %	288941145
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1116	NC_013851	CCGGC	2	10	1643614	1643623	0 %	0 %	40 %	60 %	288941150
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1118	NC_013851	GTCGA	2	10	1644191	1644200	20 %	20 %	40 %	20 %	288941150
1119	NC_013851	CGATT	2	10	1650066	1650075	20 %	40 %	20 %	20 %	288941154
1120	NC_013851	GTTCG	2	10	1655872	1655881	0 %	40 %	40 %	20 %	288941158
1121	NC_013851	CTGGT	2	10	1657107	1657116	0 %	40 %	40 %	20 %	288941159
1122	NC_013851	CCGGC	2	10	1658056	1658065	0 %	0 %	40 %	60 %	288941160
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1124	NC_013851	CGCTG	2	10	1662360	1662369	0 %	20 %	40 %	40 %	288941164
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1493	NC_013851	CGCGC	2	10	2181941	2181950	0 %	0 %	40 %	60 %	288941620
1494	NC_013851	CCCCG	2	10	2183763	2183772	0 %	0 %	20 %	80 %	288941622
1495	NC_013851	GGTCG	2	10	2186548	2186557	0 %	20 %	60 %	20 %	288941626
1496	NC_013851	CCGGC	2	10	2188515	2188524	0 %	0 %	40 %	60 %	288941626
1497	NC_013851	CGCCC	2	10	2191012	2191021	0 %	0 %	20 %	80 %	288941630
1498	NC_013851	CGGCG	2	10	2191509	2191518	0 %	0 %	60 %	40 %	288941630
1499	NC_013851	GCTCG	2	10	2191881	2191890	0 %	20 %	40 %	40 %	288941631
1500	NC_013851	GCGCG	2	10	2193972	2193981	0 %	0 %	60 %	40 %	288941634

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