MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 2388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013851	GCCCT	2	10	2194833	2194842	0 %	20 %	20 %	60 %	288941635
1502	NC_013851	TCGGC	2	10	2194916	2194925	0 %	20 %	40 %	40 %	288941635
1503	NC_013851	GCCGC	2	10	2195853	2195862	0 %	0 %	40 %	60 %	288941635
1504	NC_013851	GCCCT	2	10	2196175	2196184	0 %	20 %	20 %	60 %	288941636
1505	NC_013851	TGGTC	2	10	2197844	2197853	0 %	40 %	40 %	20 %	288941637
1506	NC_013851	CCCGG	2	10	2199477	2199486	0 %	0 %	40 %	60 %	288941639
1507	NC_013851	CCGCG	2	10	2201612	2201621	0 %	0 %	40 %	60 %	288941641
1508	NC_013851	GGGCC	2	10	2203518	2203527	0 %	0 %	60 %	40 %	288941643
1509	NC_013851	CTCGG	2	10	2205773	2205782	0 %	20 %	40 %	40 %	288941647
1510	NC_013851	CGCGC	2	10	2206269	2206278	0 %	0 %	40 %	60 %	288941647
1511	NC_013851	CAGCG	2	10	2207189	2207198	20 %	0 %	40 %	40 %	288941648
1512	NC_013851	CCGTG	2	10	2207566	2207575	0 %	20 %	40 %	40 %	288941648
1513	NC_013851	CGGTC	2	10	2208865	2208874	0 %	20 %	40 %	40 %	288941648
1514	NC_013851	CCCAG	2	10	2209347	2209356	20 %	0 %	20 %	60 %	288941648
1515	NC_013851	CGTCC	2	10	2210098	2210107	0 %	20 %	20 %	60 %	288941648
1516	NC_013851	GGACC	2	10	2210166	2210175	20 %	0 %	40 %	40 %	288941648
1517	NC_013851	GCGTC	2	10	2211939	2211948	0 %	20 %	40 %	40 %	288941650
1518	NC_013851	CGGCT	2	10	2212831	2212840	0 %	20 %	40 %	40 %	288941650
1519	NC_013851	CTGGC	2	10	2213837	2213846	0 %	20 %	40 %	40 %	288941652
1520	NC_013851	TCCAG	2	10	2215994	2216003	20 %	20 %	20 %	40 %	288941654
1521	NC_013851	ACGCA	2	10	2216068	2216077	40 %	0 %	20 %	40 %	288941654
1522	NC_013851	CTGCA	2	10	2216228	2216237	20 %	20 %	20 %	40 %	288941654
1523	NC_013851	CGGCA	2	10	2218078	2218087	20 %	0 %	40 %	40 %	288941655
1524	NC_013851	CGATC	2	10	2218939	2218948	20 %	20 %	20 %	40 %	288941656
1525	NC_013851	CCGCA	2	10	2219447	2219456	20 %	0 %	20 %	60 %	288941656
1526	NC_013851	ATCTT	2	10	2222119	2222128	20 %	60 %	0 %	20 %	288941659
1527	NC_013851	AGCTC	2	10	2223584	2223593	20 %	20 %	20 %	40 %	288941660
1528	NC_013851	CGGCG	2	10	2228201	2228210	0 %	0 %	60 %	40 %	288941664
1529	NC_013851	CGCGC	2	10	2230852	2230861	0 %	0 %	40 %	60 %	288941666
1530	NC_013851	CGGCG	2	10	2230945	2230954	0 %	0 %	60 %	40 %	288941666
1531	NC_013851	TTGCG	2	10	2231157	2231166	0 %	40 %	40 %	20 %	288941666
1532	NC_013851	GCACG	2	10	2236874	2236883	20 %	0 %	40 %	40 %	288941669
1533	NC_013851	AGCGC	2	10	2237789	2237798	20 %	0 %	40 %	40 %	288941669
1534	NC_013851	GCGCG	2	10	2238369	2238378	0 %	0 %	60 %	40 %	288941670
1535	NC_013851	GAGCG	2	10	2239265	2239274	20 %	0 %	60 %	20 %	288941671
1536	NC_013851	CGCCC	2	10	2240703	2240712	0 %	0 %	20 %	80 %	288941672
1537	NC_013851	GCCCA	2	10	2242199	2242208	20 %	0 %	20 %	60 %	288941674
1538	NC_013851	TCGCG	2	10	2243764	2243773	0 %	20 %	40 %	40 %	288941674
1539	NC_013851	CGTCA	2	10	2244175	2244184	20 %	20 %	20 %	40 %	288941675
1540	NC_013851	GGTCG	2	10	2248000	2248009	0 %	20 %	60 %	20 %	288941680
1541	NC_013851	CGGGC	2	10	2248704	2248713	0 %	0 %	60 %	40 %	288941680
1542	NC_013851	CCGAC	2	10	2249239	2249248	20 %	0 %	20 %	60 %	288941680
1543	NC_013851	CCGAC	2	10	2249708	2249717	20 %	0 %	20 %	60 %	288941680
1544	NC_013851	AGCGC	2	10	2250224	2250233	20 %	0 %	40 %	40 %	288941681
1545	NC_013851	GTCCG	2	10	2250346	2250355	0 %	20 %	40 %	40 %	288941681
1546	NC_013851	GGGTC	2	10	2250847	2250856	0 %	20 %	60 %	20 %	288941682
1547	NC_013851	GCGCC	2	10	2252856	2252865	0 %	0 %	40 %	60 %	288941683
1548	NC_013851	GCCGA	2	10	2258349	2258358	20 %	0 %	40 %	40 %	288941687
1549	NC_013851	ACAGA	2	10	2258457	2258466	60 %	0 %	20 %	20 %	288941687
1550	NC_013851	GACCG	2	10	2261952	2261961	20 %	0 %	40 %	40 %	288941691
1551	NC_013851	CGACC	2	10	2262231	2262240	20 %	0 %	20 %	60 %	288941691
1552	NC_013851	CCGCG	2	10	2265593	2265602	0 %	0 %	40 %	60 %	288941693
1553	NC_013851	ACGGC	2	10	2269031	2269040	20 %	0 %	40 %	40 %	288941695
1554	NC_013851	CTCGC	2	10	2272213	2272222	0 %	20 %	20 %	60 %	288941697
1555	NC_013851	GCCGC	2	10	2273043	2273052	0 %	0 %	40 %	60 %	288941698
1556	NC_013851	GCACG	2	10	2273688	2273697	20 %	0 %	40 %	40 %	288941698
1557	NC_013851	TCCTG	2	10	2274413	2274422	0 %	40 %	20 %	40 %	288941698
1558	NC_013851	GCGCC	2	10	2277743	2277752	0 %	0 %	40 %	60 %	288941699
1559	NC_013851	CGGCG	2	10	2279789	2279798	0 %	0 %	60 %	40 %	288941701
1560	NC_013851	TGCGC	2	10	2281889	2281898	0 %	20 %	40 %	40 %	288941703
1561	NC_013851	GTCCG	2	10	2283403	2283412	0 %	20 %	40 %	40 %	288941703
1562	NC_013851	CGATT	2	10	2283917	2283926	20 %	40 %	20 %	20 %	288941703
1563	NC_013851	CGGGC	2	10	2285833	2285842	0 %	0 %	60 %	40 %	288941704
1564	NC_013851	CGGCT	2	10	2288746	2288755	0 %	20 %	40 %	40 %	288941706
1565	NC_013851	GCCGG	2	10	2289465	2289474	0 %	0 %	60 %	40 %	288941707
1566	NC_013851	CGCGC	2	10	2289752	2289761	0 %	0 %	40 %	60 %	288941708
1567	NC_013851	GCCGG	2	10	2291108	2291117	0 %	0 %	60 %	40 %	288941708
1568	NC_013851	GCCCA	2	10	2291745	2291754	20 %	0 %	20 %	60 %	288941710
1569	NC_013851	GCAGC	2	10	2293061	2293070	20 %	0 %	40 %	40 %	288941711
1570	NC_013851	CGACC	2	10	2295422	2295431	20 %	0 %	20 %	60 %	288941711
1571	NC_013851	ACGGA	2	10	2296582	2296591	40 %	0 %	40 %	20 %	288941713
1572	NC_013851	CTGCC	2	10	2299652	2299661	0 %	20 %	20 %	60 %	288941718
1573	NC_013851	GTCAG	2	10	2301266	2301275	20 %	20 %	40 %	20 %	288941721
1574	NC_013851	GCCGG	2	10	2302321	2302330	0 %	0 %	60 %	40 %	288941721
1575	NC_013851	TTCGC	2	10	2302489	2302498	0 %	40 %	20 %	40 %	288941721
1576	NC_013851	TGGAC	2	10	2304450	2304459	20 %	20 %	40 %	20 %	288941723
1577	NC_013851	ATGGC	2	10	2305977	2305986	20 %	20 %	40 %	20 %	288941725
1578	NC_013851	CGGAC	2	10	2308343	2308352	20 %	0 %	40 %	40 %	288941728
1579	NC_013851	GCTCT	2	10	2309699	2309708	0 %	40 %	20 %	40 %	288941729
1580	NC_013851	ATGGC	2	10	2310434	2310443	20 %	20 %	40 %	20 %	288941730
1581	NC_013851	TCGAC	2	10	2311779	2311788	20 %	20 %	20 %	40 %	288941731
1582	NC_013851	AGATC	2	10	2313239	2313248	40 %	20 %	20 %	20 %	288941732
1583	NC_013851	TGCGC	2	10	2313269	2313278	0 %	20 %	40 %	40 %	288941732
1584	NC_013851	GCCCG	2	10	2313306	2313315	0 %	0 %	40 %	60 %	288941732
1585	NC_013851	GCGCC	2	10	2315676	2315685	0 %	0 %	40 %	60 %	288941734
1586	NC_013851	CCGAG	2	10	2318844	2318853	20 %	0 %	40 %	40 %	288941737
1587	NC_013851	GGTGC	2	10	2320156	2320165	0 %	20 %	60 %	20 %	288941737
1588	NC_013851	GGCGT	2	10	2320676	2320685	0 %	20 %	60 %	20 %	288941738
1589	NC_013851	GCGCC	2	10	2322520	2322529	0 %	0 %	40 %	60 %	288941741
1590	NC_013851	CGACA	2	10	2324329	2324338	40 %	0 %	20 %	40 %	288941742
1591	NC_013851	GCCCA	2	10	2325297	2325306	20 %	0 %	20 %	60 %	288941742
1592	NC_013851	CAGCC	2	10	2327076	2327085	20 %	0 %	20 %	60 %	288941744
1593	NC_013851	GCGCC	2	10	2329150	2329159	0 %	0 %	40 %	60 %	288941745
1594	NC_013851	ACGTC	2	10	2331665	2331674	20 %	20 %	20 %	40 %	288941748
1595	NC_013851	CCTGA	2	10	2334127	2334136	20 %	20 %	20 %	40 %	288941750
1596	NC_013851	AGCCG	2	10	2338129	2338138	20 %	0 %	40 %	40 %	288941753
1597	NC_013851	CGGCG	2	10	2338976	2338985	0 %	0 %	60 %	40 %	288941754
1598	NC_013851	ATGGA	2	10	2339256	2339265	40 %	20 %	40 %	0 %	288941754
1599	NC_013851	CGGCG	2	10	2339624	2339633	0 %	0 %	60 %	40 %	288941755
1600	NC_013851	GACAG	2	10	2340006	2340015	40 %	0 %	40 %	20 %	288941756
1601	NC_013851	TGCGC	2	10	2340948	2340957	0 %	20 %	40 %	40 %	288941756
1602	NC_013851	TCGCC	2	10	2341632	2341641	0 %	20 %	20 %	60 %	288941756
1603	NC_013851	GTCGA	2	10	2342567	2342576	20 %	20 %	40 %	20 %	288941756
1604	NC_013851	CCGTG	2	10	2344353	2344362	0 %	20 %	40 %	40 %	288941758
1605	NC_013851	CGAAC	2	10	2346205	2346214	40 %	0 %	20 %	40 %	288941760
1606	NC_013851	GCATC	2	10	2348053	2348062	20 %	20 %	20 %	40 %	288941763
1607	NC_013851	CTGAC	2	10	2348471	2348480	20 %	20 %	20 %	40 %	288941763
1608	NC_013851	CACGC	2	10	2350452	2350461	20 %	0 %	20 %	60 %	288941765
1609	NC_013851	ATCGC	2	10	2353680	2353689	20 %	20 %	20 %	40 %	288941767
1610	NC_013851	GGTCT	2	10	2354042	2354051	0 %	40 %	40 %	20 %	288941767
1611	NC_013851	TGCGA	2	10	2357632	2357641	20 %	20 %	40 %	20 %	288941771
1612	NC_013851	CGGCG	2	10	2359005	2359014	0 %	0 %	60 %	40 %	288941773
1613	NC_013851	CATCT	2	10	2359412	2359421	20 %	40 %	0 %	40 %	288941773
1614	NC_013851	CGATC	2	10	2362842	2362851	20 %	20 %	20 %	40 %	288941775
1615	NC_013851	TGGTC	2	10	2363454	2363463	0 %	40 %	40 %	20 %	288941775
1616	NC_013851	GCGAC	2	10	2364962	2364971	20 %	0 %	40 %	40 %	288941778
1617	NC_013851	GGATG	2	10	2365065	2365074	20 %	20 %	60 %	0 %	288941778
1618	NC_013851	CGCGC	2	10	2365675	2365684	0 %	0 %	40 %	60 %	288941778
1619	NC_013851	CCGCC	2	10	2366459	2366468	0 %	0 %	20 %	80 %	288941778
1620	NC_013851	ACGGC	2	10	2368183	2368192	20 %	0 %	40 %	40 %	288941779
1621	NC_013851	CGGTC	2	10	2368784	2368793	0 %	20 %	40 %	40 %	288941780
1622	NC_013851	TCAGC	2	10	2370534	2370543	20 %	20 %	20 %	40 %	288941782
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1624	NC_013851	TCGCT	2	10	2372350	2372359	0 %	40 %	20 %	40 %	288941783
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1747	NC_013851	AGCAG	2	10	2541539	2541548	40 %	0 %	40 %	20 %	288941933
1748	NC_013851	TCCAG	2	10	2542045	2542054	20 %	20 %	20 %	40 %	288941934
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1751	NC_013851	GCGCC	2	10	2543583	2543592	0 %	0 %	40 %	60 %	288941935
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1757	NC_013851	CAGCG	2	10	2551145	2551154	20 %	0 %	40 %	40 %	288941941
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1760	NC_013851	CGTGA	2	10	2556011	2556020	20 %	20 %	40 %	20 %	288941947
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1861	NC_013851	GCCGC	2	10	2719722	2719731	0 %	0 %	40 %	60 %	288942104
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1876	NC_013851	CCGAA	2	10	2741269	2741278	40 %	0 %	20 %	40 %	288942123
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1883	NC_013851	CGACC	2	10	2754136	2754145	20 %	0 %	20 %	60 %	288942137
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1885	NC_013851	GCCCT	2	10	2758569	2758578	0 %	20 %	20 %	60 %	288942140
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1976	NC_013851	GGGTG	2	10	2892507	2892516	0 %	20 %	80 %	0 %	288942265
1977	NC_013851	TCGGC	2	10	2892890	2892899	0 %	20 %	40 %	40 %	288942266
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1980	NC_013851	GCGTG	2	10	2895688	2895697	0 %	20 %	60 %	20 %	288942268
1981	NC_013851	CGCGC	2	10	2896618	2896627	0 %	0 %	40 %	60 %	288942269
1982	NC_013851	GCGCT	2	10	2897023	2897032	0 %	20 %	40 %	40 %	288942269
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1984	NC_013851	ATGGT	2	10	2899324	2899333	20 %	40 %	40 %	0 %	288942272
1985	NC_013851	TGGCG	2	10	2908464	2908473	0 %	20 %	60 %	20 %	288942275
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1987	NC_013851	GCCCG	2	10	2916775	2916784	0 %	0 %	40 %	60 %	288942286
1988	NC_013851	GCTCG	2	10	2922543	2922552	0 %	20 %	40 %	40 %	288942292
1989	NC_013851	CCCAG	2	10	2923183	2923192	20 %	0 %	20 %	60 %	288942293
1990	NC_013851	CCCAG	2	10	2924730	2924739	20 %	0 %	20 %	60 %	288942295
1991	NC_013851	CGGCT	2	10	2925566	2925575	0 %	20 %	40 %	40 %	288942296
1992	NC_013851	TCGGC	2	10	2925874	2925883	0 %	20 %	40 %	40 %	288942296
1993	NC_013851	TGGCG	2	10	2925997	2926006	0 %	20 %	60 %	20 %	288942296
1994	NC_013851	GTGCT	2	10	2926430	2926439	0 %	40 %	40 %	20 %	288942296
1995	NC_013851	CGGTG	2	10	2928280	2928289	0 %	20 %	60 %	20 %	288942299
1996	NC_013851	CGACA	2	10	2930543	2930552	40 %	0 %	20 %	40 %	288942300
1997	NC_013851	CCTCG	2	10	2931636	2931645	0 %	20 %	20 %	60 %	288942303
1998	NC_013851	CGGCG	2	10	2931990	2931999	0 %	0 %	60 %	40 %	288942303
1999	NC_013851	GCCCT	2	10	2932859	2932868	0 %	20 %	20 %	60 %	288942304
2000	NC_013851	CGATG	2	10	2934107	2934116	20 %	20 %	40 %	20 %	288942305

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