MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 55548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013851	GCC	2	6	134	139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_013851	ATC	2	6	179	184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013851	GCG	2	6	188	193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013851	CCG	2	6	206	211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_013851	GAC	2	6	224	229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013851	CCG	2	6	296	301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939765
7	NC_013851	GCT	2	6	357	362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939765
8	NC_013851	TCG	2	6	611	616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939765
9	NC_013851	GGC	2	6	703	708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939765
10	NC_013851	GTC	2	6	781	786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939765
11	NC_013851	TCG	2	6	806	811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939765
12	NC_013851	GAT	2	6	816	821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939765
13	NC_013851	AAG	2	6	856	861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939765
14	NC_013851	CGA	2	6	891	896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939765
15	NC_013851	TTC	2	6	937	942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939765
16	NC_013851	CTG	2	6	958	963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939765
17	NC_013851	GCA	2	6	972	977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939765
18	NC_013851	AGG	2	6	1007	1012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939765
19	NC_013851	GGA	2	6	1023	1028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939765
20	NC_013851	CCG	2	6	1075	1080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939765
21	NC_013851	CTT	2	6	1155	1160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939765
22	NC_013851	GCG	2	6	1167	1172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939765
23	NC_013851	TGG	2	6	1217	1222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939765
24	NC_013851	ACT	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939765
25	NC_013851	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939765
26	NC_013851	CGT	2	6	1748	1753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939766
27	NC_013851	CAG	2	6	1875	1880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939766
28	NC_013851	GTC	2	6	1980	1985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939766
29	NC_013851	GCT	2	6	2015	2020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939766
30	NC_013851	CGG	3	9	2023	2031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939766
31	NC_013851	GGA	2	6	2051	2056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939766
32	NC_013851	GCA	2	6	2129	2134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939766
33	NC_013851	CTG	3	9	2160	2168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939766
34	NC_013851	CAA	2	6	2279	2284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288939766
35	NC_013851	GTG	2	6	2364	2369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939766
36	NC_013851	TCG	2	6	2398	2403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939766
37	NC_013851	AGG	3	9	2587	2595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939766
38	NC_013851	ACG	2	6	2620	2625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939766
39	NC_013851	CGA	2	6	2684	2689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939766
40	NC_013851	ATC	2	6	2700	2705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939766
41	NC_013851	GCG	2	6	2740	2745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939766
42	NC_013851	TCG	2	6	2767	2772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939766
43	NC_013851	GGA	2	6	2837	2842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013851	CGG	2	6	2990	2995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939767
45	NC_013851	CAC	2	6	3127	3132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939767
46	NC_013851	GTG	2	6	3188	3193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939767
47	NC_013851	CGC	2	6	3243	3248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939767
48	NC_013851	GCG	2	6	3567	3572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939767
49	NC_013851	GCG	2	6	3736	3741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939767
50	NC_013851	GCC	2	6	3791	3796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939767
51	NC_013851	GCT	2	6	3838	3843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939767
52	NC_013851	CCG	2	6	4214	4219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939768
53	NC_013851	CGC	2	6	4335	4340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939768
54	NC_013851	CGG	2	6	4433	4438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939768
55	NC_013851	AGC	2	6	4477	4482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939768
56	NC_013851	CAG	2	6	4609	4614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939769
57	NC_013851	CAG	2	6	4618	4623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939769
58	NC_013851	GCC	2	6	4634	4639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939769
59	NC_013851	AGG	2	6	4673	4678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939769
60	NC_013851	CTC	2	6	4762	4767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939769
61	NC_013851	CAG	2	6	4810	4815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939769
62	NC_013851	GCC	2	6	4931	4936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939769
63	NC_013851	GTG	2	6	5005	5010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939769
64	NC_013851	CCG	2	6	5144	5149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939769
65	NC_013851	CGC	2	6	5221	5226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939769
66	NC_013851	GCC	2	6	5227	5232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939769
67	NC_013851	TGG	2	6	5282	5287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939769
68	NC_013851	GGC	2	6	5431	5436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939769
69	NC_013851	GCC	2	6	5471	5476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939769
70	NC_013851	GAG	2	6	5556	5561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939769
71	NC_013851	CGA	2	6	5762	5767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939770
72	NC_013851	GTC	2	6	5782	5787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939770
73	NC_013851	ACG	2	6	5809	5814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939770
74	NC_013851	CCG	2	6	5816	5821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939770
75	NC_013851	CAT	2	6	6009	6014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939770
76	NC_013851	TAA	2	6	6164	6169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288939770
77	NC_013851	TCC	2	6	6269	6274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939770
78	NC_013851	ATC	2	6	6322	6327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939770
79	NC_013851	GCG	2	6	6383	6388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939770
80	NC_013851	AGC	2	6	6446	6451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939770
81	NC_013851	GAA	2	6	6505	6510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939770
82	NC_013851	TCG	2	6	6533	6538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939770
83	NC_013851	ACC	2	6	6567	6572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939770
84	NC_013851	CGC	2	6	6700	6705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939770
85	NC_013851	CAG	2	6	6739	6744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939770
86	NC_013851	CGG	2	6	6824	6829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939771
87	NC_013851	GCC	2	6	6954	6959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939771
88	NC_013851	GCC	2	6	6991	6996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939771
89	NC_013851	GCA	2	6	7055	7060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939771
90	NC_013851	CGC	2	6	7075	7080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939771
91	NC_013851	GGC	2	6	7104	7109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939771
92	NC_013851	ATG	2	6	7126	7131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939771
93	NC_013851	CGG	3	9	7133	7141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939771
94	NC_013851	CAG	2	6	7575	7580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939771
95	NC_013851	CGG	2	6	7587	7592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939771
96	NC_013851	CCG	2	6	7693	7698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939771
97	NC_013851	ACC	2	6	7801	7806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939771
98	NC_013851	GGC	2	6	7833	7838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939771
99	NC_013851	GGC	2	6	7857	7862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939771
100	NC_013851	GCG	2	6	7873	7878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939771
101	NC_013851	CAG	2	6	7965	7970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939771
102	NC_013851	GCC	2	6	7989	7994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939771
103	NC_013851	CGC	2	6	8040	8045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939771
104	NC_013851	CGC	2	6	8077	8082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939771
105	NC_013851	GAA	2	6	8247	8252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939771
106	NC_013851	CGC	2	6	8267	8272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939771
107	NC_013851	ACC	2	6	8323	8328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939771
108	NC_013851	CAG	2	6	8361	8366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939771
109	NC_013851	CGG	2	6	8383	8388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939771
110	NC_013851	GCC	2	6	8426	8431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939771
111	NC_013851	GCC	2	6	8491	8496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939771
112	NC_013851	CGG	2	6	8549	8554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939771
113	NC_013851	GCC	2	6	8660	8665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939771
114	NC_013851	CCG	2	6	8690	8695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939771
115	NC_013851	CGG	2	6	8726	8731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939771
116	NC_013851	GCA	2	6	8830	8835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939771
117	NC_013851	AGG	2	6	8962	8967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939771
118	NC_013851	GCC	2	6	9043	9048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939771
119	NC_013851	TCG	2	6	9067	9072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939771
120	NC_013851	GCC	2	6	9075	9080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939771
121	NC_013851	CGA	2	6	9089	9094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939771
122	NC_013851	GCG	2	6	9205	9210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939771
123	NC_013851	CGC	2	6	9235	9240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939771
124	NC_013851	TGG	2	6	9412	9417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939772
125	NC_013851	TCG	2	6	9438	9443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939772
126	NC_013851	GCC	2	6	9593	9598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939772
127	NC_013851	CGC	2	6	9693	9698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939772
128	NC_013851	TCG	2	6	9717	9722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939772
129	NC_013851	GGC	2	6	9883	9888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939772
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131	NC_013851	CAA	3	9	9999	10007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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