MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 55548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013851	GGC	2	6	196198	196203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939943
3002	NC_013851	CGC	2	6	196227	196232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939943
3003	NC_013851	ATC	2	6	196304	196309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939943
3004	NC_013851	TCG	2	6	196340	196345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939943
3005	NC_013851	GCA	2	6	196390	196395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939943
3006	NC_013851	CTG	2	6	196439	196444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939943
3007	NC_013851	CAT	2	6	196504	196509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939943
3008	NC_013851	CGG	2	6	196510	196515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939943
3009	NC_013851	CGT	2	6	196618	196623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939943
3010	NC_013851	CGT	2	6	196645	196650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939943
3011	NC_013851	CGC	2	6	196707	196712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939943
3012	NC_013851	CGG	2	6	196794	196799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939943
3013	NC_013851	GGC	2	6	196872	196877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939943
3014	NC_013851	TCG	2	6	196890	196895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939943
3015	NC_013851	GGC	2	6	196982	196987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939943
3016	NC_013851	CGG	2	6	197059	197064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939943
3017	NC_013851	CTG	2	6	197117	197122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939943
3018	NC_013851	GCG	2	6	197174	197179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939943
3019	NC_013851	GGA	2	6	197182	197187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939943
3020	NC_013851	GCG	2	6	197226	197231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939943
3021	NC_013851	GGC	2	6	197242	197247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939943
3022	NC_013851	CGG	2	6	197312	197317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939943
3023	NC_013851	GGA	2	6	197344	197349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939943
3024	NC_013851	GGT	2	6	197359	197364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939943
3025	NC_013851	CGT	2	6	197365	197370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939943
3026	NC_013851	ATT	2	6	197481	197486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288939943
3027	NC_013851	GCA	2	6	197488	197493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939943
3028	NC_013851	CGG	2	6	197500	197505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939943
3029	NC_013851	CGC	2	6	197535	197540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939943
3030	NC_013851	TCG	2	6	197586	197591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939943
3031	NC_013851	GCG	2	6	197684	197689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_013851	GCG	2	6	197712	197717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_013851	GGC	2	6	197718	197723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939944
3034	NC_013851	CCA	2	6	197731	197736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939944
3035	NC_013851	CAG	2	6	197741	197746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939944
3036	NC_013851	CGG	2	6	197752	197757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939944
3037	NC_013851	TTG	2	6	197844	197849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288939944
3038	NC_013851	GCC	2	6	197912	197917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939944
3039	NC_013851	ATG	2	6	197943	197948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939944
3040	NC_013851	GGA	2	6	198016	198021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939944
3041	NC_013851	CAG	2	6	198059	198064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939944
3042	NC_013851	GAC	2	6	198071	198076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939944
3043	NC_013851	TGA	2	6	198079	198084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939944
3044	NC_013851	GCA	2	6	198133	198138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939944
3045	NC_013851	GCC	2	6	198171	198176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939944
3046	NC_013851	GCA	3	9	198181	198189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939944
3047	NC_013851	CAC	2	6	198206	198211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939944
3048	NC_013851	GAT	2	6	198221	198226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939944
3049	NC_013851	CTG	2	6	198254	198259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939944
3050	NC_013851	ACC	2	6	198264	198269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939944
3051	NC_013851	GTC	2	6	198285	198290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939944
3052	NC_013851	CGG	2	6	198305	198310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939944
3053	NC_013851	GAT	2	6	198314	198319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939944
3054	NC_013851	CCG	2	6	198420	198425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939944
3055	NC_013851	ATG	2	6	198426	198431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939944
3056	NC_013851	GCC	2	6	198525	198530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939944
3057	NC_013851	CAG	3	9	198536	198544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939944
3058	NC_013851	GCA	4	12	198721	198732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939944
3059	NC_013851	TCA	3	9	198784	198792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939944
3060	NC_013851	GCG	2	6	198878	198883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939945
3061	NC_013851	CCG	3	9	199085	199093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939945
3062	NC_013851	CGT	3	9	199209	199217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939945
3063	NC_013851	GGC	2	6	199218	199223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939945
3064	NC_013851	CGG	2	6	199229	199234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939945
3065	NC_013851	GCC	2	6	199270	199275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939945
3066	NC_013851	CGT	2	6	199337	199342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939945
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3068	NC_013851	CGC	2	6	199523	199528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939945
3069	NC_013851	GCA	2	6	199529	199534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939945
3070	NC_013851	CGG	2	6	199538	199543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939945
3071	NC_013851	GGT	2	6	199548	199553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939945
3072	NC_013851	CGA	2	6	199604	199609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939945
3073	NC_013851	CTC	2	6	199647	199652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939945
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3081	NC_013851	GGT	2	6	200013	200018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939945
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3088	NC_013851	CTG	2	6	200400	200405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939945
3089	NC_013851	GGC	2	6	200421	200426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939945
3090	NC_013851	GCC	2	6	200493	200498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939945
3091	NC_013851	GGC	2	6	200538	200543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939945
3092	NC_013851	GCA	2	6	200549	200554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939945
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3094	NC_013851	TCT	2	6	200633	200638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939945
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3098	NC_013851	CGG	2	6	200834	200839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939946
3099	NC_013851	CGG	2	6	200867	200872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939946
3100	NC_013851	CAG	4	12	200919	200930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939946
3101	NC_013851	AAC	2	6	200980	200985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288939946
3102	NC_013851	CGA	2	6	201087	201092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_013851	CTT	2	6	201168	201173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939947
3104	NC_013851	GTG	2	6	201214	201219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939947
3105	NC_013851	TCC	2	6	201289	201294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3106	NC_013851	CGA	2	6	201326	201331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939948
3107	NC_013851	CTT	2	6	201348	201353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939948
3108	NC_013851	TGG	2	6	201374	201379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939948
3109	NC_013851	TGT	2	6	201464	201469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288939948
3110	NC_013851	GTT	2	6	201483	201488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288939948
3111	NC_013851	GTT	2	6	201557	201562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_013851	GTT	2	6	201642	201647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_013851	GCC	2	6	201655	201660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3114	NC_013851	CGG	2	6	201736	201741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939949
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3116	NC_013851	TGC	2	6	201882	201887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939949
3117	NC_013851	CTG	2	6	201905	201910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939949
3118	NC_013851	TGA	2	6	201969	201974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939949
3119	NC_013851	CGG	2	6	202015	202020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939949
3120	NC_013851	CGC	2	6	202435	202440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939950
3121	NC_013851	CGC	2	6	202449	202454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939950
3122	NC_013851	GTC	2	6	202515	202520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939950
3123	NC_013851	ACT	2	6	202625	202630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939950
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3127	NC_013851	CTT	2	6	202885	202890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939951
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3130	NC_013851	AGC	2	6	203099	203104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939951
3131	NC_013851	TCG	2	6	203123	203128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939951
3132	NC_013851	GCA	2	6	203187	203192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939951
3133	NC_013851	GTC	2	6	203224	203229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939951
3134	NC_013851	CAC	2	6	203230	203235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939951
3135	NC_013851	CGC	2	6	203367	203372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939951
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3139	NC_013851	CGC	2	6	203829	203834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939951
3140	NC_013851	GTG	2	6	203864	203869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939951
3141	NC_013851	ATG	2	6	203882	203887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939951
3142	NC_013851	TCA	2	6	203928	203933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939951
3143	NC_013851	CGT	2	6	203985	203990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939951
3144	NC_013851	TGA	2	6	204000	204005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939951
3145	NC_013851	TCC	2	6	204086	204091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939951
3146	NC_013851	GCA	2	6	204114	204119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939951
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3148	NC_013851	CGG	2	6	204216	204221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939951
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3150	NC_013851	GCA	2	6	204282	204287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939951
3151	NC_013851	GTC	2	6	204301	204306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939951
3152	NC_013851	CTG	2	6	204319	204324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939951
3153	NC_013851	CAG	2	6	204328	204333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939951
3154	NC_013851	TGA	2	6	204378	204383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939951
3155	NC_013851	GCT	2	6	204417	204422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939951
3156	NC_013851	CGT	2	6	204465	204470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939951
3157	NC_013851	CAC	2	6	204580	204585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939951
3158	NC_013851	CGG	2	6	204720	204725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939951
3159	NC_013851	GCG	3	9	204767	204775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939951
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3163	NC_013851	GTC	2	6	204869	204874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939951
3164	NC_013851	TCG	2	6	205028	205033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939951
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3178	NC_013851	GCG	2	6	205898	205903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939951
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3180	NC_013851	GCT	2	6	205947	205952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939951
3181	NC_013851	CGC	2	6	206007	206012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939951
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3183	NC_013851	TCG	2	6	206153	206158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939951
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3191	NC_013851	CGG	2	6	207090	207095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939951
3192	NC_013851	CCT	2	6	207204	207209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939951
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3200	NC_013851	GCA	2	6	208110	208115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939951
3201	NC_013851	TGA	2	6	208164	208169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939951
3202	NC_013851	GGT	2	6	208187	208192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939951
3203	NC_013851	GAC	2	6	208255	208260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939951
3204	NC_013851	CGT	2	6	208342	208347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939951
3205	NC_013851	CAG	2	6	208360	208365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939951
3206	NC_013851	GCC	2	6	208498	208503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939951
3207	NC_013851	CCG	2	6	208548	208553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3208	NC_013851	CGG	2	6	208629	208634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939952
3209	NC_013851	GAG	2	6	208727	208732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939952
3210	NC_013851	TGG	2	6	208914	208919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939952
3211	NC_013851	TCG	2	6	208952	208957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939952
3212	NC_013851	ACC	2	6	208961	208966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939952
3213	NC_013851	GCC	2	6	208997	209002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939952
3214	NC_013851	GGC	2	6	209008	209013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939952
3215	NC_013851	GTC	2	6	209047	209052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939952
3216	NC_013851	CGA	2	6	209061	209066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939952
3217	NC_013851	TCG	2	6	209246	209251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939952
3218	NC_013851	CGG	2	6	209274	209279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939952
3219	NC_013851	CTG	2	6	209312	209317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939952
3220	NC_013851	TGG	2	6	209391	209396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939952
3221	NC_013851	CCA	2	6	209397	209402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939952
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3223	NC_013851	TCG	2	6	209513	209518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939952
3224	NC_013851	GCC	2	6	209567	209572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939952
3225	NC_013851	GCG	2	6	209612	209617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939952
3226	NC_013851	CAG	2	6	209716	209721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939952
3227	NC_013851	CGG	2	6	209748	209753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939952
3228	NC_013851	CGG	2	6	209880	209885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939952
3229	NC_013851	TCG	2	6	209960	209965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939952
3230	NC_013851	CGG	2	6	209976	209981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939952
3231	NC_013851	CGC	2	6	209985	209990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939952
3232	NC_013851	CGG	2	6	210081	210086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939952
3233	NC_013851	GCG	2	6	210216	210221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939952
3234	NC_013851	CCT	2	6	210270	210275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939952
3235	NC_013851	CCA	2	6	210309	210314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939952
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3237	NC_013851	TCT	2	6	210417	210422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939952
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3356	NC_013851	TCA	2	6	218055	218060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939962
3357	NC_013851	TGC	2	6	218061	218066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939962
3358	NC_013851	GAG	2	6	218141	218146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939962
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3360	NC_013851	GGT	2	6	218516	218521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939963
3361	NC_013851	TCG	2	6	218533	218538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939963
3362	NC_013851	GGC	3	9	218606	218614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939963
3363	NC_013851	CAC	2	6	218624	218629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939963
3364	NC_013851	CTG	2	6	218633	218638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939963
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3379	NC_013851	CGG	2	6	219802	219807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939964
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3383	NC_013851	TGA	2	6	220050	220055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939964
3384	NC_013851	TGA	2	6	220137	220142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939964
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3473	NC_013851	GAG	2	6	225408	225413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939969
3474	NC_013851	GCG	2	6	225541	225546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939969
3475	NC_013851	GGC	2	6	225593	225598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939969
3476	NC_013851	GAT	2	6	225632	225637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939969
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3492	NC_013851	TAG	2	6	226776	226781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939970
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3499	NC_013851	CGT	2	6	227193	227198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939970
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