MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 55548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013851	AAT	2	6	295375	295380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288940004
4502	NC_013851	GCT	2	6	295567	295572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940004
4503	NC_013851	GCA	2	6	295627	295632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940004
4504	NC_013851	CCA	2	6	295699	295704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288940004
4505	NC_013851	GTC	2	6	295820	295825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940005
4506	NC_013851	CAG	2	6	295856	295861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940005
4507	NC_013851	CGA	2	6	295891	295896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940005
4508	NC_013851	AGC	3	9	295962	295970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940005
4509	NC_013851	CCG	2	6	296091	296096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940005
4510	NC_013851	CAA	2	6	296102	296107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288940005
4511	NC_013851	ACA	2	6	296143	296148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288940005
4512	NC_013851	CGC	2	6	296584	296589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940007
4513	NC_013851	CGG	2	6	296655	296660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940007
4514	NC_013851	CGA	2	6	296688	296693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940007
4515	NC_013851	GCG	3	9	296706	296714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940007
4516	NC_013851	ACC	2	6	296964	296969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288940007
4517	NC_013851	TCG	2	6	297026	297031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940007
4518	NC_013851	CGC	2	6	297037	297042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940007
4519	NC_013851	TCC	2	6	297239	297244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288940007
4520	NC_013851	TGA	2	6	297291	297296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288940007
4521	NC_013851	GCC	2	6	297317	297322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940007
4522	NC_013851	CCG	2	6	297350	297355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940007
4523	NC_013851	TCA	2	6	297423	297428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288940007
4524	NC_013851	GCC	2	6	297528	297533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940008
4525	NC_013851	GTG	2	6	297685	297690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288940008
4526	NC_013851	GCC	2	6	297781	297786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940008
4527	NC_013851	TCG	2	6	297787	297792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940008
4528	NC_013851	CCG	2	6	297968	297973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940008
4529	NC_013851	CGA	2	6	298034	298039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940008
4530	NC_013851	CCA	2	6	298169	298174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288940008
4531	NC_013851	CAG	2	6	298257	298262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940008
4532	NC_013851	GAA	2	6	298343	298348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288940009
4533	NC_013851	ACC	3	9	298458	298466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288940009
4534	NC_013851	CAT	2	6	298484	298489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288940009
4535	NC_013851	GCC	2	6	298508	298513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940009
4536	NC_013851	ACC	2	6	298515	298520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288940009
4537	NC_013851	GCA	2	6	298654	298659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940009
4538	NC_013851	TCG	2	6	298690	298695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940009
4539	NC_013851	GAT	2	6	298801	298806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288940009
4540	NC_013851	AGT	2	6	298822	298827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288940009
4541	NC_013851	TGA	2	6	298876	298881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288940009
4542	NC_013851	TTG	2	6	298974	298979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288940009
4543	NC_013851	TCA	2	6	298984	298989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288940009
4544	NC_013851	CGG	2	6	299087	299092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940009
4545	NC_013851	GCG	2	6	299177	299182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940009
4546	NC_013851	GTC	2	6	299211	299216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940009
4547	NC_013851	CAG	2	6	299243	299248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940009
4548	NC_013851	CAG	2	6	299285	299290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940009
4549	NC_013851	GAT	2	6	299309	299314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288940009
4550	NC_013851	GCC	2	6	299324	299329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940009
4551	NC_013851	CCA	2	6	299341	299346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288940009
4552	NC_013851	CGC	3	9	299360	299368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940009
4553	NC_013851	AGC	2	6	299373	299378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940009
4554	NC_013851	TGA	2	6	299410	299415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288940009
4555	NC_013851	TGA	2	6	299521	299526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288940009
4556	NC_013851	TCG	2	6	299556	299561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940009
4557	NC_013851	GTC	2	6	299573	299578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940009
4558	NC_013851	CGA	2	6	299590	299595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940009
4559	NC_013851	CAG	2	6	299597	299602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940009
4560	NC_013851	GAT	2	6	299654	299659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288940009
4561	NC_013851	TCG	2	6	299712	299717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940009
4562	NC_013851	CGA	2	6	299728	299733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940009
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4564	NC_013851	TAG	2	6	299829	299834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288940009
4565	NC_013851	TGA	2	6	299878	299883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288940009
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4567	NC_013851	TGT	2	6	299935	299940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288940009
4568	NC_013851	CGG	2	6	299971	299976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940009
4569	NC_013851	CAG	2	6	299978	299983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940009
4570	NC_013851	GAT	2	6	300092	300097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288940009
4571	NC_013851	GCA	2	6	300121	300126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940009
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4573	NC_013851	GGT	2	6	300157	300162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288940009
4574	NC_013851	CGA	2	6	300277	300282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940009
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4578	NC_013851	GCT	2	6	300779	300784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940010
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4585	NC_013851	CGA	2	6	301323	301328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940011
4586	NC_013851	GAC	2	6	301341	301346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940011
4587	NC_013851	GAC	2	6	301367	301372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940011
4588	NC_013851	GCG	2	6	301391	301396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940011
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4600	NC_013851	GTC	2	6	302230	302235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940012
4601	NC_013851	TGA	2	6	302283	302288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288940012
4602	NC_013851	GGT	2	6	302334	302339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_013851	CGA	2	6	302386	302391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_013851	CGC	2	6	302523	302528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940013
4605	NC_013851	GCC	2	6	302572	302577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940013
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4608	NC_013851	TCG	2	6	302651	302656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940013
4609	NC_013851	AGG	2	6	302729	302734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288940013
4610	NC_013851	GTC	3	9	302743	302751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940013
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4612	NC_013851	AGC	2	6	302801	302806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940013
4613	NC_013851	GCT	2	6	302877	302882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940013
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4615	NC_013851	CGA	2	6	302913	302918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940013
4616	NC_013851	GCC	4	12	302926	302937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940013
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4975	NC_013851	GCC	2	6	323308	323313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940025
4976	NC_013851	ACC	2	6	323334	323339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288940025
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4978	NC_013851	CCG	2	6	323454	323459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940025
4979	NC_013851	GAC	2	6	323584	323589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940025
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4983	NC_013851	CCT	2	6	323884	323889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4984	NC_013851	CAG	2	6	323953	323958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940026
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