MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 55548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013851	ACG	2	6	33728	33733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939795
502	NC_013851	AGC	2	6	33850	33855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939795
503	NC_013851	ACC	2	6	33864	33869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939795
504	NC_013851	CGT	2	6	33885	33890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939795
505	NC_013851	CTG	2	6	33891	33896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939795
506	NC_013851	CGC	2	6	33920	33925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939795
507	NC_013851	CAC	2	6	33938	33943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939795
508	NC_013851	GGC	2	6	34050	34055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_013851	GCC	2	6	34062	34067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_013851	ACC	2	6	34173	34178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939796
511	NC_013851	GCT	2	6	34309	34314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939796
512	NC_013851	CAG	2	6	34355	34360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939796
513	NC_013851	TCG	2	6	34479	34484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939796
514	NC_013851	CGA	2	6	34486	34491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939796
515	NC_013851	TCC	2	6	34530	34535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939796
516	NC_013851	CGC	3	9	34684	34692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939796
517	NC_013851	TGA	2	6	34723	34728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939796
518	NC_013851	GCT	2	6	34840	34845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939796
519	NC_013851	CGC	2	6	34849	34854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939796
520	NC_013851	CTT	2	6	34979	34984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939796
521	NC_013851	GCA	2	6	35014	35019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939796
522	NC_013851	GCC	2	6	35021	35026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939796
523	NC_013851	CTG	2	6	35078	35083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939796
524	NC_013851	CGA	2	6	35113	35118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939796
525	NC_013851	CGA	2	6	35188	35193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939796
526	NC_013851	GTC	2	6	35228	35233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939796
527	NC_013851	TTG	2	6	35298	35303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288939796
528	NC_013851	GCA	2	6	35311	35316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939796
529	NC_013851	ATG	2	6	35370	35375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939796
530	NC_013851	TTG	2	6	35376	35381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288939796
531	NC_013851	CTG	2	6	35435	35440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939796
532	NC_013851	TCG	2	6	35475	35480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939796
533	NC_013851	ACC	2	6	35487	35492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939796
534	NC_013851	GTC	2	6	35688	35693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939797
535	NC_013851	CCG	2	6	35711	35716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939797
536	NC_013851	CGC	2	6	35758	35763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939797
537	NC_013851	CAT	2	6	35765	35770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939797
538	NC_013851	TCG	2	6	35920	35925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939797
539	NC_013851	CGC	2	6	35939	35944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939797
540	NC_013851	CAC	2	6	35985	35990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939797
541	NC_013851	GCC	2	6	35997	36002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939797
542	NC_013851	ACC	2	6	36040	36045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939797
543	NC_013851	CGC	2	6	36089	36094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939797
544	NC_013851	GAA	2	6	36096	36101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939797
545	NC_013851	CGA	2	6	36140	36145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939797
546	NC_013851	TGT	2	6	36149	36154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288939797
547	NC_013851	GAT	3	9	36192	36200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939797
548	NC_013851	CCG	2	6	36296	36301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939797
549	NC_013851	GTC	2	6	36327	36332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939797
550	NC_013851	CAC	2	6	36434	36439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939797
551	NC_013851	GCC	2	6	36454	36459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939797
552	NC_013851	ATC	2	6	36634	36639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939797
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554	NC_013851	AGA	2	6	36698	36703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939797
555	NC_013851	TGA	2	6	36710	36715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939797
556	NC_013851	CTT	2	6	36738	36743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939797
557	NC_013851	CAT	2	6	36804	36809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939797
558	NC_013851	CGA	2	6	36821	36826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939797
559	NC_013851	GCG	2	6	36830	36835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939797
560	NC_013851	CAG	2	6	36864	36869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939797
561	NC_013851	CAC	2	6	36879	36884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939797
562	NC_013851	CTG	2	6	36957	36962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939797
563	NC_013851	CCG	2	6	37033	37038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939797
564	NC_013851	TTC	2	6	37153	37158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939797
565	NC_013851	GCG	4	12	37208	37219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939797
566	NC_013851	ACC	2	6	37293	37298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939797
567	NC_013851	GTC	2	6	37338	37343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939797
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571	NC_013851	CAG	2	6	37656	37661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939797
572	NC_013851	TCG	2	6	37675	37680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939797
573	NC_013851	CGC	2	6	37775	37780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939797
574	NC_013851	CGC	2	6	37799	37804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939797
575	NC_013851	GCC	2	6	37873	37878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939797
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590	NC_013851	CTG	2	6	38799	38804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939797
591	NC_013851	GGC	3	9	38907	38915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939797
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593	NC_013851	CTT	2	6	39000	39005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939797
594	NC_013851	CTC	2	6	39015	39020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939797
595	NC_013851	GTC	2	6	39063	39068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939797
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599	NC_013851	TCG	2	6	39553	39558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939797
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601	NC_013851	CGG	2	6	39665	39670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939797
602	NC_013851	CGC	2	6	39746	39751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939797
603	NC_013851	GCA	2	6	39788	39793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939797
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608	NC_013851	GCG	2	6	40481	40486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_013851	ATC	3	9	40593	40601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939798
610	NC_013851	GAA	2	6	40641	40646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939798
611	NC_013851	CGC	2	6	40661	40666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939798
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613	NC_013851	CGG	2	6	40852	40857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939798
614	NC_013851	GTC	2	6	40860	40865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939798
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619	NC_013851	CAC	3	9	41425	41433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939799
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622	NC_013851	CGT	2	6	41591	41596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939799
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624	NC_013851	CGC	2	6	41767	41772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939799
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996	NC_013851	GGC	2	6	66480	66485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939823
997	NC_013851	GTC	2	6	66505	66510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939823
998	NC_013851	GGC	2	6	66606	66611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939823
999	NC_013851	CAT	2	6	66612	66617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939823
1000	NC_013851	CGG	2	6	66705	66710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939823

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