MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 55548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55501	NC_013851	GAA	2	6	3524564	3524569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288942814
55502	NC_013851	GAA	2	6	3524573	3524578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288942814
55503	NC_013851	TCA	2	6	3524602	3524607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288942814
55504	NC_013851	CGG	2	6	3524630	3524635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288942814
55505	NC_013851	CTG	2	6	3524651	3524656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288942814
55506	NC_013851	TTG	2	6	3524718	3524723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288942814
55507	NC_013851	CAG	2	6	3524765	3524770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288942814
55508	NC_013851	GCC	2	6	3524822	3524827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288942814
55509	NC_013851	TCT	2	6	3524839	3524844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288942814
55510	NC_013851	CAT	2	6	3524861	3524866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288942814
55511	NC_013851	GCT	2	6	3524881	3524886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288942814
55512	NC_013851	GTC	2	6	3524888	3524893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288942814
55513	NC_013851	GAT	2	6	3525011	3525016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288942814
55514	NC_013851	CAC	2	6	3525035	3525040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288942814
55515	NC_013851	TCC	2	6	3525132	3525137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288942814
55516	NC_013851	CGA	2	6	3525160	3525165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288942814
55517	NC_013851	CGG	2	6	3525212	3525217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288942814
55518	NC_013851	GAT	2	6	3525230	3525235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288942814
55519	NC_013851	CGG	2	6	3525287	3525292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288942814
55520	NC_013851	TGC	2	6	3525315	3525320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288942814
55521	NC_013851	TCC	2	6	3525375	3525380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288942814
55522	NC_013851	CTT	2	6	3525389	3525394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288942814
55523	NC_013851	TTC	2	6	3525401	3525406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288942814
55524	NC_013851	CGC	2	6	3525421	3525426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288942814
55525	NC_013851	TGA	2	6	3525439	3525444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288942814
55526	NC_013851	ACC	2	6	3525531	3525536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288942814
55527	NC_013851	TCT	2	6	3525580	3525585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288942814
55528	NC_013851	CAG	2	6	3525719	3525724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288942814
55529	NC_013851	GAC	2	6	3525734	3525739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288942814
55530	NC_013851	CGG	2	6	3525749	3525754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288942814
55531	NC_013851	GAG	2	6	3525764	3525769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288942814
55532	NC_013851	GTC	2	6	3525779	3525784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288942814
55533	NC_013851	GAC	2	6	3525797	3525802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288942814
55534	NC_013851	AGC	2	6	3525813	3525818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288942814
55535	NC_013851	GCA	2	6	3525862	3525867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288942814
55536	NC_013851	TCG	2	6	3525894	3525899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288942814
55537	NC_013851	GCC	2	6	3525903	3525908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288942814
55538	NC_013851	GCG	2	6	3526191	3526196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288942815
55539	NC_013851	AGC	2	6	3526291	3526296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288942815
55540	NC_013851	ATG	2	6	3526348	3526353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288942815
55541	NC_013851	CAC	2	6	3526436	3526441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288942816
55542	NC_013851	GCT	2	6	3526459	3526464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288942816
55543	NC_013851	GAC	2	6	3526606	3526611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288942816
55544	NC_013851	CGT	2	6	3526665	3526670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288942816
55545	NC_013851	GCC	2	6	3526694	3526699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288942816
55546	NC_013851	GGC	2	6	3526824	3526829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288942817
55547	NC_013851	GGT	2	6	3526872	3526877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55548	NC_013851	TGA	2	6	3526889	3526894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.