MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 42447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009922	GAA	2	6	304730	304735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319309
4002	NC_009922	ATG	2	6	304816	304821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319309
4003	NC_009922	GTG	2	6	304913	304918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319309
4004	NC_009922	TGC	2	6	305027	305032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319310
4005	NC_009922	TGG	2	6	305054	305059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319310
4006	NC_009922	GCA	2	6	305079	305084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319310
4007	NC_009922	GGT	2	6	305178	305183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319310
4008	NC_009922	ATT	2	6	305307	305312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319310
4009	NC_009922	TGG	2	6	305339	305344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319310
4010	NC_009922	ATG	2	6	305437	305442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319310
4011	NC_009922	TAA	2	6	305459	305464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319310
4012	NC_009922	AGA	2	6	305519	305524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319310
4013	NC_009922	TTG	2	6	305635	305640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319310
4014	NC_009922	AAC	2	6	305669	305674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319310
4015	NC_009922	AAG	2	6	305709	305714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319310
4016	NC_009922	CTG	2	6	305728	305733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319310
4017	NC_009922	TGC	2	6	305759	305764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319310
4018	NC_009922	CAA	2	6	305999	306004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319310
4019	NC_009922	GGT	2	6	306024	306029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319310
4020	NC_009922	GTG	2	6	306061	306066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319310
4021	NC_009922	CGG	2	6	306140	306145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319310
4022	NC_009922	CAT	2	6	306267	306272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_009922	TTG	2	6	306319	306324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319311
4024	NC_009922	CCT	2	6	306369	306374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158319311
4025	NC_009922	GCC	2	6	306528	306533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158319311
4026	NC_009922	TGA	2	6	306604	306609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319311
4027	NC_009922	TGA	2	6	306619	306624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319311
4028	NC_009922	GCT	2	6	306738	306743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319311
4029	NC_009922	AGC	2	6	306851	306856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319311
4030	NC_009922	CAC	2	6	306893	306898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319311
4031	NC_009922	GCT	2	6	307107	307112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319311
4032	NC_009922	AGG	2	6	307135	307140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319311
4033	NC_009922	ATC	2	6	307181	307186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_009922	TAC	2	6	307216	307221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_009922	GAT	2	6	307408	307413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_009922	TTG	2	6	307539	307544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319312
4037	NC_009922	AGG	2	6	307573	307578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319312
4038	NC_009922	ACG	2	6	307649	307654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319312
4039	NC_009922	GTG	2	6	308058	308063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319312
4040	NC_009922	TGC	2	6	308121	308126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319312
4041	NC_009922	ATC	3	9	308129	308137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319312
4042	NC_009922	ACA	2	6	308187	308192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319312
4043	NC_009922	AAG	2	6	308346	308351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319312
4044	NC_009922	TGC	2	6	308383	308388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319312
4045	NC_009922	AGA	2	6	308428	308433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319312
4046	NC_009922	TAT	2	6	308552	308557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319312
4047	NC_009922	GGA	2	6	308733	308738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319313
4048	NC_009922	TGC	2	6	308753	308758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319313
4049	NC_009922	TGC	2	6	308816	308821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319313
4050	NC_009922	AAT	2	6	308886	308891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319313
4051	NC_009922	ATT	2	6	309021	309026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319313
4052	NC_009922	TGG	2	6	309106	309111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319313
4053	NC_009922	GAT	2	6	309332	309337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319313
4054	NC_009922	CTA	2	6	309399	309404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319313
4055	NC_009922	TCA	2	6	309451	309456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319313
4056	NC_009922	CTT	2	6	309485	309490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319313
4057	NC_009922	GAA	2	6	309540	309545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319313
4058	NC_009922	TTA	2	6	309722	309727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_009922	TTC	2	6	309791	309796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319314
4060	NC_009922	CCA	2	6	310045	310050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319314
4061	NC_009922	TCT	2	6	310167	310172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319314
4062	NC_009922	TCA	2	6	310213	310218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319314
4063	NC_009922	TTG	2	6	310261	310266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319315
4064	NC_009922	TCT	2	6	310385	310390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319315
4065	NC_009922	CGA	2	6	310548	310553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319315
4066	NC_009922	GAA	2	6	310560	310565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319315
4067	NC_009922	AGA	2	6	310583	310588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319315
4068	NC_009922	ACG	2	6	310649	310654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319315
4069	NC_009922	CAG	2	6	310669	310674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319315
4070	NC_009922	GAT	2	6	310696	310701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319315
4071	NC_009922	TCC	2	6	310717	310722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158319315
4072	NC_009922	GAA	2	6	310786	310791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319315
4073	NC_009922	TAA	2	6	310932	310937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319315
4074	NC_009922	CCA	2	6	310949	310954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319315
4075	NC_009922	CTT	2	6	310978	310983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319315
4076	NC_009922	GAG	2	6	311200	311205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319316
4077	NC_009922	CTG	2	6	311210	311215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319316
4078	NC_009922	GTT	2	6	311248	311253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319316
4079	NC_009922	TCC	2	6	311325	311330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158319316
4080	NC_009922	GCT	2	6	311382	311387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319316
4081	NC_009922	TGC	2	6	311423	311428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319316
4082	NC_009922	TGA	2	6	311529	311534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319316
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4084	NC_009922	GGT	2	6	311789	311794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319316
4085	NC_009922	TTG	2	6	311862	311867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319316
4086	NC_009922	TGG	2	6	311905	311910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319316
4087	NC_009922	GAA	2	6	312009	312014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319316
4088	NC_009922	CAC	2	6	312424	312429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319316
4089	NC_009922	ATA	2	6	312437	312442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319316
4090	NC_009922	CTT	2	6	312469	312474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319316
4091	NC_009922	TTG	2	6	312475	312480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319316
4092	NC_009922	TCC	2	6	312534	312539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158319316
4093	NC_009922	CCA	2	6	312627	312632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319316
4094	NC_009922	GAT	2	6	312662	312667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319316
4095	NC_009922	GAT	2	6	312740	312745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319316
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4098	NC_009922	GGT	2	6	313131	313136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319316
4099	NC_009922	TGA	2	6	313183	313188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319316
4100	NC_009922	CTT	2	6	313342	313347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319316
4101	NC_009922	AAG	2	6	313473	313478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_009922	AGA	2	6	313528	313533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_009922	TAT	2	6	313546	313551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_009922	TTA	2	6	313663	313668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319317
4105	NC_009922	AGC	2	6	313690	313695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319317
4106	NC_009922	AGA	2	6	313805	313810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319317
4107	NC_009922	TAG	2	6	313828	313833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319317
4108	NC_009922	GAA	2	6	313845	313850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319317
4109	NC_009922	AGA	2	6	313982	313987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319317
4110	NC_009922	AGG	2	6	314209	314214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319317
4111	NC_009922	TGA	2	6	314297	314302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319317
4112	NC_009922	TAT	2	6	314313	314318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319317
4113	NC_009922	CAG	2	6	314334	314339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319317
4114	NC_009922	TGT	2	6	314453	314458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319317
4115	NC_009922	TTC	2	6	314518	314523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319317
4116	NC_009922	GTA	2	6	314526	314531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319317
4117	NC_009922	GAA	2	6	314540	314545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319317
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