MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 42447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009922	AGG	2	6	118254	118259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_009922	CTT	2	6	118311	118316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319149
1503	NC_009922	GAA	2	6	118425	118430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319149
1504	NC_009922	CTG	2	6	118449	118454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319149
1505	NC_009922	CTG	2	6	118464	118469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319149
1506	NC_009922	GTT	2	6	118643	118648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319149
1507	NC_009922	GGA	2	6	118709	118714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_009922	TGA	2	6	118719	118724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319150
1509	NC_009922	AGA	2	6	118804	118809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319150
1510	NC_009922	TGG	2	6	118906	118911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319150
1511	NC_009922	CAA	2	6	118962	118967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319150
1512	NC_009922	CTT	2	6	119055	119060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319150
1513	NC_009922	TAT	2	6	119218	119223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319150
1514	NC_009922	CTC	2	6	119338	119343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158319150
1515	NC_009922	GAA	2	6	119445	119450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319150
1516	NC_009922	GCT	2	6	119459	119464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319150
1517	NC_009922	AGC	2	6	119599	119604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319150
1518	NC_009922	AGG	2	6	119640	119645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319150
1519	NC_009922	GGC	2	6	119665	119670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319150
1520	NC_009922	GGC	2	6	119735	119740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319150
1521	NC_009922	ATG	2	6	119774	119779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319150
1522	NC_009922	AGG	2	6	119861	119866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_009922	ATT	2	6	119880	119885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319151
1524	NC_009922	CGA	2	6	119981	119986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319151
1525	NC_009922	AGC	2	6	120002	120007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319151
1526	NC_009922	ACC	2	6	120059	120064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319151
1527	NC_009922	GGA	2	6	120302	120307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319151
1528	NC_009922	AAG	2	6	120466	120471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319151
1529	NC_009922	AAT	2	6	120489	120494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319151
1530	NC_009922	TAG	2	6	120622	120627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319151
1531	NC_009922	AGG	2	6	120659	120664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_009922	TTA	2	6	120749	120754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319152
1533	NC_009922	CAG	2	6	120798	120803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319152
1534	NC_009922	ATT	2	6	120841	120846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319152
1535	NC_009922	ATC	2	6	120879	120884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319152
1536	NC_009922	TAT	2	6	121123	121128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319152
1537	NC_009922	GGT	2	6	121270	121275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319152
1538	NC_009922	GGA	2	6	121328	121333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319152
1539	NC_009922	AAG	2	6	121346	121351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319152
1540	NC_009922	TGT	2	6	121417	121422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319152
1541	NC_009922	GGA	2	6	121537	121542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319152
1542	NC_009922	CAT	2	6	121693	121698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_009922	ACA	2	6	121707	121712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_009922	CTT	2	6	121721	121726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_009922	AGG	2	6	121762	121767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319153
1546	NC_009922	ATG	2	6	121812	121817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319153
1547	NC_009922	AGA	2	6	121820	121825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319153
1548	NC_009922	ATC	2	6	121892	121897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319153
1549	NC_009922	AAT	2	6	121911	121916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319153
1550	NC_009922	GAA	2	6	121931	121936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319153
1551	NC_009922	TGA	2	6	121978	121983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319153
1552	NC_009922	CTT	2	6	122002	122007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319153
1553	NC_009922	AGT	2	6	122039	122044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319153
1554	NC_009922	AGT	2	6	122111	122116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319153
1555	NC_009922	CTT	2	6	122203	122208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319153
1556	NC_009922	TCT	2	6	122373	122378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319153
1557	NC_009922	CTT	2	6	122396	122401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319153
1558	NC_009922	CTA	2	6	122455	122460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319153
1559	NC_009922	CCT	2	6	122520	122525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_009922	ATT	2	6	122551	122556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_009922	ATA	2	6	122583	122588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_009922	GAA	2	6	122723	122728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_009922	ACT	2	6	122755	122760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_009922	AGA	2	6	122812	122817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319154
1565	NC_009922	AGC	2	6	122881	122886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319154
1566	NC_009922	GAA	2	6	122894	122899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319154
1567	NC_009922	TGC	2	6	122952	122957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319154
1568	NC_009922	TGA	2	6	123079	123084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319154
1569	NC_009922	ATT	2	6	123179	123184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319154
1570	NC_009922	ATG	2	6	123272	123277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319154
1571	NC_009922	CAG	2	6	123310	123315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319154
1572	NC_009922	ATT	2	6	123348	123353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319154
1573	NC_009922	AGA	2	6	123406	123411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319154
1574	NC_009922	ATA	2	6	123478	123483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319154
1575	NC_009922	GAA	2	6	123499	123504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319155
1576	NC_009922	GTA	2	6	123528	123533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319155
1577	NC_009922	GTT	2	6	123540	123545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319155
1578	NC_009922	ATT	2	6	123583	123588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319155
1579	NC_009922	AAT	2	6	123687	123692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319155
1580	NC_009922	GAT	2	6	123801	123806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319155
1581	NC_009922	TTA	2	6	123931	123936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319155
1582	NC_009922	AAG	2	6	124115	124120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319155
1583	NC_009922	ATG	3	9	124132	124140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319155
1584	NC_009922	TCC	2	6	124221	124226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158319155
1585	NC_009922	TGA	2	6	124295	124300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319155
1586	NC_009922	GAA	2	6	124418	124423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319155
1587	NC_009922	AGC	2	6	124462	124467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319155
1588	NC_009922	ATA	2	6	124489	124494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319155
1589	NC_009922	AGA	2	6	124514	124519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319155
1590	NC_009922	TCT	2	6	124531	124536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319155
1591	NC_009922	CAG	2	6	124603	124608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319155
1592	NC_009922	TGG	2	6	124624	124629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319155
1593	NC_009922	CTG	2	6	124687	124692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319155
1594	NC_009922	GAA	2	6	124729	124734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319155
1595	NC_009922	TGA	2	6	124772	124777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319155
1596	NC_009922	ATC	2	6	124779	124784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319155
1597	NC_009922	ATC	2	6	124839	124844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319155
1598	NC_009922	ATT	2	6	124889	124894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319156
1599	NC_009922	TTG	2	6	124917	124922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319156
1600	NC_009922	TCC	2	6	124973	124978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158319156
1601	NC_009922	GAA	2	6	124979	124984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319156
1602	NC_009922	ATC	2	6	125298	125303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319156
1603	NC_009922	CTT	2	6	125325	125330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319156
1604	NC_009922	ATC	2	6	125560	125565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319156
1605	NC_009922	AGA	2	6	125633	125638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319156
1606	NC_009922	AGC	2	6	125768	125773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319156
1607	NC_009922	AGA	2	6	125799	125804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319156
1608	NC_009922	ACT	2	6	125841	125846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319156
1609	NC_009922	GGA	2	6	126026	126031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319156
1610	NC_009922	GGC	2	6	126073	126078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319156
1611	NC_009922	GAA	2	6	126085	126090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319156
1612	NC_009922	AAT	2	6	126105	126110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319156
1613	NC_009922	CAG	2	6	126121	126126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319156
1614	NC_009922	GAA	2	6	126345	126350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319156
1615	NC_009922	CAG	2	6	126465	126470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_009922	ACT	2	6	126489	126494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319157
1617	NC_009922	CAG	2	6	126556	126561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319157
1618	NC_009922	GCA	2	6	126668	126673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319157
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1986	NC_009922	AGA	2	6	155163	155168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1987	NC_009922	AGA	2	6	155179	155184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1988	NC_009922	AGG	2	6	155198	155203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1989	NC_009922	GAT	2	6	155207	155212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319186
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1991	NC_009922	GTA	2	6	155247	155252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319186
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