MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 42447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_009922	AGA	2	6	78063	78068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319117
1003	NC_009922	GTA	2	6	78210	78215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319117
1004	NC_009922	ATA	2	6	78271	78276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319117
1005	NC_009922	ATA	2	6	78303	78308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319117
1006	NC_009922	TAT	2	6	78313	78318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319117
1007	NC_009922	TTG	2	6	78457	78462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319117
1008	NC_009922	ATT	2	6	78944	78949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_009922	CAA	2	6	79012	79017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_009922	GAG	2	6	79093	79098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_009922	AGC	2	6	79219	79224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_009922	TAA	2	6	79379	79384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_009922	ATT	2	6	79492	79497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_009922	TCA	2	6	79582	79587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_009922	TTG	2	6	79594	79599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_009922	ACA	2	6	79605	79610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_009922	AGC	2	6	79834	79839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_009922	TGC	2	6	79962	79967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_009922	TAT	2	6	80049	80054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_009922	TAA	2	6	80140	80145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_009922	TTA	2	6	80296	80301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319118
1022	NC_009922	AAT	2	6	80319	80324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319118
1023	NC_009922	CAT	2	6	80454	80459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319118
1024	NC_009922	GAA	2	6	80514	80519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319118
1025	NC_009922	CCA	2	6	80615	80620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319118
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1027	NC_009922	TTA	2	6	80783	80788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319118
1028	NC_009922	AGT	2	6	81048	81053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319118
1029	NC_009922	GGA	2	6	81125	81130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319118
1030	NC_009922	CTG	2	6	81132	81137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319118
1031	NC_009922	GAA	2	6	81198	81203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319118
1032	NC_009922	AGC	2	6	81414	81419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319118
1033	NC_009922	AGA	2	6	81440	81445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319118
1034	NC_009922	GAT	2	6	81644	81649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319118
1035	NC_009922	TAC	2	6	81709	81714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319118
1036	NC_009922	ATT	2	6	81751	81756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319119
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1039	NC_009922	ATT	2	6	81986	81991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319119
1040	NC_009922	TTA	2	6	82142	82147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319119
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1045	NC_009922	GGA	2	6	82363	82368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319119
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1049	NC_009922	TAC	2	6	82499	82504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319120
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1054	NC_009922	TTG	2	6	82741	82746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319121
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1057	NC_009922	GAA	2	6	82965	82970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319121
1058	NC_009922	CAT	2	6	83054	83059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319121
1059	NC_009922	TTC	2	6	83143	83148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319121
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1062	NC_009922	GAA	2	6	83436	83441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319121
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1070	NC_009922	ATA	3	9	84036	84044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319122
1071	NC_009922	GCT	2	6	84107	84112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319122
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1079	NC_009922	TAT	2	6	84704	84709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_009922	TAG	2	6	84779	84784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1082	NC_009922	TAT	2	6	84829	84834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_009922	ACT	2	6	85004	85009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319123
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1092	NC_009922	TAA	2	6	86351	86356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_009922	GAA	2	6	86409	86414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1096	NC_009922	ATG	2	6	86559	86564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_009922	AAG	2	6	86629	86634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_009922	TAT	2	6	86669	86674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_009922	TTA	2	6	86775	86780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1105	NC_009922	GAT	2	6	87133	87138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319124
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1108	NC_009922	ATG	2	6	87368	87373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319124
1109	NC_009922	CAG	2	6	87515	87520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319124
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1114	NC_009922	AGG	2	6	87977	87982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_009922	AAT	2	6	87983	87988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_009922	GCA	2	6	88180	88185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319125
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1119	NC_009922	ATA	2	6	88371	88376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319125
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1121	NC_009922	ACG	2	6	88779	88784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319126
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1490	NC_009922	GAA	2	6	117435	117440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319148
1491	NC_009922	TGG	2	6	117514	117519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319148
1492	NC_009922	TGG	2	6	117524	117529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319148
1493	NC_009922	CAT	2	6	117547	117552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319148
1494	NC_009922	GCA	2	6	117594	117599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319148
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1499	NC_009922	TAA	2	6	117879	117884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1500	NC_009922	TAC	2	6	117886	117891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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