MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 42447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009922	ATT	2	6	229712	229717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319253
3002	NC_009922	ATA	2	6	229806	229811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319253
3003	NC_009922	CTT	2	6	229880	229885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319253
3004	NC_009922	GCA	2	6	229898	229903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319253
3005	NC_009922	GTT	2	6	229925	229930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319253
3006	NC_009922	ATT	2	6	229957	229962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319253
3007	NC_009922	AGA	2	6	230005	230010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319253
3008	NC_009922	CAA	2	6	230025	230030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319253
3009	NC_009922	TGG	2	6	230056	230061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319253
3010	NC_009922	AAG	2	6	230154	230159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319253
3011	NC_009922	GAT	2	6	230312	230317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319253
3012	NC_009922	ATT	2	6	230337	230342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319253
3013	NC_009922	CTA	2	6	230405	230410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319254
3014	NC_009922	TAT	2	6	230424	230429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319254
3015	NC_009922	ATA	2	6	230548	230553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319254
3016	NC_009922	GAA	2	6	230689	230694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319254
3017	NC_009922	AGA	2	6	230769	230774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319254
3018	NC_009922	AAC	2	6	230848	230853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319254
3019	NC_009922	TAA	2	6	230996	231001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319254
3020	NC_009922	ATC	2	6	231172	231177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319254
3021	NC_009922	ATA	3	9	231199	231207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319254
3022	NC_009922	TAT	2	6	231387	231392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319254
3023	NC_009922	AGA	3	9	231393	231401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319254
3024	NC_009922	GAT	2	6	231526	231531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319254
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3026	NC_009922	CAA	2	6	231692	231697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319254
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3028	NC_009922	GAC	2	6	231970	231975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_009922	ATT	2	6	232049	232054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_009922	AGA	2	6	232100	232105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_009922	AGA	2	6	232110	232115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_009922	ATT	2	6	232225	232230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_009922	GAT	2	6	232320	232325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_009922	ATT	2	6	232528	232533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_009922	GTT	2	6	232564	232569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_009922	ATA	2	6	232633	232638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_009922	TCC	2	6	232642	232647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3038	NC_009922	TAG	2	6	232676	232681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_009922	TAG	2	6	232736	232741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_009922	AGG	2	6	232755	232760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_009922	GGC	2	6	232779	232784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_009922	TGG	2	6	232853	232858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_009922	CAG	2	6	232898	232903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_009922	GAG	2	6	233011	233016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_009922	ATG	2	6	233060	233065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_009922	AAT	2	6	233073	233078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_009922	AAG	2	6	233088	233093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_009922	GAA	2	6	233297	233302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_009922	TAT	2	6	233410	233415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_009922	ACA	2	6	233420	233425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_009922	GTA	2	6	233491	233496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_009922	GAG	2	6	233610	233615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_009922	GAA	2	6	233626	233631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_009922	GAT	2	6	233635	233640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319255
3055	NC_009922	GAA	2	6	233714	233719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319255
3056	NC_009922	ATG	2	6	233826	233831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319255
3057	NC_009922	ATT	3	9	233837	233845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319255
3058	NC_009922	ACT	2	6	233942	233947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319255
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3063	NC_009922	ACC	2	6	234437	234442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319255
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3065	NC_009922	TAG	2	6	234471	234476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319255
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3067	NC_009922	CAG	2	6	234658	234663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_009922	ATA	2	6	234672	234677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_009922	ATG	3	9	234701	234709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_009922	ATT	2	6	234710	234715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_009922	AAT	2	6	234718	234723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_009922	GAA	2	6	234776	234781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319256
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3074	NC_009922	TCT	2	6	234928	234933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319256
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3082	NC_009922	TAG	2	6	235269	235274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319256
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3093	NC_009922	GTA	2	6	236057	236062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319256
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3104	NC_009922	TTG	2	6	237031	237036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319257
3105	NC_009922	CAT	2	6	237069	237074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319257
3106	NC_009922	ATT	2	6	237113	237118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319257
3107	NC_009922	CAA	2	6	237340	237345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319257
3108	NC_009922	TCC	2	6	237428	237433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158319257
3109	NC_009922	TTA	2	6	237531	237536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319257
3110	NC_009922	ATA	2	6	237658	237663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319257
3111	NC_009922	AGC	2	6	237743	237748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319257
3112	NC_009922	GAG	2	6	237792	237797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319257
3113	NC_009922	ACA	2	6	237806	237811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319257
3114	NC_009922	ATT	2	6	237995	238000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_009922	ATG	2	6	238031	238036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_009922	ATA	2	6	238042	238047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_009922	GTA	2	6	238059	238064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_009922	ATA	2	6	238068	238073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_009922	TAA	2	6	238173	238178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319258
3120	NC_009922	GAA	2	6	238364	238369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319258
3121	NC_009922	ATC	2	6	238394	238399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319258
3122	NC_009922	ACA	2	6	238432	238437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319258
3123	NC_009922	TGC	2	6	238518	238523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319258
3124	NC_009922	ACA	2	6	238555	238560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319258
3125	NC_009922	GTG	2	6	238775	238780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319258
3126	NC_009922	CTA	2	6	238835	238840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319258
3127	NC_009922	TAT	2	6	238895	238900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319258
3128	NC_009922	TGG	2	6	238914	238919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319258
3129	NC_009922	GGT	2	6	239077	239082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319258
3130	NC_009922	ATG	2	6	239152	239157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319258
3131	NC_009922	GAA	2	6	239212	239217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319258
3132	NC_009922	GCG	2	6	239218	239223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319258
3133	NC_009922	AAT	2	6	239290	239295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319258
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3136	NC_009922	CTT	2	6	239340	239345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319258
3137	NC_009922	CTG	2	6	239393	239398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319258
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3140	NC_009922	AGA	2	6	239541	239546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319258
3141	NC_009922	TGG	2	6	239598	239603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319258
3142	NC_009922	GGT	2	6	239683	239688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319258
3143	NC_009922	CAT	2	6	239705	239710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319258
3144	NC_009922	AGC	2	6	239745	239750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319258
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3150	NC_009922	ATG	2	6	240383	240388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319258
3151	NC_009922	GGA	2	6	240411	240416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319258
3152	NC_009922	GAT	2	6	240418	240423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319258
3153	NC_009922	GGC	2	6	240462	240467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319258
3154	NC_009922	TGT	2	6	240489	240494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319258
3155	NC_009922	ATG	2	6	240545	240550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319258
3156	NC_009922	TAG	2	6	240689	240694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319258
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3163	NC_009922	ATA	2	6	241185	241190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319259
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3165	NC_009922	ATA	2	6	241383	241388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319259
3166	NC_009922	AAG	2	6	241404	241409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319259
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3182	NC_009922	ACA	2	6	242299	242304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319260
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3184	NC_009922	ACA	2	6	242327	242332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319260
3185	NC_009922	ACT	2	6	242392	242397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319260
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3187	NC_009922	TAC	2	6	242453	242458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319260
3188	NC_009922	TAG	2	6	242659	242664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319261
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3190	NC_009922	AAT	2	6	242885	242890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319261
3191	NC_009922	TGT	2	6	242899	242904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319261
3192	NC_009922	ATG	2	6	243129	243134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319261
3193	NC_009922	GCA	2	6	243241	243246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3194	NC_009922	AGG	2	6	243331	243336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3195	NC_009922	TAA	2	6	243350	243355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319262
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3200	NC_009922	GCT	2	6	243706	243711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319262
3201	NC_009922	GAT	2	6	243973	243978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319262
3202	NC_009922	GTA	2	6	244118	244123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319262
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3206	NC_009922	AGG	2	6	244504	244509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3207	NC_009922	AGA	2	6	244536	244541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319263
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3213	NC_009922	TGA	2	6	244964	244969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319263
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3225	NC_009922	ATT	2	6	245721	245726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319263
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3228	NC_009922	TAA	2	6	246020	246025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319264
3229	NC_009922	AAG	2	6	246091	246096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319264
3230	NC_009922	GAG	2	6	246123	246128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319264
3231	NC_009922	CTC	2	6	246169	246174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158319264
3232	NC_009922	AGT	2	6	246200	246205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319264
3233	NC_009922	CTT	2	6	246253	246258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3234	NC_009922	CTT	2	6	246619	246624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3235	NC_009922	ACA	2	6	246711	246716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3236	NC_009922	CAA	2	6	246767	246772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3237	NC_009922	GAA	2	6	246982	246987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3238	NC_009922	TAA	2	6	247143	247148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319265
3239	NC_009922	GGT	2	6	247156	247161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319265
3240	NC_009922	TGT	2	6	247201	247206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319265
3241	NC_009922	ATC	2	6	247381	247386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319265
3242	NC_009922	GTT	2	6	247455	247460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319265
3243	NC_009922	AGG	2	6	247574	247579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319265
3244	NC_009922	TAA	2	6	247598	247603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319265
3245	NC_009922	TTA	2	6	247604	247609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319265
3246	NC_009922	TGC	2	6	247703	247708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319265
3247	NC_009922	GTA	2	6	247745	247750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319265
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3370	NC_009922	AGA	2	6	257665	257670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319275
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3452	NC_009922	TTA	2	6	263442	263447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3453	NC_009922	ATA	2	6	263462	263467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3455	NC_009922	AGA	2	6	263621	263626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3472	NC_009922	CTG	2	6	265214	265219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319281
3473	NC_009922	CTG	2	6	265237	265242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319281
3474	NC_009922	ATA	2	6	265406	265411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319281
3475	NC_009922	CTC	2	6	265412	265417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3476	NC_009922	CTA	2	6	265452	265457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3477	NC_009922	AAT	2	6	265459	265464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3478	NC_009922	TTA	2	6	265510	265515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3479	NC_009922	TTA	2	6	265565	265570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3480	NC_009922	GTA	2	6	265593	265598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3482	NC_009922	AAT	2	6	265710	265715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319282
3483	NC_009922	GGA	2	6	265752	265757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319282
3484	NC_009922	AGA	2	6	265758	265763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319282
3485	NC_009922	ATG	2	6	265789	265794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319282
3486	NC_009922	GAA	2	6	265834	265839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319282
3487	NC_009922	CAT	3	9	265851	265859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319282
3488	NC_009922	GAT	2	6	265915	265920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319282
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3490	NC_009922	TGC	3	9	266004	266012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319282
3491	NC_009922	GAA	2	6	266023	266028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319282
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3495	NC_009922	TCA	2	6	266371	266376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3496	NC_009922	TCA	2	6	266382	266387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3497	NC_009922	CGC	2	6	266393	266398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158319283
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