MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 42447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009922	ACC	2	6	423281	423286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319423
5502	NC_009922	AGA	2	6	423388	423393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319423
5503	NC_009922	TGG	2	6	423435	423440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319423
5504	NC_009922	AGA	2	6	423562	423567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319423
5505	NC_009922	CAT	2	6	423607	423612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319423
5506	NC_009922	TGG	2	6	423663	423668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319423
5507	NC_009922	ATT	2	6	423682	423687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319423
5508	NC_009922	AGA	2	6	423715	423720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319423
5509	NC_009922	TCT	2	6	423728	423733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319423
5510	NC_009922	GGA	2	6	423751	423756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319423
5511	NC_009922	ATA	2	6	424017	424022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319423
5512	NC_009922	AAT	2	6	424325	424330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319423
5513	NC_009922	GCC	2	6	424342	424347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158319423
5514	NC_009922	CAG	2	6	424675	424680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319424
5515	NC_009922	ATG	2	6	424695	424700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319424
5516	NC_009922	GTA	2	6	424770	424775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319424
5517	NC_009922	ATA	2	6	424830	424835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319424
5518	NC_009922	CTT	2	6	424850	424855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319424
5519	NC_009922	ATC	2	6	424872	424877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319424
5520	NC_009922	GTC	2	6	424962	424967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319424
5521	NC_009922	CAT	2	6	424985	424990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319424
5522	NC_009922	TTA	2	6	425058	425063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319424
5523	NC_009922	TTA	2	6	425101	425106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319424
5524	NC_009922	CCA	2	6	425172	425177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319424
5525	NC_009922	TCC	2	6	425301	425306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158319424
5526	NC_009922	TTA	2	6	425358	425363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319424
5527	NC_009922	AAC	2	6	425378	425383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319424
5528	NC_009922	TGC	2	6	425432	425437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319424
5529	NC_009922	GAA	2	6	425455	425460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319424
5530	NC_009922	AAC	2	6	425477	425482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319424
5531	NC_009922	TAT	2	6	425506	425511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319424
5532	NC_009922	ATT	2	6	425519	425524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319424
5533	NC_009922	GCA	2	6	425541	425546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319424
5534	NC_009922	TCG	2	6	425566	425571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319424
5535	NC_009922	ATG	2	6	425580	425585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319424
5536	NC_009922	GAT	2	6	425610	425615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319424
5537	NC_009922	ATG	2	6	425652	425657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319424
5538	NC_009922	GAA	2	6	425738	425743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319424
5539	NC_009922	ATC	2	6	425793	425798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319424
5540	NC_009922	GCA	2	6	425820	425825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_009922	CGA	2	6	425842	425847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_009922	CAT	2	6	425964	425969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_009922	ATT	2	6	425973	425978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_009922	TTG	2	6	426002	426007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319425
5545	NC_009922	CGG	2	6	426097	426102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319425
5546	NC_009922	CTG	2	6	426276	426281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319425
5547	NC_009922	GGA	2	6	426329	426334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319425
5548	NC_009922	ATG	2	6	426431	426436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319425
5549	NC_009922	CAC	2	6	426558	426563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319425
5550	NC_009922	ATG	2	6	426624	426629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319425
5551	NC_009922	CAA	3	9	426922	426930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319425
5552	NC_009922	GCG	2	6	426959	426964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319425
5553	NC_009922	GGT	2	6	427037	427042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319425
5554	NC_009922	GCA	2	6	427178	427183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319425
5555	NC_009922	ACG	2	6	427202	427207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319425
5556	NC_009922	AGA	2	6	427273	427278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319425
5557	NC_009922	ACA	2	6	427297	427302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319425
5558	NC_009922	CTT	2	6	427369	427374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_009922	TAA	2	6	427497	427502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319426
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5561	NC_009922	ACC	2	6	427700	427705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319426
5562	NC_009922	GAA	2	6	427718	427723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319426
5563	NC_009922	AGA	2	6	427737	427742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319426
5564	NC_009922	AGG	2	6	427810	427815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319426
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5567	NC_009922	GAA	2	6	428000	428005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319426
5568	NC_009922	CTG	2	6	428070	428075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319426
5569	NC_009922	TGG	2	6	428103	428108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319426
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5571	NC_009922	GAG	2	6	428437	428442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319427
5572	NC_009922	AAG	2	6	428492	428497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319427
5573	NC_009922	GCG	2	6	428501	428506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319427
5574	NC_009922	ATC	2	6	428596	428601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319427
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5578	NC_009922	GGT	2	6	428870	428875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319428
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5580	NC_009922	GAT	2	6	428937	428942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319428
5581	NC_009922	GTA	2	6	429118	429123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319428
5582	NC_009922	CCA	2	6	429166	429171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319428
5583	NC_009922	GGT	2	6	429209	429214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319428
5584	NC_009922	AGG	2	6	429259	429264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319428
5585	NC_009922	ATG	2	6	429280	429285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319428
5586	NC_009922	GGA	2	6	429329	429334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319428
5587	NC_009922	GGA	2	6	429362	429367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319428
5588	NC_009922	TGG	2	6	429385	429390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319428
5589	NC_009922	AAG	2	6	429484	429489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319428
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5591	NC_009922	TTG	2	6	429658	429663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319428
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5593	NC_009922	ATT	2	6	429747	429752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319428
5594	NC_009922	AAT	2	6	429783	429788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319428
5595	NC_009922	TGA	2	6	430110	430115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319428
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5602	NC_009922	TTA	2	6	430509	430514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319429
5603	NC_009922	AAT	2	6	430856	430861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319429
5604	NC_009922	CAG	2	6	430867	430872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319429
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5609	NC_009922	TAT	2	6	431411	431416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319430
5610	NC_009922	TGC	2	6	431536	431541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319430
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