MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 63817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009484	CAG	2	6	232189	232194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259221
4002	NC_009484	GAT	2	6	232306	232311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259221
4003	NC_009484	GGC	2	6	232380	232385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259221
4004	NC_009484	CGG	2	6	232447	232452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259221
4005	NC_009484	ACC	2	6	232514	232519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259221
4006	NC_009484	CGG	2	6	232537	232542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259221
4007	NC_009484	GCA	2	6	232575	232580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259221
4008	NC_009484	TGA	2	6	232584	232589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259221
4009	NC_009484	GAT	2	6	232624	232629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259221
4010	NC_009484	TGC	2	6	232647	232652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259221
4011	NC_009484	CGC	2	6	232683	232688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259221
4012	NC_009484	CGA	2	6	232827	232832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259221
4013	NC_009484	GCC	2	6	232846	232851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259221
4014	NC_009484	GCC	2	6	232855	232860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259221
4015	NC_009484	GCC	2	6	232882	232887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259221
4016	NC_009484	GCC	2	6	232891	232896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259221
4017	NC_009484	GCC	2	6	232918	232923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259221
4018	NC_009484	GCC	2	6	232927	232932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259221
4019	NC_009484	GCC	2	6	232954	232959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259221
4020	NC_009484	GCC	2	6	232963	232968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259221
4021	NC_009484	TGC	2	6	233011	233016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259221
4022	NC_009484	CAG	2	6	233020	233025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259221
4023	NC_009484	CGA	2	6	233028	233033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259221
4024	NC_009484	TAA	2	6	233088	233093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148259222
4025	NC_009484	GCG	2	6	233145	233150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259222
4026	NC_009484	GCA	2	6	233197	233202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259222
4027	NC_009484	ACA	2	6	233221	233226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259222
4028	NC_009484	GCG	2	6	233235	233240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259222
4029	NC_009484	GGC	2	6	233245	233250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259222
4030	NC_009484	AGG	2	6	233403	233408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259222
4031	NC_009484	GTC	2	6	233417	233422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259222
4032	NC_009484	CGA	2	6	233434	233439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259222
4033	NC_009484	GCC	2	6	233493	233498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259222
4034	NC_009484	AGG	2	6	233502	233507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259222
4035	NC_009484	GTC	2	6	233522	233527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259222
4036	NC_009484	CGC	2	6	233533	233538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259222
4037	NC_009484	GTC	2	6	233541	233546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259222
4038	NC_009484	GGC	3	9	233579	233587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259222
4039	NC_009484	GCG	3	9	233613	233621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259222
4040	NC_009484	CGG	2	6	233697	233702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259222
4041	NC_009484	GAC	2	6	233714	233719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259222
4042	NC_009484	CGC	2	6	233826	233831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259222
4043	NC_009484	CGA	2	6	233842	233847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259222
4044	NC_009484	GCA	2	6	233854	233859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259222
4045	NC_009484	GCA	2	6	233866	233871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259222
4046	NC_009484	ATA	2	6	233959	233964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148259222
4047	NC_009484	ACC	2	6	234074	234079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259223
4048	NC_009484	CTG	2	6	234125	234130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259223
4049	NC_009484	CGG	2	6	234189	234194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259223
4050	NC_009484	ATC	2	6	234368	234373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259223
4051	NC_009484	CCT	2	6	234504	234509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259223
4052	NC_009484	CGA	2	6	234538	234543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259223
4053	NC_009484	GCG	2	6	234739	234744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259223
4054	NC_009484	GCG	2	6	234842	234847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259223
4055	NC_009484	GGC	2	6	235101	235106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259224
4056	NC_009484	TCA	2	6	235180	235185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259224
4057	NC_009484	CGG	2	6	235245	235250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259224
4058	NC_009484	GCG	2	6	235294	235299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259224
4059	NC_009484	CTG	2	6	235322	235327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259224
4060	NC_009484	CTG	2	6	235352	235357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259224
4061	NC_009484	GGC	2	6	235383	235388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259224
4062	NC_009484	GCC	2	6	235417	235422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259224
4063	NC_009484	GGT	2	6	235423	235428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259224
4064	NC_009484	CGG	2	6	235563	235568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259224
4065	NC_009484	GAT	2	6	235600	235605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259224
4066	NC_009484	GCT	2	6	235708	235713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259224
4067	NC_009484	GAC	2	6	235727	235732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259224
4068	NC_009484	CGT	2	6	235765	235770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259224
4069	NC_009484	TGC	2	6	235831	235836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259224
4070	NC_009484	CTG	2	6	235841	235846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259224
4071	NC_009484	CCG	2	6	235881	235886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259224
4072	NC_009484	CGG	2	6	235920	235925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259224
4073	NC_009484	GGC	3	9	235928	235936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259224
4074	NC_009484	GCG	2	6	236045	236050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259224
4075	NC_009484	CGG	3	9	236061	236069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259224
4076	NC_009484	GGA	2	6	236074	236079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259224
4077	NC_009484	TCG	2	6	236088	236093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259224
4078	NC_009484	GCC	2	6	236126	236131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259224
4079	NC_009484	CGC	2	6	236179	236184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259224
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4081	NC_009484	CTG	2	6	236249	236254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259224
4082	NC_009484	GCC	2	6	236327	236332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259224
4083	NC_009484	CGC	2	6	236335	236340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259224
4084	NC_009484	GCC	3	9	236341	236349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259224
4085	NC_009484	CGC	2	6	236398	236403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259224
4086	NC_009484	GCC	2	6	236435	236440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259224
4087	NC_009484	GCT	2	6	236625	236630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259225
4088	NC_009484	GCC	2	6	236631	236636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259225
4089	NC_009484	ACC	2	6	236640	236645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259225
4090	NC_009484	CAT	2	6	236650	236655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259225
4091	NC_009484	CGG	2	6	236696	236701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259225
4092	NC_009484	CGG	2	6	236719	236724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259225
4093	NC_009484	CGC	2	6	236822	236827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259225
4094	NC_009484	GCG	3	9	236852	236860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259225
4095	NC_009484	ATG	2	6	236950	236955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259225
4096	NC_009484	CGC	2	6	237005	237010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259225
4097	NC_009484	GCT	2	6	237090	237095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259225
4098	NC_009484	CGG	2	6	237182	237187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259225
4099	NC_009484	AAG	2	6	237226	237231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259225
4100	NC_009484	ATG	2	6	237236	237241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259225
4101	NC_009484	CGC	2	6	237249	237254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259225
4102	NC_009484	CTG	2	6	237262	237267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259225
4103	NC_009484	TCG	2	6	237299	237304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259225
4104	NC_009484	CCG	2	6	237419	237424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259225
4105	NC_009484	GGT	2	6	237516	237521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259225
4106	NC_009484	GGC	2	6	237572	237577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259225
4107	NC_009484	GGC	3	9	237657	237665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259225
4108	NC_009484	GAC	2	6	237705	237710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259225
4109	NC_009484	GAG	2	6	237748	237753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259225
4110	NC_009484	GCC	2	6	237756	237761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259225
4111	NC_009484	GGC	2	6	237795	237800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259225
4112	NC_009484	CGG	2	6	237919	237924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259226
4113	NC_009484	CAC	2	6	237953	237958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259226
4114	NC_009484	GCG	2	6	237961	237966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259226
4115	NC_009484	CGC	3	9	237976	237984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259226
4116	NC_009484	GCG	2	6	238046	238051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259226
4117	NC_009484	GAG	2	6	238233	238238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259226
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4119	NC_009484	TCG	2	6	238264	238269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259226
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4472	NC_009484	CGA	2	6	256782	256787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259242
4473	NC_009484	CCG	2	6	256814	256819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259242
4474	NC_009484	CCG	2	6	256871	256876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259242
4475	NC_009484	CGA	2	6	257001	257006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259242
4476	NC_009484	CGC	2	6	257117	257122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259242
4477	NC_009484	GCC	2	6	257125	257130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259242
4478	NC_009484	CTT	2	6	257198	257203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259243
4479	NC_009484	CGA	2	6	257322	257327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259243
4480	NC_009484	CGG	2	6	257449	257454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259243
4481	NC_009484	GCC	2	6	257473	257478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259243
4482	NC_009484	ACG	2	6	257562	257567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259243
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4484	NC_009484	CGA	2	6	257671	257676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259243
4485	NC_009484	ACG	2	6	257730	257735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259243
4486	NC_009484	ATC	2	6	257837	257842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259243
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4491	NC_009484	CCG	3	9	258235	258243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259243
4492	NC_009484	TCG	2	6	258255	258260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259243
4493	NC_009484	CTG	2	6	258293	258298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259243
4494	NC_009484	CGC	2	6	258331	258336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259243
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4497	NC_009484	GCG	2	6	258451	258456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259243
4498	NC_009484	GAT	2	6	258473	258478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259243
4499	NC_009484	TGG	2	6	258513	258518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259243
4500	NC_009484	TCG	2	6	258588	258593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259243

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