MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 63817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009484	CGT	2	6	30005	30010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259052
502	NC_009484	CCG	2	6	30025	30030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259052
503	NC_009484	CGG	3	9	30101	30109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259052
504	NC_009484	GCA	2	6	30113	30118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259052
505	NC_009484	CAG	2	6	30132	30137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259052
506	NC_009484	GCG	2	6	30233	30238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259052
507	NC_009484	GCG	2	6	30246	30251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259052
508	NC_009484	GCG	2	6	30271	30276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259052
509	NC_009484	GCG	2	6	30466	30471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259053
510	NC_009484	AGC	2	6	30538	30543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259053
511	NC_009484	CGA	2	6	30572	30577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259053
512	NC_009484	AAG	2	6	30582	30587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259053
513	NC_009484	ACC	2	6	30603	30608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259053
514	NC_009484	GAC	2	6	30612	30617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259053
515	NC_009484	GGA	2	6	30635	30640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259053
516	NC_009484	CGA	3	9	30647	30655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259053
517	NC_009484	GAT	2	6	30672	30677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259053
518	NC_009484	GAC	2	6	30684	30689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259053
519	NC_009484	CCG	2	6	30884	30889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259054
520	NC_009484	CGG	2	6	31029	31034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259054
521	NC_009484	GCG	2	6	31290	31295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259055
522	NC_009484	CAA	2	6	31369	31374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259055
523	NC_009484	CAT	2	6	31618	31623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259055
524	NC_009484	CGC	2	6	31717	31722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259055
525	NC_009484	CTG	2	6	31973	31978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259055
526	NC_009484	GCC	2	6	32003	32008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259055
527	NC_009484	TGG	2	6	32075	32080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259055
528	NC_009484	TCG	2	6	32214	32219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259055
529	NC_009484	CGA	2	6	32290	32295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259055
530	NC_009484	CGA	2	6	32320	32325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259055
531	NC_009484	CAT	2	6	32356	32361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259055
532	NC_009484	ATG	2	6	32707	32712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259056
533	NC_009484	CGC	3	9	32715	32723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259056
534	NC_009484	CGC	2	6	32778	32783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259056
535	NC_009484	GCG	2	6	32842	32847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259056
536	NC_009484	GCG	2	6	32945	32950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259056
537	NC_009484	CAC	2	6	33069	33074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259056
538	NC_009484	CTG	2	6	33082	33087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259056
539	NC_009484	GGA	3	9	33111	33119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259056
540	NC_009484	GCC	2	6	33124	33129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259056
541	NC_009484	CGG	2	6	33196	33201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259056
542	NC_009484	TGA	2	6	33280	33285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259057
543	NC_009484	TCG	2	6	33301	33306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259057
544	NC_009484	CCG	2	6	33307	33312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259057
545	NC_009484	GCC	2	6	33434	33439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259057
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549	NC_009484	GAC	2	6	33494	33499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259057
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551	NC_009484	CGG	2	6	33739	33744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259057
552	NC_009484	TGC	2	6	33754	33759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259057
553	NC_009484	CTG	2	6	33771	33776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259057
554	NC_009484	TCG	2	6	33889	33894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259057
555	NC_009484	CGA	2	6	33961	33966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259057
556	NC_009484	TGA	2	6	33976	33981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259057
557	NC_009484	CCG	2	6	34273	34278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259058
558	NC_009484	CCG	2	6	34281	34286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259058
559	NC_009484	TGC	2	6	34305	34310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259058
560	NC_009484	TGC	2	6	34407	34412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259058
561	NC_009484	CGG	2	6	34447	34452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259058
562	NC_009484	CGT	2	6	34492	34497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259058
563	NC_009484	GCC	2	6	34567	34572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259058
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567	NC_009484	CGA	2	6	34693	34698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259058
568	NC_009484	CAT	2	6	34711	34716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259058
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570	NC_009484	GCC	2	6	34792	34797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259058
571	NC_009484	CCG	2	6	34806	34811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259058
572	NC_009484	GCG	2	6	34821	34826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259058
573	NC_009484	GTG	2	6	34829	34834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259058
574	NC_009484	CGA	2	6	34981	34986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259058
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576	NC_009484	GTG	2	6	35225	35230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259058
577	NC_009484	TGC	2	6	35235	35240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259058
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579	NC_009484	GAT	2	6	35308	35313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259058
580	NC_009484	CCA	2	6	35341	35346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259058
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590	NC_009484	GCG	2	6	35819	35824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259058
591	NC_009484	TGC	2	6	35844	35849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259058
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593	NC_009484	TCT	2	6	35953	35958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259058
594	NC_009484	CGG	2	6	36042	36047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259058
595	NC_009484	GCC	2	6	36110	36115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259058
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619	NC_009484	CGG	2	6	37464	37469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259059
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997	NC_009484	CTG	2	6	60279	60284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259078
998	NC_009484	CCG	2	6	60301	60306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259078
999	NC_009484	TGA	2	6	60316	60321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259078
1000	NC_009484	GAT	2	6	60350	60355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259078

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