MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 63817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009484	CAT	3	9	258628	258636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259243
4502	NC_009484	GGC	2	6	258637	258642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259243
4503	NC_009484	CCG	2	6	258694	258699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259244
4504	NC_009484	CGA	2	6	258707	258712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259244
4505	NC_009484	CGG	2	6	258718	258723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259244
4506	NC_009484	CAG	2	6	258768	258773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259244
4507	NC_009484	TGC	2	6	258784	258789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259244
4508	NC_009484	TCG	3	9	258793	258801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259244
4509	NC_009484	GGC	2	6	258815	258820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259244
4510	NC_009484	GCG	2	6	258881	258886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259244
4511	NC_009484	CGG	2	6	258939	258944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259244
4512	NC_009484	GCC	2	6	259074	259079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259244
4513	NC_009484	CTG	2	6	259092	259097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259244
4514	NC_009484	GGC	2	6	259103	259108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259244
4515	NC_009484	CGG	2	6	259177	259182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259244
4516	NC_009484	GTG	2	6	259215	259220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259244
4517	NC_009484	GGT	2	6	259359	259364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259244
4518	NC_009484	CGA	2	6	259437	259442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259245
4519	NC_009484	GGC	2	6	259466	259471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259245
4520	NC_009484	GAA	2	6	259581	259586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259245
4521	NC_009484	CGG	2	6	259644	259649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259245
4522	NC_009484	AGC	3	9	259712	259720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259245
4523	NC_009484	GCG	2	6	259746	259751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259245
4524	NC_009484	GAA	2	6	259807	259812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259245
4525	NC_009484	CGC	2	6	259821	259826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259245
4526	NC_009484	GAG	2	6	259828	259833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259245
4527	NC_009484	CGC	3	9	259864	259872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259245
4528	NC_009484	GAG	3	9	259873	259881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259245
4529	NC_009484	CCG	2	6	259930	259935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259245
4530	NC_009484	GCT	2	6	259945	259950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259245
4531	NC_009484	GCC	2	6	260074	260079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259245
4532	NC_009484	CGA	2	6	260091	260096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259245
4533	NC_009484	AAG	2	6	260176	260181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259245
4534	NC_009484	CGC	3	9	260194	260202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259245
4535	NC_009484	GCC	2	6	260224	260229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259245
4536	NC_009484	GCC	2	6	260294	260299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259245
4537	NC_009484	GGT	2	6	260349	260354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259245
4538	NC_009484	GCC	2	6	260398	260403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259245
4539	NC_009484	GTC	2	6	260416	260421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259245
4540	NC_009484	TGA	2	6	260429	260434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259245
4541	NC_009484	GCC	2	6	260592	260597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259245
4542	NC_009484	GTC	2	6	260599	260604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259245
4543	NC_009484	CAT	2	6	260607	260612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259245
4544	NC_009484	GCC	2	6	260671	260676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259245
4545	NC_009484	GGC	2	6	260886	260891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259245
4546	NC_009484	CAT	2	6	260901	260906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259245
4547	NC_009484	CAA	2	6	260916	260921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259245
4548	NC_009484	TTG	2	6	260965	260970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148259245
4549	NC_009484	GCG	2	6	260999	261004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259245
4550	NC_009484	AGG	2	6	261059	261064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259245
4551	NC_009484	CTG	2	6	261070	261075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259245
4552	NC_009484	CGG	2	6	261116	261121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259245
4553	NC_009484	TCG	2	6	261212	261217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259245
4554	NC_009484	CGA	2	6	261255	261260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259245
4555	NC_009484	GTC	2	6	261352	261357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259245
4556	NC_009484	CGG	4	12	261419	261430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259245
4557	NC_009484	TCA	2	6	261506	261511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259245
4558	NC_009484	TGC	2	6	261590	261595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259245
4559	NC_009484	ATC	2	6	261655	261660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259245
4560	NC_009484	CTA	2	6	261729	261734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259245
4561	NC_009484	CAT	2	6	261738	261743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259245
4562	NC_009484	GCG	2	6	261902	261907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259245
4563	NC_009484	CTG	2	6	261919	261924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259245
4564	NC_009484	CGT	2	6	261933	261938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259245
4565	NC_009484	CCA	2	6	261942	261947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259245
4566	NC_009484	GAC	2	6	261979	261984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259245
4567	NC_009484	GCG	2	6	262099	262104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259246
4568	NC_009484	GGA	2	6	262139	262144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259246
4569	NC_009484	GCG	2	6	262339	262344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259246
4570	NC_009484	TCT	2	6	262463	262468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259246
4571	NC_009484	CGC	2	6	262525	262530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259247
4572	NC_009484	TGG	2	6	262554	262559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259247
4573	NC_009484	CCA	2	6	262599	262604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259247
4574	NC_009484	CGC	2	6	262618	262623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259247
4575	NC_009484	GGC	2	6	262641	262646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259247
4576	NC_009484	CGC	2	6	262795	262800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259247
4577	NC_009484	CGG	2	6	262809	262814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259247
4578	NC_009484	CGC	2	6	262870	262875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259247
4579	NC_009484	TCG	2	6	263022	263027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259247
4580	NC_009484	GCG	2	6	263129	263134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259247
4581	NC_009484	GCC	2	6	263242	263247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259247
4582	NC_009484	GCC	2	6	263254	263259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259247
4583	NC_009484	GCC	2	6	263303	263308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259247
4584	NC_009484	GCG	2	6	263405	263410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259247
4585	NC_009484	GCC	2	6	263493	263498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259248
4586	NC_009484	GGA	2	6	263518	263523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259248
4587	NC_009484	GCA	2	6	263593	263598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259248
4588	NC_009484	CGC	3	9	263633	263641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259248
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4590	NC_009484	TCG	2	6	263710	263715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259248
4591	NC_009484	CGA	2	6	263756	263761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259248
4592	NC_009484	GTC	2	6	263832	263837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259248
4593	NC_009484	GAT	2	6	263838	263843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259248
4594	NC_009484	GGT	2	6	263909	263914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259248
4595	NC_009484	CCG	2	6	264071	264076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259248
4596	NC_009484	CCA	2	6	264164	264169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259248
4597	NC_009484	GTT	2	6	264286	264291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148259248
4598	NC_009484	GGC	2	6	264333	264338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259248
4599	NC_009484	CGG	2	6	264437	264442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259248
4600	NC_009484	CCG	2	6	264488	264493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259248
4601	NC_009484	GCG	2	6	264616	264621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259248
4602	NC_009484	TGA	2	6	264659	264664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259248
4603	NC_009484	TCG	2	6	264721	264726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259248
4604	NC_009484	GCC	2	6	264735	264740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259248
4605	NC_009484	GCC	2	6	264831	264836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259248
4606	NC_009484	GGA	2	6	264920	264925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259248
4607	NC_009484	GAT	2	6	264930	264935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259248
4608	NC_009484	GAT	2	6	265005	265010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259248
4609	NC_009484	GAA	2	6	265188	265193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259248
4610	NC_009484	TGA	2	6	265246	265251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259248
4611	NC_009484	GAT	2	6	265377	265382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259248
4612	NC_009484	GGC	2	6	265453	265458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259248
4613	NC_009484	TCC	2	6	265639	265644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259248
4614	NC_009484	CGA	2	6	265712	265717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259248
4615	NC_009484	GTC	2	6	265851	265856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259248
4616	NC_009484	TCA	2	6	265939	265944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259248
4617	NC_009484	GAT	2	6	266036	266041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259248
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4619	NC_009484	CCG	2	6	266174	266179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259248
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4979	NC_009484	ATC	2	6	287080	287085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259269
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