MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 63817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009484	CCG	2	6	312510	312515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259292
5502	NC_009484	ACG	2	6	312669	312674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259292
5503	NC_009484	CTG	3	9	312770	312778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259292
5504	NC_009484	AGC	2	6	312855	312860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259292
5505	NC_009484	GCT	2	6	312898	312903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259292
5506	NC_009484	AGC	2	6	313002	313007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259292
5507	NC_009484	GTC	2	6	313010	313015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259292
5508	NC_009484	CCG	2	6	313054	313059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259292
5509	NC_009484	CGG	2	6	313063	313068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259292
5510	NC_009484	CGG	2	6	313096	313101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259292
5511	NC_009484	GGC	2	6	313118	313123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259292
5512	NC_009484	GCA	2	6	313138	313143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259292
5513	NC_009484	TCG	2	6	313146	313151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259292
5514	NC_009484	CGG	2	6	313204	313209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259292
5515	NC_009484	GGC	2	6	313265	313270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259293
5516	NC_009484	CGG	2	6	313318	313323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259293
5517	NC_009484	GCC	2	6	313340	313345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259293
5518	NC_009484	ACG	2	6	313369	313374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259293
5519	NC_009484	TCG	2	6	313375	313380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259293
5520	NC_009484	GGC	2	6	313390	313395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259293
5521	NC_009484	TGC	2	6	313426	313431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259293
5522	NC_009484	CGC	2	6	313438	313443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259293
5523	NC_009484	CGC	3	9	313469	313477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259293
5524	NC_009484	GCC	2	6	313526	313531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259293
5525	NC_009484	CGA	2	6	313535	313540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259293
5526	NC_009484	GCT	2	6	313553	313558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259293
5527	NC_009484	GTC	2	6	313563	313568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259293
5528	NC_009484	GTG	2	6	313686	313691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259293
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5531	NC_009484	CGC	2	6	313757	313762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259293
5532	NC_009484	CGG	2	6	313805	313810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259293
5533	NC_009484	TGC	3	9	313831	313839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259293
5534	NC_009484	GGT	2	6	313928	313933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259293
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5536	NC_009484	CGC	2	6	314021	314026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259293
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5539	NC_009484	CCG	2	6	314188	314193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259293
5540	NC_009484	GCG	2	6	314395	314400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259293
5541	NC_009484	CGC	2	6	314412	314417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259293
5542	NC_009484	GTG	2	6	314430	314435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259293
5543	NC_009484	CGG	2	6	314441	314446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259293
5544	NC_009484	TCC	2	6	314463	314468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259293
5545	NC_009484	GCG	2	6	314563	314568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259293
5546	NC_009484	CGG	2	6	314581	314586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259293
5547	NC_009484	GCC	2	6	314780	314785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259293
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5549	NC_009484	GCT	2	6	314922	314927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259294
5550	NC_009484	GGC	2	6	315066	315071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259294
5551	NC_009484	TCC	2	6	315125	315130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259294
5552	NC_009484	GCC	2	6	315131	315136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259294
5553	NC_009484	TGA	2	6	315146	315151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259294
5554	NC_009484	CGC	2	6	315234	315239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259294
5555	NC_009484	GAG	2	6	315262	315267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259294
5556	NC_009484	ATC	2	6	315319	315324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259294
5557	NC_009484	CGG	2	6	315353	315358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259294
5558	NC_009484	GAT	2	6	315384	315389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259294
5559	NC_009484	GCG	2	6	315415	315420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259294
5560	NC_009484	CGG	2	6	315506	315511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259294
5561	NC_009484	CAT	2	6	315522	315527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259294
5562	NC_009484	GCA	2	6	315599	315604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259294
5563	NC_009484	GCT	2	6	315621	315626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259294
5564	NC_009484	AAG	2	6	315649	315654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259294
5565	NC_009484	GGC	2	6	315670	315675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259294
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5567	NC_009484	CGC	2	6	315714	315719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259294
5568	NC_009484	CGG	2	6	315948	315953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259294
5569	NC_009484	CGG	2	6	315969	315974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259294
5570	NC_009484	GGC	2	6	315991	315996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259294
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5572	NC_009484	TCG	2	6	316211	316216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259294
5573	NC_009484	CGG	2	6	316257	316262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259294
5574	NC_009484	TCC	2	6	316270	316275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259294
5575	NC_009484	CGG	2	6	316341	316346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259294
5576	NC_009484	GGC	2	6	316351	316356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259294
5577	NC_009484	GTC	2	6	316616	316621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259295
5578	NC_009484	CAA	2	6	316681	316686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259295
5579	NC_009484	CTG	2	6	316832	316837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259295
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5583	NC_009484	TGC	2	6	317205	317210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259295
5584	NC_009484	GCC	2	6	317269	317274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259295
5585	NC_009484	GCA	2	6	317293	317298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259295
5586	NC_009484	GGC	2	6	317421	317426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259295
5587	NC_009484	GAA	2	6	317428	317433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259295
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5589	NC_009484	GGC	2	6	317540	317545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259295
5590	NC_009484	CCG	2	6	317590	317595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259295
5591	NC_009484	GGC	2	6	317650	317655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259295
5592	NC_009484	GTC	2	6	317720	317725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259295
5593	NC_009484	GCC	2	6	317726	317731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259295
5594	NC_009484	CCG	3	9	317755	317763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259295
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5599	NC_009484	AAG	2	6	318072	318077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259296
5600	NC_009484	CTG	2	6	318238	318243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259296
5601	NC_009484	GCC	2	6	318259	318264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259296
5602	NC_009484	TCA	2	6	318368	318373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259296
5603	NC_009484	AGC	2	6	318738	318743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259297
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5605	NC_009484	CTA	2	6	318851	318856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259297
5606	NC_009484	AGC	2	6	318857	318862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259297
5607	NC_009484	CGC	2	6	318949	318954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259297
5608	NC_009484	CTT	2	6	319026	319031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259297
5609	NC_009484	GCC	2	6	319033	319038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259297
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5613	NC_009484	ATC	2	6	319347	319352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259298
5614	NC_009484	ACA	2	6	319359	319364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259298
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5617	NC_009484	CGC	2	6	319583	319588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259298
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