MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 63817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009484	CTG	2	6	288184	288189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259271
5002	NC_009484	GCT	2	6	288201	288206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259271
5003	NC_009484	CGA	2	6	288420	288425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259271
5004	NC_009484	AAG	2	6	288526	288531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259271
5005	NC_009484	GCG	2	6	288582	288587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259271
5006	NC_009484	GCG	2	6	288609	288614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259271
5007	NC_009484	GAG	2	6	288658	288663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259271
5008	NC_009484	GGC	2	6	288741	288746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259272
5009	NC_009484	CGG	2	6	288751	288756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259272
5010	NC_009484	TGG	2	6	288760	288765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259272
5011	NC_009484	GCC	2	6	288846	288851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259272
5012	NC_009484	CTG	2	6	288867	288872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259272
5013	NC_009484	CGA	2	6	288875	288880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259272
5014	NC_009484	TCG	3	9	288943	288951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259272
5015	NC_009484	GCG	2	6	288964	288969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259272
5016	NC_009484	TGC	2	6	289024	289029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259272
5017	NC_009484	GCT	2	6	289070	289075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259272
5018	NC_009484	GCG	2	6	289138	289143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259272
5019	NC_009484	CAG	2	6	289239	289244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259272
5020	NC_009484	CGG	2	6	289264	289269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259272
5021	NC_009484	CCG	2	6	289364	289369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259272
5022	NC_009484	CGC	2	6	289373	289378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259272
5023	NC_009484	ACC	2	6	289384	289389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259272
5024	NC_009484	GGT	3	9	289434	289442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259272
5025	NC_009484	CGG	2	6	289505	289510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259272
5026	NC_009484	TCC	2	6	289624	289629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259272
5027	NC_009484	CGC	2	6	289655	289660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259272
5028	NC_009484	GCC	2	6	289665	289670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259272
5029	NC_009484	TCG	2	6	289678	289683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259272
5030	NC_009484	AGC	2	6	289696	289701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259272
5031	NC_009484	GCA	2	6	289820	289825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259272
5032	NC_009484	TTC	2	6	289833	289838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259272
5033	NC_009484	GAT	2	6	289891	289896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259273
5034	NC_009484	GCC	2	6	289918	289923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259273
5035	NC_009484	GCC	2	6	289961	289966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259273
5036	NC_009484	CGT	2	6	289974	289979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259273
5037	NC_009484	CGA	2	6	290052	290057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259273
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5039	NC_009484	CTG	2	6	290083	290088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259273
5040	NC_009484	GCT	2	6	290307	290312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259273
5041	NC_009484	CGA	2	6	290394	290399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259273
5042	NC_009484	CCG	2	6	290406	290411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259273
5043	NC_009484	TCG	2	6	290423	290428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259273
5044	NC_009484	TGC	2	6	290528	290533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259273
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5051	NC_009484	TCG	2	6	290840	290845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259273
5052	NC_009484	TCG	2	6	291035	291040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259273
5053	NC_009484	GCA	2	6	291191	291196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259274
5054	NC_009484	TCC	2	6	291230	291235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259274
5055	NC_009484	CGG	3	9	291300	291308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259274
5056	NC_009484	CCG	2	6	291369	291374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259274
5057	NC_009484	GTC	2	6	291421	291426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259274
5058	NC_009484	CGA	3	9	291435	291443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259274
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5063	NC_009484	CGA	2	6	291603	291608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259274
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5070	NC_009484	CGC	2	6	291897	291902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259274
5071	NC_009484	CGA	2	6	291909	291914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259274
5072	NC_009484	CGA	2	6	291922	291927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259274
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5089	NC_009484	GTC	2	6	292499	292504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259274
5090	NC_009484	GCG	2	6	292563	292568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259274
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5102	NC_009484	GCC	2	6	293224	293229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259275
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5355	NC_009484	GGC	2	6	304521	304526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259284
5356	NC_009484	TGC	2	6	304542	304547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259284
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5473	NC_009484	GCA	2	6	310861	310866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259290
5474	NC_009484	GAC	3	9	310934	310942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259290
5475	NC_009484	CCG	2	6	310953	310958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259290
5476	NC_009484	CGG	2	6	311023	311028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259290
5477	NC_009484	CGC	2	6	311031	311036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259290
5478	NC_009484	TCG	2	6	311043	311048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259290
5479	NC_009484	TCG	2	6	311086	311091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259290
5480	NC_009484	CGA	2	6	311146	311151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259290
5481	NC_009484	ACG	2	6	311196	311201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259290
5482	NC_009484	CGC	2	6	311203	311208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259290
5483	NC_009484	CGC	2	6	311225	311230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259290
5484	NC_009484	GAT	2	6	311411	311416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259290
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5495	NC_009484	CGA	2	6	312294	312299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259292
5496	NC_009484	GTC	2	6	312301	312306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259292
5497	NC_009484	CGC	2	6	312345	312350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259292
5498	NC_009484	AGC	2	6	312356	312361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259292
5499	NC_009484	ACG	2	6	312410	312415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259292
5500	NC_009484	GGC	2	6	312433	312438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259292

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