MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 40755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009051	ATC	2	6	248842	248847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178222
4002	NC_009051	TCG	2	6	248851	248856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178222
4003	NC_009051	GAG	2	6	248865	248870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178222
4004	NC_009051	CGA	2	6	248948	248953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178222
4005	NC_009051	CGA	2	6	249017	249022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178222
4006	NC_009051	GAC	2	6	249069	249074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178222
4007	NC_009051	GCC	2	6	249117	249122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178222
4008	NC_009051	GCG	2	6	249130	249135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178222
4009	NC_009051	CCG	3	9	249175	249183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178222
4010	NC_009051	ACG	2	6	249184	249189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178222
4011	NC_009051	CGT	2	6	249230	249235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178222
4012	NC_009051	CAG	2	6	249258	249263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178222
4013	NC_009051	AGG	2	6	249283	249288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178222
4014	NC_009051	GAT	2	6	249321	249326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178222
4015	NC_009051	GCC	2	6	249355	249360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178222
4016	NC_009051	CTC	2	6	249390	249395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178222
4017	NC_009051	TTG	2	6	249400	249405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178222
4018	NC_009051	TGC	2	6	249410	249415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178222
4019	NC_009051	TCT	2	6	249460	249465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178222
4020	NC_009051	GAC	2	6	249531	249536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178222
4021	NC_009051	CGG	2	6	249545	249550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178222
4022	NC_009051	GGA	2	6	249618	249623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178222
4023	NC_009051	CTT	2	6	249732	249737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178222
4024	NC_009051	CGT	2	6	249767	249772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178222
4025	NC_009051	CTT	2	6	249792	249797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178222
4026	NC_009051	GTC	2	6	249807	249812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178222
4027	NC_009051	CCA	2	6	249869	249874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178222
4028	NC_009051	GAT	2	6	250035	250040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178222
4029	NC_009051	AGC	2	6	250063	250068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178222
4030	NC_009051	CGA	2	6	250094	250099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178222
4031	NC_009051	GTG	2	6	250114	250119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178222
4032	NC_009051	TCG	2	6	250132	250137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178222
4033	NC_009051	CGA	2	6	250157	250162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178222
4034	NC_009051	GCC	2	6	250170	250175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178222
4035	NC_009051	TGC	2	6	250180	250185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178222
4036	NC_009051	CGT	2	6	250214	250219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178222
4037	NC_009051	CAC	2	6	250227	250232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178222
4038	NC_009051	GTC	2	6	250282	250287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178222
4039	NC_009051	CGG	2	6	250292	250297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178222
4040	NC_009051	ATG	2	6	250378	250383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178222
4041	NC_009051	TGC	2	6	250719	250724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178223
4042	NC_009051	CGT	2	6	250751	250756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178223
4043	NC_009051	GAC	2	6	250766	250771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178223
4044	NC_009051	GTC	2	6	250772	250777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178223
4045	NC_009051	GAT	2	6	250781	250786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178223
4046	NC_009051	GCG	2	6	250797	250802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178223
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4048	NC_009051	CGA	2	6	250939	250944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178223
4049	NC_009051	CTC	2	6	250978	250983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178223
4050	NC_009051	CCT	2	6	250984	250989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178223
4051	NC_009051	CAT	3	9	251012	251020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178223
4052	NC_009051	GCC	2	6	251058	251063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178223
4053	NC_009051	CTG	2	6	251102	251107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178223
4054	NC_009051	AGC	2	6	251112	251117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178223
4055	NC_009051	TCG	2	6	251148	251153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178223
4056	NC_009051	ATT	2	6	251248	251253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126178224
4057	NC_009051	GTC	2	6	251420	251425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178224
4058	NC_009051	CGA	2	6	251623	251628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178224
4059	NC_009051	TTC	2	6	251726	251731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178225
4060	NC_009051	GAG	2	6	251761	251766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178225
4061	NC_009051	CCG	2	6	251816	251821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178225
4062	NC_009051	TCG	2	6	251888	251893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178225
4063	NC_009051	GCT	2	6	251909	251914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178225
4064	NC_009051	CGG	2	6	251928	251933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178225
4065	NC_009051	GCC	3	9	252077	252085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178225
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4067	NC_009051	GCC	2	6	252139	252144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178225
4068	NC_009051	CTC	2	6	252145	252150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178225
4069	NC_009051	ATA	2	6	252223	252228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126178225
4070	NC_009051	CCG	2	6	252356	252361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178225
4071	NC_009051	CGG	2	6	252411	252416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178225
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4073	NC_009051	CGG	2	6	252534	252539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178225
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4085	NC_009051	CCG	2	6	253021	253026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178226
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4089	NC_009051	TTC	2	6	253308	253313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178226
4090	NC_009051	CGG	2	6	253321	253326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178226
4091	NC_009051	TGC	2	6	253372	253377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178226
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4103	NC_009051	CTC	2	6	254033	254038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178227
4104	NC_009051	ATC	2	6	254039	254044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178227
4105	NC_009051	ATC	2	6	254048	254053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178227
4106	NC_009051	ATC	2	6	254063	254068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178227
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4109	NC_009051	GAG	2	6	254141	254146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178227
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4111	NC_009051	CGA	2	6	254344	254349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178227
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4113	NC_009051	CTG	2	6	254384	254389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178227
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4116	NC_009051	TGA	2	6	254484	254489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178227
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4118	NC_009051	GAA	2	6	254608	254613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178227
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4237	NC_009051	TCG	2	6	262210	262215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178235
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4241	NC_009051	CTG	2	6	262329	262334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178235
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4354	NC_009051	GAC	2	6	268366	268371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178241
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4472	NC_009051	CAA	2	6	275774	275779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126178250
4473	NC_009051	TCA	2	6	275785	275790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178250
4474	NC_009051	CGA	3	9	275858	275866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178250
4475	NC_009051	TCG	2	6	275932	275937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178250
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4478	NC_009051	CGA	2	6	276227	276232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178250
4479	NC_009051	TCG	3	9	276253	276261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178250
4480	NC_009051	CAT	2	6	276263	276268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178250
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4491	NC_009051	ATC	2	6	276816	276821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178250
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