MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 40755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009051	GGA	2	6	187615	187620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178155
3002	NC_009051	TGA	2	6	187626	187631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178155
3003	NC_009051	CAG	2	6	187663	187668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178155
3004	NC_009051	GCC	2	6	187742	187747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178155
3005	NC_009051	GAG	2	6	187774	187779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178155
3006	NC_009051	GTA	2	6	187879	187884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178155
3007	NC_009051	GAC	2	6	187906	187911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178155
3008	NC_009051	CGT	2	6	187920	187925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178155
3009	NC_009051	AGC	2	6	187928	187933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178155
3010	NC_009051	GAT	2	6	187939	187944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178155
3011	NC_009051	CCG	2	6	187967	187972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178155
3012	NC_009051	ACG	2	6	188008	188013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178155
3013	NC_009051	GGC	2	6	188265	188270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178156
3014	NC_009051	GAT	2	6	188322	188327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178156
3015	NC_009051	TCC	2	6	188344	188349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178156
3016	NC_009051	GGT	2	6	188367	188372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178156
3017	NC_009051	GCG	2	6	188386	188391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178156
3018	NC_009051	GAA	2	6	188430	188435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178156
3019	NC_009051	GAC	2	6	188448	188453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178156
3020	NC_009051	CGG	2	6	188483	188488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178156
3021	NC_009051	GAC	2	6	188598	188603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178156
3022	NC_009051	CGA	2	6	188642	188647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178156
3023	NC_009051	GAG	2	6	188679	188684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178156
3024	NC_009051	CGG	2	6	188735	188740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178156
3025	NC_009051	TCA	3	9	189347	189355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178157
3026	NC_009051	TCC	2	6	189530	189535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178157
3027	NC_009051	GAT	2	6	189550	189555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178157
3028	NC_009051	CTT	2	6	189582	189587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178157
3029	NC_009051	TGA	2	6	189645	189650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178157
3030	NC_009051	TTC	2	6	189710	189715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178157
3031	NC_009051	CAG	2	6	190145	190150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178158
3032	NC_009051	CGC	2	6	190164	190169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178158
3033	NC_009051	GAC	2	6	190195	190200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178158
3034	NC_009051	TCA	2	6	190209	190214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178158
3035	NC_009051	TCA	2	6	190257	190262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178158
3036	NC_009051	GGC	2	6	190303	190308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178158
3037	NC_009051	CGC	2	6	190331	190336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178158
3038	NC_009051	GGC	2	6	190363	190368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178158
3039	NC_009051	CCG	2	6	190371	190376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178158
3040	NC_009051	GGA	2	6	190386	190391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178158
3041	NC_009051	GTC	2	6	190429	190434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178158
3042	NC_009051	TCT	2	6	190494	190499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178158
3043	NC_009051	CCA	2	6	190512	190517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178158
3044	NC_009051	GGA	2	6	190557	190562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178158
3045	NC_009051	AGC	2	6	190623	190628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178158
3046	NC_009051	CGG	2	6	190647	190652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178158
3047	NC_009051	GCG	2	6	190662	190667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178158
3048	NC_009051	TCG	2	6	190764	190769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178158
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3051	NC_009051	CGG	2	6	190806	190811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178158
3052	NC_009051	TCC	2	6	190922	190927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178158
3053	NC_009051	GGA	2	6	190944	190949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178158
3054	NC_009051	ACG	2	6	191009	191014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178158
3055	NC_009051	GTC	2	6	191024	191029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178158
3056	NC_009051	CGG	2	6	191032	191037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178158
3057	NC_009051	ACG	2	6	191054	191059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178158
3058	NC_009051	CGC	2	6	191107	191112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178158
3059	NC_009051	GCC	2	6	191144	191149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178158
3060	NC_009051	CGC	3	9	191293	191301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178158
3061	NC_009051	CGA	2	6	191388	191393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178158
3062	NC_009051	GAG	2	6	192049	192054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178159
3063	NC_009051	GAG	2	6	192186	192191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178159
3064	NC_009051	GGA	2	6	192192	192197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178159
3065	NC_009051	TTC	2	6	192228	192233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178159
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3067	NC_009051	CGC	2	6	192380	192385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178160
3068	NC_009051	AAG	2	6	192408	192413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178160
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3070	NC_009051	TGC	2	6	192929	192934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178161
3071	NC_009051	CTC	2	6	192940	192945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178161
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3076	NC_009051	GAC	2	6	193238	193243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178161
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3079	NC_009051	GAG	2	6	193366	193371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178162
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3090	NC_009051	GTC	2	6	194402	194407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178165
3091	NC_009051	GAC	2	6	194492	194497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178165
3092	NC_009051	CTC	2	6	194525	194530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178165
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3099	NC_009051	CTC	2	6	194888	194893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178165
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3101	NC_009051	GCT	2	6	194926	194931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178165
3102	NC_009051	CTT	2	6	194947	194952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178165
3103	NC_009051	CGC	2	6	195016	195021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178165
3104	NC_009051	CTT	2	6	195025	195030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178165
3105	NC_009051	CGG	2	6	195034	195039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178165
3106	NC_009051	CTC	2	6	195155	195160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178165
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3111	NC_009051	GCC	3	9	195221	195229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178165
3112	NC_009051	GTC	2	6	195299	195304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178165
3113	NC_009051	CAG	2	6	195515	195520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178166
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3118	NC_009051	CGG	2	6	195774	195779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178166
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3120	NC_009051	GGA	2	6	195805	195810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178166
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3238	NC_009051	CGA	2	6	202825	202830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178173
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3241	NC_009051	CGA	2	6	202903	202908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178173
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3350	NC_009051	GTC	2	6	210151	210156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178182
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3352	NC_009051	ACG	2	6	210439	210444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178183
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3355	NC_009051	TCG	2	6	210634	210639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178183
3356	NC_009051	CGT	2	6	210659	210664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178183
3357	NC_009051	CGG	2	6	210704	210709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178183
3358	NC_009051	CAT	2	6	210862	210867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178184
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3473	NC_009051	GCC	2	6	218534	218539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178190
3474	NC_009051	TCT	2	6	218608	218613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178190
3475	NC_009051	CGG	2	6	218656	218661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178190
3476	NC_009051	GCG	2	6	218676	218681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178190
3477	NC_009051	TTC	2	6	218747	218752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178190
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