MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 40755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009051	TCC	2	6	119779	119784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178083
2002	NC_009051	ACG	2	6	120007	120012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178083
2003	NC_009051	TCT	2	6	120043	120048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178083
2004	NC_009051	CTT	2	6	120120	120125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178083
2005	NC_009051	TCT	2	6	120323	120328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178083
2006	NC_009051	CGA	3	9	120437	120445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178083
2007	NC_009051	CAA	2	6	120458	120463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126178083
2008	NC_009051	TGT	2	6	120530	120535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178084
2009	NC_009051	GTC	2	6	120597	120602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178084
2010	NC_009051	CTG	2	6	120741	120746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178084
2011	NC_009051	GTA	2	6	120843	120848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178084
2012	NC_009051	GAG	2	6	120901	120906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178084
2013	NC_009051	GTC	2	6	120933	120938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178084
2014	NC_009051	GTA	2	6	120939	120944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178084
2015	NC_009051	GAA	3	9	120960	120968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178084
2016	NC_009051	GAC	2	6	121021	121026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178084
2017	NC_009051	AGT	2	6	121034	121039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178084
2018	NC_009051	CGT	2	6	121064	121069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178084
2019	NC_009051	CGT	2	6	121080	121085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178084
2020	NC_009051	GTG	2	6	121112	121117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178084
2021	NC_009051	CAG	2	6	121130	121135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178084
2022	NC_009051	TGC	2	6	121158	121163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178084
2023	NC_009051	CCT	2	6	121693	121698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178085
2024	NC_009051	GAG	2	6	121709	121714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178085
2025	NC_009051	GAA	2	6	121744	121749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178085
2026	NC_009051	TGC	2	6	121768	121773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178085
2027	NC_009051	GGC	2	6	121844	121849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178085
2028	NC_009051	GAG	2	6	121935	121940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178085
2029	NC_009051	ACC	2	6	121941	121946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178085
2030	NC_009051	GAA	2	6	121955	121960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178085
2031	NC_009051	ACT	2	6	122006	122011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178085
2032	NC_009051	CTA	2	6	122039	122044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178085
2033	NC_009051	GTG	2	6	122083	122088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178085
2034	NC_009051	TTC	2	6	122253	122258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178085
2035	NC_009051	TTA	2	6	122282	122287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126178085
2036	NC_009051	TCG	2	6	122698	122703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178085
2037	NC_009051	ATG	2	6	122741	122746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178086
2038	NC_009051	CGC	2	6	122791	122796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178086
2039	NC_009051	TGA	2	6	122814	122819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178086
2040	NC_009051	TCG	2	6	122847	122852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178086
2041	NC_009051	ATC	2	6	122855	122860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178086
2042	NC_009051	GGA	2	6	122977	122982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178086
2043	NC_009051	GAA	2	6	123115	123120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178086
2044	NC_009051	AGA	2	6	123121	123126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178086
2045	NC_009051	GCT	2	6	123133	123138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178086
2046	NC_009051	GAA	2	6	123176	123181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178086
2047	NC_009051	GTC	2	6	123215	123220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178086
2048	NC_009051	CGC	2	6	123240	123245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178086
2049	NC_009051	GAC	3	9	123328	123336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178086
2050	NC_009051	CGG	2	6	123451	123456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178087
2051	NC_009051	TCG	2	6	123491	123496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178087
2052	NC_009051	GCC	2	6	123555	123560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178087
2053	NC_009051	CCT	2	6	123629	123634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178087
2054	NC_009051	GGA	2	6	123642	123647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178087
2055	NC_009051	ATC	2	6	123682	123687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178087
2056	NC_009051	TCT	2	6	123734	123739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178087
2057	NC_009051	CGG	2	6	123741	123746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178087
2058	NC_009051	GCA	2	6	123761	123766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178087
2059	NC_009051	TTC	2	6	123838	123843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178087
2060	NC_009051	GTT	2	6	123894	123899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178087
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2062	NC_009051	CGG	2	6	124130	124135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178087
2063	NC_009051	CTC	2	6	124164	124169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178087
2064	NC_009051	CAT	2	6	124218	124223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178087
2065	NC_009051	CAT	2	6	124242	124247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178087
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2068	NC_009051	ATC	2	6	124390	124395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178087
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2070	NC_009051	GAT	3	9	124477	124485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178087
2071	NC_009051	GAT	2	6	124512	124517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178087
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2079	NC_009051	TCG	3	9	125298	125306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178089
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2089	NC_009051	CTG	2	6	126693	126698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178090
2090	NC_009051	TCA	2	6	126792	126797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178090
2091	NC_009051	TCT	2	6	126842	126847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178090
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2101	NC_009051	CGG	2	6	127999	128004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178091
2102	NC_009051	GGT	2	6	128136	128141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178091
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2105	NC_009051	GCC	2	6	128240	128245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178091
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2118	NC_009051	TGG	2	6	128948	128953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178092
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2234	NC_009051	GCC	2	6	136732	136737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178102
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2472	NC_009051	GCG	2	6	149335	149340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178113
2473	NC_009051	GCT	2	6	149354	149359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178113
2474	NC_009051	TTC	2	6	149391	149396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178113
2475	NC_009051	CCG	2	6	149430	149435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178113
2476	NC_009051	TCC	2	6	149462	149467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178113
2477	NC_009051	GGA	2	6	149477	149482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178113
2478	NC_009051	TCG	2	6	149539	149544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178113
2479	NC_009051	CGT	2	6	149594	149599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178113
2480	NC_009051	GGA	2	6	149651	149656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178113
2481	NC_009051	CCG	2	6	149700	149705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178113
2482	NC_009051	GAG	2	6	149739	149744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178113
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2491	NC_009051	TCT	2	6	150556	150561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178114
2492	NC_009051	CGA	2	6	150616	150621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178114
2493	NC_009051	TCG	2	6	150645	150650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178114
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2495	NC_009051	TTC	2	6	150821	150826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178114
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2497	NC_009051	TCC	2	6	150945	150950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178115
2498	NC_009051	CTT	2	6	151040	151045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178115
2499	NC_009051	ATC	2	6	151077	151082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178115
2500	NC_009051	TCT	2	6	151162	151167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178115

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